MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Mannheimia haemolytica D171

Total Repeats: 1876

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_021738	ATGCA	2	10	1363993	1364002	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
1002	NC_021738	ATGAG	2	10	1364915	1364924	40 %	20 %	40 %	0 %	525656905
1003	NC_021738	CTGAA	2	10	1365713	1365722	40 %	20 %	20 %	20 %	525656906
1004	NC_021738	ATTGG	2	10	1366128	1366137	20 %	40 %	40 %	0 %	525656906
1005	NC_021738	CAGAA	2	10	1367156	1367165	60 %	0 %	20 %	20 %	525656907
1006	NC_021738	GAAAA	2	10	1367263	1367272	80 %	0 %	20 %	0 %	525656907
1007	NC_021738	AATGG	2	10	1367592	1367601	40 %	20 %	40 %	0 %	525656907
1008	NC_021738	GGTGT	2	10	1368073	1368082	0 %	40 %	60 %	0 %	525656908
1009	NC_021738	ACATT	2	10	1368601	1368610	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1010	NC_021738	TTAAC	2	10	1369352	1369361	40 %	40 %	0 %	20 %	525656909
1011	NC_021738	TACTT	2	10	1369752	1369761	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1012	NC_021738	TTATT	2	10	1369943	1369952	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_021738	CGCAA	2	10	1372901	1372910	40 %	0 %	20 %	40 %	525656912
1014	NC_021738	TATTC	2	10	1373849	1373858	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1015	NC_021738	CAATC	2	10	1374035	1374044	40 %	20 %	0 %	40 %	525656914
1016	NC_021738	TTCAT	2	10	1374733	1374742	20 %	60 %	0 %	20 %	525656914
1017	NC_021738	AAAAT	2	10	1376286	1376295	80 %	20 %	0 %	0 %	525656915
1018	NC_021738	ACACC	2	10	1376512	1376521	40 %	0 %	0 %	60 %	525656915
1019	NC_021738	ATTTG	2	10	1382707	1382716	20 %	60 %	20 %	0 %	525656921
1020	NC_021738	TAACT	2	10	1383511	1383520	40 %	40 %	0 %	20 %	525656922
1021	NC_021738	CCATT	2	10	1386483	1386492	20 %	40 %	0 %	40 %	525656925
1022	NC_021738	TATTT	2	10	1386824	1386833	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_021738	ATTGC	2	10	1387709	1387718	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1024	NC_021738	ATGGA	2	10	1389301	1389310	40 %	20 %	40 %	0 %	525656926
1025	NC_021738	TCTTA	2	10	1389385	1389394	20 %	60 %	0 %	20 %	525656926
1026	NC_021738	AATTA	2	10	1390713	1390722	60 %	40 %	0 %	0 %	525656927
1027	NC_021738	CAAAA	2	10	1391769	1391778	80 %	0 %	0 %	20 %	525656928
1028	NC_021738	CAAAA	2	10	1392258	1392267	80 %	0 %	0 %	20 %	525656928
1029	NC_021738	GTTTG	2	10	1393095	1393104	0 %	60 %	40 %	0 %	525656929
1030	NC_021738	CGGTT	2	10	1393723	1393732	0 %	40 %	40 %	20 %	525656929
1031	NC_021738	TGCGT	2	10	1394763	1394772	0 %	40 %	40 %	20 %	525656929
1032	NC_021738	CTCCG	2	10	1397964	1397973	0 %	20 %	20 %	60 %	525656933
1033	NC_021738	CGAAA	2	10	1398911	1398920	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1034	NC_021738	CCCAA	2	10	1399183	1399192	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
1035	NC_021738	CCAAA	2	10	1400747	1400756	60 %	0 %	0 %	40 %	525656934
1036	NC_021738	GGTGG	2	10	1401114	1401123	0 %	20 %	80 %	0 %	525656935
1037	NC_021738	TCAAG	2	10	1401727	1401736	40 %	20 %	20 %	20 %	525656935
1038	NC_021738	GCCAA	2	10	1401842	1401851	40 %	0 %	20 %	40 %	525656935
1039	NC_021738	AGAAA	2	10	1403256	1403265	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1040	NC_021738	CTAAC	2	10	1405307	1405316	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
