MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Mannheimia haemolytica D171

Total Repeats: 1876

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021738	AGTTG	2	10	71	80	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021738	GCAGA	2	10	2994	3003	40 %	0 %	40 %	20 %	525655725
3	NC_021738	ATTTT	2	10	3239	3248	20 %	80 %	0 %	0 %	525655725
4	NC_021738	TTTGC	2	10	4022	4031	0 %	60 %	20 %	20 %	525655725
5	NC_021738	AATTG	2	10	5469	5478	40 %	40 %	20 %	0 %	525655725
6	NC_021738	TCATA	2	10	5631	5640	40 %	40 %	0 %	20 %	525655725
7	NC_021738	GGTTC	2	10	6756	6765	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
8	NC_021738	ATTCA	2	10	9780	9789	40 %	40 %	0 %	20 %	525655727
9	NC_021738	CTGTA	2	10	9971	9980	20 %	40 %	20 %	20 %	525655727
10	NC_021738	AATAC	2	10	11515	11524	60 %	20 %	0 %	20 %	525655614
11	NC_021738	TGAAT	2	10	14809	14818	40 %	40 %	20 %	0 %	525655730
12	NC_021738	ATACC	2	10	15732	15741	40 %	20 %	0 %	40 %	525655730
13	NC_021738	AAATT	2	10	16545	16554	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021738	ATTTT	2	10	16648	16657	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021738	TTGGC	2	10	17425	17434	0 %	40 %	40 %	20 %	525655731
16	NC_021738	AGCTG	2	10	19633	19642	20 %	20 %	40 %	20 %	525655735
17	NC_021738	AAGTG	2	10	19936	19945	40 %	20 %	40 %	0 %	525655735
18	NC_021738	TTCAC	2	10	20606	20615	20 %	40 %	0 %	40 %	525655735
19	NC_021738	CTTAT	2	10	21078	21087	20 %	60 %	0 %	20 %	525655736
20	NC_021738	TTTTA	2	10	22325	22334	20 %	80 %	0 %	0 %	525655738
21	NC_021738	GTTTC	2	10	22654	22663	0 %	60 %	20 %	20 %	525655738
22	NC_021738	AATCC	2	10	24187	24196	40 %	20 %	0 %	40 %	525655739
23	NC_021738	GTTTC	2	10	24340	24349	0 %	60 %	20 %	20 %	525655739
24	NC_021738	GCAAC	2	10	25472	25481	40 %	0 %	20 %	40 %	525655741
25	NC_021738	GTGGC	2	10	27989	27998	0 %	20 %	60 %	20 %	525655743
26	NC_021738	TTAAA	2	10	33323	33332	60 %	40 %	0 %	0 %	525655745
27	NC_021738	AAACT	2	10	34319	34328	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_021738	CATTT	2	10	34670	34679	20 %	60 %	0 %	20 %	525655746
29	NC_021738	GTTTT	2	10	35104	35113	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021738	GTTTT	2	10	36761	36770	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021738	TTGCA	2	10	37973	37982	20 %	40 %	20 %	20 %	525655749
32	NC_021738	TAAAT	2	10	38070	38079	60 %	40 %	0 %	0 %	525655749
33	NC_021738	ATTAA	2	10	38465	38474	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021738	CCAAG	2	10	40769	40778	40 %	0 %	20 %	40 %	525655752
35	NC_021738	CGTTT	2	10	42354	42363	0 %	60 %	20 %	20 %	525655753
36	NC_021738	AATGA	2	10	42551	42560	60 %	20 %	20 %	0 %	525655753
37	NC_021738	ACCCA	2	10	42839	42848	40 %	0 %	0 %	60 %	525655753
38	NC_021738	AATCA	2	10	44006	44015	60 %	20 %	0 %	20 %	525655754
39	NC_021738	AGCAC	2	10	46952	46961	40 %	0 %	20 %	40 %	525655757
40	NC_021738	TAAGT	2	10	47011	47020	40 %	40 %	20 %	0 %	525655757
41	NC_021738	TAAAA	2	10	47590	47599	80 %	20 %	0 %	0 %	525655757
42	NC_021738	ACATC	2	10	48281	48290	40 %	20 %	0 %	40 %	525655758
43	NC_021738	GTAAT	2	10	48332	48341	40 %	40 %	20 %	0 %	525655758
44	NC_021738	AAATT	2	10	48956	48965	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_021738	ATAGA	2	10	49162	49171	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
46	NC_021738	CCGGC	2	10	49226	49235	0 %	0 %	40 %	60 %	525655759
47	NC_021738	ACCCA	2	10	52455	52464	40 %	0 %	0 %	60 %	525655761
48	NC_021738	TAAAT	2	10	54050	54059	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021738	AAATC	2	10	54558	54567	60 %	20 %	0 %	20 %	525655762
50	NC_021738	TCCAA	2	10	55353	55362	40 %	20 %	0 %	40 %	525655763
51	NC_021738	ATACC	2	10	56652	56661	40 %	20 %	0 %	40 %	525655764
