MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Methylophaga sp. JAM1 chromosome

Total Repeats: 37216

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_017857	TTG	2	6	420729	420734	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387126310
5002	NC_017857	AGC	2	6	420752	420757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126310
5003	NC_017857	GTG	2	6	420857	420862	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387126310
5004	NC_017857	ATC	3	9	420892	420900	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126310
5005	NC_017857	CCT	2	6	420927	420932	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	387126310
5006	NC_017857	CAT	2	6	421098	421103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126310
5007	NC_017857	AAG	2	6	421109	421114	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387126310
5008	NC_017857	GGC	2	6	421115	421120	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387126310
5009	NC_017857	CAT	2	6	421131	421136	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126310
5010	NC_017857	TGC	2	6	421201	421206	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126310
5011	NC_017857	TCA	2	6	421232	421237	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126310
5012	NC_017857	CAA	2	6	421287	421292	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387126310
5013	NC_017857	CCA	2	6	421428	421433	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387126310
5014	NC_017857	CAG	2	6	421458	421463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126310
5015	NC_017857	GAC	2	6	421518	421523	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126310
5016	NC_017857	ACC	2	6	421562	421567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387126310
5017	NC_017857	CAT	2	6	421594	421599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126310
5018	NC_017857	TGA	2	6	421710	421715	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126310
5019	NC_017857	GCC	2	6	421784	421789	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387126310
5020	NC_017857	TAA	2	6	421818	421823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387126310
5021	NC_017857	GGA	2	6	421834	421839	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387126310
5022	NC_017857	TTC	2	6	421870	421875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387126310
5023	NC_017857	ATC	2	6	422247	422252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126311
5024	NC_017857	AGG	2	6	422360	422365	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387126311
5025	NC_017857	TCA	2	6	422371	422376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126311
5026	NC_017857	TGA	2	6	422381	422386	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126311
5027	NC_017857	GTA	2	6	422414	422419	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126311
5028	NC_017857	TCA	2	6	422425	422430	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126311
5029	NC_017857	CTT	2	6	422447	422452	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387126311
5030	NC_017857	TTA	2	6	422524	422529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387126311
5031	NC_017857	TCA	2	6	422747	422752	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126311
5032	NC_017857	GCA	2	6	422809	422814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126311
5033	NC_017857	TTG	2	6	423100	423105	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387126313
5034	NC_017857	CAG	2	6	423225	423230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126313
5035	NC_017857	CAA	2	6	423336	423341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387126313
5036	NC_017857	TGC	3	9	423395	423403	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126313
5037	NC_017857	ATG	2	6	423598	423603	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126313
5038	NC_017857	ATT	2	6	423630	423635	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387126313
5039	NC_017857	ATA	2	6	423685	423690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387126313
5040	NC_017857	GCT	2	6	423821	423826	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126313
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5042	NC_017857	TTG	2	6	423921	423926	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387126313
5043	NC_017857	TCA	2	6	423993	423998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126313
5044	NC_017857	GTG	2	6	424106	424111	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387126313
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5046	NC_017857	ATG	2	6	424174	424179	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126313
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5050	NC_017857	TGG	2	6	424297	424302	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387126313
5051	NC_017857	CAT	2	6	424484	424489	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126313
5052	NC_017857	ATG	3	9	424504	424512	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126313
5053	NC_017857	TGA	2	6	424624	424629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126313
5054	NC_017857	GCA	2	6	424694	424699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126313
5055	NC_017857	GAT	2	6	424839	424844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126313
5056	NC_017857	TTA	2	6	424887	424892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387126313
5057	NC_017857	TGG	2	6	424955	424960	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387126313
5058	NC_017857	CGA	2	6	424961	424966	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126313
5059	NC_017857	AGC	2	6	425011	425016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126313
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5061	NC_017857	TGC	2	6	425137	425142	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126313
5062	NC_017857	CAG	2	6	425220	425225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126313
5063	NC_017857	CAT	2	6	425238	425243	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126313
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5089	NC_017857	GAG	2	6	427453	427458	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387126314
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