MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Methanotorris igneus Kol 5 chromosome

Total Repeats: 23954

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_015562	GAA	2	6	232652	232657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333910116
3002	NC_015562	AAT	2	6	232673	232678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333910116
3003	NC_015562	TAA	2	6	232786	232791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333910116
3004	NC_015562	CAT	2	6	232878	232883	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333910116
3005	NC_015562	ATT	2	6	232969	232974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333910116
3006	NC_015562	ATA	2	6	233130	233135	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333910116
3007	NC_015562	ATC	2	6	233146	233151	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333910116
3008	NC_015562	TAA	2	6	233199	233204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333910116
3009	NC_015562	ACA	2	6	233217	233222	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333910116
3010	NC_015562	TAA	2	6	233238	233243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333910116
3011	NC_015562	GAG	2	6	233264	233269	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333910116
3012	NC_015562	TTA	2	6	233302	233307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333910116
3013	NC_015562	TGA	2	6	233365	233370	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333910116
3014	NC_015562	AAT	3	9	233566	233574	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333910116
3015	NC_015562	TAA	2	6	233593	233598	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333910116
3016	NC_015562	AGA	2	6	233599	233604	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333910116
3017	NC_015562	TTA	2	6	233785	233790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333910117
3018	NC_015562	ATG	3	9	233798	233806	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333910117
3019	NC_015562	ACT	2	6	233837	233842	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333910117
3020	NC_015562	GTT	2	6	234097	234102	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333910117
3021	NC_015562	TGC	2	6	234189	234194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333910117
3022	NC_015562	AAG	2	6	234201	234206	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333910117
3023	NC_015562	ATC	2	6	234230	234235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333910117
3024	NC_015562	GAT	2	6	234252	234257	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333910117
3025	NC_015562	AAT	2	6	234414	234419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333910117
3026	NC_015562	GAA	2	6	234522	234527	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333910117
3027	NC_015562	AAT	2	6	234760	234765	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333910118
3028	NC_015562	CAT	2	6	234769	234774	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333910118
3029	NC_015562	TAA	2	6	234837	234842	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333910118
3030	NC_015562	ATG	2	6	234924	234929	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333910118
3031	NC_015562	ATA	2	6	234983	234988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333910118
3032	NC_015562	TTA	2	6	235055	235060	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333910118
3033	NC_015562	CCA	2	6	235071	235076	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	333910118
3034	NC_015562	ATT	2	6	235142	235147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333910118
3035	NC_015562	TCT	2	6	235265	235270	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333910118
3036	NC_015562	GAT	2	6	235340	235345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333910118
3037	NC_015562	AGG	2	6	235447	235452	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333910118
3038	NC_015562	ATT	2	6	235518	235523	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333910118
3039	NC_015562	ATT	2	6	235648	235653	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333910118
3040	NC_015562	AAG	2	6	235715	235720	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333910118
3041	NC_015562	ATT	2	6	235870	235875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333910119
3042	NC_015562	AAG	2	6	236001	236006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333910119
3043	NC_015562	TTG	2	6	236033	236038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333910119
3044	NC_015562	GAG	2	6	236059	236064	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333910119
3045	NC_015562	TTA	2	6	236206	236211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333910119
3046	NC_015562	AGA	2	6	236220	236225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333910119
3047	NC_015562	AAT	2	6	236238	236243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333910119
3048	NC_015562	GAA	2	6	236518	236523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333910119
3049	NC_015562	GGA	2	6	236548	236553	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333910119
3050	NC_015562	ATG	2	6	236630	236635	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333910119
3051	NC_015562	CTT	2	6	236655	236660	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333910119
3052	NC_015562	AGG	2	6	236672	236677	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333910119
3053	NC_015562	AAG	2	6	236696	236701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333910119
3054	NC_015562	AAG	2	6	236925	236930	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333910120
3055	NC_015562	AAT	2	6	236939	236944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333910120
3056	NC_015562	ATT	2	6	237018	237023	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333910120
3057	NC_015562	TGT	2	6	237047	237052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333910120
3058	NC_015562	GAG	2	6	237117	237122	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333910120
3059	NC_015562	TAA	2	6	237163	237168	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333910120
3060	NC_015562	ATT	2	6	237180	237185	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333910120
3061	NC_015562	AAT	2	6	237305	237310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333910120
3062	NC_015562	AGA	2	6	237328	237333	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333910120
3063	NC_015562	ATT	2	6	237379	237384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333910120
3064	NC_015562	TCT	2	6	237432	237437	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333910120
3065	NC_015562	TAG	2	6	237502	237507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333910120
3066	NC_015562	AGG	2	6	237614	237619	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333910120
3067	NC_015562	TAA	3	9	237631	237639	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333910120
3068	NC_015562	AGA	2	6	237728	237733	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333910120
3069	NC_015562	GAA	2	6	237741	237746	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333910120
3070	NC_015562	ATA	2	6	237768	237773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333910120
