MICAS: Microsatellite Analysis Server

Hexa-nucleotide Repeats of Microcoleus sp. PCC 7113 chromosome

Total Repeats: 2768

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_019738	CTCAAT	2	12	5414885	5414896	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428312726
2002	NC_019738	CGCAAT	2	12	5417315	5417326	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428312729
2003	NC_019738	GTTAAG	2	12	5429672	5429683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2004	NC_019738	ATGACA	2	12	5430035	5430046	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2005	NC_019738	GTAGGG	2	12	5432590	5432601	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2006	NC_019738	GGGAAC	2	12	5433914	5433925	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	428312743
2007	NC_019738	ATAAGT	2	12	5440979	5440990	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	428312750
2008	NC_019738	CTATTA	2	12	5441939	5441950	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2009	NC_019738	TGGTTC	2	12	5448135	5448146	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	428312755
2010	NC_019738	CTTTGA	2	12	5450974	5450985	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	428312758
2011	NC_019738	ATCGCC	2	12	5453382	5453393	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	428312760
2012	NC_019738	ATCATT	2	12	5463723	5463734	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	428312768
2013	NC_019738	TAATCC	2	12	5466093	5466104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428312771
2014	NC_019738	CATCTT	2	12	5466770	5466781	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	428312771
2015	NC_019738	ATTAAG	2	12	5467214	5467225	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2016	NC_019738	ACGATT	2	12	5467453	5467464	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2017	NC_019738	AAAATT	2	12	5467784	5467795	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2018	NC_019738	GTGAAT	2	12	5470148	5470159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428312774
2019	NC_019738	TGGCGA	2	12	5472683	5472694	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	428312776
2020	NC_019738	ATTTTA	2	12	5476881	5476892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	428312780
2021	NC_019738	TACCAT	2	12	5482411	5482422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428312785
2022	NC_019738	TTTGAT	2	12	5486023	5486034	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	428312790
2023	NC_019738	TAGAGA	2	12	5486918	5486929	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2024	NC_019738	AGTGGG	2	12	5499092	5499103	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	428312805
2025	NC_019738	TTGCTG	2	12	5504138	5504149	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	428312810
2026	NC_019738	AAGTAA	2	12	5507715	5507726	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	428312813
2027	NC_019738	GCGGTA	2	12	5509948	5509959	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
2028	NC_019738	GGGACG	2	12	5511335	5511346	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	428312817
2029	NC_019738	ACAGTT	2	12	5517160	5517171	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2030	NC_019738	GATTCC	2	12	5520588	5520599	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	428312826
2031	NC_019738	CCCACC	2	12	5523689	5523700	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	428312828
2032	NC_019738	TCGCTT	2	12	5523972	5523983	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
2033	NC_019738	TGCAGT	2	12	5525350	5525361	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	428312830
2034	NC_019738	GCGAAA	2	12	5526690	5526701	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	428312831
2035	NC_019738	TTACCG	2	12	5527568	5527579	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	428312832
2036	NC_019738	ATCTAT	2	12	5532776	5532787	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2037	NC_019738	CCTGAT	2	12	5535776	5535787	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	428312842
2038	NC_019738	GATTGA	2	12	5538297	5538308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428312845
2039	NC_019738	GGGCAA	2	12	5538421	5538432	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	428312846
2040	NC_019738	TGGCAA	2	12	5539041	5539052	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	428312846
2041	NC_019738	ATCCTG	2	12	5541161	5541172	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	428312850
2042	NC_019738	GTTCCC	2	12	5547952	5547963	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	428312858
2043	NC_019738	TACGAT	2	12	5548510	5548521	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	428312859
2044	NC_019738	ATGTAG	2	12	5562936	5562947	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428312870
2045	NC_019738	CGGAAC	2	12	5564529	5564540	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428312870
2046	NC_019738	GGGTTT	2	12	5570174	5570185	0 %	50 %	50 %	0 %	428312873
2047	NC_019738	GAACCG	2	12	5573134	5573145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428312875
2048	NC_019738	GATTGT	2	12	5575635	5575646	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	428312877
2049	NC_019738	GTTGAA	2	12	5576684	5576695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428312878
2050	NC_019738	CACCAA	2	12	5577531	5577542	50 %	0 %	0 %	50 %	428312880
2051	NC_019738	TTCCTC	2	12	5583829	5583840	0 %	50 %	0 %	50 %	428312885
2052	NC_019738	ATCCAA	2	12	5588509	5588520	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	428312887
2053	NC_019738	CCGCCA	2	12	5588584	5588595	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	428312887
2054	NC_019738	TCATAT	2	12	5590119	5590130	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	428312889
2055	NC_019738	TAAGCG	2	12	5590513	5590524	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2056	NC_019738	CATCCG	2	12	5598478	5598489	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	428312892
2057	NC_019738	TAATGA	2	12	5598866	5598877	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	428312892
2058	NC_019738	GCTTTT	2	12	5599432	5599443	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	428312893
2059	NC_019738	CCTCCA	2	12	5600415	5600426	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	428312893
2060	NC_019738	CCAGTG	2	12	5601104	5601115	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	428312894
