MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Mannheimia haemolytica D171

Total Repeats: 26377

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021738	ATC	2	6	735	740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655724
2	NC_021738	GCT	2	6	866	871	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525655724
3	NC_021738	TAA	2	6	930	935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655724
4	NC_021738	TGT	2	6	2228	2233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525655725
5	NC_021738	TTA	2	6	2351	2356	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525655725
6	NC_021738	CTC	2	6	2508	2513	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525655725
7	NC_021738	GTA	2	6	2542	2547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525655725
8	NC_021738	TTG	2	6	2559	2564	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525655725
9	NC_021738	CGG	2	6	2627	2632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525655725
10	NC_021738	TTG	2	6	2710	2715	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525655725
11	NC_021738	TAG	2	6	2746	2751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525655725
12	NC_021738	TGT	2	6	2873	2878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525655725
13	NC_021738	GCT	2	6	2929	2934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525655725
14	NC_021738	AAT	2	6	3067	3072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655725
15	NC_021738	TCA	2	6	3075	3080	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655725
16	NC_021738	TTA	2	6	3126	3131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525655725
17	NC_021738	CTT	2	6	3168	3173	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655725
18	NC_021738	AAT	2	6	3250	3255	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655725
19	NC_021738	CGA	2	6	3299	3304	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525655725
20	NC_021738	GTC	2	6	3345	3350	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525655725
21	NC_021738	ATT	2	6	3622	3627	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525655725
22	NC_021738	CTT	2	6	3654	3659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655725
23	NC_021738	TAG	2	6	3679	3684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525655725
24	NC_021738	GAT	2	6	3771	3776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525655725
25	NC_021738	GAT	2	6	3841	3846	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525655725
26	NC_021738	TTG	2	6	3851	3856	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525655725
27	NC_021738	GTT	2	6	3989	3994	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525655725
28	NC_021738	GTT	2	6	4082	4087	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525655725
29	NC_021738	TAA	2	6	4185	4190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655725
30	NC_021738	CAT	2	6	4338	4343	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655725
31	NC_021738	CAA	2	6	4390	4395	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525655725
32	NC_021738	ACC	2	6	4399	4404	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525655725
33	NC_021738	TCC	2	6	4435	4440	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525655725
34	NC_021738	ATA	2	6	4672	4677	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655725
35	NC_021738	CTG	2	6	4752	4757	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525655725
36	NC_021738	TAT	2	6	4819	4824	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525655725
37	NC_021738	TAC	2	6	4974	4979	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655725
38	NC_021738	TTC	2	6	5034	5039	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655725
39	NC_021738	CGA	2	6	5202	5207	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525655725
40	NC_021738	CTA	2	6	5390	5395	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655725
41	NC_021738	ATT	2	6	5425	5430	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525655725
42	NC_021738	TAT	2	6	5493	5498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525655725
43	NC_021738	AAT	2	6	5721	5726	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655725
44	NC_021738	GTT	2	6	5807	5812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525655725
45	NC_021738	TTA	2	6	5813	5818	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525655725
46	NC_021738	GAA	2	6	5859	5864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525655725
47	NC_021738	TTC	2	6	5878	5883	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655725
48	NC_021738	GAG	2	6	5961	5966	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	525655725
49	NC_021738	CCT	2	6	5987	5992	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525655725
50	NC_021738	CAA	2	6	6018	6023	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525655725
51	NC_021738	GCA	2	6	6062	6067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525655725
52	NC_021738	TAT	2	6	6093	6098	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525655725
53	NC_021738	TTG	2	6	6212	6217	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525655725
54	NC_021738	CAT	2	6	6297	6302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655725
55	NC_021738	ACA	2	6	6308	6313	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525655725
56	NC_021738	CAG	2	6	6321	6326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525655725
57	NC_021738	AAG	2	6	6351	6356	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525655725
58	NC_021738	AAC	2	6	7512	7517	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525655726
59	NC_021738	TTA	2	6	7542	7547	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525655726
60	NC_021738	AGA	2	6	7556	7561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525655726
61	NC_021738	CAA	2	6	7626	7631	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525655726
62	NC_021738	GGT	2	6	7644	7649	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525655726
63	NC_021738	TGA	2	6	7703	7708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525655726
64	NC_021738	TGT	2	6	7724	7729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525655726
