MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Mannheimia haemolytica D171

Total Repeats: 26377

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_021738	CCA	2	6	415055	415060	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525656071
4502	NC_021738	CGG	2	6	415157	415162	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525656071
4503	NC_021738	GTT	2	6	415250	415255	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525656071
4504	NC_021738	TTA	2	6	415261	415266	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525656071
4505	NC_021738	CTA	2	6	415301	415306	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525656071
4506	NC_021738	GAT	2	6	415385	415390	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525656071
4507	NC_021738	AAT	2	6	415543	415548	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525656072
4508	NC_021738	GCT	2	6	415719	415724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525656072
4509	NC_021738	TTG	2	6	415883	415888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525656072
4510	NC_021738	TCT	2	6	415992	415997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525656072
4511	NC_021738	CCA	2	6	416172	416177	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525656072
4512	NC_021738	TAA	2	6	416183	416188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525656072
4513	NC_021738	TTC	2	6	416259	416264	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525656072
4514	NC_021738	TTG	2	6	416409	416414	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525656073
4515	NC_021738	CGG	2	6	416492	416497	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525656073
4516	NC_021738	ATT	2	6	416688	416693	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525656074
4517	NC_021738	GTC	2	6	416719	416724	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525656074
4518	NC_021738	CCG	2	6	416774	416779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525656074
4519	NC_021738	GTA	2	6	416780	416785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525656074
4520	NC_021738	TAA	2	6	416845	416850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525656074
4521	NC_021738	CAT	2	6	416940	416945	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525656074
4522	NC_021738	CTG	2	6	416969	416974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525656074
4523	NC_021738	TAA	2	6	416977	416982	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525656074
4524	NC_021738	TAT	2	6	416994	416999	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525656074
4525	NC_021738	AAT	2	6	417317	417322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525656074
4526	NC_021738	TCA	2	6	417610	417615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525656075
4527	NC_021738	ATC	2	6	417643	417648	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525656075
4528	NC_021738	TAA	2	6	417656	417661	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525656075
4529	NC_021738	CTG	2	6	417707	417712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525656075
4530	NC_021738	TTG	2	6	417825	417830	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525656075
4531	NC_021738	CCG	2	6	417833	417838	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525656075
4532	NC_021738	GAC	2	6	417916	417921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525656075
4533	NC_021738	GCG	2	6	417960	417965	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525656075
4534	NC_021738	TCA	2	6	418063	418068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525656075
4535	NC_021738	GAA	2	6	418213	418218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525656075
4536	NC_021738	TAA	2	6	418344	418349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525656075
4537	NC_021738	TTG	2	6	418368	418373	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525656075
4538	NC_021738	CTT	2	6	418391	418396	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525656075
4539	NC_021738	TTC	2	6	418426	418431	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525656075
4540	NC_021738	TCC	2	6	418534	418539	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525656075
4541	NC_021738	AAT	2	6	418570	418575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525656075
4542	NC_021738	TGG	2	6	418699	418704	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525656075
4543	NC_021738	TCT	2	6	418726	418731	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525656075
4544	NC_021738	GGC	2	6	418839	418844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525656075
4545	NC_021738	GAC	2	6	418862	418867	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525656075
4546	NC_021738	ATC	2	6	418894	418899	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525656075
4547	NC_021738	CTC	2	6	419082	419087	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525656075
4548	NC_021738	TTG	2	6	419106	419111	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525656075
4549	NC_021738	ATT	2	6	419373	419378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525656075
4550	NC_021738	AAT	2	6	419464	419469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525656075
4551	NC_021738	CGG	2	6	419738	419743	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525656075
4552	NC_021738	CAT	2	6	419951	419956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525656075
4553	NC_021738	ATC	2	6	420039	420044	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525656075
4554	NC_021738	TGG	2	6	420051	420056	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525656075
4555	NC_021738	AAC	2	6	420079	420084	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525656075
4556	NC_021738	GAA	2	6	420253	420258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525656075
4557	NC_021738	CCA	2	6	420263	420268	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525656075
4558	NC_021738	ATT	2	6	420421	420426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525656076
4559	NC_021738	TTG	2	6	420546	420551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525656076
4560	NC_021738	TTG	2	6	420611	420616	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525656076
4561	NC_021738	CTT	3	9	420634	420642	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525656076
4562	NC_021738	AAT	2	6	420677	420682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525656076
4563	NC_021738	TTG	2	6	420724	420729	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525656076
4564	NC_021738	TAA	2	6	420794	420799	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525656076
4565	NC_021738	ATT	2	6	420839	420844	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525656076
4566	NC_021738	TAA	3	9	420878	420886	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525656076
4567	NC_021738	ATA	2	6	420925	420930	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525656076
4568	NC_021738	CAC	2	6	421082	421087	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525656076
4569	NC_021738	ATT	2	6	421187	421192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525656076
4570	NC_021738	CAT	2	6	421204	421209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525656076
4571	NC_021738	TTC	2	6	421238	421243	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525656076
4572	NC_021738	TCA	2	6	421350	421355	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525656076
