MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Mannheimia haemolytica D171

Total Repeats: 1876

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_021738	ATTTT	2	10	1998029	1998038	20 %	80 %	0 %	0 %	525657479
1502	NC_021738	TATTT	2	10	2000107	2000116	20 %	80 %	0 %	0 %	525657484
1503	NC_021738	AATAA	2	10	2001960	2001969	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1504	NC_021738	CATTG	2	10	2004163	2004172	20 %	40 %	20 %	20 %	525657489
1505	NC_021738	TCAAA	2	10	2005772	2005781	60 %	20 %	0 %	20 %	525657490
1506	NC_021738	TTAAA	2	10	2007658	2007667	60 %	40 %	0 %	0 %	525657491
1507	NC_021738	AGAGA	2	10	2010454	2010463	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
1508	NC_021738	GTGAA	2	10	2010986	2010995	40 %	20 %	40 %	0 %	525657492
1509	NC_021738	CCAAG	2	10	2011293	2011302	40 %	0 %	20 %	40 %	525657492
1510	NC_021738	ACTAA	2	10	2013209	2013218	60 %	20 %	0 %	20 %	525657493
1511	NC_021738	ATAAA	2	10	2013467	2013476	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1512	NC_021738	AATTT	2	10	2013759	2013768	40 %	60 %	0 %	0 %	525657494
1513	NC_021738	ATTGT	2	10	2016682	2016691	20 %	60 %	20 %	0 %	525657497
1514	NC_021738	GCACA	2	10	2016757	2016766	40 %	0 %	20 %	40 %	525657497
1515	NC_021738	AAAAC	2	10	2017432	2017441	80 %	0 %	0 %	20 %	525655703
1516	NC_021738	ACCGC	2	10	2020327	2020336	20 %	0 %	20 %	60 %	525657498
1517	NC_021738	CGGTA	2	10	2021110	2021119	20 %	20 %	40 %	20 %	525657499
1518	NC_021738	AACTC	2	10	2022398	2022407	40 %	20 %	0 %	40 %	525657500
1519	NC_021738	GCCAA	2	10	2023416	2023425	40 %	0 %	20 %	40 %	525657500
1520	NC_021738	TCTTT	2	10	2024046	2024055	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1521	NC_021738	TTATT	2	10	2026088	2026097	20 %	80 %	0 %	0 %	525657503
1522	NC_021738	TCTTG	2	10	2029066	2029075	0 %	60 %	20 %	20 %	525657506
1523	NC_021738	CCATT	2	10	2030516	2030525	20 %	40 %	0 %	40 %	525657506
1524	NC_021738	CATTG	2	10	2032700	2032709	20 %	40 %	20 %	20 %	525657508
1525	NC_021738	ATCAA	2	10	2032968	2032977	60 %	20 %	0 %	20 %	525657508
1526	NC_021738	GTGTT	2	10	2034326	2034335	0 %	60 %	40 %	0 %	525657509
1527	NC_021738	GCCAC	2	10	2034989	2034998	20 %	0 %	20 %	60 %	525657510
1528	NC_021738	TCGGC	2	10	2035251	2035260	0 %	20 %	40 %	40 %	525657510
1529	NC_021738	TGAAA	2	10	2035582	2035591	60 %	20 %	20 %	0 %	525657510
1530	NC_021738	TCTTA	2	10	2036079	2036088	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1531	NC_021738	CGCCA	2	10	2036731	2036740	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1532	NC_021738	AACAA	2	10	2039840	2039849	80 %	0 %	0 %	20 %	525657511
1533	NC_021738	ACAAT	2	10	2042418	2042427	60 %	20 %	0 %	20 %	525657513
1534	NC_021738	GCCAC	2	10	2045417	2045426	20 %	0 %	20 %	60 %	525657516
1535	NC_021738	CCCCG	2	10	2045565	2045574	0 %	0 %	20 %	80 %	525657516
1536	NC_021738	GAGGT	2	10	2045823	2045832	20 %	20 %	60 %	0 %	525657517
1537	NC_021738	CGCCA	2	10	2046212	2046221	20 %	0 %	20 %	60 %	525657517
1538	NC_021738	GCTGC	2	10	2046576	2046585	0 %	20 %	40 %	40 %	525657517
1539	NC_021738	CAACA	2	10	2050340	2050349	60 %	0 %	0 %	40 %	525657522
1540	NC_021738	CACGC	2	10	2053451	2053460	20 %	0 %	20 %	60 %	525657525
1541	NC_021738	TGGGT	2	10	2057851	2057860	0 %	40 %	60 %	0 %	525657532
1542	NC_021738	CCGGG	2	10	2060785	2060794	0 %	0 %	60 %	40 %	525657536
