MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Mannheimia haemolytica USDA-ARS-SAM-185

Total Repeats: 2935

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_020834	ATT	2	6	503714	503719	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_020834	TAA	2	6	503805	503810	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
503	NC_020834	AAC	2	6	506281	506286	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_020834	ATT	2	6	508219	508224	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
505	NC_020834	GTT	2	6	508329	508334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
506	NC_020834	GCA	2	6	508355	508360	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_020834	ACG	2	6	508365	508370	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
508	NC_020834	TGT	2	6	508374	508379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
509	NC_020834	CGT	2	6	508406	508411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_020834	TTG	2	6	508457	508462	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
511	NC_020834	CAG	2	6	508584	508589	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_020834	GGC	2	6	508648	508653	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_020834	ACT	2	6	508762	508767	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_020834	GCA	2	6	508961	508966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
515	NC_020834	AGA	2	6	509103	509108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
516	NC_020834	CAG	2	6	509129	509134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_020834	GTT	2	6	509198	509203	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
518	NC_020834	GGA	2	6	509320	509325	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
519	NC_020834	GAA	2	6	509581	509586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
520	NC_020834	TGC	2	6	509657	509662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_020834	GTC	2	6	509669	509674	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_020834	TTG	2	6	509730	509735	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
523	NC_020834	GGA	2	6	509782	509787	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
524	NC_020834	TCA	2	6	509807	509812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
525	NC_020834	GCG	2	6	509863	509868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_020834	CCT	2	6	510143	510148	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
527	NC_020834	TGT	2	6	510314	510319	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
528	NC_020834	CGG	2	6	510356	510361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_020834	GAT	2	6	510400	510405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
530	NC_020834	TCT	2	6	510414	510419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_020834	GAA	2	6	510683	510688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
532	NC_020834	GAA	2	6	510772	510777	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
533	NC_020834	CTA	2	6	510779	510784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_020834	TAG	2	6	510875	510880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
535	NC_020834	AAC	2	6	511001	511006	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
536	NC_020834	TCC	2	6	511053	511058	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
537	NC_020834	GGA	2	6	511362	511367	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
538	NC_020834	AAC	2	6	511616	511621	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
539	NC_020834	AGC	2	6	511706	511711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_020834	CTG	2	6	511865	511870	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_020834	TAA	2	6	512043	512048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_020834	TGA	2	6	512155	512160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
543	NC_020834	TTA	2	6	512224	512229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
544	NC_020834	GGT	2	6	512254	512259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
545	NC_020834	TTA	2	6	512412	512417	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_020834	CGG	2	6	512536	512541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_020834	ATG	2	6	512612	512617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
548	NC_020834	ACC	2	6	512807	512812	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
549	NC_020834	TGG	2	6	512867	512872	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
550	NC_020834	TCC	2	6	512893	512898	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
551	NC_020834	GGA	2	6	512910	512915	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
552	NC_020834	GGT	2	6	513030	513035	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
553	NC_020834	CGG	2	6	513117	513122	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_020834	TCA	2	6	513145	513150	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_020834	CGT	2	6	513225	513230	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_020834	GCT	2	6	513279	513284	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_020834	GTT	2	6	513443	513448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
558	NC_020834	ACG	2	6	513456	513461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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560	NC_020834	AGA	2	6	513591	513596	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
561	NC_020834	CGA	2	6	513698	513703	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_020834	GTG	2	6	513774	513779	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
563	NC_020834	TCG	2	6	513803	513808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
564	NC_020834	GCC	2	6	513917	513922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
565	NC_020834	GTT	2	6	513946	513951	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
566	NC_020834	TAA	2	6	514090	514095	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
567	NC_020834	ATT	2	6	514256	514261	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
568	NC_020834	TCA	2	6	520871	520876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_020834	GCA	2	6	520930	520935	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_020834	GCC	2	6	521007	521012	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
571	NC_020834	GAT	2	6	524185	524190	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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573	NC_020834	TGT	2	6	524302	524307	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
574	NC_020834	GTT	2	6	524348	524353	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
575	NC_020834	ATG	2	6	524417	524422	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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579	NC_020834	TAA	2	6	528777	528782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
580	NC_020834	ATT	2	6	528793	528798	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
581	NC_020834	AAT	2	6	528802	528807	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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585	NC_020834	ATT	2	6	533772	533777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_020834	ATT	2	6	534394	534399	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
587	NC_020834	ATA	2	6	534422	534427	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
588	NC_020834	TTA	2	6	534432	534437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
589	NC_020834	ATA	2	6	534438	534443	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
590	NC_020834	TAG	2	6	534540	534545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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592	NC_020834	TAA	2	6	535004	535009	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
593	NC_020834	TAA	2	6	535046	535051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
594	NC_020834	CAA	2	6	538883	538888	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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596	NC_020834	GGC	2	6	545143	545148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_020834	TGA	2	6	545165	545170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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599	NC_020834	CAA	2	6	545498	545503	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_020834	TGC	2	6	545604	545609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
601	NC_020834	CAA	2	6	545705	545710	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_020834	CAC	2	6	545818	545823	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
603	NC_020834	TAT	2	6	546717	546722	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
604	NC_020834	CAA	2	6	546723	546728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_020834	TTG	2	6	548448	548453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
606	NC_020834	CCT	2	6	550121	550126	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
607	NC_020834	ATG	2	6	550178	550183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
608	NC_020834	ATT	3	9	552255	552263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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610	NC_020834	TGT	2	6	552360	552365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
611	NC_020834	TTA	2	6	555297	555302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
612	NC_020834	TTC	2	6	555933	555938	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_020834	ATT	2	6	558130	558135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
614	NC_020834	TAC	2	6	558247	558252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_020834	ATA	2	6	561028	561033	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
616	NC_020834	GGT	2	6	561279	561284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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619	NC_020834	TGT	2	6	567997	568002	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
620	NC_020834	TAT	2	6	568017	568022	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_020834	CAT	2	6	568099	568104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_020834	TAC	2	6	568152	568157	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_020834	TTA	2	6	568268	568273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
624	NC_020834	ATT	2	6	568306	568311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
625	NC_020834	ATT	2	6	572291	572296	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
626	NC_020834	TCT	2	6	572319	572324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_020834	GAA	2	6	572329	572334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
628	NC_020834	GAT	2	6	576039	576044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
629	NC_020834	ATT	2	6	577624	577629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
630	NC_020834	TTA	2	6	577679	577684	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
631	NC_020834	ACA	2	6	579825	579830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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