MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Aeropyrum pernix K1

Total Repeats: 26686

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_000854	ATG	2	6	360380	360385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118431090
5502	NC_000854	CGG	2	6	360388	360393	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118431090
5503	NC_000854	TAG	2	6	360399	360404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118431090
5504	NC_000854	CGA	2	6	360424	360429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118431090
5505	NC_000854	AGG	2	6	360482	360487	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118431090
5506	NC_000854	AGG	2	6	360536	360541	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118431090
5507	NC_000854	CTC	2	6	360605	360610	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431090
5508	NC_000854	AGG	2	6	360620	360625	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118431090
5509	NC_000854	ATA	2	6	360740	360745	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118431090
5510	NC_000854	CCT	2	6	360862	360867	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431091
5511	NC_000854	CCT	2	6	360905	360910	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431091
5512	NC_000854	GCT	2	6	360956	360961	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118431091
5513	NC_000854	CGA	2	6	361054	361059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118431091
5514	NC_000854	CGC	2	6	361100	361105	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118431091
5515	NC_000854	TTA	2	6	361225	361230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118431091
5516	NC_000854	TAG	2	6	361305	361310	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118431091
5517	NC_000854	AGG	2	6	361326	361331	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118431091
5518	NC_000854	CTT	2	6	361343	361348	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118431091
5519	NC_000854	TAG	2	6	361417	361422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5520	NC_000854	GAT	2	6	361551	361556	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14600779
5521	NC_000854	ATA	2	6	361648	361653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14600779
5522	NC_000854	AGA	2	6	361665	361670	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14600779
5523	NC_000854	AGG	2	6	361690	361695	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14600779
5524	NC_000854	GTA	2	6	361726	361731	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14600779
5525	NC_000854	GAG	2	6	361817	361822	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14600780
5526	NC_000854	AGG	2	6	361842	361847	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14600780
5527	NC_000854	AGG	2	6	361854	361859	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14600780
5528	NC_000854	AGG	2	6	361911	361916	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14600780
5529	NC_000854	GAG	2	6	361919	361924	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14600780
5530	NC_000854	AAG	2	6	361941	361946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14600780
5531	NC_000854	CTC	2	6	362020	362025	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5532	NC_000854	TGG	2	6	362069	362074	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5533	NC_000854	GGC	2	6	362120	362125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118431092
5534	NC_000854	GAG	2	6	362130	362135	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118431092
5535	NC_000854	GGC	2	6	362390	362395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118431092
5536	NC_000854	GCA	2	6	362416	362421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118431092
5537	NC_000854	AGG	2	6	362533	362538	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118431092
5538	NC_000854	GCC	2	6	362583	362588	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118431092
5539	NC_000854	AGG	2	6	362592	362597	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118431092
5540	NC_000854	GAG	2	6	362604	362609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118431092
5541	NC_000854	TTA	2	6	362659	362664	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118431092
5542	NC_000854	CCT	2	6	362686	362691	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431092
5543	NC_000854	TAG	2	6	362701	362706	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118431092
5544	NC_000854	CGG	2	6	362711	362716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118431092
5545	NC_000854	GGA	2	6	362847	362852	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118431092
5546	NC_000854	AGG	2	6	362862	362867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118431092
5547	NC_000854	AGG	2	6	362971	362976	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118431092
5548	NC_000854	AGC	2	6	363057	363062	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118431092
5549	NC_000854	GAG	2	6	363063	363068	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118431092
5550	NC_000854	CTC	2	6	363174	363179	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431092
5551	NC_000854	CAG	2	6	363221	363226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5552	NC_000854	CAG	3	9	363231	363239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5553	NC_000854	TCT	2	6	363278	363283	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5554	NC_000854	CTT	2	6	363310	363315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14600782
5555	NC_000854	GGC	2	6	363326	363331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	14600782
5556	NC_000854	GGA	2	6	363351	363356	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14600782
5557	NC_000854	GCC	2	6	363410	363415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	14600782
5558	NC_000854	CAG	2	6	363424	363429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14600782
5559	NC_000854	CAG	2	6	363463	363468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14600782
5560	NC_000854	CAG	2	6	363481	363486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14600782
5561	NC_000854	CTT	2	6	363631	363636	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14600782
5562	NC_000854	CGA	2	6	363759	363764	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14600782
5563	NC_000854	TCC	2	6	363817	363822	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600782
5564	NC_000854	GGT	2	6	363899	363904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	14600782
5565	NC_000854	GCC	2	6	363913	363918	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	14600782
5566	NC_000854	GAG	2	6	363925	363930	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14600782
5567	NC_000854	TCC	2	6	363935	363940	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600782
5568	NC_000854	CGA	2	6	364164	364169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14600782
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5570	NC_000854	CGT	2	6	364251	364256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14600782
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5572	NC_000854	ACC	2	6	364427	364432	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	14600782
5573	NC_000854	CTC	2	6	364502	364507	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431093
5574	NC_000854	AGC	2	6	364608	364613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118431093
5575	NC_000854	TCG	2	6	364647	364652	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118431093
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5579	NC_000854	GGT	2	6	364795	364800	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118431093
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5581	NC_000854	CTG	2	6	364929	364934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118431093
5582	NC_000854	GGT	2	6	364957	364962	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118431093
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5585	NC_000854	CCT	2	6	365088	365093	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431093
5586	NC_000854	CAC	2	6	365096	365101	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118431093
5587	NC_000854	CCA	2	6	365116	365121	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118431093
5588	NC_000854	CGC	2	6	365194	365199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118431093
5589	NC_000854	ACC	2	6	365267	365272	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118431093
5590	NC_000854	ACC	2	6	365394	365399	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5591	NC_000854	CCT	2	6	365434	365439	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5592	NC_000854	ATA	2	6	365604	365609	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118431094
5593	NC_000854	TGG	2	6	365722	365727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118431094
5594	NC_000854	TCC	2	6	365857	365862	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431094
5595	NC_000854	GTG	2	6	365878	365883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118431094
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5598	NC_000854	TGA	2	6	366067	366072	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118431094
5599	NC_000854	CCT	2	6	366089	366094	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431094
5600	NC_000854	CAT	2	6	366110	366115	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118431094
5601	NC_000854	GCC	2	6	366149	366154	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118431094
5602	NC_000854	GAG	2	6	366156	366161	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118431094
5603	NC_000854	GGA	2	6	366170	366175	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118431094
5604	NC_000854	GCG	2	6	366278	366283	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5605	NC_000854	CGC	2	6	366392	366397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118431095
5606	NC_000854	CGC	2	6	366415	366420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118431095
5607	NC_000854	GCG	2	6	366483	366488	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118431095
5608	NC_000854	CGG	2	6	366567	366572	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118431095
5609	NC_000854	CCT	2	6	366577	366582	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431095
5610	NC_000854	GCT	2	6	366673	366678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118431095
5611	NC_000854	CCT	2	6	366736	366741	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431095
5612	NC_000854	GGA	2	6	366781	366786	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118431095
5613	NC_000854	CCT	3	9	366823	366831	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431095
5614	NC_000854	GTG	2	6	366872	366877	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118431095
5615	NC_000854	TCC	2	6	366897	366902	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431095
5616	NC_000854	TAC	2	6	366924	366929	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118431095
5617	NC_000854	AGG	2	6	366964	366969	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118431095
5618	NC_000854	GCC	2	6	366983	366988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118431095
5619	NC_000854	GGC	2	6	366995	367000	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118431095
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5621	NC_000854	GTC	2	6	367073	367078	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118431095
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