MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Mannheimia haemolytica D171

Total Repeats: 1876

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_021738	TAAGT	2	10	663319	663328	40 %	40 %	20 %	0 %	525656275
502	NC_021738	TTTAT	2	10	664652	664661	20 %	80 %	0 %	0 %	525656277
503	NC_021738	ACTGC	2	10	666565	666574	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
504	NC_021738	TGGCA	2	10	667101	667110	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
505	NC_021738	ACCGC	2	10	672090	672099	20 %	0 %	20 %	60 %	525656284
506	NC_021738	AAATA	2	10	678446	678455	80 %	20 %	0 %	0 %	525656291
507	NC_021738	ATTAG	2	10	679252	679261	40 %	40 %	20 %	0 %	525656292
508	NC_021738	TGAAA	2	10	679672	679681	60 %	20 %	20 %	0 %	525656292
509	NC_021738	TTGTT	2	10	682784	682793	0 %	80 %	20 %	0 %	525656295
510	NC_021738	AATAG	2	10	683540	683549	60 %	20 %	20 %	0 %	525656295
511	NC_021738	TATAT	2	10	683692	683701	40 %	60 %	0 %	0 %	525656296
512	NC_021738	ATTTT	2	10	683897	683906	20 %	80 %	0 %	0 %	525656296
513	NC_021738	AAATA	2	10	685172	685181	80 %	20 %	0 %	0 %	525656297
514	NC_021738	GCAAC	2	10	687154	687163	40 %	0 %	20 %	40 %	525656299
515	NC_021738	AAATG	2	10	689219	689228	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
516	NC_021738	AGTGC	2	10	689382	689391	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
517	NC_021738	GAAAA	2	10	689910	689919	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
518	NC_021738	AAGCG	2	10	693655	693664	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
519	NC_021738	GAAAA	2	10	694243	694252	80 %	0 %	20 %	0 %	525656302
520	NC_021738	AAAGA	2	10	694390	694399	80 %	0 %	20 %	0 %	525656302
521	NC_021738	TGCCC	2	10	696459	696468	0 %	20 %	20 %	60 %	525656304
522	NC_021738	CAATA	2	10	698909	698918	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
523	NC_021738	CTTTT	2	10	699054	699063	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
524	NC_021738	TTAAA	2	10	699308	699317	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
525	NC_021738	CTAAC	2	10	701049	701058	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
526	NC_021738	CGACT	2	10	701378	701387	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
527	NC_021738	TCGGT	2	10	701753	701762	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
528	NC_021738	TTCAA	2	10	704511	704520	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
529	NC_021738	GCTAT	2	10	705231	705240	20 %	40 %	20 %	20 %	525656307
530	NC_021738	GTTTG	2	10	705893	705902	0 %	60 %	40 %	0 %	525656307
531	NC_021738	TCAAT	2	10	707466	707475	40 %	40 %	0 %	20 %	525656308
532	NC_021738	CGTTG	2	10	712867	712876	0 %	40 %	40 %	20 %	525656313
533	NC_021738	TAACG	2	10	713262	713271	40 %	20 %	20 %	20 %	525656313
534	NC_021738	ACATC	2	10	713704	713713	40 %	20 %	0 %	40 %	525656313
535	NC_021738	TCCAT	2	10	714256	714265	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
536	NC_021738	ATTAC	2	10	714292	714301	40 %	40 %	0 %	20 %	525656314
537	NC_021738	AAAGT	2	10	714937	714946	60 %	20 %	20 %	0 %	525656315
538	NC_021738	AAATT	2	10	716545	716554	60 %	40 %	0 %	0 %	525656316
539	NC_021738	ATTAA	2	10	716808	716817	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
540	NC_021738	ATTTT	2	10	716828	716837	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
541	NC_021738	ACACA	2	10	718107	718116	60 %	0 %	0 %	40 %	525656318
