MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Aeropyrum pernix K1

Total Repeats: 1056

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_000854	CCTCT	2	10	749234	749243	0 %	40 %	0 %	60 %	118431358
502	NC_000854	TGGAG	2	10	751059	751068	20 %	20 %	60 %	0 %	118431360
503	NC_000854	GGTAC	2	10	751898	751907	20 %	20 %	40 %	20 %	14601246
504	NC_000854	GAGGG	2	10	754023	754032	20 %	0 %	80 %	0 %	118431361
505	NC_000854	CCGGG	2	10	756010	756019	0 %	0 %	60 %	40 %	118431362
506	NC_000854	GTGTG	2	10	757323	757332	0 %	40 %	60 %	0 %	118431363
507	NC_000854	TAGAC	2	10	758291	758300	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
508	NC_000854	TTTGC	2	10	758538	758547	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
509	NC_000854	TTGTT	2	10	761487	761496	0 %	80 %	20 %	0 %	118431369
510	NC_000854	TTCTC	2	10	762683	762692	0 %	60 %	0 %	40 %	118431369
511	NC_000854	TGGGC	2	10	764367	764376	0 %	20 %	60 %	20 %	118431371
512	NC_000854	CGAGG	2	10	765723	765732	20 %	0 %	60 %	20 %	118431371
513	NC_000854	TGGAG	2	10	767682	767691	20 %	20 %	60 %	0 %	118431371
514	NC_000854	TCCTC	2	10	781704	781713	0 %	40 %	0 %	60 %	14601276
515	NC_000854	ATCAC	2	10	783772	783781	40 %	20 %	0 %	40 %	118431378
516	NC_000854	TAGGC	2	10	784798	784807	20 %	20 %	40 %	20 %	118431380
517	NC_000854	CCTCC	2	10	789814	789823	0 %	20 %	0 %	80 %	118431383
518	NC_000854	TAGGC	2	10	790416	790425	20 %	20 %	40 %	20 %	118431383
519	NC_000854	GGCCC	2	10	791243	791252	0 %	0 %	40 %	60 %	118431383
520	NC_000854	CCTCC	2	10	791932	791941	0 %	20 %	0 %	80 %	118431384
521	NC_000854	CTGGC	2	10	792139	792148	0 %	20 %	40 %	40 %	118431384
522	NC_000854	AGTGG	2	10	793437	793446	20 %	20 %	60 %	0 %	14601287
523	NC_000854	GAGGG	2	10	794442	794451	20 %	0 %	80 %	0 %	14601287
524	NC_000854	AGGGG	2	10	794602	794611	20 %	0 %	80 %	0 %	14601287
525	NC_000854	TGGCG	2	10	795514	795523	0 %	20 %	60 %	20 %	14601291
526	NC_000854	CTATG	2	10	798356	798365	20 %	40 %	20 %	20 %	14601293
527	NC_000854	GGCCT	2	10	799961	799970	0 %	20 %	40 %	40 %	14601295
528	NC_000854	GCCTA	2	10	800551	800560	20 %	20 %	20 %	40 %	14601296
529	NC_000854	CTCCC	2	10	802626	802635	0 %	20 %	0 %	80 %	118431388
530	NC_000854	GGGGC	2	10	802678	802687	0 %	0 %	80 %	20 %	118431388
531	NC_000854	CTAGC	2	10	804486	804495	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
532	NC_000854	GCCCT	2	10	805697	805706	0 %	20 %	20 %	60 %	118431391
533	NC_000854	ACGGG	2	10	807748	807757	20 %	0 %	60 %	20 %	118431392
534	NC_000854	GTAGC	2	10	808248	808257	20 %	20 %	40 %	20 %	14601305
535	NC_000854	GATAA	2	10	809216	809225	60 %	20 %	20 %	0 %	14601305
536	NC_000854	GTGCC	2	10	809394	809403	0 %	20 %	40 %	40 %	14601306
537	NC_000854	TGCTG	2	10	810931	810940	0 %	40 %	40 %	20 %	118431394
538	NC_000854	AGCAG	2	10	811974	811983	40 %	0 %	40 %	20 %	14601310
539	NC_000854	GAGGC	2	10	812422	812431	20 %	0 %	60 %	20 %	14601310
540	NC_000854	CAACA	2	10	813048	813057	60 %	0 %	0 %	40 %	14601310
541	NC_000854	GGAGA	2	10	814010	814019	40 %	0 %	60 %	0 %	118431396
542	NC_000854	GGCTG	2	10	818901	818910	0 %	20 %	60 %	20 %	118431398
543	NC_000854	AGCCC	2	10	819523	819532	20 %	0 %	20 %	60 %	118431398
