MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Mannheimia haemolytica USMARC_2286

Total Repeats: 1961

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021883	GCGGT	2	10	688663	688672	0 %	20 %	60 %	20 %	526468044
502	NC_021883	ATCTT	2	10	692646	692655	20 %	60 %	0 %	20 %	526468047
503	NC_021883	TTTAG	2	10	692670	692679	20 %	60 %	20 %	0 %	526468047
504	NC_021883	TTCGC	2	10	693661	693670	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
505	NC_021883	TCACT	2	10	695142	695151	20 %	40 %	0 %	40 %	526468051
506	NC_021883	AACCA	2	10	696807	696816	60 %	0 %	0 %	40 %	526468052
507	NC_021883	TAAAT	2	10	700196	700205	60 %	40 %	0 %	0 %	526468055
508	NC_021883	TTTCA	2	10	700639	700648	20 %	60 %	0 %	20 %	526468056
509	NC_021883	CTGTT	2	10	701026	701035	0 %	60 %	20 %	20 %	526468056
510	NC_021883	TTAAT	2	10	701187	701196	40 %	60 %	0 %	0 %	526468057
511	NC_021883	GCTTG	2	10	701809	701818	0 %	40 %	40 %	20 %	526468057
512	NC_021883	TCAAA	2	10	702097	702106	60 %	20 %	0 %	20 %	526468057
513	NC_021883	AACCC	2	10	704225	704234	40 %	0 %	0 %	60 %	526468060
514	NC_021883	CCAAT	2	10	705597	705606	40 %	20 %	0 %	40 %	526468061
515	NC_021883	AACAC	2	10	707640	707649	60 %	0 %	0 %	40 %	526468063
516	NC_021883	AAATG	2	10	709039	709048	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
517	NC_021883	ATTTA	2	10	710828	710837	40 %	60 %	0 %	0 %	526468066
518	NC_021883	ATCAC	2	10	711950	711959	40 %	20 %	0 %	40 %	526468067
519	NC_021883	CATCG	2	10	712279	712288	20 %	20 %	20 %	40 %	526468067
520	NC_021883	CATCG	2	10	712321	712330	20 %	20 %	20 %	40 %	526468067
521	NC_021883	GGCTA	2	10	712924	712933	20 %	20 %	40 %	20 %	526468068
522	NC_021883	CAGTG	2	10	713994	714003	20 %	20 %	40 %	20 %	526468068
523	NC_021883	CTTCA	2	10	714312	714321	20 %	40 %	0 %	40 %	526468068
524	NC_021883	GGTTC	2	10	714827	714836	0 %	40 %	40 %	20 %	526468068
525	NC_021883	GGCGT	2	10	717567	717576	0 %	20 %	60 %	20 %	526468070
526	NC_021883	GTTTA	2	10	717946	717955	20 %	60 %	20 %	0 %	526468071
527	NC_021883	CCAAT	2	10	718191	718200	40 %	20 %	0 %	40 %	526468072
528	NC_021883	GTATG	2	10	718959	718968	20 %	40 %	40 %	0 %	526468072
529	NC_021883	AATTC	2	10	719119	719128	40 %	40 %	0 %	20 %	526468072
530	NC_021883	CATAT	2	10	719454	719463	40 %	40 %	0 %	20 %	526468072
531	NC_021883	TTTCC	2	10	719498	719507	0 %	60 %	0 %	40 %	526468072
532	NC_021883	TTTTG	2	10	719587	719596	0 %	80 %	20 %	0 %	526468072
533	NC_021883	ATTTA	2	10	719931	719940	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
534	NC_021883	AAATC	2	10	720557	720566	60 %	20 %	0 %	20 %	526468074
535	NC_021883	TTGCC	2	10	721557	721566	0 %	40 %	20 %	40 %	526468075
536	NC_021883	GCGGT	2	10	723814	723823	0 %	20 %	60 %	20 %	526468077
537	NC_021883	TGCCT	2	10	725639	725648	0 %	40 %	20 %	40 %	526468079
538	NC_021883	GTGAT	2	10	725755	725764	20 %	40 %	40 %	0 %	526468079
539	NC_021883	CCGCC	2	10	728557	728566	0 %	0 %	20 %	80 %	526468080
540	NC_021883	TGCCG	2	10	731681	731690	0 %	20 %	40 %	40 %	526468082
541	NC_021883	GGTTG	2	10	739169	739178	0 %	40 %	60 %	0 %	526468089
542	NC_021883	GTAGC	2	10	739470	739479	20 %	20 %	40 %	20 %	526468089
543	NC_021883	TATTT	2	10	740110	740119	20 %	80 %	0 %	0 %	526468090
