MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Methylophaga sp. JAM1 chromosome

Total Repeats: 37216

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017857	GTC	2	6	356	361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387125903
2	NC_017857	CTG	2	6	720	725	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387125903
3	NC_017857	ACC	2	6	765	770	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387125903
4	NC_017857	CCG	2	6	836	841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387125903
5	NC_017857	AAT	2	6	1046	1051	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387125904
6	NC_017857	CAC	2	6	1312	1317	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387125904
7	NC_017857	TAA	2	6	1361	1366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387125904
8	NC_017857	CGC	2	6	1396	1401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387125904
9	NC_017857	CAA	2	6	1444	1449	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387125904
10	NC_017857	ATG	2	6	1728	1733	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387125905
11	NC_017857	TTA	2	6	1802	1807	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387125905
12	NC_017857	AAT	2	6	1893	1898	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387125905
13	NC_017857	TTC	2	6	2104	2109	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387125905
14	NC_017857	TGG	2	6	2167	2172	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387125905
15	NC_017857	TGC	2	6	2174	2179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387125905
16	NC_017857	AAT	2	6	2344	2349	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387125905
17	NC_017857	TAC	2	6	2431	2436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387125905
18	NC_017857	GTT	2	6	2445	2450	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387125905
19	NC_017857	ATT	2	6	2487	2492	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387125906
20	NC_017857	TCA	2	6	2523	2528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387125906
21	NC_017857	CAG	2	6	2539	2544	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387125906
22	NC_017857	TTG	2	6	2576	2581	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387125906
23	NC_017857	CAA	2	6	2737	2742	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387125906
24	NC_017857	CAA	2	6	2854	2859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387125906
25	NC_017857	CTC	2	6	2936	2941	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387125906
26	NC_017857	ATT	2	6	3061	3066	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387125907
27	NC_017857	CAG	2	6	3148	3153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387125907
28	NC_017857	TTG	2	6	3504	3509	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387125907
29	NC_017857	AGG	2	6	3637	3642	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387125907
30	NC_017857	CTG	2	6	3671	3676	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387125907
31	NC_017857	ATA	2	6	3753	3758	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387125907
32	NC_017857	AAT	2	6	4005	4010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387125907
33	NC_017857	CTG	2	6	4044	4049	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387125907
34	NC_017857	TAA	2	6	4079	4084	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387125907
35	NC_017857	ACT	2	6	4166	4171	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387125907
36	NC_017857	AAT	2	6	4187	4192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387125907
37	NC_017857	ACC	2	6	4268	4273	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387125907
38	NC_017857	GCA	2	6	4424	4429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387125908
39	NC_017857	AGC	2	6	4574	4579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387125908
40	NC_017857	GTT	3	9	4668	4676	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387125908
41	NC_017857	GTT	2	6	4680	4685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387125908
42	NC_017857	CTT	2	6	4716	4721	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387125908
43	NC_017857	CAG	2	6	4788	4793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387125908
44	NC_017857	CTT	3	9	4806	4814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387125908
45	NC_017857	CTT	3	9	4878	4886	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387125908
46	NC_017857	CTG	2	6	4926	4931	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387125908
47	NC_017857	CTT	2	6	4962	4967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387125908
48	NC_017857	TGT	2	6	4994	4999	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387125908
49	NC_017857	TTG	2	6	5014	5019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387125908
50	NC_017857	CTT	2	6	5046	5051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387125908
51	NC_017857	GTT	2	6	5064	5069	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387125908
52	NC_017857	GTT	2	6	5118	5123	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387125908
53	NC_017857	TAA	2	6	5526	5531	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387125909
54	NC_017857	ATA	2	6	5682	5687	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387125909
55	NC_017857	GTT	3	9	5888	5896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387125909
56	NC_017857	TTA	2	6	5921	5926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387125910
57	NC_017857	TTG	2	6	5930	5935	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387125910
58	NC_017857	TTC	2	6	5957	5962	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387125910
59	NC_017857	AAT	2	6	6485	6490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387125910
60	NC_017857	CAG	2	6	6512	6517	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387125910
61	NC_017857	AAG	2	6	6614	6619	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387125911
62	NC_017857	CAT	2	6	6767	6772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387125911
63	NC_017857	CGA	2	6	6787	6792	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387125911
64	NC_017857	CCA	2	6	6931	6936	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387125911
65	NC_017857	TGG	2	6	7042	7047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387125912