544	NC_000854	CCCTA	2	10	822544	822553	20 %	20 %	0 %	60 %	14601316
545	NC_000854	GTATA	2	10	823229	823238	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
546	NC_000854	TCTGC	2	10	824800	824809	0 %	40 %	20 %	40 %	118431401
547	NC_000854	TACCC	2	10	825212	825221	20 %	20 %	0 %	60 %	118431401
548	NC_000854	TCCTC	2	10	826594	826603	0 %	40 %	0 %	60 %	118431402
549	NC_000854	ATCCA	2	10	827818	827827	40 %	20 %	0 %	40 %	118431403
550	NC_000854	GCCCG	2	10	830458	830467	0 %	0 %	40 %	60 %	14601325
551	NC_000854	CACAG	2	10	831431	831440	40 %	0 %	20 %	40 %	14601326
552	NC_000854	CTGCA	2	10	834354	834363	20 %	20 %	20 %	40 %	118431405
553	NC_000854	CCTCT	2	10	835906	835915	0 %	40 %	0 %	60 %	118431406
554	NC_000854	TGGCT	2	10	836883	836892	0 %	40 %	40 %	20 %	118431406
555	NC_000854	GGCGT	2	10	837337	837346	0 %	20 %	60 %	20 %	118431407
556	NC_000854	TTGTG	2	10	838393	838402	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
557	NC_000854	GATAA	2	10	838995	839004	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
558	NC_000854	TCCTC	2	10	840324	840333	0 %	40 %	0 %	60 %	118431410
559	NC_000854	CCACC	2	10	845573	845582	20 %	0 %	0 %	80 %	118431412
560	NC_000854	AGGGT	2	10	845814	845823	20 %	20 %	60 %	0 %	118431412
561	NC_000854	GCTGG	2	10	846065	846074	0 %	20 %	60 %	20 %	118431412
562	NC_000854	CACAG	2	10	846173	846182	40 %	0 %	20 %	40 %	118431412
563	NC_000854	GAGGG	2	10	847465	847474	20 %	0 %	80 %	0 %	14602204
564	NC_000854	GCCCT	2	10	847610	847619	0 %	20 %	20 %	60 %	14602204
565	NC_000854	TACCC	2	10	847663	847672	20 %	20 %	0 %	60 %	14602204
566	NC_000854	TGTGG	2	10	848167	848176	0 %	40 %	60 %	0 %	118431413
567	NC_000854	CTGTT	2	10	848286	848295	0 %	60 %	20 %	20 %	118431413
568	NC_000854	CAGGC	2	10	850251	850260	20 %	0 %	40 %	40 %	118431415
569	NC_000854	CCAGC	2	10	851474	851483	20 %	0 %	20 %	60 %	118431415
570	NC_000854	CTCCG	2	10	853263	853272	0 %	20 %	20 %	60 %	118431415
571	NC_000854	GGCGG	2	10	854491	854500	0 %	0 %	80 %	20 %	14601345
572	NC_000854	CCGCC	2	10	856846	856855	0 %	0 %	20 %	80 %	118431417
573	NC_000854	ACCGC	2	10	858479	858488	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
574	NC_000854	GGGGT	2	10	859625	859634	0 %	20 %	80 %	0 %	118431420
575	NC_000854	GGCGT	2	10	861966	861975	0 %	20 %	60 %	20 %	118431420
576	NC_000854	CAATA	2	10	862494	862503	60 %	20 %	0 %	20 %	118431420
577	NC_000854	CTATC	2	10	862623	862632	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
578	NC_000854	ATTAT	2	10	863423	863432	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
579	NC_000854	GGACC	2	10	866628	866637	20 %	0 %	40 %	40 %	118431425
580	NC_000854	TTAGA	2	10	869414	869423	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
581	NC_000854	GCCCC	2	10	872824	872833	0 %	0 %	20 %	80 %	118431429
582	NC_000854	ACTCT	2	10	874013	874022	20 %	40 %	0 %	40 %	14601368
583	NC_000854	AGCCC	2	10	877698	877707	20 %	0 %	20 %	60 %	118431431
584	NC_000854	CCCGC	2	10	877986	877995	0 %	0 %	20 %	80 %	118431431
585	NC_000854	AGGAT	2	10	878707	878716	40 %	20 %	40 %	0 %	118431432
586	NC_000854	AAGTT	2	10	881748	881757	40 %	40 %	20 %	0 %	14601373
587	NC_000854	AGCCA	2	10	887195	887204	40 %	0 %	20 %	40 %	118431437
