MICAS: Microsatellite Analysis Server

Penta-nucleotide Repeats of Aeropyrum pernix K1

Total Repeats: 1056

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_000854	TCGCC	2	10	1572587	1572596	0 %	20 %	20 %	60 %	118431887
1002	NC_000854	CCGGC	2	10	1573500	1573509	0 %	0 %	40 %	60 %	118431889
1003	NC_000854	TTGCC	2	10	1573704	1573713	0 %	40 %	20 %	40 %	118431889
1004	NC_000854	CCACT	2	10	1573923	1573932	20 %	20 %	0 %	60 %	118431889
1005	NC_000854	GCCCC	2	10	1576738	1576747	0 %	0 %	20 %	80 %	118431892
1006	NC_000854	TGGGG	2	10	1577720	1577729	0 %	20 %	80 %	0 %	118431893
1007	NC_000854	GCCTA	2	10	1578330	1578339	20 %	20 %	20 %	40 %	118431894
1008	NC_000854	TAGGA	2	10	1586711	1586720	40 %	20 %	40 %	0 %	118431903
1009	NC_000854	CTGGC	2	10	1588411	1588420	0 %	20 %	40 %	40 %	118431903
1010	NC_000854	TCCTC	2	10	1591552	1591561	0 %	40 %	0 %	60 %	14602108
1011	NC_000854	CACAC	2	10	1592720	1592729	40 %	0 %	0 %	60 %	118431906
1012	NC_000854	CTCCC	2	10	1596900	1596909	0 %	20 %	0 %	80 %	14602114
1013	NC_000854	ACCCT	2	10	1597897	1597906	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
1014	NC_000854	CCAGA	2	10	1601054	1601063	40 %	0 %	20 %	40 %	118431910
1015	NC_000854	CATGG	2	10	1602360	1602369	20 %	20 %	40 %	20 %	118431912
1016	NC_000854	AGTGC	2	10	1604878	1604887	20 %	20 %	40 %	20 %	118431914
1017	NC_000854	GAGGG	2	10	1605319	1605328	20 %	0 %	80 %	0 %	118431914
1018	NC_000854	GGAGG	2	10	1606482	1606491	20 %	0 %	80 %	0 %	118431914
1019	NC_000854	ATCGC	2	10	1607259	1607268	20 %	20 %	20 %	40 %	118431915
1020	NC_000854	AGGCT	2	10	1607281	1607290	20 %	20 %	40 %	20 %	118431915
1021	NC_000854	AGGCC	2	10	1608120	1608129	20 %	0 %	40 %	40 %	118431915
1022	NC_000854	CAGAG	2	10	1608683	1608692	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1023	NC_000854	CCTAC	2	10	1611165	1611174	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
1024	NC_000854	CCCGA	2	10	1611534	1611543	20 %	0 %	20 %	60 %	118431917
1025	NC_000854	ACTAA	2	10	1612940	1612949	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1026	NC_000854	GAAAA	2	10	1613192	1613201	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_000854	CCCAG	2	10	1618636	1618645	20 %	0 %	20 %	60 %	118431921
1028	NC_000854	GTCCT	2	10	1620096	1620105	0 %	40 %	20 %	40 %	14602137
1029	NC_000854	TGCAG	2	10	1620740	1620749	20 %	20 %	40 %	20 %	14602138
1030	NC_000854	CGGCG	2	10	1621188	1621197	0 %	0 %	60 %	40 %	14602139
1031	NC_000854	GAGAG	2	10	1621954	1621963	40 %	0 %	60 %	0 %	14602139
1032	NC_000854	CCTCC	2	10	1624041	1624050	0 %	20 %	0 %	80 %	118431922
1033	NC_000854	TCGTC	2	10	1626139	1626148	0 %	40 %	20 %	40 %	118431923
1034	NC_000854	GCTGG	2	10	1627632	1627641	0 %	20 %	60 %	20 %	118431923
1035	NC_000854	AGGCG	2	10	1633393	1633402	20 %	0 %	60 %	20 %	118431927
1036	NC_000854	GTAAG	2	10	1634394	1634403	40 %	20 %	40 %	0 %	118431927
1037	NC_000854	ATCCT	2	10	1636709	1636718	20 %	40 %	0 %	40 %	14602153
1038	NC_000854	ACGCC	2	10	1637025	1637034	20 %	0 %	20 %	60 %	14602153
1039	NC_000854	AGCAC	2	10	1637263	1637272	40 %	0 %	20 %	40 %	14602153
1040	NC_000854	TCACC	2	10	1639286	1639295	20 %	20 %	0 %	60 %	118431929
1041	NC_000854	CTCAT	2	10	1639995	1640004	20 %	40 %	0 %	40 %	118431929
1042	NC_000854	GCCCG	2	10	1640972	1640981	0 %	0 %	40 %	60 %	14602157
1043	NC_000854	TGGAG	2	10	1641891	1641900	20 %	20 %	60 %	0 %	14602158
1044	NC_000854	GCCGT	2	10	1643016	1643025	0 %	20 %	40 %	40 %	118431930
1045	NC_000854	CCTCC	2	10	1650158	1650167	0 %	20 %	0 %	80 %	118431933
1046	NC_000854	TCCTC	2	10	1652315	1652324	0 %	40 %	0 %	60 %	14602168
1047	NC_000854	GCATG	2	10	1655624	1655633	20 %	20 %	40 %	20 %	14602170
1048	NC_000854	GCTCG	2	10	1656322	1656331	0 %	20 %	40 %	40 %	118431938
1049	NC_000854	GGGGA	2	10	1660274	1660283	20 %	0 %	80 %	0 %	14602172
1050	NC_000854	GGCAC	2	10	1660665	1660674	20 %	0 %	40 %	40 %	14602175
1051	NC_000854	GCCTC	2	10	1663868	1663877	0 %	20 %	20 %	60 %	118431941
1052	NC_000854	GACCC	2	10	1665333	1665342	20 %	0 %	20 %	60 %	118431942
1053	NC_000854	CCAAG	2	10	1665499	1665508	40 %	0 %	20 %	40 %	118431942
1054	NC_000854	TATCG	2	10	1667639	1667648	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1055	NC_000854	TCAAT	2	10	1669476	1669485	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1056	NC_000854	AAAGT	2	10	1669604	1669613	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding

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