MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Aeropyrum pernix K1

Total Repeats: 24235

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_000854	GCT	2	6	264852	264857	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14600670
3502	NC_000854	TCA	2	6	264947	264952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14600670
3503	NC_000854	TCC	2	6	264982	264987	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600670
3504	NC_000854	GCA	2	6	265001	265006	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14600670
3505	NC_000854	CTC	2	6	265047	265052	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600670
3506	NC_000854	TCG	2	6	265099	265104	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14600670
3507	NC_000854	CCT	2	6	265128	265133	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600670
3508	NC_000854	CGC	2	6	265160	265165	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	14600670
3509	NC_000854	CAG	2	6	265170	265175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14600670
3510	NC_000854	GAA	2	6	265179	265184	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14600670
3511	NC_000854	CCT	2	6	265401	265406	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600670
3512	NC_000854	GCC	2	6	265407	265412	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	14600670
3513	NC_000854	CTC	2	6	265425	265430	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600670
3514	NC_000854	CGA	2	6	265628	265633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14600670
3515	NC_000854	AGG	2	6	265654	265659	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14600670
3516	NC_000854	CGC	2	6	265797	265802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	14600670
3517	NC_000854	ACT	2	6	265948	265953	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14600670
3518	NC_000854	CCA	2	6	265985	265990	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	14600670
3519	NC_000854	AGG	2	6	266215	266220	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14600670
3520	NC_000854	TCC	2	6	266269	266274	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600670
3521	NC_000854	CTT	2	6	266379	266384	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14600670
3522	NC_000854	CCA	2	6	266391	266396	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	14600670
3523	NC_000854	CGC	2	6	266517	266522	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	14600670
3524	NC_000854	CAC	2	6	266673	266678	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	14600670
3525	NC_000854	TCC	2	6	266812	266817	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600670
3526	NC_000854	TCG	2	6	266980	266985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118431017
3527	NC_000854	CGA	2	6	267160	267165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118431017
3528	NC_000854	TCG	2	6	267180	267185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118431017
3529	NC_000854	GTA	2	6	267197	267202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118431017
3530	NC_000854	CCG	2	6	267223	267228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118431017
3531	NC_000854	GTC	2	6	267491	267496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14602188
3532	NC_000854	CAG	2	6	267547	267552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14602188
3533	NC_000854	GCC	2	6	267608	267613	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	14602188
3534	NC_000854	GAG	2	6	267683	267688	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14602188
3535	NC_000854	ATA	2	6	267701	267706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	14602188
3536	NC_000854	CGT	2	6	267769	267774	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14602188
3537	NC_000854	TAG	2	6	268050	268055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14600672
3538	NC_000854	GCC	2	6	268061	268066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	14600672
3539	NC_000854	AGC	2	6	268136	268141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14600672
3540	NC_000854	GCC	2	6	268184	268189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	14600672
3541	NC_000854	AGG	2	6	268190	268195	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14600672
3542	NC_000854	AGG	2	6	268215	268220	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14600672
3543	NC_000854	CGA	2	6	268260	268265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14600672
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3551	NC_000854	ATA	2	6	268916	268921	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	118431018
3552	NC_000854	CTA	2	6	268990	268995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	118431018
3553	NC_000854	GAC	2	6	269006	269011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118431018
3554	NC_000854	GAG	2	6	269448	269453	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14600674
3555	NC_000854	GTG	2	6	269517	269522	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	14600674
3556	NC_000854	GAG	2	6	269552	269557	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14600674
3557	NC_000854	CAT	2	6	269695	269700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14600674
3558	NC_000854	TAC	2	6	269751	269756	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14600674
3559	NC_000854	CAG	2	6	269762	269767	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14600674
3560	NC_000854	CAT	2	6	269816	269821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14600674
3561	NC_000854	GGC	2	6	270008	270013	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	14600674
3562	NC_000854	TAC	2	6	270045	270050	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14600674
3563	NC_000854	GCG	2	6	270144	270149	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	14600674
3564	NC_000854	ACT	2	6	270161	270166	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	14600674
3565	NC_000854	GGC	2	6	270180	270185	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	14600674
3566	NC_000854	AAG	2	6	270276	270281	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14600674
