MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis KZN 1435 chromosome

Total Repeats: 5278

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_012943	TGC	2	6	966458	966463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1002	NC_012943	GGC	2	6	966468	966473	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_012943	TGG	2	6	967749	967754	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1004	NC_012943	TCG	2	6	971137	971142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1005	NC_012943	AGC	2	6	977010	977015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1006	NC_012943	TGG	2	6	977035	977040	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_012943	GGC	2	6	978191	978196	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_012943	TGC	2	6	980110	980115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_012943	CGG	2	6	981829	981834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_012943	CAC	2	6	981888	981893	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1011	NC_012943	TGC	2	6	982349	982354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1012	NC_012943	GAC	2	6	982367	982372	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_012943	CGG	2	6	982390	982395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_012943	GGT	2	6	982439	982444	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_012943	CCT	2	6	983394	983399	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1016	NC_012943	AGG	2	6	983434	983439	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1017	NC_012943	CGT	2	6	983517	983522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_012943	TCG	2	6	984036	984041	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_012943	ACC	2	6	984089	984094	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1020	NC_012943	CAG	2	6	984119	984124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1021	NC_012943	CCG	2	6	984175	984180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1022	NC_012943	GCG	2	6	984228	984233	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_012943	GCT	2	6	986579	986584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_012943	CGA	2	6	986602	986607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_012943	AGG	2	6	988338	988343	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_012943	CGG	2	6	988651	988656	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1027	NC_012943	AGC	2	6	992129	992134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1028	NC_012943	CTG	2	6	992166	992171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_012943	AGC	2	6	992226	992231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_012943	TGC	2	6	992238	992243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1031	NC_012943	ATC	2	6	992287	992292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1032	NC_012943	CTT	2	6	992302	992307	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1033	NC_012943	AGC	2	6	992356	992361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1034	NC_012943	GCT	2	6	992431	992436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1035	NC_012943	TCG	2	6	992526	992531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1036	NC_012943	TCA	2	6	992567	992572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_012943	GTC	2	6	992638	992643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_012943	CGG	2	6	992708	992713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1039	NC_012943	CGC	2	6	992735	992740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1040	NC_012943	CCG	2	6	992807	992812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1041	NC_012943	GGT	2	6	994314	994319	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_012943	CCG	2	6	995109	995114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1043	NC_012943	CGC	2	6	996016	996021	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1044	NC_012943	CCG	2	6	996037	996042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1045	NC_012943	CAA	2	6	997778	997783	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1046	NC_012943	CGG	2	6	998415	998420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_012943	GCG	2	6	998428	998433	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1048	NC_012943	CGT	2	6	1001739	1001744	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_012943	GCG	2	6	1002563	1002568	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1050	NC_012943	CAA	2	6	1002592	1002597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1051	NC_012943	CGC	2	6	1002666	1002671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1052	NC_012943	CTT	2	6	1004310	1004315	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1053	NC_012943	TTG	2	6	1004372	1004377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1054	NC_012943	CTA	2	6	1005446	1005451	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1055	NC_012943	TCG	2	6	1005940	1005945	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1056	NC_012943	GAC	2	6	1005960	1005965	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_012943	GTG	2	6	1006009	1006014	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1058	NC_012943	CGC	2	6	1006040	1006045	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1059	NC_012943	TGG	2	6	1006082	1006087	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_012943	CCG	2	6	1008643	1008648	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1061	NC_012943	CGG	2	6	1008733	1008738	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1062	NC_012943	ACG	2	6	1008751	1008756	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_012943	GCC	2	6	1008775	1008780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1064	NC_012943	GGA	2	6	1008845	1008850	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_012943	CAC	2	6	1015378	1015383	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1066	NC_012943	CCG	2	6	1015479	1015484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1067	NC_012943	GGC	2	6	1016579	1016584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1068	NC_012943	TGG	2	6	1018437	1018442	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1069	NC_012943	TCG	2	6	1018449	1018454	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1070	NC_012943	GCT	2	6	1018462	1018467	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1071	NC_012943	GGC	2	6	1018471	1018476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NC_012943	CGG	2	6	1018566	1018571	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_012943	GCC	2	6	1018580	1018585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1074	NC_012943	CGG	2	6	1018655	1018660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1075	NC_012943	CAC	2	6	1018750	1018755	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1076	NC_012943	GTG	2	6	1018842	1018847	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1077	NC_012943	CCG	2	6	1024731	1024736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1078	NC_012943	ACC	2	6	1024772	1024777	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1079	NC_012943	CAC	2	6	1024796	1024801	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1080	NC_012943	GCC	2	6	1024877	1024882	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1081	NC_012943	GAG	2	6	1024886	1024891	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1082	NC_012943	GCT	2	6	1028644	1028649	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1083	NC_012943	CGC	2	6	1028680	1028685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1084	NC_012943	GTG	2	6	1031045	1031050	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_012943	GCT	2	6	1032483	1032488	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1086	NC_012943	CCG	2	6	1032494	1032499	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1087	NC_012943	CGA	2	6	1032520	1032525	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1088	NC_012943	TAG	2	6	1032623	1032628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_012943	AAT	2	6	1032713	1032718	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1090	NC_012943	GCT	2	6	1034749	1034754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_012943	GAT	2	6	1035098	1035103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_012943	TGG	2	6	1037295	1037300	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1093	NC_012943	GTC	2	6	1037317	1037322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_012943	GCA	2	6	1038058	1038063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1095	NC_012943	GGC	2	6	1038073	1038078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_012943	CGA	2	6	1038083	1038088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1097	NC_012943	GAG	2	6	1039220	1039225	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_012943	TTA	2	6	1039246	1039251	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_012943	ATC	2	6	1039269	1039274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1100	NC_012943	CGA	2	6	1039289	1039294	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_012943	GCT	2	6	1039295	1039300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_012943	GAG	2	6	1039320	1039325	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1103	NC_012943	CGG	2	6	1039370	1039375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1104	NC_012943	CCG	2	6	1039447	1039452	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1105	NC_012943	CGC	2	6	1039460	1039465	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1106	NC_012943	CGC	2	6	1039499	1039504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1107	NC_012943	CGA	2	6	1039667	1039672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_012943	TCT	2	6	1039711	1039716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_012943	GAC	2	6	1039725	1039730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_012943	TCG	2	6	1039754	1039759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1111	NC_012943	AGG	2	6	1039760	1039765	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_012943	GCG	2	6	1039798	1039803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_012943	CGG	2	6	1043899	1043904	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_012943	GTG	2	6	1047178	1047183	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_012943	TCG	2	6	1047242	1047247	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_012943	CGG	2	6	1047265	1047270	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1117	NC_012943	GCG	2	6	1047297	1047302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_012943	GGC	2	6	1049134	1049139	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1119	NC_012943	TGG	2	6	1049155	1049160	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_012943	TGG	2	6	1050461	1050466	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_012943	CAT	2	6	1050476	1050481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1122	NC_012943	TGG	2	6	1050491	1050496	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_012943	CTG	2	6	1050593	1050598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_012943	GTA	2	6	1050657	1050662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1125	NC_012943	GCA	2	6	1050719	1050724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_012943	CCA	2	6	1050752	1050757	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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1128	NC_012943	ACG	3	9	1054334	1054342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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