MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Aeropyrum pernix K1

Total Repeats: 26686

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_000854	AGA	2	6	33389	33394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118430856
502	NC_000854	GTT	2	6	33572	33577	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118430856
503	NC_000854	ACA	2	6	33578	33583	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118430856
504	NC_000854	CCA	2	6	33594	33599	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
505	NC_000854	ATA	2	6	33624	33629	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_000854	TAA	2	6	33640	33645	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
507	NC_000854	GCT	2	6	33819	33824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14600412
508	NC_000854	GCA	2	6	33903	33908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14600412
509	NC_000854	AGA	2	6	33936	33941	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14600412
510	NC_000854	CAT	2	6	33943	33948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14600412
511	NC_000854	CGA	2	6	34027	34032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14600412
512	NC_000854	ACC	2	6	34073	34078	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	14600412
513	NC_000854	GCA	2	6	34095	34100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14600412
514	NC_000854	CCA	2	6	34150	34155	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	14600412
515	NC_000854	AGG	2	6	34245	34250	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14600412
516	NC_000854	GAA	2	6	34283	34288	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14600412
517	NC_000854	ATG	2	6	34299	34304	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14600412
518	NC_000854	TGA	2	6	34375	34380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14600412
519	NC_000854	AGA	2	6	34390	34395	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14600412
520	NC_000854	ACT	2	6	34436	34441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14600412
521	NC_000854	AAG	2	6	34496	34501	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14600412
522	NC_000854	GCG	2	6	34504	34509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	14600412
523	NC_000854	CTA	2	6	34558	34563	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14600412
524	NC_000854	GGA	2	6	34564	34569	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14600412
525	NC_000854	CTT	2	6	34595	34600	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14600412
526	NC_000854	AGC	2	6	34601	34606	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14600412
527	NC_000854	AGG	2	6	34629	34634	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14600412
528	NC_000854	CAA	2	6	34819	34824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	14600412
529	NC_000854	CCT	2	6	34834	34839	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600412
530	NC_000854	GCG	2	6	34887	34892	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	14600412
531	NC_000854	AAC	2	6	34916	34921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	14600412
532	NC_000854	AGC	2	6	34944	34949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14600412
533	NC_000854	AGG	2	6	34978	34983	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
534	NC_000854	TCC	2	6	35046	35051	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430857
535	NC_000854	CCT	2	6	35082	35087	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430857
536	NC_000854	ACA	2	6	35246	35251	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118430857
537	NC_000854	CTA	2	6	35256	35261	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118430857
538	NC_000854	CCT	2	6	35277	35282	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430857
539	NC_000854	AGG	2	6	35360	35365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118430857
540	NC_000854	AGA	2	6	35441	35446	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118430857
541	NC_000854	CCT	2	6	35459	35464	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430857
542	NC_000854	CAG	2	6	35481	35486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118430857
543	NC_000854	GAA	2	6	35542	35547	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118430857
544	NC_000854	TCG	2	6	35594	35599	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118430857
545	NC_000854	GTT	2	6	35921	35926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118430858
546	NC_000854	GCT	2	6	35968	35973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118430858
547	NC_000854	ATT	2	6	36025	36030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118430858
548	NC_000854	AGG	2	6	36114	36119	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118430858
549	NC_000854	GTG	2	6	36260	36265	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118430858
550	NC_000854	GAC	2	6	36343	36348	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118430858
551	NC_000854	TCT	2	6	36375	36380	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118430858
552	NC_000854	GCG	2	6	36445	36450	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118430858
553	NC_000854	GTT	2	6	36451	36456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118430858
554	NC_000854	GAC	2	6	36481	36486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118430858
555	NC_000854	TAA	2	6	36510	36515	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118430858
556	NC_000854	GCA	2	6	36597	36602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118430858
557	NC_000854	CCT	2	6	36779	36784	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430858
558	NC_000854	TTA	2	6	36848	36853	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118430858
559	NC_000854	TTG	2	6	36971	36976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118430858
560	NC_000854	AGC	2	6	37103	37108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118430858