4573	NC_021738	TCA	2	6	421489	421494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525656076
4574	NC_021738	TGA	2	6	421545	421550	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525656076
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4576	NC_021738	GTT	2	6	421690	421695	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525656076
4577	NC_021738	TTA	2	6	421704	421709	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525656076
4578	NC_021738	AAC	2	6	421715	421720	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525656076
4579	NC_021738	TTC	2	6	421736	421741	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525656076
4580	NC_021738	TAG	2	6	421883	421888	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525656077
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4582	NC_021738	AAT	2	6	421959	421964	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525656077
4583	NC_021738	CGG	2	6	422217	422222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525656077
4584	NC_021738	TTG	2	6	422325	422330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525656077
4585	NC_021738	AGT	2	6	422383	422388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525656077
4586	NC_021738	CCA	2	6	422461	422466	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525656077
4587	NC_021738	GCT	2	6	422485	422490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525656077
4588	NC_021738	ATC	2	6	422563	422568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525656077
4589	NC_021738	CTC	2	6	422691	422696	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525656078
4590	NC_021738	CAC	2	6	422752	422757	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525656078
4591	NC_021738	TAA	2	6	422758	422763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525656078
4592	NC_021738	AAT	2	6	422836	422841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525656078
4593	NC_021738	GCA	2	6	423185	423190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525656078
4594	NC_021738	TCT	2	6	423212	423217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525656078
4595	NC_021738	GTA	2	6	423323	423328	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525656078
4596	NC_021738	GCC	2	6	423338	423343	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525656078
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4598	NC_021738	CCA	2	6	423833	423838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525656078
4599	NC_021738	AAG	2	6	423859	423864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525656078
4600	NC_021738	ATA	2	6	423875	423880	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525656078
4601	NC_021738	AGA	2	6	423915	423920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525656079
4602	NC_021738	TCA	2	6	424054	424059	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525656079
4603	NC_021738	ACC	2	6	424191	424196	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525656079
4604	NC_021738	ACC	2	6	424206	424211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525656079
4605	NC_021738	TAA	2	6	424247	424252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525656079
4606	NC_021738	CCA	2	6	424271	424276	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525656079
4607	NC_021738	TAA	2	6	424404	424409	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525656079
4608	NC_021738	TTG	2	6	424416	424421	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525656079
4609	NC_021738	GGC	2	6	424433	424438	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525656079
4610	NC_021738	TTC	2	6	424521	424526	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525656079
4611	NC_021738	AAT	2	6	424579	424584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525656079
4612	NC_021738	CAG	2	6	424607	424612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525656079
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4614	NC_021738	TAA	2	6	424992	424997	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525656080
4615	NC_021738	GAA	2	6	425053	425058	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525656080
4616	NC_021738	CAC	2	6	425093	425098	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525656080
4617	NC_021738	AAT	2	6	425133	425138	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525656080
4618	NC_021738	ATA	2	6	425185	425190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525656080
4619	NC_021738	TGC	2	6	425229	425234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525656080
4620	NC_021738	TAC	2	6	425325	425330	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525656080
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4622	NC_021738	CAT	2	6	425376	425381	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525656080
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4625	NC_021738	GTA	2	6	425503	425508	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525656080
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4977	NC_021738	TCA	2	6	455287	455292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525656102
4978	NC_021738	TTA	2	6	455299	455304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525656102
4979	NC_021738	CAA	2	6	455453	455458	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525656102
4980	NC_021738	ATT	2	6	455544	455549	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525656102
4981	NC_021738	ATA	2	6	455558	455563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525656102
4982	NC_021738	CAA	2	6	455567	455572	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525656102
4983	NC_021738	TCC	2	6	455578	455583	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	525656102
4984	NC_021738	TCA	2	6	455593	455598	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525656102
4985	NC_021738	ATC	2	6	455628	455633	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525656102
4986	NC_021738	TCA	2	6	455656	455661	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525656102
4987	NC_021738	CAT	2	6	455697	455702	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525656102
4988	NC_021738	TCA	2	6	455776	455781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525656102
4989	NC_021738	GTT	2	6	456173	456178	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525656103
4990	NC_021738	TCA	2	6	456524	456529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525656104
4991	NC_021738	AAT	2	6	456711	456716	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525656104
4992	NC_021738	TAA	2	6	456743	456748	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525656104
4993	NC_021738	AAT	2	6	456752	456757	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525656104
4994	NC_021738	TAT	2	6	456760	456765	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525656104
4995	NC_021738	ATC	2	6	456812	456817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525656104
4996	NC_021738	CAG	2	6	456881	456886	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525656104
4997	NC_021738	ACT	2	6	456963	456968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525656104
4998	NC_021738	AAC	2	6	457080	457085	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525656104
4999	NC_021738	GTG	2	6	457116	457121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525656104
5000	NC_021738	GGC	2	6	457263	457268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525656104

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