52	NC_021738	TTTGG	2	10	57346	57355	0 %	60 %	40 %	0 %	525655765
53	NC_021738	TACCG	2	10	57589	57598	20 %	20 %	20 %	40 %	525655765
54	NC_021738	TAAGA	2	10	57627	57636	60 %	20 %	20 %	0 %	525655765
55	NC_021738	TTTAA	2	10	59622	59631	40 %	60 %	0 %	0 %	525655767
56	NC_021738	TCAAA	2	10	60380	60389	60 %	20 %	0 %	20 %	525655769
57	NC_021738	TCGCT	2	10	61354	61363	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
58	NC_021738	AAATG	2	10	62222	62231	60 %	20 %	20 %	0 %	525655771
59	NC_021738	GTTTT	2	10	62674	62683	0 %	80 %	20 %	0 %	525655771
60	NC_021738	CATAA	2	10	63464	63473	60 %	20 %	0 %	20 %	525655771
61	NC_021738	ATCTC	2	10	63732	63741	20 %	40 %	0 %	40 %	525655771
62	NC_021738	AAATC	2	10	63987	63996	60 %	20 %	0 %	20 %	525655771
63	NC_021738	ATTTA	2	10	64673	64682	40 %	60 %	0 %	0 %	525655771
64	NC_021738	ATTGC	2	10	65440	65449	20 %	40 %	20 %	20 %	525655771
65	NC_021738	ATTGT	2	10	65513	65522	20 %	60 %	20 %	0 %	525655771
66	NC_021738	TGTAA	2	10	71099	71108	40 %	40 %	20 %	0 %	525655776
67	NC_021738	GGATA	2	10	73741	73750	40 %	20 %	40 %	0 %	525655778
68	NC_021738	GGCAA	2	10	74306	74315	40 %	0 %	40 %	20 %	525655778
69	NC_021738	AAAGT	2	10	75608	75617	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021738	GCTTT	2	10	77129	77138	0 %	60 %	20 %	20 %	525655781
71	NC_021738	TAGAA	2	10	82048	82057	60 %	20 %	20 %	0 %	525655786
72	NC_021738	TTTGC	2	10	82191	82200	0 %	60 %	20 %	20 %	525655787
73	NC_021738	CGGTA	2	10	82513	82522	20 %	20 %	40 %	20 %	525655788
74	NC_021738	CTTCA	2	10	83179	83188	20 %	40 %	0 %	40 %	525655788
75	NC_021738	ACCGA	2	10	83417	83426	40 %	0 %	20 %	40 %	525655788
76	NC_021738	TAAAA	2	10	84483	84492	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_021738	GATTG	2	10	85825	85834	20 %	40 %	40 %	0 %	525655790
78	NC_021738	TAAGC	2	10	87519	87528	40 %	20 %	20 %	20 %	525655793
79	NC_021738	AATTA	2	10	87661	87670	60 %	40 %	0 %	0 %	525655794
80	NC_021738	ACCAT	2	10	92169	92178	40 %	20 %	0 %	40 %	525655797
81	NC_021738	TATAA	2	10	92447	92456	60 %	40 %	0 %	0 %	525655797
82	NC_021738	ATTTT	2	10	93327	93336	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_021738	AATAA	2	10	93700	93709	80 %	20 %	0 %	0 %	525655798
84	NC_021738	AATAG	2	10	94447	94456	60 %	20 %	20 %	0 %	525655799
85	NC_021738	TTAAT	2	10	94623	94632	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_021738	TTGGT	2	10	95706	95715	0 %	60 %	40 %	0 %	525655801
87	NC_021738	AACTG	2	10	96959	96968	40 %	20 %	20 %	20 %	525655803
88	NC_021738	TTAGC	2	10	99681	99690	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
89	NC_021738	TAGAT	2	10	100423	100432	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
90	NC_021738	AAAAT	2	10	101773	101782	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_021738	TAAGC	2	10	102163	102172	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
92	NC_021738	GAATA	2	10	102334	102343	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
93	NC_021738	AAGCC	2	10	105340	105349	40 %	0 %	20 %	40 %	525655807
94	NC_021738	TTAGA	2	10	106898	106907	40 %	40 %	20 %	0 %	525655809
95	NC_021738	ACGCT	2	10	106908	106917	20 %	20 %	20 %	40 %	525655809
96	NC_021738	AGTTA	2	10	106933	106942	40 %	40 %	20 %	0 %	525655809
97	NC_021738	GCACG	2	10	110437	110446	20 %	0 %	40 %	40 %	525655812
98	NC_021738	AACCC	2	10	111480	111489	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
99	NC_021738	TCAAA	2	10	112234	112243	60 %	20 %	0 %	20 %	525655815
100	NC_021738	CGATG	2	10	115650	115659	20 %	20 %	40 %	20 %	525655817
101	NC_021738	CGAGC	2	10	116374	116383	20 %	0 %	40 %	40 %	525655817
102	NC_021738	AGCAG	2	10	116427	116436	40 %	0 %	40 %	20 %	525655817