542	NC_021738	GAATG	2	10	720095	720104	40 %	20 %	40 %	0 %	525656319
543	NC_021738	GGGTT	2	10	721421	721430	0 %	40 %	60 %	0 %	525656320
544	NC_021738	TTTTA	2	10	721553	721562	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
545	NC_021738	AAATT	2	10	724392	724401	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_021738	TAACA	2	10	724752	724761	60 %	20 %	0 %	20 %	525656324
547	NC_021738	CATTT	2	10	724773	724782	20 %	60 %	0 %	20 %	525656324
548	NC_021738	ATTGC	2	10	725247	725256	20 %	40 %	20 %	20 %	525656325
549	NC_021738	ATTAA	2	10	726035	726044	60 %	40 %	0 %	0 %	525656326
550	NC_021738	AGCGG	2	10	726264	726273	20 %	0 %	60 %	20 %	525656326
551	NC_021738	GGTAA	2	10	730056	730065	40 %	20 %	40 %	0 %	525656329
552	NC_021738	AAAAT	2	10	730158	730167	80 %	20 %	0 %	0 %	525656329
553	NC_021738	TTCAT	2	10	731562	731571	20 %	60 %	0 %	20 %	525656330
554	NC_021738	TTCCA	2	10	731736	731745	20 %	40 %	0 %	40 %	525656331
555	NC_021738	AAAAT	2	10	733371	733380	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
556	NC_021738	CGTAA	2	10	734001	734010	40 %	20 %	20 %	20 %	525656333
557	NC_021738	CAAGC	2	10	736258	736267	40 %	0 %	20 %	40 %	525656334
558	NC_021738	AAAAT	2	10	737020	737029	80 %	20 %	0 %	0 %	525656335
559	NC_021738	TCCAA	2	10	737371	737380	40 %	20 %	0 %	40 %	525656336
560	NC_021738	AACAA	2	10	737552	737561	80 %	0 %	0 %	20 %	525656336
561	NC_021738	ATTGA	2	10	737707	737716	40 %	40 %	20 %	0 %	525656336
562	NC_021738	TTGAT	2	10	740509	740518	20 %	60 %	20 %	0 %	525656340
563	NC_021738	TATTT	2	10	741639	741648	20 %	80 %	0 %	0 %	525656342
564	NC_021738	TTTAC	2	10	742007	742016	20 %	60 %	0 %	20 %	525656342
565	NC_021738	TGCTA	2	10	742328	742337	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
566	NC_021738	CCATA	2	10	744315	744324	40 %	20 %	0 %	40 %	525656345
567	NC_021738	AATTT	2	10	745636	745645	40 %	60 %	0 %	0 %	525656347
568	NC_021738	CAATG	2	10	748157	748166	40 %	20 %	20 %	20 %	525656349
569	NC_021738	AATGA	2	10	748950	748959	60 %	20 %	20 %	0 %	525656349
570	NC_021738	AAAGA	2	10	749023	749032	80 %	0 %	20 %	0 %	525656349
571	NC_021738	TCAAC	2	10	750988	750997	40 %	20 %	0 %	40 %	525656351
572	NC_021738	ACGAT	2	10	752216	752225	40 %	20 %	20 %	20 %	525656353
573	NC_021738	TACTC	2	10	756536	756545	20 %	40 %	0 %	40 %	525656359
574	NC_021738	TTTTG	2	10	758051	758060	0 %	80 %	20 %	0 %	525656360
575	NC_021738	AGTAA	2	10	758061	758070	60 %	20 %	20 %	0 %	525656360
576	NC_021738	GCTCT	2	10	762519	762528	0 %	40 %	20 %	40 %	525656364
577	NC_021738	TATTT	2	10	763567	763576	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
578	NC_021738	TTGGG	2	10	767675	767684	0 %	40 %	60 %	0 %	525656367
579	NC_021738	AATAA	2	10	768204	768213	80 %	20 %	0 %	0 %	525656367
580	NC_021738	TGCCT	2	10	770722	770731	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
581	NC_021738	TATCA	2	10	770987	770996	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
582	NC_021738	ATTTT	2	10	773174	773183	20 %	80 %	0 %	0 %	525656371
583	NC_021738	AGAGG	2	10	774005	774014	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
584	NC_021738	TTGAT	2	10	776240	776249	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
585	NC_021738	TAAAT	2	10	777265	777274	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
586	NC_021738	ATCAG	2	10	777331	777340	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
587	NC_021738	ATTGA	2	10	777945	777954	40 %	40 %	20 %	0 %	525656376
