MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Aeropyrum pernix K1

Total Repeats: 24235

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_000854	GCA	2	6	187381	187386	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118430959
2502	NC_000854	GGA	2	6	187391	187396	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118430959
2503	NC_000854	ACC	2	6	187495	187500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118430959
2504	NC_000854	CTC	2	6	187624	187629	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430959
2505	NC_000854	CGC	2	6	187764	187769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118430959
2506	NC_000854	TCC	2	6	187792	187797	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430959
2507	NC_000854	GCT	2	6	187860	187865	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118430959
2508	NC_000854	TCC	2	6	187954	187959	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430959
2509	NC_000854	ATA	2	6	188096	188101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14600575
2510	NC_000854	GGA	2	6	188121	188126	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14600575
2511	NC_000854	TCT	2	6	188133	188138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14600575
2512	NC_000854	AGG	2	6	188225	188230	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14600575
2513	NC_000854	GTT	2	6	188354	188359	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	14600575
2514	NC_000854	GTT	2	6	188492	188497	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	14600575
2515	NC_000854	ACA	2	6	188501	188506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	14600575
2516	NC_000854	TCA	2	6	188601	188606	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14600575
2517	NC_000854	GGT	3	9	188632	188640	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	14600575
2518	NC_000854	GGA	2	6	188656	188661	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14600575
2519	NC_000854	AGT	2	6	188751	188756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14600575
2520	NC_000854	AGT	2	6	188925	188930	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118430960
2521	NC_000854	CTC	2	6	189042	189047	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430960
2522	NC_000854	TCG	2	6	189055	189060	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118430960
2523	NC_000854	GCA	2	6	189091	189096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118430960
2524	NC_000854	CGT	2	6	189203	189208	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118430960
2525	NC_000854	GCT	2	6	189214	189219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118430960
2526	NC_000854	CGC	2	6	189246	189251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118430960
2527	NC_000854	CGT	2	6	189260	189265	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118430960
2528	NC_000854	TGG	3	9	189273	189281	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118430960
2529	NC_000854	GCT	2	6	189282	189287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118430960
2530	NC_000854	CAT	2	6	189320	189325	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118430960
2531	NC_000854	CGA	2	6	189341	189346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118430960
2532	NC_000854	TAT	2	6	189405	189410	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118430960
2533	NC_000854	GGC	2	6	189510	189515	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118430960
2534	NC_000854	GGA	2	6	189564	189569	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118430960
2535	NC_000854	CGC	2	6	189785	189790	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118430960
2536	NC_000854	CGG	2	6	189798	189803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118430960
2537	NC_000854	ACA	2	6	189844	189849	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118430960
2538	NC_000854	CTC	2	6	189969	189974	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430960
2539	NC_000854	GCC	2	6	190012	190017	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118430960
2540	NC_000854	TCT	2	6	190829	190834	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118430961
2541	NC_000854	GAT	2	6	191093	191098	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118430961
2542	NC_000854	TCA	2	6	191145	191150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118430961
2543	NC_000854	TCG	2	6	191181	191186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118430961
2544	NC_000854	TTG	2	6	191759	191764	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	14600578
2545	NC_000854	CTA	2	6	191834	191839	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14600578
2546	NC_000854	ATA	2	6	191879	191884	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14600578
2547	NC_000854	TGC	2	6	191911	191916	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14600578
2548	NC_000854	CTC	2	6	191984	191989	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600578
2549	NC_000854	ACC	2	6	191998	192003	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	14600578
2550	NC_000854	TAT	2	6	193063	193068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14600580
2551	NC_000854	TCT	2	6	193146	193151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14600580
2552	NC_000854	TAT	3	9	193153	193161	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14600580
2553	NC_000854	GTC	3	9	193168	193176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14600580
2554	NC_000854	TAT	2	6	193258	193263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14600580
2555	NC_000854	ACG	2	6	193307	193312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14600580
2556	NC_000854	CTC	2	6	193326	193331	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600580
2557	NC_000854	TCT	2	6	193900	193905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118430962
2558	NC_000854	GAG	2	6	193984	193989	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118430962
2559	NC_000854	TCA	2	6	194058	194063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118430962
2560	NC_000854	AAT	2	6	194224	194229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118430962
2561	NC_000854	CTC	2	6	194416	194421	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430962
2562	NC_000854	ATC	2	6	194500	194505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118430962
2563	NC_000854	CTA	2	6	194690	194695	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118430962
2564	NC_000854	CGG	2	6	194869	194874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118430962
2565	NC_000854	TAG	2	6	194904	194909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118430962
2566	NC_000854	GAC	2	6	194965	194970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118430962
2567	NC_000854	TAG	2	6	195000	195005	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118430962
