MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Aeropyrum pernix K1

Total Repeats: 26686

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000854	ATA	3	9	3	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_000854	TTA	2	6	229	234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14600380
3	NC_000854	CCA	2	6	291	296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	14600380
4	NC_000854	AGG	2	6	347	352	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14600380
5	NC_000854	TGC	2	6	729	734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14600380
6	NC_000854	CAG	2	6	909	914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14600380
7	NC_000854	TAC	2	6	992	997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14600381
8	NC_000854	TTA	2	6	1081	1086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14600381
9	NC_000854	CAT	2	6	1114	1119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14600381
10	NC_000854	TCA	2	6	1252	1257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14600381
11	NC_000854	CTG	2	6	1264	1269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14600381
12	NC_000854	CCA	2	6	1284	1289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	14600382
13	NC_000854	TTA	2	6	1292	1297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14600382
14	NC_000854	CTA	2	6	1304	1309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14600382
15	NC_000854	CAA	2	6	1349	1354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	14600382
16	NC_000854	CTC	2	6	1385	1390	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600382
17	NC_000854	ATG	2	6	1429	1434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14600382
18	NC_000854	ACT	2	6	1498	1503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14600382
19	NC_000854	TAA	2	6	1613	1618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14600382
20	NC_000854	TTC	2	6	1683	1688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14600382
21	NC_000854	CAA	2	6	1697	1702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	14600382
22	NC_000854	TAT	2	6	1746	1751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14600382
23	NC_000854	AGT	2	6	1770	1775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14600382
24	NC_000854	CCT	2	6	1784	1789	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600382
25	NC_000854	ATA	2	6	1877	1882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14600382
26	NC_000854	AGG	2	6	2002	2007	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14600382
27	NC_000854	GAG	3	9	2016	2024	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14600382
28	NC_000854	TGG	2	6	2045	2050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	14600382
29	NC_000854	AGG	2	6	2095	2100	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14600382
30	NC_000854	TAC	2	6	2174	2179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14600382
31	NC_000854	CTA	2	6	2306	2311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118430836
32	NC_000854	TAT	2	6	2346	2351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118430836
33	NC_000854	TCA	2	6	2379	2384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118430836
34	NC_000854	GAG	2	6	2593	2598	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118430836
35	NC_000854	TGA	2	6	2725	2730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118430836
36	NC_000854	TCC	2	6	2763	2768	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430836
37	NC_000854	AGT	2	6	2819	2824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118430836
38	NC_000854	TAT	2	6	2848	2853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_000854	TAT	2	6	2855	2860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_000854	AGA	2	6	2928	2933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_000854	ATA	2	6	2934	2939	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_000854	TTA	2	6	2965	2970	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_000854	ATA	2	6	3020	3025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_000854	GGT	2	6	3125	3130	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_000854	ATA	2	6	3164	3169	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_000854	CCA	2	6	3170	3175	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
47	NC_000854	TAT	2	6	3224	3229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_000854	ACA	2	6	3284	3289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_000854	TAA	2	6	3308	3313	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_000854	AAT	2	6	3319	3324	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_000854	GAT	2	6	3354	3359	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_000854	TAT	2	6	3415	3420	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_000854	CCT	2	6	3426	3431	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_000854	CAT	2	6	3544	3549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_000854	GAA	2	6	3576	3581	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_000854	ATT	2	6	3611	3616	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_000854	CAA	2	6	3752	3757	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_000854	ATA	2	6	3793	3798	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_000854	AGT	2	6	3848	3853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_000854	CAG	2	6	3866	3871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_000854	TAA	2	6	3874	3879	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_000854	GTG	2	6	3889	3894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_000854	GTT	2	6	3971	3976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118430837
64	NC_000854	GTT	2	6	3986	3991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118430837
65	NC_000854	GAA	2	6	4028	4033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118430837
66	NC_000854	AGA	2	6	4086	4091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118430837
67	NC_000854	TGA	2	6	4195	4200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118430837
68	NC_000854	AAG	2	6	4203	4208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118430837
69	NC_000854	GAA	2	6	4216	4221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118430837
70	NC_000854	AAT	2	6	4234	4239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118430837
71	NC_000854	ATG	2	6	4374	4379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118430837
72	NC_000854	CTA	2	6	4390	4395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118430837
73	NC_000854	TGG	2	6	4431	4436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118430837
74	NC_000854	TCT	2	6	4438	4443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118430837
75	NC_000854	TGT	2	6	4546	4551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118430837
76	NC_000854	TGA	2	6	4657	4662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118430837
77	NC_000854	CTC	2	6	4676	4681	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430837
78	NC_000854	GGA	2	6	4744	4749	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118430837
79	NC_000854	GGT	2	6	4888	4893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118430837
80	NC_000854	GGA	2	6	4963	4968	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118430837
