MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Mannheimia haemolytica USDA-ARS-SAM-185

Total Repeats: 2935

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_020834	TTA	2	6	943161	943166	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_020834	ATG	2	6	943179	943184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1003	NC_020834	TAT	2	6	943211	943216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_020834	TCG	2	6	943243	943248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_020834	ATT	2	6	944053	944058	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1006	NC_020834	TGA	2	6	944085	944090	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_020834	TAT	2	6	944098	944103	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1008	NC_020834	TAA	2	6	944191	944196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1009	NC_020834	TAT	2	6	944225	944230	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_020834	ATT	2	6	944337	944342	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_020834	ATA	2	6	944347	944352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_020834	ATA	3	9	944380	944388	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_020834	TAT	2	6	944503	944508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_020834	TAT	2	6	944543	944548	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_020834	ATT	2	6	944555	944560	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1016	NC_020834	TAA	2	6	944666	944671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_020834	TAA	2	6	944811	944816	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1018	NC_020834	CAT	2	6	945043	945048	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_020834	ATT	2	6	947096	947101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_020834	ATT	2	6	947134	947139	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_020834	ATG	2	6	947177	947182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1022	NC_020834	ACT	2	6	947185	947190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_020834	CTT	2	6	948149	948154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_020834	GAA	2	6	948178	948183	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1025	NC_020834	ATG	2	6	948199	948204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_020834	CTA	2	6	948300	948305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_020834	AAC	2	6	948351	948356	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_020834	AGT	2	6	948358	948363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1029	NC_020834	TTG	2	6	948403	948408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1030	NC_020834	TGA	2	6	953364	953369	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1031	NC_020834	ATA	2	6	953435	953440	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_020834	ATC	2	6	953497	953502	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_020834	TAA	2	6	953655	953660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_020834	AAT	2	6	953666	953671	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_020834	CAT	2	6	953809	953814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_020834	TCA	2	6	957524	957529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_020834	AAG	2	6	959067	959072	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1041	NC_020834	ATA	2	6	961113	961118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_020834	TCA	2	6	961141	961146	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1043	NC_020834	AAC	2	6	963838	963843	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1048	NC_020834	TTA	2	6	966870	966875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1052	NC_020834	TTG	2	6	974472	974477	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1053	NC_020834	TTC	2	6	979753	979758	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_020834	AGA	2	6	979763	979768	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1057	NC_020834	GTT	2	6	984670	984675	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_020834	ATT	2	6	984762	984767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1059	NC_020834	TAA	2	6	985264	985269	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_020834	CAA	2	6	985321	985326	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_020834	CAA	2	6	986060	986065	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_020834	ATG	2	6	989838	989843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1063	NC_020834	TAA	2	6	989938	989943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1064	NC_020834	TAA	2	6	995366	995371	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_020834	TTA	2	6	997249	997254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_020834	ATT	2	6	999680	999685	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1072	NC_020834	ATT	2	6	1007128	1007133	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_020834	TTG	2	6	1010518	1010523	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_020834	TTG	2	6	1010529	1010534	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1075	NC_020834	ATT	2	6	1012097	1012102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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1077	NC_020834	ATA	2	6	1012145	1012150	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_020834	TGA	2	6	1016521	1016526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1085	NC_020834	CAA	2	6	1027345	1027350	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_020834	AAT	2	6	1031391	1031396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1087	NC_020834	ATG	2	6	1032601	1032606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_020834	TAT	2	6	1032882	1032887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_020834	TGT	2	6	1033275	1033280	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_020834	ATA	2	6	1033476	1033481	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1091	NC_020834	TAA	2	6	1033590	1033595	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_020834	ATT	2	6	1033602	1033607	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_020834	ATT	2	6	1033685	1033690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_020834	TCA	2	6	1033703	1033708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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1099	NC_020834	TCA	2	6	1033797	1033802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_020834	ATT	2	6	1033813	1033818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_020834	TTG	2	6	1033844	1033849	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_020834	CTT	2	6	1033971	1033976	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_020834	TCA	2	6	1036302	1036307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1104	NC_020834	TGA	2	6	1036316	1036321	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1105	NC_020834	ATG	2	6	1036326	1036331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_020834	TCA	2	6	1036345	1036350	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1107	NC_020834	TGA	2	6	1036391	1036396	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1108	NC_020834	GAC	2	6	1036400	1036405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_020834	ATT	2	6	1037696	1037701	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_020834	CCA	2	6	1037911	1037916	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1111	NC_020834	CCA	3	9	1037945	1037953	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1112	NC_020834	ATA	2	6	1038355	1038360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_020834	ATT	2	6	1040342	1040347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_020834	GTT	2	6	1040391	1040396	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_020834	TAA	2	6	1049416	1049421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_020834	CAC	2	6	1049447	1049452	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1119	NC_020834	AAT	2	6	1051155	1051160	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_020834	TAA	2	6	1051403	1051408	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_020834	TGA	2	6	1053458	1053463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_020834	TAG	2	6	1053486	1053491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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1125	NC_020834	ATT	2	6	1058568	1058573	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1126	NC_020834	AAG	2	6	1058581	1058586	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_020834	TTA	2	6	1063483	1063488	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1128	NC_020834	AAT	2	6	1065014	1065019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1129	NC_020834	ATC	2	6	1068211	1068216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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