3567	NC_000854	TGG	2	6	270304	270309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	14600674
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3569	NC_000854	GCC	2	6	270417	270422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	14600674
3570	NC_000854	GAA	2	6	270431	270436	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	14600674
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3572	NC_000854	CCT	2	6	270494	270499	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431019
3573	NC_000854	CCT	2	6	270519	270524	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431019
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3577	NC_000854	TCC	2	6	270700	270705	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431019
3578	NC_000854	CTT	2	6	270795	270800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	118431019
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3580	NC_000854	GCC	2	6	270955	270960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118431019
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3588	NC_000854	CCT	2	6	271398	271403	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431019
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3591	NC_000854	TAG	2	6	271654	271659	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	118431019
3592	NC_000854	CTC	2	6	271668	271673	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431019
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3598	NC_000854	CCG	2	6	272408	272413	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	14600676
3599	NC_000854	GAG	2	6	272424	272429	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14600676
3600	NC_000854	CTT	2	6	272443	272448	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14600676
3601	NC_000854	CCT	2	6	272508	272513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600676
3602	NC_000854	TGA	2	6	272531	272536	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	14600676
3603	NC_000854	TAT	2	6	272568	272573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14600676
3604	NC_000854	GTC	2	6	272583	272588	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	14600676
3605	NC_000854	CTC	2	6	272661	272666	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600676
3606	NC_000854	TCT	2	6	272675	272680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14600676
3607	NC_000854	CCT	2	6	272771	272776	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600677
3608	NC_000854	CCT	2	6	272880	272885	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600677
3609	NC_000854	CCT	2	6	272888	272893	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600677
3610	NC_000854	AGG	2	6	272908	272913	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	14600677
3611	NC_000854	CCT	2	6	272931	272936	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600677
3612	NC_000854	CAG	2	6	272988	272993	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	14600677
3613	NC_000854	CCT	2	6	273032	273037	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600677
3614	NC_000854	TCT	2	6	273086	273091	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	14600677
3615	NC_000854	CCT	2	6	273110	273115	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600677
3616	NC_000854	CTC	2	6	273150	273155	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600677
3617	NC_000854	CCT	2	6	273194	273199	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600677
3618	NC_000854	CTC	2	6	273245	273250	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600677
3619	NC_000854	TCC	2	6	273316	273321	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	14600678
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3621	NC_000854	TAT	2	6	273332	273337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	14600678
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3741	NC_000854	GGT	2	6	279911	279916	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118431025
3742	NC_000854	CTC	2	6	279972	279977	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431025
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3981	NC_000854	CAA	2	6	298545	298550	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	118431035
3982	NC_000854	CCT	2	6	298552	298557	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431035
3983	NC_000854	GAC	2	6	298675	298680	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118431035
3984	NC_000854	CCG	2	6	298685	298690	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118431035
3985	NC_000854	TCC	2	6	298713	298718	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431035
3986	NC_000854	TCC	2	6	298781	298786	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431035
3987	NC_000854	GAG	2	6	298921	298926	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118431036
3988	NC_000854	GCC	2	6	299003	299008	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118431036
3989	NC_000854	CGC	3	9	299059	299067	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	118431036
3990	NC_000854	GTG	2	6	299147	299152	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	118431036
3991	NC_000854	CTG	2	6	299201	299206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	118431036
3992	NC_000854	GGC	2	6	299321	299326	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118431037
3993	NC_000854	AGG	2	6	299441	299446	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118431037
3994	NC_000854	AGG	2	6	299475	299480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118431037
3995	NC_000854	GGA	2	6	299491	299496	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118431037
3996	NC_000854	AGG	2	6	299501	299506	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	118431037
3997	NC_000854	GCG	2	6	299533	299538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	118431038
3998	NC_000854	GAA	2	6	299609	299614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	118431038
3999	NC_000854	GAC	2	6	299661	299666	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	118431038
4000	NC_000854	TCC	2	6	299667	299672	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	118431038

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