3071	NC_015562	ATT	2	6	238007	238012	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333910121
3072	NC_015562	GAT	2	6	238025	238030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333910121
3073	NC_015562	AAT	2	6	238084	238089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333910121
3074	NC_015562	ATG	2	6	238161	238166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333910121
3075	NC_015562	AGA	2	6	238198	238203	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333910121
3076	NC_015562	TAA	2	6	238221	238226	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333910121
3077	NC_015562	TAA	2	6	238233	238238	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333910121
3078	NC_015562	AAC	2	6	238368	238373	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333910121
3079	NC_015562	ATT	2	6	238379	238384	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333910121
3080	NC_015562	AGA	2	6	238398	238403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333910121
3081	NC_015562	TCT	2	6	238502	238507	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333910121
3082	NC_015562	TGA	2	6	238576	238581	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333910121
3083	NC_015562	AGG	2	6	238684	238689	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333910121
3084	NC_015562	TTA	2	6	238713	238718	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333910121
3085	NC_015562	ATG	2	6	238767	238772	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333910121
3086	NC_015562	ATT	2	6	238809	238814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333910121
3087	NC_015562	AAG	2	6	238842	238847	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333910121
3088	NC_015562	ATT	2	6	238885	238890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333910121
3089	NC_015562	AAG	2	6	238952	238957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333910121
3090	NC_015562	AAG	2	6	239092	239097	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333910122
3091	NC_015562	GAT	2	6	239125	239130	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333910122
3092	NC_015562	AAT	2	6	239184	239189	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333910122
3093	NC_015562	GAT	2	6	239263	239268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333910122
3094	NC_015562	GAA	2	6	239287	239292	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333910122
3095	NC_015562	TAA	2	6	239321	239326	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333910122
3096	NC_015562	TTA	2	6	239443	239448	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333910122
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3099	NC_015562	CTT	2	6	239526	239531	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333910122
3100	NC_015562	AGG	2	6	239784	239789	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333910122
3101	NC_015562	ATG	2	6	239867	239872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333910122
3102	NC_015562	CTT	2	6	239892	239897	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333910122
3103	NC_015562	AGA	2	6	239898	239903	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333910122
3104	NC_015562	GAA	2	6	239920	239925	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333910122
3105	NC_015562	TCA	2	6	240200	240205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333910123
3106	NC_015562	TCG	2	6	240266	240271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333910123
3107	NC_015562	AGA	3	9	240522	240530	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333910124
3108	NC_015562	TGA	3	9	240570	240578	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333910124
3109	NC_015562	AAT	2	6	240592	240597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333910124
3110	NC_015562	ATT	2	6	240685	240690	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333910124
3111	NC_015562	GAG	2	6	240700	240705	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333910124
3112	NC_015562	TAT	2	6	240903	240908	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333910124
3113	NC_015562	TTA	2	6	240945	240950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333910124
3114	NC_015562	GAG	2	6	240964	240969	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	333910124
3115	NC_015562	GCT	2	6	241120	241125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	333910124
3116	NC_015562	AAG	2	6	241213	241218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333910124
3117	NC_015562	AGA	2	6	241224	241229	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333910124
3118	NC_015562	GTG	2	6	241301	241306	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333910124
3119	NC_015562	GTT	2	6	241324	241329	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333910124
3120	NC_015562	ATG	2	6	241397	241402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333910124
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3361	NC_015562	TTC	2	6	257324	257329	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333910142
3362	NC_015562	TTA	2	6	257391	257396	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333910143
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3481	NC_015562	ACT	2	6	266692	266697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	333910151
3482	NC_015562	GTA	2	6	266722	266727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	333910151
3483	NC_015562	AGA	2	6	266739	266744	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	333910151
3484	NC_015562	TTG	2	6	266750	266755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333910151
3485	NC_015562	TGT	2	6	266814	266819	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333910151
3486	NC_015562	ATA	2	6	266863	266868	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333910151
3487	NC_015562	TCT	2	6	267181	267186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333910152
3488	NC_015562	GTT	2	6	267201	267206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	333910152
3489	NC_015562	AAT	3	9	267210	267218	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333910152
3490	NC_015562	CTC	2	6	267345	267350	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	333910152
3491	NC_015562	AAC	2	6	267427	267432	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	333910152
3492	NC_015562	ATT	2	6	267529	267534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333910152
3493	NC_015562	TTC	2	6	267552	267557	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333910152
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3495	NC_015562	TTC	2	6	267663	267668	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333910152
3496	NC_015562	AAT	2	6	267748	267753	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	333910152
3497	NC_015562	TCT	2	6	267842	267847	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	333910152
3498	NC_015562	TAT	2	6	267998	268003	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	333910153
3499	NC_015562	TGG	2	6	268016	268021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	333910153
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