1041	NC_021738	CGACT	2	10	1405636	1405645	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1042	NC_021738	TCGGT	2	10	1406011	1406020	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1043	NC_021738	TTCAA	2	10	1408769	1408778	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1044	NC_021738	CAAAA	2	10	1409042	1409051	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
1045	NC_021738	AAAAG	2	10	1412216	1412225	80 %	0 %	20 %	0 %	525656939
1046	NC_021738	TTTAA	2	10	1414311	1414320	40 %	60 %	0 %	0 %	525656943
1047	NC_021738	CCAAA	2	10	1417263	1417272	60 %	0 %	0 %	40 %	525656945
1048	NC_021738	AATGC	2	10	1419064	1419073	40 %	20 %	20 %	20 %	525656947
1049	NC_021738	TCAAA	2	10	1421263	1421272	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1050	NC_021738	ACAGC	2	10	1421795	1421804	40 %	0 %	20 %	40 %	525656950
1051	NC_021738	GGCAA	2	10	1422875	1422884	40 %	0 %	40 %	20 %	525656951
1052	NC_021738	AAAGC	2	10	1422963	1422972	60 %	0 %	20 %	20 %	525656951
1053	NC_021738	CACCT	2	10	1423586	1423595	20 %	20 %	0 %	60 %	525656952
1054	NC_021738	TGGTG	2	10	1424201	1424210	0 %	40 %	60 %	0 %	525656953
1055	NC_021738	GGCAA	2	10	1425589	1425598	40 %	0 %	40 %	20 %	525656954
1056	NC_021738	GCTTG	2	10	1428081	1428090	0 %	40 %	40 %	20 %	525656956
1057	NC_021738	TTCGG	2	10	1430479	1430488	0 %	40 %	40 %	20 %	525656958
1058	NC_021738	ACCAA	2	10	1432674	1432683	60 %	0 %	0 %	40 %	525656961
1059	NC_021738	TTAAA	2	10	1434840	1434849	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1060	NC_021738	CTAAC	2	10	1436580	1436589	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
1061	NC_021738	CGACT	2	10	1436909	1436918	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1062	NC_021738	TCGGT	2	10	1437284	1437293	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1063	NC_021738	TCGCT	2	10	1438445	1438454	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1064	NC_021738	TTCAA	2	10	1440157	1440166	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1065	NC_021738	TTGTT	2	10	1440501	1440510	0 %	80 %	20 %	0 %	525656964
1066	NC_021738	GATTT	2	10	1443210	1443219	20 %	60 %	20 %	0 %	525656967
1067	NC_021738	TAACC	2	10	1444106	1444115	40 %	20 %	0 %	40 %	525656968
1068	NC_021738	ATTAA	2	10	1444793	1444802	60 %	40 %	0 %	0 %	525656969
1069	NC_021738	TGTTC	2	10	1445288	1445297	0 %	60 %	20 %	20 %	525656970
1070	NC_021738	TTTGA	2	10	1446863	1446872	20 %	60 %	20 %	0 %	525656971
1071	NC_021738	ACATC	2	10	1447543	1447552	40 %	20 %	0 %	40 %	525656971
1072	NC_021738	CAATC	2	10	1448565	1448574	40 %	20 %	0 %	40 %	525656973
1073	NC_021738	AAGGC	2	10	1452305	1452314	40 %	0 %	40 %	20 %	525656976
1074	NC_021738	ATCAA	2	10	1453940	1453949	60 %	20 %	0 %	20 %	525656977
1075	NC_021738	AATTT	2	10	1454442	1454451	40 %	60 %	0 %	0 %	525656978
1076	NC_021738	GTTTC	2	10	1458626	1458635	0 %	60 %	20 %	20 %	525656981
1077	NC_021738	TGCAA	2	10	1461505	1461514	40 %	20 %	20 %	20 %	525656982
1078	NC_021738	AATAC	2	10	1461847	1461856	60 %	20 %	0 %	20 %	525656982
1079	NC_021738	GGATA	2	10	1463685	1463694	40 %	20 %	40 %	0 %	525656984
1080	NC_021738	TTATT	2	10	1463799	1463808	20 %	80 %	0 %	0 %	525656984
1081	NC_021738	ATTAC	2	10	1466120	1466129	40 %	40 %	0 %	20 %	525656986
1082	NC_021738	TTCAG	2	10	1466868	1466877	20 %	40 %	20 %	20 %	525656987
1083	NC_021738	CAAGA	2	10	1467167	1467176	60 %	0 %	20 %	20 %	525656987