103	NC_021738	ACGAT	2	10	117387	117396	40 %	20 %	20 %	20 %	525655819
104	NC_021738	CGCTA	2	10	117840	117849	20 %	20 %	20 %	40 %	525655819
105	NC_021738	ATTTC	2	10	118743	118752	20 %	60 %	0 %	20 %	525655821
106	NC_021738	TAAAT	2	10	118761	118770	60 %	40 %	0 %	0 %	525655822
107	NC_021738	CATTT	2	10	119370	119379	20 %	60 %	0 %	20 %	525655822
108	NC_021738	TTTTG	2	10	120872	120881	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
109	NC_021738	ATTAA	2	10	124311	124320	60 %	40 %	0 %	0 %	525655827
110	NC_021738	GCGTA	2	10	125115	125124	20 %	20 %	40 %	20 %	525655827
111	NC_021738	AAAAG	2	10	126532	126541	80 %	0 %	20 %	0 %	525655829
112	NC_021738	ATTTT	2	10	126821	126830	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_021738	TTTGT	2	10	128051	128060	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
114	NC_021738	TCCAA	2	10	128954	128963	40 %	20 %	0 %	40 %	525655832
115	NC_021738	GTTTA	2	10	130331	130340	20 %	60 %	20 %	0 %	525655834
116	NC_021738	GCTTT	2	10	133393	133402	0 %	60 %	20 %	20 %	525655836
117	NC_021738	GGCGA	2	10	142394	142403	20 %	0 %	60 %	20 %	525655843
118	NC_021738	AATTA	2	10	143770	143779	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_021738	ATTTT	2	10	143819	143828	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_021738	GAATG	2	10	145420	145429	40 %	20 %	40 %	0 %	525655846
121	NC_021738	AGAAA	2	10	146225	146234	80 %	0 %	20 %	0 %	525655847
122	NC_021738	ATTTT	2	10	146728	146737	20 %	80 %	0 %	0 %	525655848
123	NC_021738	CTTTC	2	10	148880	148889	0 %	60 %	0 %	40 %	525655849
124	NC_021738	TTGTG	2	10	148965	148974	0 %	60 %	40 %	0 %	525655849
125	NC_021738	CCAAG	2	10	149804	149813	40 %	0 %	20 %	40 %	525655850
126	NC_021738	GTTTC	2	10	149980	149989	0 %	60 %	20 %	20 %	525655850
127	NC_021738	GCGAT	2	10	150045	150054	20 %	20 %	40 %	20 %	525655850
128	NC_021738	TTCCG	2	10	151263	151272	0 %	40 %	20 %	40 %	525655851
129	NC_021738	TGGCT	2	10	151372	151381	0 %	40 %	40 %	20 %	525655851
130	NC_021738	AATGA	2	10	153678	153687	60 %	20 %	20 %	0 %	525655853
131	NC_021738	CTTGG	2	10	154080	154089	0 %	40 %	40 %	20 %	525655854
132	NC_021738	ATTTT	2	10	154214	154223	20 %	80 %	0 %	0 %	525655854
133	NC_021738	ATTTT	2	10	154322	154331	20 %	80 %	0 %	0 %	525655854
134	NC_021738	GTTTT	2	10	154415	154424	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
135	NC_021738	TGGTG	2	10	157304	157313	0 %	40 %	60 %	0 %	525655857
136	NC_021738	AATGC	2	10	159621	159630	40 %	20 %	20 %	20 %	525655860
137	NC_021738	ATCAC	2	10	159722	159731	40 %	20 %	0 %	40 %	525655860
138	NC_021738	AAATC	2	10	160008	160017	60 %	20 %	0 %	20 %	525655860
139	NC_021738	TGCAT	2	10	160025	160034	20 %	40 %	20 %	20 %	525655860
140	NC_021738	TTTCA	2	10	165562	165571	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
141	NC_021738	AGTGC	2	10	166995	167004	20 %	20 %	40 %	20 %	525655864
142	NC_021738	CATTT	2	10	170074	170083	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
143	NC_021738	TAATG	2	10	171696	171705	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
144	NC_021738	ATTAA	2	10	171983	171992	60 %	40 %	0 %	0 %	525655869
145	NC_021738	CGAAG	2	10	172371	172380	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
146	NC_021738	GGGTA	2	10	174852	174861	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
147	NC_021738	ATAGA	2	10	175329	175338	60 %	20 %	20 %	0 %	525655873
148	NC_021738	TAATT	2	10	175429	175438	40 %	60 %	0 %	0 %	525655873
149	NC_021738	TTTTA	2	10	176158	176167	20 %	80 %	0 %	0 %	525655874
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152	NC_021738	TGCCC	2	10	182693	182702	0 %	20 %	20 %	60 %	525655881
153	NC_021738	TGCCC	2	10	183750	183759	0 %	20 %	20 %	60 %	525655882
