MICAS: Microsatellite Analysis Server

Hexa-nucleotide Repeats of Microcoleus sp. PCC 7113 chromosome

Total Repeats: 2768

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_019738	TTGGCT	2	12	4081295	4081306	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	428311689
1502	NC_019738	CACATC	2	12	4085611	4085622	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	428311693
1503	NC_019738	CCTCTG	2	12	4087297	4087308	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	428311695
1504	NC_019738	CTTCCT	2	12	4093333	4093344	0 %	50 %	0 %	50 %	428311698
1505	NC_019738	CATTAA	2	12	4096557	4096568	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	428311701
1506	NC_019738	GAAAGG	2	12	4097254	4097265	50 %	0 %	50 %	0 %	428311702
1507	NC_019738	GTAGGT	2	12	4100472	4100483	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	428311704
1508	NC_019738	ACAGTC	2	12	4110751	4110762	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1509	NC_019738	AGAATC	2	12	4110988	4110999	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	428311714
1510	NC_019738	TCTTGC	2	12	4111444	4111455	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1511	NC_019738	CAATCC	2	12	4113790	4113801	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	428311717
1512	NC_019738	CACGCC	2	12	4117166	4117177	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	428311719
1513	NC_019738	AACGCC	2	12	4117178	4117189	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	428311719
1514	NC_019738	CCAACG	2	12	4117200	4117211	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	428311719
1515	NC_019738	CCTCGT	2	12	4117624	4117635	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	428311719
1516	NC_019738	ATACAG	2	12	4125545	4125556	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	428311725
1517	NC_019738	CAACCT	2	12	4126876	4126887	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
1518	NC_019738	GCGATC	2	12	4128814	4128825	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	428311727
1519	NC_019738	ACGGTA	2	12	4130354	4130365	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	428311728
1520	NC_019738	CAGTCC	2	12	4132923	4132934	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	428311730
1521	NC_019738	AAAACC	2	12	4134055	4134066	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428311731
1522	NC_019738	ACCCAA	2	12	4137456	4137467	50 %	0 %	0 %	50 %	428311735
1523	NC_019738	CTTTCC	2	12	4141326	4141337	0 %	50 %	0 %	50 %	428311736
1524	NC_019738	GGCGAT	2	12	4141440	4141451	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	428311736
1525	NC_019738	CGATCG	2	12	4150675	4150686	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	428311741
1526	NC_019738	CTCATC	2	12	4151231	4151242	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	428311741
1527	NC_019738	ACCTTG	2	12	4153265	4153276	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	428311742
1528	NC_019738	GTGTCA	2	12	4160814	4160825	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1529	NC_019738	GGTTTA	2	12	4166531	4166542	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	428311753
1530	NC_019738	TGCCCG	2	12	4166802	4166813	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	428311753
1531	NC_019738	GCGGTG	2	12	4167341	4167352	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	428311753
1532	NC_019738	TTGCCT	2	12	4167410	4167421	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	428311753
1533	NC_019738	TGGCTG	2	12	4170455	4170466	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	428311756
1534	NC_019738	GAACTC	2	12	4178958	4178969	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428311760
1535	NC_019738	CGATGG	2	12	4184250	4184261	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	428311764
1536	NC_019738	ACCAAA	2	12	4184640	4184651	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	428311765
1537	NC_019738	TGGCCC	2	12	4188159	4188170	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	428311767
1538	NC_019738	CAGAAG	2	12	4188854	4188865	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	428311768
1539	NC_019738	TCCCAA	2	12	4189969	4189980	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	428311768
1540	NC_019738	AGTATC	2	12	4190614	4190625	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	428311769
1541	NC_019738	TTTTAG	2	12	4191337	4191348	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	428311769
1542	NC_019738	GCAACC	2	12	4193290	4193301	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	428311771
1543	NC_019738	GAACTG	2	12	4197410	4197421	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	428311772
1544	NC_019738	TAAAAC	2	12	4199225	4199236	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1545	NC_019738	GTTGCT	2	12	4199293	4199304	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1546	NC_019738	ACTCCA	2	12	4199943	4199954	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	428311774
1547	NC_019738	AATTTA	2	12	4202435	4202446	50 %	50 %	0 %	0 %	428311776
1548	NC_019738	TTTCTT	2	12	4205128	4205139	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	428311779
1549	NC_019738	TCGGTT	2	12	4207095	4207106	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	428311781
1550	NC_019738	CACAGA	2	12	4208643	4208654	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	428311783
1551	NC_019738	TTAGTG	2	12	4214152	4214163	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	428311788
1552	NC_019738	AAGGTA	2	12	4216298	4216309	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1553	NC_019738	CCATTA	2	12	4216407	4216418	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428311791
1554	NC_019738	TCCCCG	2	12	4225310	4225321	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	428311798
1555	NC_019738	TAGGAA	2	12	4226940	4226951	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1556	NC_019738	CAGCTT	2	12	4233803	4233814	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	428311807