2061	NC_019738	AATTCC	2	12	5605649	5605660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428312897
2062	NC_019738	TAAGGA	2	12	5606924	5606935	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2063	NC_019738	ATTAGG	2	12	5607342	5607353	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428312899
2064	NC_019738	AATCAA	2	12	5610769	5610780	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	428312899
2065	NC_019738	CCAGCT	2	12	5617216	5617227	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	428312907
2066	NC_019738	ATCGAT	2	12	5620904	5620915	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	428312910
2067	NC_019738	TTCCCG	2	12	5620928	5620939	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	428312910
2068	NC_019738	TTCGGA	2	12	5621584	5621595	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	428312910
2069	NC_019738	GTTTTC	2	12	5623741	5623752	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	428312912
2070	NC_019738	TGCCCG	2	12	5624792	5624803	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	428312912
2071	NC_019738	CTAAAG	2	12	5626482	5626493	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	428312913
2072	NC_019738	CCTCAC	2	12	5626983	5626994	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	428312914
2073	NC_019738	GAGAAG	2	12	5627285	5627296	50 %	0 %	50 %	0 %	428312914
2074	NC_019738	GCGATC	2	12	5629351	5629362	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	428312916
2075	NC_019738	GTCATT	2	12	5629977	5629988	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	428312916
2076	NC_019738	CAATAA	2	12	5640716	5640727	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	428312924
2077	NC_019738	CAACAG	2	12	5643129	5643140	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	428312924
2078	NC_019738	GCGGTG	2	12	5645206	5645217	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	428312924
2079	NC_019738	TAAAGC	2	12	5645266	5645277	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	428312924
2080	NC_019738	AATGCC	2	12	5648859	5648870	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428312927
2081	NC_019738	GCAATG	2	12	5652088	5652099	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	428312929
2082	NC_019738	ATTTCT	2	12	5655583	5655594	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	428312932
2083	NC_019738	TTGATG	2	12	5661979	5661990	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2084	NC_019738	TATAAA	2	12	5664969	5664980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	428312937
2085	NC_019738	ATGTTG	2	12	5668249	5668260	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	428312938
2086	NC_019738	GAGGCT	2	12	5668922	5668933	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	428312939
2087	NC_019738	GTTCTG	2	12	5669649	5669660	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	428312939
2088	NC_019738	TCACCT	2	12	5672344	5672355	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	428312942
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2090	NC_019738	AAAGCA	2	12	5673559	5673570	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	428312943
2091	NC_019738	CGCTAC	2	12	5675486	5675497	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
2092	NC_019738	TATTTA	2	12	5680535	5680546	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2093	NC_019738	AAGTTT	2	12	5684199	5684210	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	428312954
2094	NC_019738	AGCAGT	2	12	5686873	5686884	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	428312955
2095	NC_019738	TCAGCA	2	12	5686955	5686966	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428312955
2096	NC_019738	TTTTTG	2	12	5690699	5690710	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	428312960
2097	NC_019738	CGTTTA	2	12	5694577	5694588	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	428312962
2098	NC_019738	CTTGTT	2	12	5697705	5697716	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	428312965
2099	NC_019738	AAAGCG	2	12	5699740	5699751	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2100	NC_019738	GGATAA	2	12	5703206	5703217	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	428312969
2101	NC_019738	CTTTCT	2	12	5712954	5712965	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2102	NC_019738	AAGCCA	2	12	5713613	5713624	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	428312977
2103	NC_019738	TCATTT	2	12	5714774	5714785	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	428312978
2104	NC_019738	CTAGCG	2	12	5716693	5716704	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	428312980
2105	NC_019738	GCTTTA	2	12	5719259	5719270	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	428312981
2106	NC_019738	CAAGAA	2	12	5722416	5722427	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	428312983
2107	NC_019738	TATCAA	2	12	5722689	5722700	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	428312983
2108	NC_019738	GGAACT	2	12	5724822	5724833	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	428312984
2109	NC_019738	AAAAGC	2	12	5727402	5727413	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2110	NC_019738	AAGAAA	2	12	5729207	5729218	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2111	NC_019738	TAGATG	2	12	5729682	5729693	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428312988
2112	NC_019738	TGGGAT	2	12	5730844	5730855	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	428312988
2113	NC_019738	TGGGGC	2	12	5732016	5732027	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	428312988
2114	NC_019738	TCCCAA	2	12	5732970	5732981	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	428312989
2115	NC_019738	GTAAAG	2	12	5732995	5733006	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	428312989
2116	NC_019738	CCGAAC	2	12	5735031	5735042	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	428312990
2117	NC_019738	ACCGTC	2	12	5736812	5736823	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	428312993
2118	NC_019738	TGAACC	2	12	5737247	5737258	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428312993
2119	NC_019738	AATCTC	2	12	5740198	5740209	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428312997
2120	NC_019738	TTGCTC	2	12	5742341	5742352	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