65	NC_021738	CAG	2	6	7807	7812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525655726
66	NC_021738	TCA	2	6	7838	7843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655726
67	NC_021738	TAT	2	6	7901	7906	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525655726
68	NC_021738	CAA	2	6	8052	8057	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525655726
69	NC_021738	TGC	2	6	8123	8128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525655726
70	NC_021738	GAA	2	6	8369	8374	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525655726
71	NC_021738	TAT	2	6	8427	8432	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525655726
72	NC_021738	ATT	2	6	9003	9008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525655727
73	NC_021738	CTT	2	6	9011	9016	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655727
74	NC_021738	TCA	2	6	9025	9030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655727
75	NC_021738	TTG	2	6	9045	9050	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525655727
76	NC_021738	ATA	2	6	9176	9181	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655727
77	NC_021738	ATC	2	6	9225	9230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655727
78	NC_021738	TTC	2	6	9260	9265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655727
79	NC_021738	ATA	2	6	9357	9362	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655727
80	NC_021738	ATC	2	6	9540	9545	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655727
81	NC_021738	GAC	2	6	9625	9630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525655727
82	NC_021738	AAT	2	6	9662	9667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655727
83	NC_021738	TGC	2	6	9705	9710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525655727
84	NC_021738	GTG	3	9	9737	9745	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525655727
85	NC_021738	TAT	2	6	9758	9763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525655727
86	NC_021738	CTG	2	6	10017	10022	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525655727
87	NC_021738	AGA	2	6	10092	10097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525655727
88	NC_021738	TCA	2	6	10163	10168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655727
89	NC_021738	TAA	2	6	10178	10183	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655728
90	NC_021738	TCA	2	6	10212	10217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655728
91	NC_021738	GTA	2	6	10274	10279	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525655728
92	NC_021738	AAT	2	6	10353	10358	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655728
93	NC_021738	ATT	3	9	10467	10475	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525655728
94	NC_021738	ATC	3	9	11184	11192	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655614
95	NC_021738	GCA	2	6	11242	11247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525655614
96	NC_021738	GGT	2	6	11394	11399	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525655614
97	NC_021738	CGG	2	6	11506	11511	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525655614
98	NC_021738	AAT	2	6	11661	11666	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655614
99	NC_021738	GCT	2	6	12223	12228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525655729
100	NC_021738	TGG	2	6	12245	12250	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525655729
101	NC_021738	GAA	2	6	12262	12267	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525655729
102	NC_021738	GAT	2	6	12282	12287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525655729
103	NC_021738	ATT	2	6	12333	12338	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525655729
104	NC_021738	GTG	3	9	12445	12453	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525655729
105	NC_021738	ATT	2	6	12538	12543	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525655729
106	NC_021738	GAC	2	6	12553	12558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525655729
107	NC_021738	GAA	2	6	12568	12573	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525655729
108	NC_021738	AAC	2	6	12652	12657	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525655729
109	NC_021738	GCC	2	6	12748	12753	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525655729
110	NC_021738	CGC	2	6	12775	12780	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525655729
111	NC_021738	CTA	2	6	12786	12791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655729
112	NC_021738	TTA	2	6	12799	12804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525655729
113	NC_021738	ATT	2	6	12877	12882	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525655729
114	NC_021738	AGA	2	6	12897	12902	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525655729
115	NC_021738	AAT	2	6	12973	12978	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655729
116	NC_021738	CGC	2	6	12985	12990	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525655729
117	NC_021738	TAA	2	6	13041	13046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655729
118	NC_021738	TAG	2	6	13352	13357	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525655729
119	NC_021738	AAC	2	6	13699	13704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525655729
120	NC_021738	CTC	2	6	13925	13930	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525655729
121	NC_021738	ATT	2	6	13956	13961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525655729
122	NC_021738	AAG	2	6	13994	13999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525655729
123	NC_021738	CTT	2	6	14100	14105	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655729
124	NC_021738	GAT	2	6	14250	14255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525655729
125	NC_021738	TCT	2	6	14314	14319	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655729
126	NC_021738	ACC	2	6	14416	14421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525655729
127	NC_021738	GGC	2	6	14569	14574	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525655729
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129	NC_021738	GAA	2	6	14602	14607	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525655729
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