MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Aeropyrum pernix K1

Total Repeats: 24235

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000854	TTA	2	6	229	234	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14600380
2	NC_000854	CCA	2	6	291	296	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	14600380
3	NC_000854	AGG	2	6	347	352	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14600380
4	NC_000854	TGC	2	6	729	734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14600380
5	NC_000854	CAG	2	6	909	914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14600380
6	NC_000854	TAC	2	6	992	997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14600381
7	NC_000854	TTA	2	6	1081	1086	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14600381
8	NC_000854	CAT	2	6	1114	1119	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14600381
9	NC_000854	TCA	2	6	1252	1257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14600381
10	NC_000854	CTG	2	6	1264	1269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14600381
11	NC_000854	CCA	2	6	1284	1289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	14600382
12	NC_000854	TTA	2	6	1292	1297	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14600382
13	NC_000854	CTA	2	6	1304	1309	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14600382
14	NC_000854	CAA	2	6	1349	1354	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	14600382
15	NC_000854	CTC	2	6	1385	1390	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600382
16	NC_000854	ATG	2	6	1429	1434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14600382
17	NC_000854	ACT	2	6	1498	1503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14600382
18	NC_000854	TAA	2	6	1613	1618	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14600382
19	NC_000854	TTC	2	6	1683	1688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14600382
20	NC_000854	CAA	2	6	1697	1702	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	14600382
21	NC_000854	TAT	2	6	1746	1751	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14600382
22	NC_000854	AGT	2	6	1770	1775	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14600382
23	NC_000854	CCT	2	6	1784	1789	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600382
24	NC_000854	ATA	2	6	1877	1882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14600382
25	NC_000854	AGG	2	6	2002	2007	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14600382
26	NC_000854	GAG	3	9	2016	2024	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14600382
27	NC_000854	TGG	2	6	2045	2050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	14600382
28	NC_000854	AGG	2	6	2095	2100	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14600382
29	NC_000854	TAC	2	6	2174	2179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14600382
30	NC_000854	CTA	2	6	2306	2311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118430836
31	NC_000854	TAT	2	6	2346	2351	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118430836
32	NC_000854	TCA	2	6	2379	2384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118430836
33	NC_000854	GAG	2	6	2593	2598	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118430836
34	NC_000854	TGA	2	6	2725	2730	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118430836
35	NC_000854	TCC	2	6	2763	2768	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430836
36	NC_000854	AGT	2	6	2819	2824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118430836
37	NC_000854	GTT	2	6	3971	3976	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118430837
38	NC_000854	GTT	2	6	3986	3991	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118430837
39	NC_000854	GAA	2	6	4028	4033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118430837
40	NC_000854	AGA	2	6	4086	4091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118430837
41	NC_000854	TGA	2	6	4195	4200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118430837
42	NC_000854	AAG	2	6	4203	4208	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118430837
43	NC_000854	GAA	2	6	4216	4221	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118430837
44	NC_000854	AAT	2	6	4234	4239	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118430837
45	NC_000854	ATG	2	6	4374	4379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118430837
46	NC_000854	CTA	2	6	4390	4395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118430837
47	NC_000854	TGG	2	6	4431	4436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118430837
48	NC_000854	TCT	2	6	4438	4443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118430837
49	NC_000854	TGT	2	6	4546	4551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118430837
50	NC_000854	TGA	2	6	4657	4662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118430837
51	NC_000854	CTC	2	6	4676	4681	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430837
52	NC_000854	GGA	2	6	4744	4749	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118430837
53	NC_000854	GGT	2	6	4888	4893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118430837
54	NC_000854	GGA	2	6	4963	4968	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118430837
55	NC_000854	TCG	2	6	4992	4997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118430837
56	NC_000854	ACG	2	6	4998	5003	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118430837
57	NC_000854	CCT	2	6	5081	5086	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430837
58	NC_000854	CGG	2	6	5280	5285	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118430837
59	NC_000854	GCC	2	6	5309	5314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118430837
60	NC_000854	ACA	2	6	5381	5386	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118430837
61	NC_000854	GTC	2	6	5864	5869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118430838
62	NC_000854	TAT	2	6	6010	6015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118430838
63	NC_000854	GGT	2	6	6289	6294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118430839
64	NC_000854	TGG	2	6	6359	6364	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118430839
65	NC_000854	CTG	2	6	6464	6469	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118430839