1084	NC_021738	AAAAT	2	10	1467263	1467272	80 %	20 %	0 %	0 %	525656987
1085	NC_021738	AGAGG	2	10	1467574	1467583	40 %	0 %	60 %	0 %	525656987
1086	NC_021738	TCATT	2	10	1467904	1467913	20 %	60 %	0 %	20 %	525656988
1087	NC_021738	TTATA	2	10	1468463	1468472	40 %	60 %	0 %	0 %	525656988
1088	NC_021738	TTCGT	2	10	1468806	1468815	0 %	60 %	20 %	20 %	525656989
1089	NC_021738	TTCAA	2	10	1469959	1469968	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
1090	NC_021738	AGCGT	2	10	1470393	1470402	20 %	20 %	40 %	20 %	525656991
1091	NC_021738	TATAT	2	10	1470768	1470777	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1092	NC_021738	CGATG	2	10	1471080	1471089	20 %	20 %	40 %	20 %	525656992
1093	NC_021738	TGCGT	2	10	1473436	1473445	0 %	40 %	40 %	20 %	525656994
1094	NC_021738	ATGAT	2	10	1473546	1473555	40 %	40 %	20 %	0 %	525656994
1095	NC_021738	CTTTC	2	10	1474356	1474365	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
1096	NC_021738	AAATG	2	10	1478000	1478009	60 %	20 %	20 %	0 %	525656995
1097	NC_021738	AGGCC	2	10	1482021	1482030	20 %	0 %	40 %	40 %	525656998
1098	NC_021738	ATTTT	2	10	1482540	1482549	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1099	NC_021738	CCAAG	2	10	1483339	1483348	40 %	0 %	20 %	40 %	525656999
1100	NC_021738	TTTAA	2	10	1485462	1485471	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_021738	TAAAT	2	10	1485492	1485501	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1102	NC_021738	TAAGT	2	10	1488290	1488299	40 %	40 %	20 %	0 %	525657005
1103	NC_021738	CACAA	2	10	1489989	1489998	60 %	0 %	0 %	40 %	525657006
1104	NC_021738	TTGAT	2	10	1490251	1490260	20 %	60 %	20 %	0 %	525657006
1105	NC_021738	CCTGC	2	10	1491096	1491105	0 %	20 %	20 %	60 %	525657007
1106	NC_021738	CAGTG	2	10	1492472	1492481	20 %	20 %	40 %	20 %	525657008
1107	NC_021738	TTAAA	2	10	1493050	1493059	60 %	40 %	0 %	0 %	525657008
1108	NC_021738	TAATT	2	10	1493943	1493952	40 %	60 %	0 %	0 %	525657009
1109	NC_021738	TAAAT	2	10	1494111	1494120	60 %	40 %	0 %	0 %	525657009
1110	NC_021738	AAATG	2	10	1494870	1494879	60 %	20 %	20 %	0 %	525657010
1111	NC_021738	GGGTT	2	10	1496963	1496972	0 %	40 %	60 %	0 %	525657013
1112	NC_021738	GTGAA	2	10	1498022	1498031	40 %	20 %	40 %	0 %	525657014
1113	NC_021738	TTTAG	2	10	1498429	1498438	20 %	60 %	20 %	0 %	525657014
1114	NC_021738	ATTTT	2	10	1504394	1504403	20 %	80 %	0 %	0 %	525657018
1115	NC_021738	AAACT	2	10	1507360	1507369	60 %	20 %	0 %	20 %	525657022
1116	NC_021738	ATGGT	2	10	1508243	1508252	20 %	40 %	40 %	0 %	525657023
1117	NC_021738	CTAAA	2	10	1510051	1510060	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
1118	NC_021738	GTTTT	2	10	1510516	1510525	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_021738	TAAAA	2	10	1511586	1511595	80 %	20 %	0 %	0 %	525657026
1120	NC_021738	GTTTT	2	10	1512328	1512337	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_021738	CTTTT	2	10	1514792	1514801	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1122	NC_021738	AAAAG	2	10	1515339	1515348	80 %	0 %	20 %	0 %	525657031
1123	NC_021738	AATTA	2	10	1516824	1516833	60 %	40 %	0 %	0 %	525657033
1124	NC_021738	TCCGT	2	10	1518813	1518822	0 %	40 %	20 %	40 %	525657035
1125	NC_021738	CGGAG	2	10	1519000	1519009	20 %	0 %	60 %	20 %	525657035
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