588	NC_021738	GCCAC	2	10	779405	779414	20 %	0 %	20 %	60 %	525656378
589	NC_021738	CATCA	2	10	780108	780117	40 %	20 %	0 %	40 %	525656379
590	NC_021738	CACTT	2	10	780456	780465	20 %	40 %	0 %	40 %	525656379
591	NC_021738	GCACC	2	10	784452	784461	20 %	0 %	20 %	60 %	525656384
592	NC_021738	AAAAT	2	10	787200	787209	80 %	20 %	0 %	0 %	525656388
593	NC_021738	CAATA	2	10	787974	787983	60 %	20 %	0 %	20 %	525656389
594	NC_021738	TTCGC	2	10	789207	789216	0 %	40 %	20 %	40 %	525656390
595	NC_021738	AACGC	2	10	790967	790976	40 %	0 %	20 %	40 %	525656391
596	NC_021738	TGCCG	2	10	791196	791205	0 %	20 %	40 %	40 %	525656391
597	NC_021738	ATACC	2	10	792483	792492	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
598	NC_021738	AGCTG	2	10	793938	793947	20 %	20 %	40 %	20 %	525656392
599	NC_021738	ATTTA	2	10	794256	794265	40 %	60 %	0 %	0 %	525656392
600	NC_021738	AATTT	2	10	794590	794599	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
601	NC_021738	GCTAT	2	10	795103	795112	20 %	40 %	20 %	20 %	525656393
602	NC_021738	CAGCA	2	10	795279	795288	40 %	0 %	20 %	40 %	525656393
603	NC_021738	GAAAA	2	10	796877	796886	80 %	0 %	20 %	0 %	525656393
604	NC_021738	AAGCC	2	10	798850	798859	40 %	0 %	20 %	40 %	525656394
605	NC_021738	GTTTT	2	10	800578	800587	0 %	80 %	20 %	0 %	525656396
606	NC_021738	TAATT	2	10	800963	800972	40 %	60 %	0 %	0 %	525656396
607	NC_021738	GATTT	2	10	801561	801570	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
608	NC_021738	AAAAT	2	10	805066	805075	80 %	20 %	0 %	0 %	525656399
609	NC_021738	GGTTA	2	10	805555	805564	20 %	40 %	40 %	0 %	525656399
610	NC_021738	GTGCA	2	10	808759	808768	20 %	20 %	40 %	20 %	525656401
611	NC_021738	AATTA	2	10	809711	809720	60 %	40 %	0 %	0 %	525656402
612	NC_021738	CAATC	2	10	809908	809917	40 %	20 %	0 %	40 %	525656402
613	NC_021738	TCAAT	2	10	810520	810529	40 %	40 %	0 %	20 %	525656402
614	NC_021738	AATGC	2	10	811630	811639	40 %	20 %	20 %	20 %	525656402
615	NC_021738	CATAC	2	10	811956	811965	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
616	NC_021738	ATTAC	2	10	814788	814797	40 %	40 %	0 %	20 %	525656404
617	NC_021738	GCTTT	2	10	815287	815296	0 %	60 %	20 %	20 %	525656404
618	NC_021738	TTAAT	2	10	816547	816556	40 %	60 %	0 %	0 %	525656404
619	NC_021738	GTGAT	2	10	819543	819552	20 %	40 %	40 %	0 %	525656406
620	NC_021738	CAAAA	2	10	820363	820372	80 %	0 %	0 %	20 %	525656407
621	NC_021738	ATTTA	2	10	823174	823183	40 %	60 %	0 %	0 %	525656411
622	NC_021738	ATTAT	2	10	823759	823768	40 %	60 %	0 %	0 %	525656412
623	NC_021738	AAGTG	2	10	826058	826067	40 %	20 %	40 %	0 %	525656414
624	NC_021738	GTTCA	2	10	827125	827134	20 %	40 %	20 %	20 %	525656416
625	NC_021738	GCCAA	2	10	828227	828236	40 %	0 %	20 %	40 %	525656417
626	NC_021738	ATTGA	2	10	828713	828722	40 %	40 %	20 %	0 %	525656418
627	NC_021738	GTGCG	2	10	828869	828878	0 %	20 %	60 %	20 %	525656418
628	NC_021738	TTTTG	2	10	828937	828946	0 %	80 %	20 %	0 %	525656418
629	NC_021738	GCATC	2	10	829003	829012	20 %	20 %	20 %	40 %	525656418
630	NC_021738	CCAAG	2	10	830061	830070	40 %	0 %	20 %	40 %	525656418
631	NC_021738	TAAAA	2	10	830796	830805	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
632	NC_021738	AGTTT	2	10	831649	831658	20 %	60 %	20 %	0 %	525656421
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634	NC_021738	TACTC	2	10	835089	835098	20 %	40 %	0 %	40 %	525656424
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