2568	NC_000854	TGC	2	6	195124	195129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118430962
2569	NC_000854	AGA	2	6	195187	195192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118430962
2570	NC_000854	GAA	2	6	195275	195280	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118430962
2571	NC_000854	TTG	2	6	196189	196194	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118430963
2572	NC_000854	CTG	2	6	196206	196211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118430963
2573	NC_000854	GTA	2	6	196327	196332	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118430963
2574	NC_000854	CTC	2	6	196401	196406	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430963
2575	NC_000854	TCT	2	6	196476	196481	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14600583
2576	NC_000854	CTC	2	6	196486	196491	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600583
2577	NC_000854	AGG	2	6	196538	196543	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14600583
2578	NC_000854	GAA	2	6	196887	196892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118430964
2579	NC_000854	CCT	2	6	196988	196993	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430964
2580	NC_000854	GAG	2	6	197058	197063	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118430964
2581	NC_000854	GAA	2	6	197091	197096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118430964
2582	NC_000854	AGG	3	9	197191	197199	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118430964
2583	NC_000854	GGC	2	6	197225	197230	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118430964
2584	NC_000854	GCC	2	6	197371	197376	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118430964
2585	NC_000854	CAA	2	6	197457	197462	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118430964
2586	NC_000854	TCC	2	6	197529	197534	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430965
2587	NC_000854	CAA	3	9	197563	197571	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118430965
2588	NC_000854	CGT	2	6	197599	197604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118430965
2589	NC_000854	CCT	2	6	197608	197613	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430965
2590	NC_000854	CCT	2	6	197752	197757	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430965
2591	NC_000854	CTC	2	6	197768	197773	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430965
2592	NC_000854	CAT	2	6	197836	197841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118430965
2593	NC_000854	CAA	2	6	197893	197898	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118430965
2594	NC_000854	CTC	2	6	197954	197959	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430965
2595	NC_000854	GCT	2	6	198044	198049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118430965
2596	NC_000854	CCT	2	6	198103	198108	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430965
2597	NC_000854	AGC	2	6	198185	198190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118430965
2598	NC_000854	GTT	2	6	198728	198733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	14600586
2599	NC_000854	CTG	2	6	198758	198763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14600586
2600	NC_000854	TTC	2	6	198777	198782	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14600586
2601	NC_000854	ATT	2	6	198793	198798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14600586
2602	NC_000854	ATC	2	6	199035	199040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14600586
2603	NC_000854	ATG	2	6	199063	199068	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14600586
2604	NC_000854	ATA	2	6	199162	199167	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118430966
2605	NC_000854	TAT	2	6	199195	199200	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118430966
2606	NC_000854	CCT	2	6	199209	199214	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430966
2607	NC_000854	CCT	2	6	199218	199223	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430966
2608	NC_000854	TGC	2	6	199411	199416	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14600587
2609	NC_000854	CTA	2	6	199449	199454	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14600587
2610	NC_000854	AGA	2	6	199530	199535	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14600587
2611	NC_000854	CTA	2	6	199631	199636	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14600587
2612	NC_000854	CCT	2	6	200045	200050	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430967
2613	NC_000854	ATG	2	6	200073	200078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118430967
2614	NC_000854	ATA	2	6	200130	200135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118430967
2615	NC_000854	TCT	2	6	201001	201006	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118430968
2616	NC_000854	AGA	2	6	201140	201145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118430968
2617	NC_000854	TTA	2	6	201182	201187	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	118430968
2618	NC_000854	TGC	2	6	201207	201212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118430968
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2620	NC_000854	AAT	2	6	202045	202050	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118430969
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2978	NC_000854	AGG	2	6	231203	231208	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118430994
2979	NC_000854	ATC	2	6	231244	231249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118430994
2980	NC_000854	CAT	2	6	231276	231281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118430994
2981	NC_000854	GGA	2	6	231364	231369	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118430994
2982	NC_000854	TGT	2	6	231436	231441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	118430994
2983	NC_000854	CGC	3	9	231456	231464	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118430994
2984	NC_000854	CGC	3	9	231486	231494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118430994
2985	NC_000854	ACC	2	6	231521	231526	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118430994
2986	NC_000854	ATA	2	6	231535	231540	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118430994
2987	NC_000854	CGT	2	6	231549	231554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118430994
2988	NC_000854	CTC	2	6	231581	231586	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430994
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2990	NC_000854	CAC	2	6	231666	231671	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	118430994
2991	NC_000854	CAG	2	6	231822	231827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118430994
2992	NC_000854	CTA	2	6	231884	231889	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118430994
2993	NC_000854	CCT	3	9	231991	231999	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118430994
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