MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Aeropyrum pernix K1

Total Repeats: 1056

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000854	TAATA	2	10	558	567	60 %	40 %	0 %	0 %	14600380
2	NC_000854	TTTAA	2	10	577	586	40 %	60 %	0 %	0 %	14600380
3	NC_000854	TAATC	2	10	3835	3844	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_000854	TAGGG	2	10	4813	4822	20 %	20 %	60 %	0 %	118430837
5	NC_000854	CTAGG	2	10	5432	5441	20 %	20 %	40 %	20 %	118430837
6	NC_000854	ATGAA	2	10	5776	5785	60 %	20 %	20 %	0 %	118430838
7	NC_000854	CCTCT	2	10	6315	6324	0 %	40 %	0 %	60 %	118430839
8	NC_000854	CTCTC	2	10	6399	6408	0 %	40 %	0 %	60 %	118430839
9	NC_000854	AGCTT	2	10	7625	7634	20 %	40 %	20 %	20 %	118430839
10	NC_000854	AACAA	2	10	7930	7939	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_000854	ACTAT	2	10	8032	8041	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
12	NC_000854	CTCGG	2	10	10633	10642	0 %	20 %	40 %	40 %	118430841
13	NC_000854	ACTTC	2	10	11964	11973	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
14	NC_000854	GGAGA	2	10	12322	12331	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
15	NC_000854	TGGCT	2	10	12996	13005	0 %	40 %	40 %	20 %	118430842
16	NC_000854	CCTGC	2	10	14271	14280	0 %	20 %	20 %	60 %	118430843
17	NC_000854	CCTTC	2	10	15607	15616	0 %	40 %	0 %	60 %	118430844
18	NC_000854	CACAG	2	10	16022	16031	40 %	0 %	20 %	40 %	118430845
19	NC_000854	GTCAA	2	10	18402	18411	40 %	20 %	20 %	20 %	14600396
20	NC_000854	TTATG	2	10	22100	22109	20 %	60 %	20 %	0 %	118430848
21	NC_000854	GGCTG	2	10	25678	25687	0 %	20 %	60 %	20 %	118430851
22	NC_000854	CCAGG	2	10	28303	28312	20 %	0 %	40 %	40 %	118430853
23	NC_000854	GAGGT	2	10	30655	30664	20 %	20 %	60 %	0 %	14600407
24	NC_000854	CGATG	2	10	31144	31153	20 %	20 %	40 %	20 %	14600408
25	NC_000854	ACTTG	2	10	33061	33070	20 %	40 %	20 %	20 %	118430856
26	NC_000854	TAATG	2	10	33697	33706	40 %	40 %	20 %	0 %	14600412
27	NC_000854	TAGAA	2	10	34101	34110	60 %	20 %	20 %	0 %	14600412
28	NC_000854	CTGGT	2	10	35179	35188	0 %	40 %	40 %	20 %	118430857
29	NC_000854	TGGCC	2	10	36922	36931	0 %	20 %	40 %	40 %	118430858
30	NC_000854	GTGCT	2	10	37514	37523	0 %	40 %	40 %	20 %	118430858
31	NC_000854	TTGTC	2	10	37610	37619	0 %	60 %	20 %	20 %	118430858
32	NC_000854	AGGCA	2	10	37908	37917	40 %	0 %	40 %	20 %	118430858
33	NC_000854	GCCAT	2	10	38239	38248	20 %	20 %	20 %	40 %	118430858
34	NC_000854	ATCAT	2	10	38323	38332	40 %	40 %	0 %	20 %	118430858
35	NC_000854	CTATC	2	10	38477	38486	20 %	40 %	0 %	40 %	118430858
36	NC_000854	ACATA	2	10	39293	39302	60 %	20 %	0 %	20 %	118430858
37	NC_000854	ATAGG	2	10	43200	43209	40 %	20 %	40 %	0 %	14600419
38	NC_000854	AGCAT	2	10	46252	46261	40 %	20 %	20 %	20 %	118430862
39	NC_000854	TCCAT	2	10	46468	46477	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
40	NC_000854	TGTGG	2	10	50849	50858	0 %	40 %	60 %	0 %	118430866
41	NC_000854	AGGCG	2	10	51306	51315	20 %	0 %	60 %	20 %	118430866
42	NC_000854	CTGGG	2	10	56092	56101	0 %	20 %	60 %	20 %	118430869
43	NC_000854	GAAAG	3	15	58558	58572	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