561	NC_000854	CGC	2	6	37116	37121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118430858
562	NC_000854	TCG	2	6	37484	37489	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118430858
563	NC_000854	AGG	2	6	37497	37502	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118430858
564	NC_000854	TAG	2	6	37598	37603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118430858
565	NC_000854	CAA	2	6	37620	37625	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118430858
566	NC_000854	CCT	2	6	37953	37958	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430858
567	NC_000854	AAG	2	6	38005	38010	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118430858
568	NC_000854	GAT	2	6	38032	38037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118430858
569	NC_000854	GAG	2	6	38074	38079	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118430858
570	NC_000854	AGA	2	6	38187	38192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118430858
571	NC_000854	AAC	2	6	38212	38217	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118430858
572	NC_000854	AGG	2	6	38280	38285	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118430858
573	NC_000854	ATA	2	6	38450	38455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118430858
574	NC_000854	CCT	2	6	38582	38587	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430858
575	NC_000854	GGC	2	6	38722	38727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118430858
576	NC_000854	TTG	2	6	38735	38740	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118430858
577	NC_000854	GTA	2	6	38755	38760	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118430858
578	NC_000854	GTT	2	6	38779	38784	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118430858
579	NC_000854	CGT	2	6	38810	38815	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118430858
580	NC_000854	CTG	2	6	38834	38839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118430858
581	NC_000854	TTG	2	6	38849	38854	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118430858
582	NC_000854	GTA	2	6	39004	39009	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118430858
583	NC_000854	TGG	2	6	39081	39086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118430858
584	NC_000854	GTA	2	6	39127	39132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118430858
585	NC_000854	GTA	2	6	39158	39163	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118430858
586	NC_000854	GGA	2	6	39358	39363	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118430858
587	NC_000854	AAT	2	6	39394	39399	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118430858
588	NC_000854	CAT	2	6	39476	39481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118430858
589	NC_000854	TAG	2	6	39539	39544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118430858
590	NC_000854	AGG	2	6	39650	39655	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118430858
591	NC_000854	GCT	2	6	39784	39789	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118430858
592	NC_000854	CTA	2	6	39819	39824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118430858
593	NC_000854	GCT	2	6	39927	39932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118430858
594	NC_000854	CGG	2	6	39945	39950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118430858
595	NC_000854	GAA	2	6	39979	39984	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118430858
596	NC_000854	GGA	2	6	39985	39990	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118430858
597	NC_000854	ACA	2	6	40009	40014	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118430858
598	NC_000854	GGA	2	6	40025	40030	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118430858
599	NC_000854	AAC	3	9	40101	40109	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118430858
600	NC_000854	ACC	2	6	40117	40122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118430858
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604	NC_000854	TAG	2	6	40328	40333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118430858
605	NC_000854	CAG	2	6	40349	40354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118430858
606	NC_000854	GAG	2	6	40455	40460	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118430859
607	NC_000854	TGA	2	6	40512	40517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118430859
608	NC_000854	CTT	2	6	40618	40623	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118430859
609	NC_000854	GGC	2	6	40659	40664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118430859
610	NC_000854	GCT	2	6	40753	40758	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118430859
611	NC_000854	TGT	2	6	40803	40808	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118430859
612	NC_000854	TAG	2	6	41036	41041	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118430859
613	NC_000854	GAG	2	6	41067	41072	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118430859
614	NC_000854	ATA	2	6	41103	41108	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118430859
615	NC_000854	AAT	2	6	41133	41138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_000854	AAG	2	6	41165	41170	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
617	NC_000854	TTG	2	6	41276	41281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118430860
618	NC_000854	CAG	2	6	41323	41328	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118430860
619	NC_000854	GGT	2	6	41347	41352	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118430860
620	NC_000854	CAC	2	6	41416	41421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118430860
621	NC_000854	GCA	2	6	41441	41446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118430860
622	NC_000854	ACG	2	6	41501	41506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118430860
623	NC_000854	GAG	2	6	41638	41643	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118430860
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