1543	NC_021738	CACCG	2	10	2061164	2061173	20 %	0 %	20 %	60 %	525657537
1544	NC_021738	GCAAG	2	10	2061701	2061710	40 %	0 %	40 %	20 %	525657537
1545	NC_021738	TTAAT	2	10	2063824	2063833	40 %	60 %	0 %	0 %	525657539
1546	NC_021738	CGATG	2	10	2064101	2064110	20 %	20 %	40 %	20 %	525657539
1547	NC_021738	AAAGT	2	10	2065589	2065598	60 %	20 %	20 %	0 %	525657540
1548	NC_021738	TAATA	2	10	2070931	2070940	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_021738	TTTAA	2	10	2073987	2073996	40 %	60 %	0 %	0 %	525657546
1550	NC_021738	CTGTG	2	10	2074052	2074061	0 %	40 %	40 %	20 %	525657546
1551	NC_021738	TTTTC	2	10	2075317	2075326	0 %	80 %	0 %	20 %	525657547
1552	NC_021738	TTGCC	2	10	2075581	2075590	0 %	40 %	20 %	40 %	525657548
1553	NC_021738	TTATT	2	10	2077994	2078003	20 %	80 %	0 %	0 %	525657552
1554	NC_021738	AAAAT	2	10	2084059	2084068	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1555	NC_021738	GTGAT	2	10	2084897	2084906	20 %	40 %	40 %	0 %	525657560
1556	NC_021738	GCGGT	2	10	2085759	2085768	0 %	20 %	60 %	20 %	525657561
1557	NC_021738	ATCTT	2	10	2089742	2089751	20 %	60 %	0 %	20 %	525657564
1558	NC_021738	TTTAG	2	10	2089766	2089775	20 %	60 %	20 %	0 %	525657564
1559	NC_021738	TTCGC	2	10	2090757	2090766	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1560	NC_021738	TCACT	2	10	2092238	2092247	20 %	40 %	0 %	40 %	525657568
1561	NC_021738	AACCA	2	10	2093903	2093912	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
1562	NC_021738	TAAAT	2	10	2097291	2097300	60 %	40 %	0 %	0 %	525657571
1563	NC_021738	TTTCA	2	10	2097796	2097805	20 %	60 %	0 %	20 %	525657572
1564	NC_021738	TTAAT	2	10	2098344	2098353	40 %	60 %	0 %	0 %	525657573
1565	NC_021738	GCTTG	2	10	2098966	2098975	0 %	40 %	40 %	20 %	525657573
1566	NC_021738	TCAAA	2	10	2099254	2099263	60 %	20 %	0 %	20 %	525657573
1567	NC_021738	AACCC	2	10	2101382	2101391	40 %	0 %	0 %	60 %	525657576
1568	NC_021738	CCAAT	2	10	2102754	2102763	40 %	20 %	0 %	40 %	525657577
1569	NC_021738	AACAC	2	10	2104436	2104445	60 %	0 %	0 %	40 %	525657579
1570	NC_021738	AAATG	2	10	2105834	2105843	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
1571	NC_021738	ATTTA	2	10	2107623	2107632	40 %	60 %	0 %	0 %	525657582
1572	NC_021738	ATCAC	2	10	2108745	2108754	40 %	20 %	0 %	40 %	525657583
1573	NC_021738	CATCG	2	10	2109074	2109083	20 %	20 %	20 %	40 %	525657583
1574	NC_021738	CATCG	2	10	2109116	2109125	20 %	20 %	20 %	40 %	525657583
1575	NC_021738	GGCTA	2	10	2109719	2109728	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1576	NC_021738	CAGTG	2	10	2110788	2110797	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1577	NC_021738	CTTCA	2	10	2111106	2111115	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
1578	NC_021738	GGTTC	2	10	2111621	2111630	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1579	NC_021738	GGCGT	2	10	2114361	2114370	0 %	20 %	60 %	20 %	525657585
1580	NC_021738	GTTTA	2	10	2114740	2114749	20 %	60 %	20 %	0 %	525657586
1581	NC_021738	GTATG	2	10	2115753	2115762	20 %	40 %	40 %	0 %	525657587
1582	NC_021738	AAATT	2	10	2115912	2115921	60 %	40 %	0 %	0 %	525657588
1583	NC_021738	CATAT	2	10	2116248	2116257	40 %	40 %	0 %	20 %	525657588
1584	NC_021738	TTTCC	2	10	2116292	2116301	0 %	60 %	0 %	40 %	525657588
1585	NC_021738	TTTTG	2	10	2116381	2116390	0 %	80 %	20 %	0 %	525657588