544	NC_021883	TTTTG	2	10	740723	740732	0 %	80 %	20 %	0 %	526468090
545	NC_021883	GGCAA	2	10	741704	741713	40 %	0 %	40 %	20 %	526468092
546	NC_021883	AACTC	2	10	742521	742530	40 %	20 %	0 %	40 %	526468093
547	NC_021883	TAATT	2	10	744032	744041	40 %	60 %	0 %	0 %	526468095
548	NC_021883	ATAAA	2	10	745076	745085	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
549	NC_021883	GCTCG	2	10	746008	746017	0 %	20 %	40 %	40 %	526468097
550	NC_021883	AGCGT	2	10	746240	746249	20 %	20 %	40 %	20 %	526468097
551	NC_021883	CGGTG	2	10	746672	746681	0 %	20 %	60 %	20 %	526468098
552	NC_021883	TGAAG	2	10	747212	747221	40 %	20 %	40 %	0 %	526468098
553	NC_021883	GTCAA	2	10	748230	748239	40 %	20 %	20 %	20 %	526468099
554	NC_021883	TAGCA	2	10	748352	748361	40 %	20 %	20 %	20 %	526468099
555	NC_021883	TACGA	2	10	749906	749915	40 %	20 %	20 %	20 %	526468100
556	NC_021883	CTTTT	2	10	751113	751122	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
557	NC_021883	TTTAG	2	10	751151	751160	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
558	NC_021883	TTTCA	2	10	754057	754066	20 %	60 %	0 %	20 %	526468104
559	NC_021883	CAATC	2	10	754458	754467	40 %	20 %	0 %	40 %	526468105
560	NC_021883	GTAAT	2	10	756394	756403	40 %	40 %	20 %	0 %	526468108
561	NC_021883	TAAAT	2	10	757255	757264	60 %	40 %	0 %	0 %	526468108
562	NC_021883	GAAAT	2	10	758449	758458	60 %	20 %	20 %	0 %	526467266
563	NC_021883	AAGCC	2	10	760297	760306	40 %	0 %	20 %	40 %	526468110
564	NC_021883	TGAAA	2	10	761455	761464	60 %	20 %	20 %	0 %	526468111
565	NC_021883	ATTGT	2	10	761523	761532	20 %	60 %	20 %	0 %	526468111
566	NC_021883	AAATG	2	10	763297	763306	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
567	NC_021883	CCGAT	2	10	764117	764126	20 %	20 %	20 %	40 %	526468116
568	NC_021883	TGGTG	2	10	765899	765908	0 %	40 %	60 %	0 %	526468118
569	NC_021883	TCCAA	2	10	766873	766882	40 %	20 %	0 %	40 %	526468119
570	NC_021883	ATTGC	2	10	772890	772899	20 %	40 %	20 %	20 %	526468124
571	NC_021883	ATTGC	2	10	772932	772941	20 %	40 %	20 %	20 %	526468124
572	NC_021883	GGTTG	2	10	773472	773481	0 %	40 %	60 %	0 %	526468125
573	NC_021883	ATTGC	2	10	774792	774801	20 %	40 %	20 %	20 %	526468126
574	NC_021883	TGGTT	2	10	776149	776158	0 %	60 %	40 %	0 %	526468127
575	NC_021883	TATCT	2	10	776620	776629	20 %	60 %	0 %	20 %	526468127
576	NC_021883	CATTG	2	10	782285	782294	20 %	40 %	20 %	20 %	526468133
577	NC_021883	ACCGC	2	10	783704	783713	20 %	0 %	20 %	60 %	526468134
578	NC_021883	GGTGG	2	10	784731	784740	0 %	20 %	80 %	0 %	526468136
579	NC_021883	AAACT	2	10	784984	784993	60 %	20 %	0 %	20 %	526468136
580	NC_021883	CGTGC	2	10	785450	785459	0 %	20 %	40 %	40 %	526468136
581	NC_021883	TTTTG	2	10	786486	786495	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
582	NC_021883	AAGGT	2	10	789204	789213	40 %	20 %	40 %	0 %	526468140
583	NC_021883	GCACC	2	10	789313	789322	20 %	0 %	20 %	60 %	526468140
584	NC_021883	GCTGG	2	10	789899	789908	0 %	20 %	60 %	20 %	526468140
585	NC_021883	CTTGC	2	10	789962	789971	0 %	40 %	20 %	40 %	526468140
586	NC_021883	TAAAA	2	10	794670	794679	80 %	20 %	0 %	0 %	526468147
587	NC_021883	TTTAA	2	10	794851	794860	40 %	60 %	0 %	0 %	526468147