66	NC_017857	GCA	2	6	7143	7148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387125912
67	NC_017857	AAT	2	6	7187	7192	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387125912
68	NC_017857	CAA	2	6	7196	7201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387125912
69	NC_017857	CGT	2	6	7320	7325	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387125912
70	NC_017857	GTT	2	6	7521	7526	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387125912
71	NC_017857	ACA	2	6	7627	7632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387125912
72	NC_017857	CTT	2	6	7633	7638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387125912
73	NC_017857	ACC	2	6	7641	7646	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387125912
74	NC_017857	CAT	2	6	7681	7686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387125912
75	NC_017857	TGC	2	6	7709	7714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387125912
76	NC_017857	ATA	2	6	7782	7787	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387125912
77	NC_017857	GGA	2	6	7815	7820	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387125912
78	NC_017857	CTT	2	6	7846	7851	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387125912
79	NC_017857	CAA	2	6	7870	7875	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387125912
80	NC_017857	CAC	2	6	7895	7900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387125912
81	NC_017857	TCA	3	9	7956	7964	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387125912
82	NC_017857	TAA	2	6	7981	7986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387125912
83	NC_017857	TGA	2	6	8025	8030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387125913
84	NC_017857	CGG	2	6	8085	8090	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387125913
85	NC_017857	CTT	2	6	8124	8129	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387125913
86	NC_017857	GCT	3	9	8140	8148	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387125913
87	NC_017857	TCG	2	6	8157	8162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387125913
88	NC_017857	TCA	2	6	8171	8176	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387125913
89	NC_017857	CTT	2	6	8196	8201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387125913
90	NC_017857	TAA	2	6	8223	8228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387125913
91	NC_017857	CTG	2	6	8235	8240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387125913
92	NC_017857	ATA	2	6	8385	8390	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387125913
93	NC_017857	AGT	2	6	8401	8406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387125913
94	NC_017857	CGG	2	6	8554	8559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387125913
95	NC_017857	ATA	2	6	8570	8575	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387125913
96	NC_017857	GAC	2	6	8586	8591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387125913
97	NC_017857	ATC	2	6	8594	8599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387125913
98	NC_017857	TCC	2	6	8610	8615	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387125914
99	NC_017857	CGA	3	9	8617	8625	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387125914
100	NC_017857	CTT	2	6	8732	8737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387125914
101	NC_017857	CAT	2	6	8757	8762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387125914
102	NC_017857	ATG	2	6	9079	9084	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387125914
103	NC_017857	TCA	2	6	9174	9179	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387125915
104	NC_017857	CAT	2	6	9211	9216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387125915
105	NC_017857	TTC	2	6	9221	9226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387125915
106	NC_017857	TCT	2	6	9363	9368	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387125915
107	NC_017857	TCT	2	6	9414	9419	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387125915
108	NC_017857	ATA	2	6	9480	9485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387125915
109	NC_017857	CCG	2	6	9534	9539	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387125915
110	NC_017857	TTC	2	6	9647	9652	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387125915
111	NC_017857	CAC	2	6	9679	9684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387125915
112	NC_017857	TGC	2	6	9721	9726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387125915
113	NC_017857	GCA	2	6	9744	9749	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387125915
114	NC_017857	GCC	2	6	9779	9784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387125915
115	NC_017857	ATA	2	6	9970	9975	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387125916
116	NC_017857	TCA	2	6	10133	10138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387125916
117	NC_017857	TAA	2	6	10309	10314	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387125916
118	NC_017857	CAT	2	6	10357	10362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387125916
119	NC_017857	ATG	2	6	10414	10419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387125916
120	NC_017857	TTC	2	6	10465	10470	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387125916
121	NC_017857	CCA	2	6	10500	10505	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387125916
122	NC_017857	ACC	2	6	10604	10609	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387125916
123	NC_017857	TTG	2	6	10951	10956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387125917
124	NC_017857	ACT	2	6	10985	10990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387125917
125	NC_017857	CTT	2	6	11064	11069	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387125917
126	NC_017857	AGA	2	6	11236	11241	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387125917
127	NC_017857	CTT	2	6	11283	11288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387125917
128	NC_017857	CTG	2	6	11326	11331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387125917
129	NC_017857	TAA	2	6	11536	11541	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387125917
130	NC_017857	ATC	2	6	11546	11551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387125917
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