588	NC_000854	GCCGG	2	10	890582	890591	0 %	0 %	60 %	40 %	14601383
589	NC_000854	GGCGA	2	10	898339	898348	20 %	0 %	60 %	20 %	118431445
590	NC_000854	GCTAG	2	10	901162	901171	20 %	20 %	40 %	20 %	118431448
591	NC_000854	GGCTA	2	10	901410	901419	20 %	20 %	40 %	20 %	118431448
592	NC_000854	TGGCT	2	10	902173	902182	0 %	40 %	40 %	20 %	118431448
593	NC_000854	ACCTC	2	10	904635	904644	20 %	20 %	0 %	60 %	118431450
594	NC_000854	CCCAA	2	10	908333	908342	40 %	0 %	0 %	60 %	14601399
595	NC_000854	CAGCC	2	10	908688	908697	20 %	0 %	20 %	60 %	118431453
596	NC_000854	ACTCC	2	10	909969	909978	20 %	20 %	0 %	60 %	14601403
597	NC_000854	CTGCT	2	10	910628	910637	0 %	40 %	20 %	40 %	14601403
598	NC_000854	CGGCG	2	10	910912	910921	0 %	0 %	60 %	40 %	14601403
599	NC_000854	TTGGG	2	10	911280	911289	0 %	40 %	60 %	0 %	14601403
600	NC_000854	CGCCT	2	10	912833	912842	0 %	20 %	20 %	60 %	118431455
601	NC_000854	GTATG	2	10	913061	913070	20 %	40 %	40 %	0 %	118431456
602	NC_000854	GCCGC	2	10	913675	913684	0 %	0 %	40 %	60 %	118431456
603	NC_000854	CGCCT	2	10	913955	913964	0 %	20 %	20 %	60 %	118431456
604	NC_000854	CTCTC	2	10	914658	914667	0 %	40 %	0 %	60 %	118431458
605	NC_000854	CTCCC	2	10	920709	920718	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
606	NC_000854	GCATG	2	10	920896	920905	20 %	20 %	40 %	20 %	118431461
607	NC_000854	GCCTT	2	10	922651	922660	0 %	40 %	20 %	40 %	14601417
608	NC_000854	TCTAG	2	10	922935	922944	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
609	NC_000854	TCGCT	2	10	928655	928664	0 %	40 %	20 %	40 %	118431465
610	NC_000854	GCATT	2	10	929383	929392	20 %	40 %	20 %	20 %	14601422
611	NC_000854	CATAG	2	10	929393	929402	40 %	20 %	20 %	20 %	14601422
612	NC_000854	CTAGC	2	10	929959	929968	20 %	20 %	20 %	40 %	14601422
613	NC_000854	ACGGG	2	10	932273	932282	20 %	0 %	60 %	20 %	14601424
614	NC_000854	ATACG	2	10	934689	934698	40 %	20 %	20 %	20 %	118431467
615	NC_000854	AGTAT	2	10	935399	935408	40 %	40 %	20 %	0 %	14601428
616	NC_000854	TCCTC	2	10	935531	935540	0 %	40 %	0 %	60 %	14601428
617	NC_000854	TCCTC	2	10	936558	936567	0 %	40 %	0 %	60 %	118431469
618	NC_000854	AAGCC	2	10	937566	937575	40 %	0 %	20 %	40 %	118431469
619	NC_000854	TCGAA	2	10	937728	937737	40 %	20 %	20 %	20 %	118431469
620	NC_000854	GCTGG	2	10	941610	941619	0 %	20 %	60 %	20 %	118431473
621	NC_000854	GCCGG	2	10	941981	941990	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
622	NC_000854	CGGGG	2	10	943374	943383	0 %	0 %	80 %	20 %	118431474
623	NC_000854	TCCTC	2	10	944748	944757	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
624	NC_000854	GGAGC	2	10	945254	945263	20 %	0 %	60 %	20 %	118431476
625	NC_000854	AGTGA	2	10	949179	949188	40 %	20 %	40 %	0 %	14601442
626	NC_000854	ATTGA	2	10	952334	952343	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
627	NC_000854	GGATG	2	10	953289	953298	20 %	20 %	60 %	0 %	118431483
628	NC_000854	AGGCA	2	10	954100	954109	40 %	0 %	40 %	20 %	118431484
629	NC_000854	CGAGG	2	10	955152	955161	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
630	NC_000854	GAGGG	2	10	955382	955391	20 %	0 %	80 %	0 %	118431485
631	NC_000854	CAGCC	2	10	956207	956216	20 %	0 %	20 %	60 %	118431486
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