44	NC_000854	AGGTT	2	10	61099	61108	20 %	40 %	40 %	0 %	118430875
45	NC_000854	AAAAG	2	10	61793	61802	80 %	0 %	20 %	0 %	118430875
46	NC_000854	TCTCC	2	10	64689	64698	0 %	40 %	0 %	60 %	14600442
47	NC_000854	CACAA	2	10	64939	64948	60 %	0 %	0 %	40 %	14600442
48	NC_000854	ATATA	2	10	65268	65277	60 %	40 %	0 %	0 %	14600442
49	NC_000854	TCATA	2	10	65313	65322	40 %	40 %	0 %	20 %	14600442
50	NC_000854	GCCAG	2	10	65546	65555	20 %	0 %	40 %	40 %	14602183
51	NC_000854	ATATT	2	10	67937	67946	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_000854	GTAGG	2	10	70898	70907	20 %	20 %	60 %	0 %	14600448
53	NC_000854	CTGTC	2	10	71626	71635	0 %	40 %	20 %	40 %	14600448
54	NC_000854	CTACT	2	10	72775	72784	20 %	40 %	0 %	40 %	118430880
55	NC_000854	AGGCC	2	10	80185	80194	20 %	0 %	40 %	40 %	118430885
56	NC_000854	AGCCT	2	10	81258	81267	20 %	20 %	20 %	40 %	14600457
57	NC_000854	CTGGA	2	10	83166	83175	20 %	20 %	40 %	20 %	14600457
58	NC_000854	CCTCA	2	10	83397	83406	20 %	20 %	0 %	60 %	14600458
59	NC_000854	TTGCT	2	10	83704	83713	0 %	60 %	20 %	20 %	14600458
60	NC_000854	GCATA	2	10	87281	87290	40 %	20 %	20 %	20 %	118430887
61	NC_000854	CAGAG	2	10	89633	89642	40 %	0 %	40 %	20 %	14600463
62	NC_000854	GAGCC	2	10	90582	90591	20 %	0 %	40 %	40 %	14600464
63	NC_000854	AGGCG	2	10	91077	91086	20 %	0 %	60 %	20 %	118430889
64	NC_000854	CTATG	2	10	92581	92590	20 %	40 %	20 %	20 %	118430890
65	NC_000854	TACCC	2	10	95401	95410	20 %	20 %	0 %	60 %	14600469
66	NC_000854	GAACA	2	10	96079	96088	60 %	0 %	20 %	20 %	118430892
67	NC_000854	AGTCG	2	10	97496	97505	20 %	20 %	40 %	20 %	118430893
68	NC_000854	GTCTT	2	10	101418	101427	0 %	60 %	20 %	20 %	118430897
69	NC_000854	GAGGG	2	10	102578	102587	20 %	0 %	80 %	0 %	14600477
70	NC_000854	GGAGT	2	10	107038	107047	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
71	NC_000854	AAGCA	2	10	108142	108151	60 %	0 %	20 %	20 %	14600482
72	NC_000854	AGGCA	2	10	108537	108546	40 %	0 %	40 %	20 %	14600482
73	NC_000854	GATAA	2	10	110866	110875	60 %	20 %	20 %	0 %	118430904
74	NC_000854	ATGGA	2	10	113077	113086	40 %	20 %	40 %	0 %	118430906
75	NC_000854	CCCTG	2	10	115408	115417	0 %	20 %	20 %	60 %	14600490
76	NC_000854	GAGTA	2	10	119722	119731	40 %	20 %	40 %	0 %	14600495
77	NC_000854	ACCTC	2	10	123365	123374	20 %	20 %	0 %	60 %	118430913
78	NC_000854	AGCCT	2	10	123872	123881	20 %	20 %	20 %	40 %	118430913
79	NC_000854	CTCCA	2	10	124311	124320	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
80	NC_000854	GAAGG	2	10	125341	125350	40 %	0 %	60 %	0 %	14600500
81	NC_000854	GTAAT	2	10	127305	127314	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_000854	GGCGT	2	10	128154	128163	0 %	20 %	60 %	20 %	118430917
83	NC_000854	GCCCC	2	10	128514	128523	0 %	0 %	20 %	80 %	118430918
84	NC_000854	AGGGT	2	10	130567	130576	20 %	20 %	60 %	0 %	118430919
85	NC_000854	GTTGA	2	10	133184	133193	20 %	40 %	40 %	0 %	14600510
86	NC_000854	TCCTC	2	10	133606	133615	0 %	40 %	0 %	60 %	14600511
87	NC_000854	GAGGG	2	10	134986	134995	20 %	0 %	80 %	0 %	118430921
88	NC_000854	CTCTT	2	10	136640	136649	0 %	60 %	0 %	40 %	118430923
89	NC_000854	AGGCG	2	10	137522	137531	20 %	0 %	60 %	20 %	14600516
