MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Methylophaga sp. JAM1 chromosome

Total Repeats: 37216

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_017857	GAG	2	6	125283	125288	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387126023
1502	NC_017857	TAA	2	6	125322	125327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387126023
1503	NC_017857	GGC	2	6	125419	125424	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387126023
1504	NC_017857	GAT	2	6	125446	125451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126023
1505	NC_017857	AAT	2	6	125485	125490	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387126023
1506	NC_017857	AAT	2	6	125509	125514	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387126023
1507	NC_017857	CAA	2	6	125550	125555	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387126023
1508	NC_017857	CGG	2	6	125565	125570	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387126023
1509	NC_017857	ACC	2	6	125578	125583	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387126023
1510	NC_017857	CGC	2	6	125592	125597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387126023
1511	NC_017857	AGC	2	6	125659	125664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126023
1512	NC_017857	TAA	2	6	125668	125673	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387126023
1513	NC_017857	CAT	2	6	125680	125685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126023
1514	NC_017857	ATG	2	6	125732	125737	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126023
1515	NC_017857	CAG	2	6	125784	125789	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126023
1516	NC_017857	ACC	2	6	125902	125907	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387126023
1517	NC_017857	CGG	2	6	125913	125918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387126023
1518	NC_017857	ATT	2	6	125935	125940	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387126023
1519	NC_017857	ACC	2	6	125947	125952	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387126023
1520	NC_017857	GCA	2	6	125981	125986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126023
1521	NC_017857	TGC	2	6	126240	126245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126024
1522	NC_017857	CAG	2	6	126247	126252	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126024
1523	NC_017857	GAT	2	6	126443	126448	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126024
1524	NC_017857	CGG	2	6	126478	126483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387126024
1525	NC_017857	ATG	2	6	126495	126500	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126024
1526	NC_017857	GCA	2	6	126683	126688	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126024
1527	NC_017857	ACC	2	6	126716	126721	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387126024
1528	NC_017857	TTA	2	6	126833	126838	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387126024
1529	NC_017857	GAT	2	6	126865	126870	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126024
1530	NC_017857	ATT	2	6	126887	126892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387126024
1531	NC_017857	ACC	2	6	126914	126919	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387126024
1532	NC_017857	CGG	2	6	127003	127008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387126024
1533	NC_017857	TGC	2	6	127023	127028	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126024
1534	NC_017857	TTG	2	6	127053	127058	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387126024
1535	NC_017857	CAA	2	6	127124	127129	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387126024
1536	NC_017857	CAG	2	6	127154	127159	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126024
1537	NC_017857	CGT	2	6	127177	127182	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126024
1538	NC_017857	GCT	2	6	127192	127197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126024
1539	NC_017857	ATT	2	6	127294	127299	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387126024
1540	NC_017857	ATT	2	6	127334	127339	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387126024
1541	NC_017857	CTG	2	6	127358	127363	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126024
1542	NC_017857	CTG	2	6	127487	127492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126024
1543	NC_017857	TGA	2	6	127494	127499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126024
1544	NC_017857	CAA	2	6	127522	127527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387126024
1545	NC_017857	GCG	2	6	127623	127628	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387126024
1546	NC_017857	ACA	2	6	127676	127681	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387126024
1547	NC_017857	GGA	2	6	127723	127728	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	387126024
1548	NC_017857	GAC	2	6	127816	127821	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126024
1549	NC_017857	TGT	2	6	127947	127952	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387126024
1550	NC_017857	CTG	2	6	127977	127982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126024
1551	NC_017857	GCC	2	6	128009	128014	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387126024
1552	NC_017857	TTA	2	6	128184	128189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387126025
1553	NC_017857	TTG	2	6	128228	128233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387126025
1554	NC_017857	CCA	2	6	128262	128267	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387126025
1555	NC_017857	GCA	2	6	128375	128380	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126025
1556	NC_017857	TCG	2	6	128503	128508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126025
1557	NC_017857	CAA	2	6	128522	128527	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387126025
1558	NC_017857	AAC	2	6	128610	128615	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387126025
1559	NC_017857	GAA	2	6	128714	128719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387126026
1560	NC_017857	CAA	3	9	128756	128764	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387126026
1561	NC_017857	TGC	2	6	128770	128775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126026
1562	NC_017857	GCA	2	6	128792	128797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126026
1563	NC_017857	CAG	3	9	128841	128849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126026
1564	NC_017857	CAA	2	6	128850	128855	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387126026
1565	NC_017857	TCT	2	6	128858	128863	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387126026
1566	NC_017857	GCT	2	6	128930	128935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126026
1567	NC_017857	CAG	2	6	128951	128956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126026
1568	NC_017857	CAT	2	6	128980	128985	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126026
1569	NC_017857	AAT	2	6	129099	129104	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387126026
1570	NC_017857	ACA	2	6	129153	129158	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387126027
1571	NC_017857	TGA	2	6	129292	129297	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126027
1572	NC_017857	GCC	2	6	129362	129367	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387126027
1573	NC_017857	ATG	2	6	129491	129496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126027
1574	NC_017857	ATC	2	6	129626	129631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126027
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1576	NC_017857	CGT	2	6	129857	129862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126027
1577	NC_017857	GTC	2	6	129872	129877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126027
1578	NC_017857	GAA	2	6	129878	129883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387126027
1579	NC_017857	GTG	2	6	129966	129971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387126027
1580	NC_017857	CAT	2	6	130138	130143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126027
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1582	NC_017857	GGT	2	6	130454	130459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387126027
1583	NC_017857	GCA	2	6	130545	130550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126028
1584	NC_017857	CTG	2	6	130714	130719	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126028
1585	NC_017857	ATC	2	6	130754	130759	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126028
1586	NC_017857	GCC	2	6	130863	130868	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387126028
1587	NC_017857	CTG	2	6	130891	130896	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126028
1588	NC_017857	ACA	2	6	130933	130938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387126028
1589	NC_017857	GCC	3	9	131026	131034	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387126028
1590	NC_017857	CTG	2	6	131035	131040	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387126028
1591	NC_017857	ATC	2	6	131122	131127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126028
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1594	NC_017857	TGG	2	6	131493	131498	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387126029
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1598	NC_017857	ATT	2	6	131663	131668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387126029
1599	NC_017857	AAT	2	6	131825	131830	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387126029
1600	NC_017857	TTG	2	6	132014	132019	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387126029
1601	NC_017857	ACA	2	6	132025	132030	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387126029
1602	NC_017857	TGA	2	6	132048	132053	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126029
1603	NC_017857	CAG	2	6	132089	132094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126029
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1605	NC_017857	CAA	2	6	132278	132283	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387126029
1606	NC_017857	ACG	2	6	132386	132391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387126030
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1609	NC_017857	TGA	2	6	132527	132532	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387126030
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1614	NC_017857	ACT	2	6	132779	132784	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387126031
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1616	NC_017857	AAG	2	6	132835	132840	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387126031
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1618	NC_017857	TGG	2	6	132908	132913	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387126031
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