588	NC_021883	ATTGA	2	10	798290	798299	40 %	40 %	20 %	0 %	526468150
589	NC_021883	ATTTT	2	10	800778	800787	20 %	80 %	0 %	0 %	526468154
590	NC_021883	CAAAT	2	10	801129	801138	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
591	NC_021883	GTTAA	2	10	801148	801157	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
592	NC_021883	AATTT	2	10	801233	801242	40 %	60 %	0 %	0 %	526468155
593	NC_021883	ATAGC	2	10	801348	801357	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
594	NC_021883	CTTGT	2	10	801845	801854	0 %	60 %	20 %	20 %	526468156
595	NC_021883	AGTAG	2	10	803280	803289	40 %	20 %	40 %	0 %	526468157
596	NC_021883	AGATA	2	10	807614	807623	60 %	20 %	20 %	0 %	526468159
597	NC_021883	TTTGG	2	10	809115	809124	0 %	60 %	40 %	0 %	526468162
598	NC_021883	CTGAA	2	10	811289	811298	40 %	20 %	20 %	20 %	526468163
599	NC_021883	GGGCA	2	10	813088	813097	20 %	0 %	60 %	20 %	526468165
600	NC_021883	TCGGC	2	10	813160	813169	0 %	20 %	40 %	40 %	526468165
601	NC_021883	GGTGT	2	10	814062	814071	0 %	40 %	60 %	0 %	526468165
602	NC_021883	TTGGT	2	10	814511	814520	0 %	60 %	40 %	0 %	526468166
603	NC_021883	GCCTT	2	10	815105	815114	0 %	40 %	20 %	40 %	526468166
604	NC_021883	GCAGA	2	10	818133	818142	40 %	0 %	40 %	20 %	526468169
605	NC_021883	AGGAC	2	10	819601	819610	40 %	0 %	40 %	20 %	526468169
606	NC_021883	GAGCA	2	10	819755	819764	40 %	0 %	40 %	20 %	526468169
607	NC_021883	TTCCG	2	10	821845	821854	0 %	40 %	20 %	40 %	526468173
608	NC_021883	GTGGA	2	10	823220	823229	20 %	20 %	60 %	0 %	526468174
609	NC_021883	TAAAT	2	10	823241	823250	60 %	40 %	0 %	0 %	526468174
610	NC_021883	ACCGG	2	10	826735	826744	20 %	0 %	40 %	40 %	526468180
611	NC_021883	AAATA	2	10	826956	826965	80 %	20 %	0 %	0 %	526468180
612	NC_021883	ATCCC	2	10	827012	827021	20 %	20 %	0 %	60 %	526468180
613	NC_021883	GCTTT	2	10	831799	831808	0 %	60 %	20 %	20 %	526468183
614	NC_021883	ATTTG	2	10	832151	832160	20 %	60 %	20 %	0 %	526468183
615	NC_021883	GATTT	2	10	832975	832984	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
616	NC_021883	GTTTT	2	10	833432	833441	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
617	NC_021883	CTGAT	2	10	834629	834638	20 %	40 %	20 %	20 %	526468186
618	NC_021883	AGCCA	2	10	836114	836123	40 %	0 %	20 %	40 %	526468187
619	NC_021883	AGCAG	2	10	837691	837700	40 %	0 %	40 %	20 %	526468188
620	NC_021883	CAGGG	2	10	839231	839240	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
621	NC_021883	CGAGC	2	10	839269	839278	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
622	NC_021883	CAAAC	2	10	839942	839951	60 %	0 %	0 %	40 %	526468189
623	NC_021883	ATCCA	2	10	843877	843886	40 %	20 %	0 %	40 %	526468193
624	NC_021883	TGATT	2	10	844097	844106	20 %	60 %	20 %	0 %	526468193
625	NC_021883	ACCAA	2	10	844784	844793	60 %	0 %	0 %	40 %	526468193
626	NC_021883	TGAAA	2	10	846011	846020	60 %	20 %	20 %	0 %	526468195
627	NC_021883	ATAAA	2	10	846615	846624	80 %	20 %	0 %	0 %	526468195
628	NC_021883	GGTGG	2	10	847778	847787	0 %	20 %	80 %	0 %	526468198
629	NC_021883	CGAGA	2	10	848700	848709	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
630	NC_021883	CAAAT	2	10	848836	848845	60 %	20 %	0 %	20 %	526468199
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