1586	NC_021738	ATTTA	2	10	2116725	2116734	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
1587	NC_021738	AAATC	2	10	2117351	2117360	60 %	20 %	0 %	20 %	525657590
1588	NC_021738	TTGCC	2	10	2118351	2118360	0 %	40 %	20 %	40 %	525657591
1589	NC_021738	GCGGT	2	10	2120609	2120618	0 %	20 %	60 %	20 %	525657593
1590	NC_021738	TGCCT	2	10	2122434	2122443	0 %	40 %	20 %	40 %	525657595
1591	NC_021738	GTGAT	2	10	2122550	2122559	20 %	40 %	40 %	0 %	525657595
1592	NC_021738	ATACT	2	10	2126909	2126918	40 %	40 %	0 %	20 %	525657597
1593	NC_021738	TTTTA	2	10	2127709	2127718	20 %	80 %	0 %	0 %	525657597
1594	NC_021738	AAATT	2	10	2127898	2127907	60 %	40 %	0 %	0 %	525657597
1595	NC_021738	ATTAA	2	10	2128221	2128230	60 %	40 %	0 %	0 %	525657598
1596	NC_021738	ATTGA	2	10	2129936	2129945	40 %	40 %	20 %	0 %	525657599
1597	NC_021738	AGAAC	2	10	2132527	2132536	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
1598	NC_021738	CCGCC	2	10	2132815	2132824	0 %	0 %	20 %	80 %	525657600
1599	NC_021738	TGCCG	2	10	2135869	2135878	0 %	20 %	40 %	40 %	525657602
1600	NC_021738	GGTTG	2	10	2143356	2143365	0 %	40 %	60 %	0 %	525657609
1601	NC_021738	GTAGC	2	10	2143657	2143666	20 %	20 %	40 %	20 %	525657609
1602	NC_021738	TATTT	2	10	2144297	2144306	20 %	80 %	0 %	0 %	525657610
1603	NC_021738	TTTTG	2	10	2144909	2144918	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
1604	NC_021738	GGCAA	2	10	2145889	2145898	40 %	0 %	40 %	20 %	525657612
1605	NC_021738	AACTC	2	10	2146706	2146715	40 %	20 %	0 %	40 %	525657613
1606	NC_021738	TAATT	2	10	2148216	2148225	40 %	60 %	0 %	0 %	525657614
1607	NC_021738	ATAAA	2	10	2149260	2149269	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1608	NC_021738	GCTCG	2	10	2150190	2150199	0 %	20 %	40 %	40 %	525657615
1609	NC_021738	AGCGT	2	10	2150422	2150431	20 %	20 %	40 %	20 %	525657615
1610	NC_021738	CGGTG	2	10	2150854	2150863	0 %	20 %	60 %	20 %	525657616
1611	NC_021738	TGAAG	2	10	2151394	2151403	40 %	20 %	40 %	0 %	525657616
1612	NC_021738	GTCAA	2	10	2152412	2152421	40 %	20 %	20 %	20 %	525657617
1613	NC_021738	TAGCA	2	10	2152534	2152543	40 %	20 %	20 %	20 %	525657617
1614	NC_021738	TACGA	2	10	2154088	2154097	40 %	20 %	20 %	20 %	525657618
1615	NC_021738	CTTTT	2	10	2155295	2155304	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
1616	NC_021738	TTTAG	2	10	2155333	2155342	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
1617	NC_021738	TTTCA	2	10	2158239	2158248	20 %	60 %	0 %	20 %	525657622
1618	NC_021738	CAATC	2	10	2158640	2158649	40 %	20 %	0 %	40 %	525657623
1619	NC_021738	GTAAT	2	10	2160576	2160585	40 %	40 %	20 %	0 %	525657626
1620	NC_021738	TAAAT	2	10	2161437	2161446	60 %	40 %	0 %	0 %	525657626
1621	NC_021738	GAAAT	2	10	2162631	2162640	60 %	20 %	20 %	0 %	525655705
1622	NC_021738	AAGCC	2	10	2164479	2164488	40 %	0 %	20 %	40 %	525657629
1623	NC_021738	TGAAA	2	10	2165637	2165646	60 %	20 %	20 %	0 %	525657630
1624	NC_021738	ATTGT	2	10	2165705	2165714	20 %	60 %	20 %	0 %	525657630
1625	NC_021738	ATTTT	2	10	2167193	2167202	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1626	NC_021738	GGTGG	2	10	2167926	2167935	0 %	20 %	80 %	0 %	525657633
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1757	NC_021738	TTCAC	2	10	2351062	2351071	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.