MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Mycobacterium tuberculosis KZN 1435 chromosome

Total Repeats: 5278

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_012943	TGC	2	6	556619	556624	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
502	NC_012943	GAG	2	6	556694	556699	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
503	NC_012943	GAC	2	6	557731	557736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_012943	GCG	2	6	559103	559108	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
505	NC_012943	GAG	2	6	559143	559148	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
506	NC_012943	GTA	2	6	560107	560112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
507	NC_012943	CGC	2	6	561013	561018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
508	NC_012943	GCT	2	6	562059	562064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_012943	GGC	2	6	562069	562074	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_012943	GTC	2	6	563783	563788	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
511	NC_012943	GAT	2	6	563814	563819	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
512	NC_012943	TGG	2	6	565239	565244	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
513	NC_012943	GCA	2	6	565834	565839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_012943	TCC	2	6	565965	565970	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
515	NC_012943	GGA	2	6	565973	565978	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
516	NC_012943	GGC	2	6	568173	568178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_012943	CGA	2	6	570086	570091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
518	NC_012943	CGA	2	6	570142	570147	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
519	NC_012943	CGG	2	6	571863	571868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_012943	GGC	2	6	571869	571874	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_012943	TAA	2	6	574016	574021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
522	NC_012943	ACG	2	6	574064	574069	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_012943	GTT	2	6	574095	574100	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
524	NC_012943	GCC	2	6	574101	574106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
525	NC_012943	CAG	2	6	574135	574140	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
526	NC_012943	GAA	2	6	574176	574181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
527	NC_012943	CGA	3	9	577550	577558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
528	NC_012943	CGA	3	9	577608	577616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_012943	CGA	3	9	577666	577674	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
530	NC_012943	TGG	2	6	577740	577745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
531	NC_012943	GCC	2	6	578484	578489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
532	NC_012943	ACC	2	6	578528	578533	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
533	NC_012943	CGG	2	6	578535	578540	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
534	NC_012943	GAG	2	6	578565	578570	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
535	NC_012943	GAG	2	6	578595	578600	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
536	NC_012943	CGG	2	6	579399	579404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_012943	CGG	2	6	579408	579413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_012943	TGA	2	6	580933	580938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
539	NC_012943	CGA	3	9	580946	580954	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
540	NC_012943	GAG	3	9	580971	580979	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
541	NC_012943	CGC	2	6	591799	591804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
542	NC_012943	CTC	3	9	595529	595537	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
543	NC_012943	TCG	2	6	595558	595563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_012943	CTC	3	9	595587	595595	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
545	NC_012943	TCG	2	6	595616	595621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_012943	TTC	2	6	596802	596807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_012943	TAC	2	6	596858	596863	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
548	NC_012943	AGG	2	6	596881	596886	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
549	NC_012943	GGT	2	6	600608	600613	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
550	NC_012943	GAA	2	6	602973	602978	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
551	NC_012943	GCT	3	9	606650	606658	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_012943	GTA	2	6	606692	606697	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
553	NC_012943	GCC	2	6	608806	608811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
554	NC_012943	AAG	2	6	608826	608831	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
555	NC_012943	TGA	2	6	608918	608923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
556	NC_012943	GAC	2	6	611098	611103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
557	NC_012943	CGG	2	6	611197	611202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
558	NC_012943	CAG	2	6	611213	611218	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_012943	TCG	3	9	611267	611275	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_012943	GGT	2	6	611279	611284	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
561	NC_012943	GCA	2	6	612311	612316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
562	NC_012943	GAA	2	6	612327	612332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
563	NC_012943	ATG	2	6	612398	612403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
564	NC_012943	GTC	2	6	612420	612425	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
565	NC_012943	CGG	2	6	613122	613127	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
566	NC_012943	TGG	2	6	614947	614952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
567	NC_012943	GTC	2	6	615008	615013	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
568	NC_012943	GCA	2	6	621073	621078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
569	NC_012943	CCG	2	6	622330	622335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
570	NC_012943	TCG	3	9	622349	622357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
571	NC_012943	GAG	2	6	622444	622449	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
572	NC_012943	CCT	2	6	622468	622473	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
573	NC_012943	GGC	2	6	622921	622926	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_012943	TCG	2	6	625761	625766	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
575	NC_012943	CGA	2	6	625782	625787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
576	NC_012943	TGC	2	6	627517	627522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
577	NC_012943	TGG	2	6	630038	630043	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
578	NC_012943	CGA	2	6	630102	630107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
579	NC_012943	GGA	2	6	631973	631978	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
580	NC_012943	CAG	3	9	635781	635789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_012943	CTG	2	6	637736	637741	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_012943	TCG	2	6	637798	637803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_012943	CGG	2	6	638260	638265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
584	NC_012943	TCG	2	6	639227	639232	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_012943	GGC	2	6	640330	640335	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
586	NC_012943	GCT	2	6	640371	640376	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
587	NC_012943	TCA	2	6	640383	640388	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
588	NC_012943	GCG	2	6	640454	640459	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
589	NC_012943	CGG	2	6	641172	641177	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
590	NC_012943	CGG	2	6	641258	641263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_012943	CGT	2	6	651022	651027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_012943	CAG	2	6	654094	654099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_012943	AGG	2	6	654124	654129	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
594	NC_012943	TGA	2	6	655028	655033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
595	NC_012943	GAG	2	6	655050	655055	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
596	NC_012943	GCG	2	6	655090	655095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
597	NC_012943	CGC	2	6	657801	657806	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
598	NC_012943	CCT	2	6	658311	658316	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
599	NC_012943	GGC	2	6	658367	658372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_012943	CCA	2	6	658448	658453	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
601	NC_012943	GCG	2	6	658539	658544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
602	NC_012943	CAA	2	6	658559	658564	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_012943	TGG	2	6	659614	659619	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
604	NC_012943	CAA	2	6	659682	659687	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
605	NC_012943	CGG	2	6	663635	663640	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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608	NC_012943	GGT	2	6	665237	665242	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
609	NC_012943	GGC	2	6	665283	665288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_012943	CTC	2	6	665866	665871	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
611	NC_012943	CGG	2	6	665944	665949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_012943	CGG	2	6	665992	665997	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
613	NC_012943	GAC	2	6	666094	666099	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_012943	TTG	2	6	666104	666109	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
615	NC_012943	ACC	2	6	668661	668666	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
616	NC_012943	GCC	2	6	668667	668672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
617	NC_012943	GGC	3	9	668732	668740	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_012943	CGG	2	6	668831	668836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
619	NC_012943	GAT	2	6	671420	671425	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
620	NC_012943	GGT	2	6	677256	677261	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
621	NC_012943	TCG	2	6	677273	677278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_012943	CGG	2	6	677306	677311	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
623	NC_012943	GCG	2	6	677318	677323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_012943	CCA	2	6	677332	677337	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
625	NC_012943	TGC	2	6	678598	678603	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
626	NC_012943	CGG	2	6	695058	695063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
627	NC_012943	GCT	2	6	695755	695760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
628	NC_012943	CGC	2	6	695765	695770	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
629	NC_012943	GCT	2	6	695814	695819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
630	NC_012943	TGG	2	6	695840	695845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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