MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Methylophaga sp. JAM1 chromosome

Total Repeats: 37216

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_017857	CAG	2	6	41809	41814	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387125941
502	NC_017857	CTG	2	6	41833	41838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387125941
503	NC_017857	TGG	2	6	41966	41971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387125941
504	NC_017857	TTC	2	6	41987	41992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	387125941
505	NC_017857	CGA	2	6	42024	42029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387125941
506	NC_017857	ACA	2	6	42048	42053	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387125941
507	NC_017857	GTC	2	6	42097	42102	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387125941
508	NC_017857	TGA	2	6	42114	42119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387125941
509	NC_017857	ATA	2	6	42185	42190	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387125941
510	NC_017857	TGT	2	6	42288	42293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387125941
511	NC_017857	TTG	2	6	42403	42408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387125941
512	NC_017857	CAG	2	6	42424	42429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387125941
513	NC_017857	CCA	2	6	42600	42605	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387125941
514	NC_017857	GTG	2	6	42629	42634	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387125941
515	NC_017857	AAC	2	6	42816	42821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387125941
516	NC_017857	GAA	2	6	42859	42864	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387125941
517	NC_017857	GAT	2	6	42892	42897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387125941
518	NC_017857	GTG	2	6	42952	42957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387125941
519	NC_017857	ATT	2	6	43066	43071	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387125941
520	NC_017857	GAT	2	6	43192	43197	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387125941
521	NC_017857	ATT	2	6	43204	43209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387125941
522	NC_017857	ACA	2	6	43218	43223	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387125941
523	NC_017857	GCA	2	6	43327	43332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387125942
524	NC_017857	TGT	2	6	43338	43343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387125942
525	NC_017857	CAA	2	6	43487	43492	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387125942
526	NC_017857	CTG	2	6	43570	43575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387125942
527	NC_017857	GCA	2	6	43844	43849	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387125943
528	NC_017857	AGC	2	6	44011	44016	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387125943
529	NC_017857	CAA	2	6	44105	44110	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387125943
530	NC_017857	GCA	2	6	44113	44118	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387125943
531	NC_017857	CAA	2	6	44195	44200	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387125943
532	NC_017857	GCT	3	9	44204	44212	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387125943
533	NC_017857	TCA	2	6	44275	44280	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387125943
534	NC_017857	AAC	2	6	44286	44291	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387125943
535	NC_017857	GCT	2	6	44326	44331	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387125943
536	NC_017857	ATT	2	6	44528	44533	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387125943
537	NC_017857	TGA	2	6	44623	44628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387125943
538	NC_017857	GCA	2	6	44646	44651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387125943
539	NC_017857	TAT	2	6	44693	44698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387125943
540	NC_017857	ATC	2	6	44715	44720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387125943
541	NC_017857	GCA	2	6	44746	44751	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387125943
542	NC_017857	TGG	2	6	44889	44894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387125943
543	NC_017857	ATT	2	6	44904	44909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387125943
544	NC_017857	GCA	2	6	44921	44926	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387125943
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546	NC_017857	TTG	2	6	45114	45119	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387125943
547	NC_017857	ATC	2	6	45420	45425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387125943
548	NC_017857	CGT	2	6	45461	45466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387125943
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551	NC_017857	GTT	2	6	45800	45805	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387125944
552	NC_017857	GCA	2	6	45810	45815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387125944
553	NC_017857	GAA	2	6	45893	45898	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387125944
554	NC_017857	AGA	3	9	45979	45987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	387125944
555	NC_017857	CAA	2	6	46078	46083	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	387125944
556	NC_017857	TTG	2	6	46110	46115	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387125944
557	NC_017857	TGC	2	6	46150	46155	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387125944
558	NC_017857	TGA	2	6	46177	46182	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387125944
559	NC_017857	GAT	2	6	46204	46209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387125944
560	NC_017857	TTA	2	6	46271	46276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387125944
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562	NC_017857	GAT	2	6	46448	46453	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	387125944
563	NC_017857	GGT	2	6	46471	46476	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	387125944
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565	NC_017857	CAG	2	6	46600	46605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387125944
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570	NC_017857	GTT	2	6	47158	47163	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387125945
571	NC_017857	CGG	2	6	47184	47189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	387125945
572	NC_017857	GCA	2	6	47252	47257	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387125945
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575	NC_017857	ACC	2	6	47575	47580	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387125945
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582	NC_017857	ATT	2	6	48471	48476	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387125946
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587	NC_017857	TGC	2	6	48873	48878	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	387125946
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593	NC_017857	TAT	3	9	49188	49196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	387125947
594	NC_017857	CCA	2	6	49363	49368	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	387125947
595	NC_017857	AAT	2	6	49442	49447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387125947
596	NC_017857	CTA	2	6	49544	49549	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387125947
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607	NC_017857	GTT	2	6	50409	50414	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	387125948
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609	NC_017857	CGC	2	6	50624	50629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	387125949
610	NC_017857	TCA	2	6	50716	50721	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	387125949
611	NC_017857	ATA	2	6	50803	50808	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387125949
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615	NC_017857	ATA	2	6	51507	51512	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	387125951
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622	NC_017857	CAG	2	6	51983	51988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	387125951
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