MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis KZN 1435 chromosome

Total Repeats: 5278

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_012943	CAA	2	6	37	42	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_012943	TTC	2	6	1636	1641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_012943	CGG	2	6	1745	1750	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_012943	TCG	2	6	1903	1908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_012943	ACC	2	6	1950	1955	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
6	NC_012943	TCG	2	6	1968	1973	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_012943	ATG	2	6	1991	1996	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_012943	GTT	3	9	2027	2035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_012943	CTG	2	6	2039	2044	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_012943	CGT	2	6	2052	2057	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_012943	TCG	2	6	2081	2086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_012943	GAA	2	6	5193	5198	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_012943	CGA	3	9	9932	9940	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_012943	GAG	2	6	9961	9966	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_012943	TCG	2	6	10964	10969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_012943	TCC	2	6	11049	11054	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_012943	ACG	2	6	11079	11084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_012943	GGC	2	6	11124	11129	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_012943	TCG	2	6	11132	11137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_012943	CCT	2	6	11185	11190	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_012943	CGG	2	6	11422	11427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_012943	ACG	2	6	11484	11489	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_012943	ACC	2	6	11527	11532	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_012943	ACC	3	9	11597	11605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
25	NC_012943	GCC	2	6	11634	11639	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_012943	CCG	2	6	11739	11744	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_012943	CGA	2	6	11796	11801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_012943	ACT	2	6	11843	11848	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_012943	CAT	2	6	11904	11909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_012943	GAC	2	6	11965	11970	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_012943	GCC	2	6	12417	12422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_012943	CGG	2	6	12497	12502	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_012943	TCG	2	6	13136	13141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_012943	CAC	2	6	13679	13684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
35	NC_012943	CGG	2	6	13804	13809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_012943	GAC	2	6	14134	14139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_012943	TCG	2	6	23356	23361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_012943	GGT	2	6	23918	23923	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_012943	TCG	2	6	25578	25583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_012943	CCG	2	6	25679	25684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
41	NC_012943	CTA	2	6	25714	25719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_012943	TCC	2	6	25731	25736	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_012943	GTT	2	6	25738	25743	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_012943	TCG	3	9	25858	25866	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_012943	GCC	2	6	25872	25877	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_012943	AAC	2	6	26984	26989	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_012943	CGT	2	6	27002	27007	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_012943	CTT	2	6	27053	27058	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_012943	CCT	2	6	27552	27557	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_012943	GTA	2	6	27667	27672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_012943	GCG	2	6	31185	31190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_012943	CGG	2	6	31237	31242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_012943	CAA	2	6	31272	31277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_012943	GAG	2	6	31278	31283	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_012943	CAC	2	6	32107	32112	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_012943	GAT	2	6	32136	32141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57	NC_012943	TGG	2	6	33301	33306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_012943	CGG	2	6	34016	34021	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_012943	GCG	2	6	34037	34042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_012943	TGG	2	6	34098	34103	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_012943	CGG	2	6	34169	34174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_012943	GGT	2	6	34231	34236	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_012943	CCA	2	6	34253	34258	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_012943	TCA	2	6	39066	39071	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_012943	CAC	2	6	39933	39938	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
66	NC_012943	TCG	2	6	39955	39960	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_012943	GCC	2	6	41329	41334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
68	NC_012943	GGT	2	6	41390	41395	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
69	NC_012943	GAT	2	6	41398	41403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
70	NC_012943	CCG	3	9	42022	42030	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_012943	AGC	2	6	42041	42046	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_012943	GCC	2	6	42471	42476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_012943	CGT	2	6	43506	43511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_012943	GTG	2	6	43583	43588	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_012943	CGG	2	6	46582	46587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_012943	CGC	2	6	46637	46642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_012943	CGG	2	6	46649	46654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_012943	GCT	2	6	47439	47444	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_012943	GTG	2	6	50103	50108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
80	NC_012943	CCT	2	6	51838	51843	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
81	NC_012943	ACG	2	6	51869	51874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_012943	ACA	2	6	51917	51922	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_012943	TAG	2	6	52809	52814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_012943	CCG	2	6	52843	52848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_012943	CAA	2	6	52857	52862	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_012943	GGT	2	6	52881	52886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
87	NC_012943	CGT	2	6	52895	52900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_012943	CGC	2	6	58129	58134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_012943	TCG	2	6	58138	58143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_012943	GGT	2	6	58166	58171	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_012943	CCT	2	6	58238	58243	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
92	NC_012943	AGG	2	6	58276	58281	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_012943	TGA	2	6	58282	58287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_012943	GAA	3	9	58639	58647	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_012943	GCC	2	6	58656	58661	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_012943	AGG	2	6	58678	58683	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
97	NC_012943	ATG	2	6	63169	63174	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_012943	CGG	2	6	63207	63212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_012943	CGT	2	6	63236	63241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_012943	AGG	3	9	63999	64007	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_012943	TCG	2	6	65082	65087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_012943	GCC	2	6	65636	65641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
103	NC_012943	GGT	2	6	66924	66929	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_012943	TGC	2	6	66962	66967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_012943	TCG	2	6	68688	68693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_012943	AGG	2	6	68712	68717	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
107	NC_012943	CGT	2	6	72390	72395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_012943	GCG	2	6	74704	74709	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_012943	CGA	3	9	74760	74768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_012943	GAG	2	6	75430	75435	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_012943	CGG	2	6	79120	79125	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_012943	CGA	2	6	79202	79207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_012943	GCG	2	6	79267	79272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_012943	CAT	2	6	79276	79281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_012943	CGG	2	6	79346	79351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_012943	GAG	2	6	79382	79387	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_012943	CGG	2	6	79588	79593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
118	NC_012943	GGC	2	6	79606	79611	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_012943	ACC	2	6	80325	80330	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_012943	GGC	2	6	80389	80394	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_012943	GCA	2	6	80411	80416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_012943	CCA	2	6	80477	80482	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_012943	CGG	2	6	80501	80506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_012943	ACC	3	9	80653	80661	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_012943	CTT	2	6	85742	85747	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_012943	CTC	2	6	87968	87973	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_012943	TCC	2	6	87991	87996	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_012943	GCT	2	6	88008	88013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_012943	CAA	2	6	88021	88026	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_012943	GCC	2	6	88187	88192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_012943	GTG	2	6	88223	88228	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132	NC_012943	TTC	2	6	89658	89663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_012943	CCG	2	6	97866	97871	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
134	NC_012943	GGC	3	9	98498	98506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_012943	CGG	2	6	98561	98566	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_012943	ACC	2	6	98580	98585	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
137	NC_012943	GCC	2	6	99478	99483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_012943	CGA	2	6	99522	99527	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_012943	TGC	2	6	99634	99639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_012943	GTT	2	6	99697	99702	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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