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2130	NC_019738	CCTGCA	2	12	5757664	5757675	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	428313011
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2133	NC_019738	ATTGCC	2	12	5760262	5760273	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	428313013
2134	NC_019738	ATTGCC	2	12	5760541	5760552	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	428313013
2135	NC_019738	CGTCAG	2	12	5760856	5760867	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	428313013
2136	NC_019738	CGTCAG	2	12	5761108	5761119	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	428313013
2137	NC_019738	GCTGGA	2	12	5761609	5761620	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
2138	NC_019738	TATGGA	2	12	5763132	5763143	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2139	NC_019738	GATGCT	2	12	5768163	5768174	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	428313024
2140	NC_019738	GCGATC	2	12	5778152	5778163	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	428313032
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2143	NC_019738	AGAACA	2	12	5779359	5779370	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	428313035
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2147	NC_019738	TAGCGA	2	12	5789161	5789172	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	428313042
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2204	NC_019738	ACTTTG	2	12	5932854	5932865	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	428313154
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2207	NC_019738	GGCTTC	2	12	5946910	5946921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428313163
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2211	NC_019738	GCTCCT	2	12	5963197	5963208	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
2212	NC_019738	CCTACC	2	12	5965118	5965129	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2213	NC_019738	CGGTGA	2	12	5967119	5967130	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	428313176
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2215	NC_019738	CGGAGC	2	12	5971715	5971726	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
2216	NC_019738	CAATAT	2	12	5974133	5974144	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	428313181
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2218	NC_019738	TTCACC	2	12	5979265	5979276	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	428313184
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2221	NC_019738	GCAGCG	2	12	5988331	5988342	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	428313193
2222	NC_019738	TATAGC	2	12	5993526	5993537	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
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2317	NC_019738	ATCTCA	2	12	6238677	6238688	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428313398
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2321	NC_019738	TGACAG	2	12	6243741	6243752	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	428313404
2322	NC_019738	ACCTCC	2	12	6245445	6245456	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	428313406
2323	NC_019738	TCCGCC	2	12	6245811	6245822	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	428313406
2324	NC_019738	GGCTTT	2	12	6247091	6247102	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	428313407
2325	NC_019738	TTCACA	2	12	6248276	6248287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428313408
2326	NC_019738	CCTCAT	2	12	6249141	6249152	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
2327	NC_019738	GCCCAA	2	12	6249441	6249452	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
2328	NC_019738	CAAAAA	2	12	6249465	6249476	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2329	NC_019738	GTGCGG	2	12	6253976	6253987	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	428313413
2330	NC_019738	CAAAGC	2	12	6256680	6256691	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	428313415
2331	NC_019738	CTTACC	2	12	6256975	6256986	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	428313416
2332	NC_019738	TCAGAG	2	12	6263085	6263096	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	428313418
2333	NC_019738	CAACCA	2	12	6263763	6263774	50 %	0 %	0 %	50 %	428313419
2334	NC_019738	GGCTAA	2	12	6266277	6266288	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	428313420
2335	NC_019738	ACCATT	2	12	6270404	6270415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428313423
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2416	NC_019738	CTATCG	2	12	6502109	6502120	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	428313618
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2427	NC_019738	TCCCCA	2	12	6527263	6527274	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	428313632
2428	NC_019738	CAAGAT	2	12	6528685	6528696	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	428313634
2429	NC_019738	GATATG	2	12	6530842	6530853	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428313637
2430	NC_019738	AGCCTC	2	12	6531423	6531434	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	428313637
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2432	NC_019738	TTATAA	2	12	6534691	6534702	50 %	50 %	0 %	0 %	428313639
2433	NC_019738	GCTGAA	2	12	6535087	6535098	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	428313640
2434	NC_019738	GATGGG	2	12	6539333	6539344	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	428313644
2435	NC_019738	GGCGAT	2	12	6540654	6540665	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	428313645
2436	NC_019738	ACTGAA	2	12	6544833	6544844	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	428313649
2437	NC_019738	TCCTCA	2	12	6546004	6546015	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
2438	NC_019738	TGGTAG	2	12	6548915	6548926	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	428313652
2439	NC_019738	ATTTTC	2	12	6550081	6550092	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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2441	NC_019738	ATTGCT	2	12	6557332	6557343	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	428313660
2442	NC_019738	CGGAAT	2	12	6558904	6558915	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	428313662
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