66	NC_000854	CCT	2	6	6546	6551	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430839
67	NC_000854	CAA	2	6	6689	6694	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118430839
68	NC_000854	CTG	2	6	6752	6757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118430839
69	NC_000854	CTG	2	6	6785	6790	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118430839
70	NC_000854	TAG	2	6	6822	6827	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118430839
71	NC_000854	AGG	2	6	6850	6855	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118430839
72	NC_000854	GCT	2	6	6966	6971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118430839
73	NC_000854	GGC	2	6	6984	6989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118430839
74	NC_000854	CTA	2	6	7031	7036	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118430839
75	NC_000854	CTA	2	6	7097	7102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118430839
76	NC_000854	ATG	2	6	7123	7128	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118430839
77	NC_000854	ACA	2	6	7135	7140	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118430839
78	NC_000854	CGT	2	6	7164	7169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118430839
79	NC_000854	ACG	2	6	7315	7320	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118430839
80	NC_000854	ACT	2	6	7402	7407	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118430839
81	NC_000854	TAC	2	6	7428	7433	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118430839
82	NC_000854	CAG	2	6	7459	7464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118430839
83	NC_000854	AGC	2	6	7534	7539	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118430839
84	NC_000854	ATG	2	6	7540	7545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118430839
85	NC_000854	TCC	2	6	7551	7556	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430839
86	NC_000854	TTA	2	6	7652	7657	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118430839
87	NC_000854	CCG	2	6	7756	7761	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118430839
88	NC_000854	GGA	2	6	8187	8192	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118430840
89	NC_000854	GTT	2	6	8208	8213	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118430840
90	NC_000854	GTT	2	6	8224	8229	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118430840
91	NC_000854	TCC	2	6	8360	8365	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430840
92	NC_000854	GTT	2	6	8392	8397	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118430840
93	NC_000854	TGG	2	6	8403	8408	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118430840
94	NC_000854	GCG	2	6	8419	8424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118430840
95	NC_000854	GCT	2	6	8590	8595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118430840
96	NC_000854	TAC	2	6	8626	8631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118430840
97	NC_000854	AGG	2	6	8653	8658	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118430840
98	NC_000854	TGA	2	6	8690	8695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118430840
99	NC_000854	GTG	2	6	8696	8701	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118430840
100	NC_000854	GTT	2	6	8776	8781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118430840
101	NC_000854	GAA	2	6	8783	8788	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118430840
102	NC_000854	GCG	2	6	9040	9045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	14600388
103	NC_000854	ATT	2	6	9088	9093	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14600388
104	NC_000854	GAC	2	6	9109	9114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14600388
105	NC_000854	GGA	2	6	9119	9124	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14600388
106	NC_000854	GCT	2	6	9256	9261	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14600388
107	NC_000854	TAC	2	6	9342	9347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14600388
108	NC_000854	CAT	2	6	9462	9467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14600388
109	NC_000854	GAA	2	6	9489	9494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14600388
110	NC_000854	TTG	2	6	9557	9562	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	14600388
111	NC_000854	TCT	2	6	9696	9701	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14600388
112	NC_000854	CTA	2	6	9737	9742	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14600388
113	NC_000854	TCG	2	6	9743	9748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14600388
114	NC_000854	ATG	2	6	10019	10024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118430841
115	NC_000854	CGA	2	6	10077	10082	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118430841
116	NC_000854	TGC	2	6	10148	10153	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118430841
117	NC_000854	AGG	2	6	10172	10177	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118430841
118	NC_000854	GTT	2	6	10222	10227	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118430841
119	NC_000854	ATG	2	6	10378	10383	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118430841
120	NC_000854	CCT	2	6	10818	10823	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430841
121	NC_000854	CGA	2	6	10869	10874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118430841
122	NC_000854	TGG	2	6	10931	10936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118430841
123	NC_000854	GTG	2	6	10952	10957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118430841
124	NC_000854	ACT	2	6	11040	11045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118430841
125	NC_000854	GAA	2	6	11224	11229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118430841
126	NC_000854	AGA	2	6	11259	11264	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118430841
127	NC_000854	CGT	3	9	11271	11279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118430841
128	NC_000854	CAA	2	6	11405	11410	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118430841
129	NC_000854	GAG	2	6	11411	11416	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118430841
130	NC_000854	GCA	2	6	11431	11436	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118430841
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