MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Mannheimia haemolytica D171

Total Repeats: 26377

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_021738	ATC	2	6	273608	273613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655945
3002	NC_021738	TTC	2	6	273632	273637	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655945
3003	NC_021738	TAA	2	6	273701	273706	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655945
3004	NC_021738	TTC	2	6	273710	273715	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655945
3005	NC_021738	TAA	2	6	273731	273736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655945
3006	NC_021738	TTC	2	6	273791	273796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655945
3007	NC_021738	TTC	2	6	273905	273910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655945
3008	NC_021738	TAA	2	6	273932	273937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655945
3009	NC_021738	TGA	2	6	273940	273945	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525655945
3010	NC_021738	TCT	3	9	273954	273962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655945
3011	NC_021738	CTT	2	6	273968	273973	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655945
3012	NC_021738	CGC	2	6	274204	274209	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	525655945
3013	NC_021738	CAC	2	6	274240	274245	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525655945
3014	NC_021738	TCT	2	6	274545	274550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655945
3015	NC_021738	AAT	2	6	274610	274615	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655945
3016	NC_021738	TCA	2	6	274638	274643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655945
3017	NC_021738	TCT	2	6	274654	274659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655945
3018	NC_021738	ATT	2	6	274814	274819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525655945
3019	NC_021738	ACG	2	6	274841	274846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525655945
3020	NC_021738	ACC	2	6	274878	274883	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525655945
3021	NC_021738	TAA	2	6	275003	275008	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655945
3022	NC_021738	TGA	2	6	275127	275132	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525655946
3023	NC_021738	AAT	2	6	275246	275251	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655946
3024	NC_021738	GAA	2	6	275270	275275	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525655946
3025	NC_021738	GGC	2	6	275334	275339	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525655946
3026	NC_021738	ATC	2	6	275353	275358	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655946
3027	NC_021738	CTT	2	6	275373	275378	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655946
3028	NC_021738	TCT	2	6	275477	275482	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655946
3029	NC_021738	ATA	2	6	275939	275944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655947
3030	NC_021738	TAC	2	6	276034	276039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655947
3031	NC_021738	ATT	2	6	276101	276106	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525655947
3032	NC_021738	ATA	2	6	276150	276155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655947
3033	NC_021738	TGT	2	6	276227	276232	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525655947
3034	NC_021738	CTT	2	6	276549	276554	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655947
3035	NC_021738	AAT	2	6	276668	276673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655947
3036	NC_021738	TTG	2	6	276680	276685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525655947
3037	NC_021738	AGC	2	6	276686	276691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525655947
3038	NC_021738	TGC	2	6	276846	276851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525655947
3039	NC_021738	TCA	2	6	276912	276917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655947
3040	NC_021738	CTG	2	6	277031	277036	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525655947
3041	NC_021738	AAT	2	6	277097	277102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655947
3042	NC_021738	ATT	2	6	277172	277177	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525655947
3043	NC_021738	TGC	2	6	277478	277483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525655947
3044	NC_021738	ACT	2	6	277526	277531	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655947
3045	NC_021738	AGC	2	6	277587	277592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525655947
3046	NC_021738	AGC	2	6	277701	277706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525655947
3047	NC_021738	TAA	2	6	277751	277756	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655947
3048	NC_021738	TTC	2	6	277791	277796	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655947
3049	NC_021738	TTC	2	6	278013	278018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655947
3050	NC_021738	ACC	2	6	278129	278134	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525655948
3051	NC_021738	CCA	2	6	278229	278234	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525655948
3052	NC_021738	CTT	2	6	278380	278385	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655948
3053	NC_021738	TTA	2	6	278386	278391	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525655948
3054	NC_021738	GAC	2	6	278582	278587	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525655949
3055	NC_021738	TCA	2	6	278633	278638	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655949
3056	NC_021738	CTT	2	6	278732	278737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655949
3057	NC_021738	TAA	2	6	278877	278882	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655949
3058	NC_021738	CAT	2	6	278928	278933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655949
3059	NC_021738	ACC	2	6	278940	278945	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525655949
3060	NC_021738	CAG	3	9	278981	278989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525655949
3061	NC_021738	CAA	2	6	279191	279196	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525655949
3062	NC_021738	AAT	2	6	279242	279247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655950
3063	NC_021738	AAG	2	6	279292	279297	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525655950
3064	NC_021738	CCA	2	6	279376	279381	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525655950
3065	NC_021738	TAA	2	6	279389	279394	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655950
3066	NC_021738	CTG	2	6	279488	279493	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525655950
3067	NC_021738	GCA	2	6	279510	279515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525655950
3068	NC_021738	TTC	2	6	279530	279535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655950
3069	NC_021738	ACT	2	6	279563	279568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655950
3070	NC_021738	ATA	2	6	279782	279787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655950
3071	NC_021738	ATC	2	6	279827	279832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655950
3072	NC_021738	TCA	2	6	280002	280007	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655950
3073	NC_021738	TAA	2	6	280020	280025	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655950
3074	NC_021738	TAA	2	6	280085	280090	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655950
3075	NC_021738	AAT	2	6	280105	280110	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655950
3076	NC_021738	CTG	2	6	280280	280285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525655950