90	NC_000854	AGCAC	2	10	139029	139038	40 %	0 %	20 %	40 %	118430924
91	NC_000854	GTGAG	2	10	141422	141431	20 %	20 %	60 %	0 %	118430925
92	NC_000854	CCCTC	2	10	145744	145753	0 %	20 %	0 %	80 %	118430929
93	NC_000854	AGGGT	2	10	146358	146367	20 %	20 %	60 %	0 %	118430929
94	NC_000854	GAGTC	2	10	147219	147228	20 %	20 %	40 %	20 %	14600524
95	NC_000854	TAAGA	2	10	147361	147370	60 %	20 %	20 %	0 %	14600524
96	NC_000854	AGGAG	2	10	149676	149685	40 %	0 %	60 %	0 %	118430932
97	NC_000854	TCCGG	2	10	150374	150383	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
98	NC_000854	AGAGG	2	10	151498	151507	40 %	0 %	60 %	0 %	14600529
99	NC_000854	GAGGG	2	10	151690	151699	20 %	0 %	80 %	0 %	14600530
100	NC_000854	GCCTA	2	10	151929	151938	20 %	20 %	20 %	40 %	14600530
101	NC_000854	CCCTC	2	10	153532	153541	0 %	20 %	0 %	80 %	118430934
102	NC_000854	TAGAT	2	10	153558	153567	40 %	40 %	20 %	0 %	118430934
103	NC_000854	TGAGA	2	10	154138	154147	40 %	20 %	40 %	0 %	118430935
104	NC_000854	AAACC	2	10	155714	155723	60 %	0 %	0 %	40 %	118430936
105	NC_000854	CCCTC	2	10	155983	155992	0 %	20 %	0 %	80 %	118430937
106	NC_000854	CTACC	2	10	157103	157112	20 %	20 %	0 %	60 %	118430939
107	NC_000854	ACCCT	2	10	157522	157531	20 %	20 %	0 %	60 %	118430939
108	NC_000854	ACCCT	2	10	158492	158501	20 %	20 %	0 %	60 %	14600539
109	NC_000854	AGGAG	2	10	161447	161456	40 %	0 %	60 %	0 %	118430940
110	NC_000854	CCCTC	2	10	162958	162967	0 %	20 %	0 %	80 %	118430942
111	NC_000854	GGCAG	2	10	163013	163022	20 %	0 %	60 %	20 %	118430942
112	NC_000854	TAGAC	2	10	163804	163813	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
113	NC_000854	GCCGC	2	10	166594	166603	0 %	0 %	40 %	60 %	118430945
114	NC_000854	TCCGC	2	10	167231	167240	0 %	20 %	20 %	60 %	118430945
115	NC_000854	TATGT	2	10	167985	167994	20 %	60 %	20 %	0 %	14600549
116	NC_000854	TAAAG	2	10	169372	169381	60 %	20 %	20 %	0 %	14600551
117	NC_000854	CCCTG	2	10	171407	171416	0 %	20 %	20 %	60 %	118430947
118	NC_000854	CCTCA	2	10	172760	172769	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
119	NC_000854	CCTAT	2	10	175570	175579	20 %	40 %	0 %	40 %	14600560
120	NC_000854	CCGGG	2	10	175859	175868	0 %	0 %	60 %	40 %	14600560
121	NC_000854	CCGTG	2	10	177259	177268	0 %	20 %	40 %	40 %	118430952
122	NC_000854	GAGGG	2	10	179230	179239	20 %	0 %	80 %	0 %	118430954
123	NC_000854	GGGAG	2	10	179583	179592	20 %	0 %	80 %	0 %	118430954
124	NC_000854	ACTCT	2	10	180984	180993	20 %	40 %	0 %	40 %	14600565
125	NC_000854	CTGGG	2	10	182140	182149	0 %	20 %	60 %	20 %	14600566
126	NC_000854	GAGGC	2	10	182700	182709	20 %	0 %	60 %	20 %	118430955
127	NC_000854	ACCCT	2	10	182760	182769	20 %	20 %	0 %	60 %	118430955
128	NC_000854	CCCTA	2	10	185182	185191	20 %	20 %	0 %	60 %	118430957
129	NC_000854	GCGAG	2	10	187676	187685	20 %	0 %	60 %	20 %	118430959
130	NC_000854	TGGCC	2	10	188420	188429	0 %	20 %	40 %	40 %	14600575
131	NC_000854	GGTTT	2	10	190393	190402	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
132	NC_000854	CCAAC	2	10	191289	191298	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