81	NC_000854	TCG	2	6	4992	4997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118430837
82	NC_000854	ACG	2	6	4998	5003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118430837
83	NC_000854	CCT	2	6	5081	5086	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430837
84	NC_000854	CGG	2	6	5280	5285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118430837
85	NC_000854	GCC	2	6	5309	5314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118430837
86	NC_000854	ACA	2	6	5381	5386	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118430837
87	NC_000854	CCG	2	6	5470	5475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
88	NC_000854	ACA	2	6	5639	5644	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_000854	GCA	2	6	5648	5653	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_000854	CAG	2	6	5762	5767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_000854	GTC	2	6	5864	5869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118430838
92	NC_000854	TAT	2	6	6010	6015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118430838
93	NC_000854	TGT	2	6	6110	6115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_000854	GTT	2	6	6131	6136	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_000854	GTG	2	6	6148	6153	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_000854	GGT	2	6	6289	6294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118430839
97	NC_000854	TGG	2	6	6359	6364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118430839
98	NC_000854	CTG	2	6	6464	6469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118430839
99	NC_000854	CCT	2	6	6546	6551	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430839
100	NC_000854	CAA	2	6	6689	6694	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118430839
101	NC_000854	CTG	2	6	6752	6757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118430839
102	NC_000854	CTG	2	6	6785	6790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118430839
103	NC_000854	TAG	2	6	6822	6827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118430839
104	NC_000854	AGG	2	6	6850	6855	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118430839
105	NC_000854	GCT	2	6	6966	6971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118430839
106	NC_000854	GGC	2	6	6984	6989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118430839
107	NC_000854	CTA	2	6	7031	7036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118430839
108	NC_000854	CTA	2	6	7097	7102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118430839
109	NC_000854	ATG	2	6	7123	7128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118430839
110	NC_000854	ACA	2	6	7135	7140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118430839
111	NC_000854	CGT	2	6	7164	7169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118430839
112	NC_000854	ACG	2	6	7315	7320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118430839
113	NC_000854	ACT	2	6	7402	7407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118430839
114	NC_000854	TAC	2	6	7428	7433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118430839
115	NC_000854	CAG	2	6	7459	7464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118430839
116	NC_000854	AGC	2	6	7534	7539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118430839
117	NC_000854	ATG	2	6	7540	7545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118430839
118	NC_000854	TCC	2	6	7551	7556	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430839
119	NC_000854	TTA	2	6	7652	7657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118430839
120	NC_000854	CCG	2	6	7756	7761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118430839
121	NC_000854	CTT	2	6	7831	7836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_000854	CAT	2	6	7889	7894	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_000854	TAT	2	6	7915	7920	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_000854	GGA	2	6	8187	8192	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118430840
125	NC_000854	GTT	2	6	8208	8213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118430840
126	NC_000854	GTT	2	6	8224	8229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118430840
127	NC_000854	TCC	2	6	8360	8365	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430840
128	NC_000854	GTT	2	6	8392	8397	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118430840
129	NC_000854	TGG	2	6	8403	8408	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118430840
130	NC_000854	GCG	2	6	8419	8424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118430840
131	NC_000854	GCT	2	6	8590	8595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118430840
132	NC_000854	TAC	2	6	8626	8631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118430840
133	NC_000854	AGG	2	6	8653	8658	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118430840
134	NC_000854	TGA	2	6	8690	8695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118430840
135	NC_000854	GTG	2	6	8696	8701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118430840
136	NC_000854	GTT	2	6	8776	8781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118430840
137	NC_000854	GAA	2	6	8783	8788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118430840
138	NC_000854	GTA	2	6	8902	8907	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_000854	GCG	2	6	9040	9045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	14600388
140	NC_000854	ATT	2	6	9088	9093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14600388
141	NC_000854	GAC	2	6	9109	9114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14600388
142	NC_000854	GGA	2	6	9119	9124	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14600388
143	NC_000854	GCT	2	6	9256	9261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14600388
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149	NC_000854	CTA	2	6	9737	9742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14600388
150	NC_000854	TCG	2	6	9743	9748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14600388
151	NC_000854	TTA	2	6	9938	9943	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_000854	TGG	2	6	9980	9985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
153	NC_000854	ATG	2	6	10019	10024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118430841
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162	NC_000854	GTG	2	6	10952	10957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118430841
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174	NC_000854	CTC	2	6	11781	11786	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
175	NC_000854	CGG	2	6	11915	11920	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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177	NC_000854	AGG	2	6	12082	12087	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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262	NC_000854	GTC	2	6	18279	18284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14600396
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275	NC_000854	CGC	2	6	19258	19263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	14600397
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294	NC_000854	ATC	2	6	20367	20372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118430847
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