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158	NC_021738	GCACC	2	10	185532	185541	20 %	0 %	20 %	60 %	525655882
159	NC_021738	CAAAA	2	10	186112	186121	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
160	NC_021738	CAACC	2	10	188917	188926	40 %	0 %	0 %	60 %	525655884
161	NC_021738	CCAAT	2	10	190410	190419	40 %	20 %	0 %	40 %	525655885
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169	NC_021738	AAGTT	2	10	197563	197572	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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175	NC_021738	TGCTC	2	10	210149	210158	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
176	NC_021738	TTTGC	2	10	210666	210675	0 %	60 %	20 %	20 %	525655906
177	NC_021738	CCACC	2	10	212194	212203	20 %	0 %	0 %	80 %	525655908
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241	NC_021738	AACAT	2	10	287612	287621	60 %	20 %	0 %	20 %	525655956
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252	NC_021738	TAAAA	2	10	305747	305756	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
253	NC_021738	CAAAC	2	10	307966	307975	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
254	NC_021738	GCCAA	2	10	308284	308293	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
255	NC_021738	GCAAT	2	10	308737	308746	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
256	NC_021738	TCCGC	2	10	310339	310348	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
257	NC_021738	CTGCT	2	10	312525	312534	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
258	NC_021738	CCGAT	2	10	312729	312738	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
259	NC_021738	TAGGT	2	10	313591	313600	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
260	NC_021738	TCAAC	2	10	314250	314259	40 %	20 %	0 %	40 %	525655974
261	NC_021738	GAAAT	2	10	314414	314423	60 %	20 %	20 %	0 %	525655974
262	NC_021738	ACTGC	2	10	317616	317625	20 %	20 %	20 %	40 %	525655978
263	NC_021738	AAGCC	2	10	319653	319662	40 %	0 %	20 %	40 %	525655978
264	NC_021738	CCGTT	2	10	320376	320385	0 %	40 %	20 %	40 %	525655979
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266	NC_021738	TACCT	2	10	324251	324260	20 %	40 %	0 %	40 %	525655627
267	NC_021738	CTTTA	2	10	325181	325190	20 %	60 %	0 %	20 %	525655984
268	NC_021738	GCCCT	2	10	325446	325455	0 %	20 %	20 %	60 %	525655984
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270	NC_021738	CGGTA	2	10	329742	329751	20 %	20 %	40 %	20 %	525655988
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272	NC_021738	CATTG	2	10	332680	332689	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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382	NC_021738	CCAAA	2	10	501503	501512	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
383	NC_021738	GGAAT	2	10	501588	501597	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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385	NC_021738	AAATA	2	10	505073	505082	80 %	20 %	0 %	0 %	525656138
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389	NC_021738	CATTT	2	10	510826	510835	20 %	60 %	0 %	20 %	525656141
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392	NC_021738	CAACC	2	10	513325	513334	40 %	0 %	0 %	60 %	525656143
393	NC_021738	ATTAA	2	10	518011	518020	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
394	NC_021738	TAATT	2	10	518062	518071	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
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399	NC_021738	CCAAG	2	10	526534	526543	40 %	0 %	20 %	40 %	525656154
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402	NC_021738	TGATT	2	10	531019	531028	20 %	60 %	20 %	0 %	525656158
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