133	NC_000854	AGGAG	2	10	192242	192251	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
134	NC_000854	TCTAC	2	10	193023	193032	20 %	40 %	0 %	40 %	14600580
135	NC_000854	GGTGT	2	10	196159	196168	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
136	NC_000854	GGCGA	2	10	197386	197395	20 %	0 %	60 %	20 %	118430964
137	NC_000854	ATAGG	2	10	199308	199317	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
138	NC_000854	TCCTC	2	10	200853	200862	0 %	40 %	0 %	60 %	118430968
139	NC_000854	TATGG	2	10	201673	201682	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
140	NC_000854	AATAT	2	10	203015	203024	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_000854	GCAAT	2	10	204249	204258	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
142	NC_000854	TGATT	2	10	205361	205370	20 %	60 %	20 %	0 %	118430974
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144	NC_000854	ACACC	2	10	208496	208505	40 %	0 %	0 %	60 %	118430976
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150	NC_000854	CTTCT	2	10	219778	219787	0 %	60 %	0 %	40 %	14600616
151	NC_000854	TATAT	2	10	220512	220521	40 %	60 %	0 %	0 %	14600616
152	NC_000854	GCTCA	2	10	221445	221454	20 %	20 %	20 %	40 %	118430987
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154	NC_000854	GCTTT	2	10	223314	223323	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
155	NC_000854	GTGAT	2	10	223656	223665	20 %	40 %	40 %	0 %	118430988
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157	NC_000854	GGTCT	2	10	225963	225972	0 %	40 %	40 %	20 %	118430989
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161	NC_000854	AGGCT	2	10	227663	227672	20 %	20 %	40 %	20 %	14600622
162	NC_000854	CGTCA	2	10	230361	230370	20 %	20 %	20 %	40 %	118430993
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164	NC_000854	TAGTA	2	10	233294	233303	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
165	NC_000854	GCCGG	2	10	233380	233389	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
166	NC_000854	GTCTG	2	10	233421	233430	0 %	40 %	40 %	20 %	118430996
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173	NC_000854	GGAGT	2	10	254565	254574	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
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179	NC_000854	GTAGG	2	10	263218	263227	20 %	20 %	60 %	0 %	14600669
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182	NC_000854	GTGCC	2	10	265879	265888	0 %	20 %	40 %	40 %	14600670
183	NC_000854	TAAAA	2	10	266932	266941	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
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217	NC_000854	AGCCT	2	10	327051	327060	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
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238	NC_000854	CCGGC	2	10	350815	350824	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
239	NC_000854	GTGCT	2	10	352317	352326	0 %	40 %	40 %	20 %	118431084
240	NC_000854	CCCCA	2	10	356918	356927	20 %	0 %	0 %	80 %	118431088
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243	NC_000854	CTTAT	2	10	364067	364076	20 %	60 %	0 %	20 %	14600782
