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Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Mannheimia haemolytica USDA-ARS-SAM-185

Total Repeats: 2935

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020834	ATC	2	6	29	34	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_020834	TAA	3	9	89	97	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020834	TAA	2	6	178	183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_020834	TCT	2	6	229	234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_020834	GGT	2	6	548	553	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020834	TAA	2	6	558	563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020834	ATC	2	6	572	577	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_020834	TCT	2	6	639	644	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_020834	GAT	2	6	719	724	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020834	TAA	2	6	1083	1088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020834	ATT	2	6	9514	9519	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020834	ATT	2	6	9539	9544	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020834	ATA	2	6	11980	11985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020834	TAA	2	6	14956	14961	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020834	TAT	2	6	14993	14998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020834	TGA	2	6	15045	15050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020834	TAC	2	6	17010	17015	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_020834	CCG	2	6	17089	17094	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
19	NC_020834	TAA	2	6	18051	18056	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020834	TAT	2	6	18077	18082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020834	GTA	2	6	18139	18144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020834	GAG	2	6	18209	18214	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_020834	ATA	2	6	18561	18566	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020834	TTA	2	6	18599	18604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020834	ACA	2	6	18784	18789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_020834	GAG	2	6	20858	20863	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020834	TAC	2	6	23030	23035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_020834	CTA	2	6	23060	23065	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_020834	ATT	2	6	23124	23129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020834	CTT	2	6	23160	23165	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_020834	GAA	2	6	24322	24327	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020834	AAT	2	6	25869	25874	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020834	ATA	2	6	28548	28553	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020834	ATT	2	6	28981	28986	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020834	TAA	2	6	29004	29009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020834	ATT	2	6	29030	29035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020834	ACA	2	6	30642	30647	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_020834	TCC	2	6	35536	35541	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_020834	TAG	2	6	36636	36641	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020834	ACA	2	6	36649	36654	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_020834	ATT	2	6	46809	46814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020834	AAT	2	6	46862	46867	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020834	TGT	2	6	46898	46903	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020834	GAA	2	6	46976	46981	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020834	CAA	2	6	47011	47016	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_020834	ATT	2	6	47070	47075	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_020834	CAA	2	6	48381	48386	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_020834	AGG	2	6	48732	48737	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020834	AGG	2	6	49216	49221	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020834	AAC	2	6	53622	53627	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_020834	TGA	2	6	55228	55233	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020834	GAG	2	6	55353	55358	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020834	CTA	2	6	55917	55922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_020834	ATT	2	6	56607	56612	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_020834	TAG	2	6	56669	56674	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020834	ATC	2	6	58465	58470	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_020834	TAA	2	6	58672	58677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020834	CAC	2	6	58695	58700	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
59	NC_020834	TGA	2	6	58816	58821	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020834	AGT	2	6	58865	58870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020834	ATC	2	6	61343	61348	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_020834	TTC	2	6	64754	64759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_020834	TTA	2	6	65227	65232	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_020834	TAC	2	6	67036	67041	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_020834	AGC	2	6	68885	68890	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_020834	TAA	2	6	69663	69668	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020834	TAC	2	6	69674	69679	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_020834	ATT	2	6	71362	71367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020834	AAT	2	6	72065	72070	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020834	AAG	2	6	74517	74522	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020834	GTT	2	6	75700	75705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020834	TAA	2	6	75728	75733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_020834	GAG	2	6	75755	75760	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020834	AGA	2	6	82719	82724	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020834	TGA	2	6	84204	84209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020834	CTT	2	6	85600	85605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_020834	TTG	2	6	85685	85690	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_020834	TGT	2	6	85700	85705	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020834	TTG	2	6	90236	90241	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_020834	TAT	2	6	94238	94243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020834	ATT	2	6	95359	95364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020834	AAT	2	6	95392	95397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_020834	CTT	2	6	98216	98221	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_020834	GTT	2	6	102355	102360	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020834	TAT	2	6	102877	102882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020834	CTT	2	6	102945	102950	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_020834	AAC	2	6	103645	103650	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_020834	ACA	2	6	103736	103741	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_020834	TAA	3	9	103755	103763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_020834	ACA	2	6	104517	104522	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_020834	GAA	2	6	104562	104567	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020834	TAA	2	6	105173	105178	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020834	GCA	2	6	105183	105188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_020834	TGA	2	6	105218	105223	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020834	AAT	2	6	105240	105245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020834	ATT	2	6	105337	105342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020834	TCA	2	6	105547	105552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_020834	TTA	2	6	106317	106322	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020834	AAT	2	6	106425	106430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_020834	TAT	2	6	106448	106453	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020834	ATT	2	6	106812	106817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020834	CAA	2	6	106828	106833	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_020834	TAA	2	6	106849	106854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020834	ATT	2	6	106899	106904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020834	CTG	2	6	107649	107654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_020834	TTG	2	6	109232	109237	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_020834	TTA	2	6	109238	109243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_020834	TCT	2	6	109330	109335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_020834	AGA	2	6	109344	109349	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
110	NC_020834	TGA	2	6	109922	109927	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020834	CAA	2	6	109941	109946	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_020834	TAA	2	6	109997	110002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020834	TAT	2	6	110069	110074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_020834	TAA	2	6	110109	110114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_020834	ATT	2	6	111596	111601	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020834	TAA	2	6	111750	111755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020834	CGG	2	6	112912	112917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_020834	TGT	2	6	112932	112937	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020834	ATT	2	6	113542	113547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020834	GTT	2	6	113647	113652	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020834	AAT	2	6	115806	115811	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020834	ACA	2	6	116662	116667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_020834	TTA	2	6	116782	116787	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_020834	GGA	2	6	117922	117927	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020834	ATA	2	6	119957	119962	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_020834	GTG	2	6	120509	120514	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_020834	TGT	2	6	122436	122441	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
128	NC_020834	ATC	2	6	122526	122531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_020834	GGA	2	6	124326	124331	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_020834	CTC	2	6	126208	126213	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_020834	AGG	2	6	127084	127089	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020834	CCT	2	6	127136	127141	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_020834	TAT	2	6	127388	127393	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_020834	CAT	2	6	127476	127481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_020834	GCT	2	6	127483	127488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_020834	TTA	2	6	132050	132055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_020834	AAT	2	6	132101	132106	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_020834	GAT	2	6	132156	132161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
139	NC_020834	ATT	2	6	132173	132178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_020834	ATT	2	6	132197	132202	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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441	NC_020834	ATT	2	6	462370	462375	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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