3077	NC_021738	TTA	2	6	280332	280337	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525655950
3078	NC_021738	CTT	2	6	280355	280360	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655950
3079	NC_021738	TGC	2	6	280394	280399	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525655950
3080	NC_021738	AAT	2	6	280419	280424	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655950
3081	NC_021738	ATT	2	6	280435	280440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525655951
3082	NC_021738	ACG	2	6	280490	280495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525655951
3083	NC_021738	ATT	2	6	280649	280654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525655951
3084	NC_021738	AAT	2	6	280676	280681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655951
3085	NC_021738	CTT	2	6	280924	280929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655623
3086	NC_021738	CCA	2	6	280975	280980	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525655623
3087	NC_021738	ATT	2	6	281169	281174	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525655952
3088	NC_021738	GCT	2	6	281183	281188	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525655952
3089	NC_021738	ACA	2	6	281216	281221	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525655952
3090	NC_021738	TGC	2	6	281248	281253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525655952
3091	NC_021738	TTC	2	6	281257	281262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655952
3092	NC_021738	TCT	2	6	281369	281374	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655952
3093	NC_021738	CAG	2	6	281382	281387	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525655952
3094	NC_021738	AAC	2	6	281581	281586	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525655952
3095	NC_021738	TCA	2	6	281597	281602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655952
3096	NC_021738	CTT	2	6	281625	281630	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655952
3097	NC_021738	ACC	2	6	281680	281685	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525655952
3098	NC_021738	ACG	3	9	281815	281823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525655952
3099	NC_021738	TTC	2	6	281824	281829	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655952
3100	NC_021738	GGT	2	6	282015	282020	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525655952
3101	NC_021738	TAA	2	6	282184	282189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655952
3102	NC_021738	ACG	2	6	282325	282330	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525655952
3103	NC_021738	TAC	3	9	282334	282342	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655952
3104	NC_021738	GTT	2	6	282343	282348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	525655952
3105	NC_021738	TTC	2	6	282526	282531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655952
3106	NC_021738	CAC	2	6	282576	282581	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525655952
3107	NC_021738	ACT	2	6	282587	282592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655952
3108	NC_021738	TCT	2	6	282608	282613	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655952
3109	NC_021738	AAC	2	6	282625	282630	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525655952
3110	NC_021738	TCA	2	6	282638	282643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655952
3111	NC_021738	CAA	2	6	282723	282728	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525655952
3112	NC_021738	CAA	2	6	282750	282755	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525655952
3113	NC_021738	AAC	2	6	282766	282771	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	525655952
3114	NC_021738	GTG	2	6	282783	282788	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525655952
3115	NC_021738	TTC	2	6	282802	282807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655952
3116	NC_021738	AGT	2	6	282809	282814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525655952
3117	NC_021738	ATA	2	6	282836	282841	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655952
3118	NC_021738	TTC	2	6	283151	283156	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655953
3119	NC_021738	CTA	2	6	283245	283250	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655953
3120	NC_021738	AGC	2	6	283295	283300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525655953
3121	NC_021738	TCA	3	9	283440	283448	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655953
3122	NC_021738	CAC	2	6	283564	283569	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525655953
3123	NC_021738	TCA	2	6	283661	283666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655954
3124	NC_021738	GTA	2	6	283688	283693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525655954
3125	NC_021738	CAT	2	6	283720	283725	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655954
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3234	NC_021738	CTG	2	6	294567	294572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525655625
3235	NC_021738	ACC	3	9	294658	294666	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	525655625
3236	NC_021738	GCG	2	6	294835	294840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	525655625
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3358	NC_021738	CTG	2	6	304723	304728	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525655970
3359	NC_021738	CTA	2	6	304736	304741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655970
3360	NC_021738	GTC	2	6	304879	304884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525655970
3361	NC_021738	GCT	2	6	304930	304935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525655970
3362	NC_021738	GCA	2	6	304978	304983	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525655970
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3462	NC_021738	CAT	2	6	319739	319744	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	525655978
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3474	NC_021738	ATA	2	6	321847	321852	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	525655980
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3476	NC_021738	TGA	2	6	322261	322266	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525655981
3477	NC_021738	GTG	2	6	322326	322331	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	525655981
3478	NC_021738	GCA	2	6	322396	322401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525655981
3479	NC_021738	GAT	2	6	322463	322468	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525655981
3480	NC_021738	TGA	2	6	322512	322517	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	525655981
3481	NC_021738	GAA	2	6	322574	322579	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525655981
3482	NC_021738	TTA	2	6	322715	322720	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525655981
3483	NC_021738	TAT	3	9	322765	322773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	525655981
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3485	NC_021738	GCA	2	6	322819	322824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	525655981
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3488	NC_021738	GAA	2	6	323140	323145	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525655982
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3490	NC_021738	GCT	2	6	323383	323388	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	525655982
3491	NC_021738	CTT	2	6	323394	323399	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	525655982
3492	NC_021738	AAG	2	6	323531	323536	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	525655982
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