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249	NC_000854	ACTCA	2	10	368718	368727	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
250	NC_000854	GTATG	2	10	369526	369535	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
251	NC_000854	AACCC	2	10	370278	370287	40 %	0 %	0 %	60 %	118431097
252	NC_000854	AGAGG	2	10	370322	370331	40 %	0 %	60 %	0 %	118431097
253	NC_000854	CCCTC	2	10	371884	371893	0 %	20 %	0 %	80 %	118431098
254	NC_000854	TAGAG	2	10	371930	371939	40 %	20 %	40 %	0 %	118431098
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260	NC_000854	CGGGG	2	10	377915	377924	0 %	0 %	80 %	20 %	14600800
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262	NC_000854	TAGCC	2	10	382269	382278	20 %	20 %	20 %	40 %	118431107
263	NC_000854	GGCCC	2	10	383880	383889	0 %	0 %	40 %	60 %	118431108
264	NC_000854	ACCCT	2	10	384610	384619	20 %	20 %	0 %	60 %	118431108
265	NC_000854	CCCAG	2	10	388349	388358	20 %	0 %	20 %	60 %	118431110
266	NC_000854	GCGGG	2	10	390037	390046	0 %	0 %	80 %	20 %	14600814
267	NC_000854	GGCCT	2	10	398200	398209	0 %	20 %	40 %	40 %	118431115
268	NC_000854	TTAAG	2	10	400604	400613	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
269	NC_000854	GGGGA	2	10	402393	402402	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
270	NC_000854	CATCC	2	10	402554	402563	20 %	20 %	0 %	60 %	14600827
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382	NC_000854	GGCGG	2	10	566636	566645	0 %	0 %	80 %	20 %	118431229
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386	NC_000854	CTCTT	2	10	572479	572488	0 %	60 %	0 %	40 %	118431237
387	NC_000854	GCCCT	2	10	578921	578930	0 %	20 %	20 %	60 %	14601046
388	NC_000854	TGTCT	2	10	580760	580769	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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392	NC_000854	AGGCG	2	10	589763	589772	20 %	0 %	60 %	20 %	118431254
393	NC_000854	TGTGC	2	10	593097	593106	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
394	NC_000854	CGAGG	2	10	593598	593607	20 %	0 %	60 %	20 %	14601062
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396	NC_000854	TCTAC	2	10	594012	594021	20 %	40 %	0 %	40 %	118431256
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398	NC_000854	GCAGA	2	10	597586	597595	40 %	0 %	40 %	20 %	14601066
399	NC_000854	ACAGC	2	10	601328	601337	40 %	0 %	20 %	40 %	14601070
400	NC_000854	CAGGC	2	10	604746	604755	20 %	0 %	40 %	40 %	14601073
401	NC_000854	CCCTG	2	10	605144	605153	0 %	20 %	20 %	60 %	118431260
402	NC_000854	TACTC	2	10	605503	605512	20 %	40 %	0 %	40 %	118431260
403	NC_000854	GGGTA	2	10	606682	606691	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
404	NC_000854	TCCAG	2	10	607367	607376	20 %	20 %	20 %	40 %	118431262
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410	NC_000854	TGCTA	2	10	616735	616744	20 %	40 %	20 %	20 %	14601089
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444	NC_000854	AGGCT	2	10	659172	659181	20 %	20 %	40 %	20 %	118431301
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484	NC_000854	CCCTC	2	10	723456	723465	0 %	20 %	0 %	80 %	14601219
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