1557	NC_019738	ATCAAT	2	12	4235852	4235863	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	428311810
1558	NC_019738	CCAACC	4	24	4240292	4240315	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428311811
1559	NC_019738	CCAACC	2	12	4240322	4240333	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	428311811
1560	NC_019738	CCAACG	2	12	4240352	4240363	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	428311811
1561	NC_019738	GCAATA	2	12	4241954	4241965	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1562	NC_019738	TCAATT	2	12	4248988	4248999	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	428311817
1563	NC_019738	CTATGA	2	12	4255440	4255451	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1564	NC_019738	GCTGGG	2	12	4256333	4256344	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	428311823
1565	NC_019738	TTGGGA	2	12	4257540	4257551	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	428311824
1566	NC_019738	ATCCCA	2	12	4258539	4258550	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	428311825
1567	NC_019738	GGAATT	2	12	4269515	4269526	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428311837
1568	NC_019738	AATTGA	2	12	4273363	4273374	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	428311840
1569	NC_019738	CGTCCT	2	12	4291071	4291082	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	428311855
1570	NC_019738	CAGTTG	2	12	4293160	4293171	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1571	NC_019738	GTAAAG	2	12	4305440	4305451	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	428311867
1572	NC_019738	ACCAGT	2	12	4306911	4306922	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428311868
1573	NC_019738	GGGTTT	2	12	4308314	4308325	0 %	50 %	50 %	0 %	428311869
1574	NC_019738	TTCACG	2	12	4321562	4321573	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	428311883
1575	NC_019738	GTTTTG	2	12	4328795	4328806	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	428311886
1576	NC_019738	AGGAAC	2	12	4331943	4331954	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	428311888
1577	NC_019738	ATTGAA	2	12	4333844	4333855	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	428311888
1578	NC_019738	ATACTG	2	12	4335723	4335734	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1579	NC_019738	CTTATT	2	12	4335979	4335990	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	428311890
1580	NC_019738	ATCGAA	2	12	4339784	4339795	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1581	NC_019738	TTGATT	2	12	4339975	4339986	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1582	NC_019738	CACAGG	2	12	4340518	4340529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428311892
1583	NC_019738	CACGCC	2	12	4341180	4341191	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	428311893
1584	NC_019738	ATGTGG	2	12	4341457	4341468	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	428311893
1585	NC_019738	TCCTCA	2	12	4342281	4342292	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
1586	NC_019738	ATTTCA	2	12	4356500	4356511	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	428311900
1587	NC_019738	TAACTT	2	12	4357076	4357087	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	428311901
1588	NC_019738	ATGCCG	2	12	4365520	4365531	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	428311908
1589	NC_019738	ATGGTG	2	12	4365799	4365810	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	428311908
1590	NC_019738	GTTTGG	2	12	4366240	4366251	0 %	50 %	50 %	0 %	428311908
1591	NC_019738	CTTCAT	2	12	4367388	4367399	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	428311911
1592	NC_019738	GAAATT	2	12	4367965	4367976	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	428311911
1593	NC_019738	CAGCTA	2	12	4369226	4369237	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428311911
1594	NC_019738	CGATTG	2	12	4371583	4371594	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	428311913
1595	NC_019738	GCATCA	2	12	4375334	4375345	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428311917
1596	NC_019738	GGGCAT	2	12	4377147	4377158	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	428311919
1597	NC_019738	CGGAAG	2	12	4379134	4379145	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	428311920
1598	NC_019738	TCCACA	2	12	4381692	4381703	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	428311924
1599	NC_019738	GCAAAG	2	12	4382920	4382931	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1600	NC_019738	GAAGCA	2	12	4384277	4384288	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	428311925
1601	NC_019738	AGGGCG	2	12	4392596	4392607	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	428311934
1602	NC_019738	ACCAGC	2	12	4394159	4394170	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	428311934
1603	NC_019738	AAGCTT	2	12	4398977	4398988	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1604	NC_019738	TGGTGT	2	12	4399035	4399046	0 %	50 %	50 %	0 %	428311938
1605	NC_019738	ATGTCG	2	12	4399823	4399834	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	428311938
1606	NC_019738	TTGATG	2	12	4401815	4401826	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	428311940
1607	NC_019738	AAAAGA	2	12	4404913	4404924	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	428311942
1608	NC_019738	CGCGAA	2	12	4405113	4405124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428311942
1609	NC_019738	CGGTTC	2	12	4405233	4405244	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428311942
1610	NC_019738	TCTTGC	2	12	4406415	4406426	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	428311944
1611	NC_019738	AACTCT	2	12	4410251	4410262	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428311945
1612	NC_019738	TTGTAG	2	12	4411951	4411962	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	428311947
1613	NC_019738	TGCTCT	2	12	4413241	4413252	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	428311948
1614	NC_019738	AGGCTA	2	12	4414281	4414292	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1615	NC_019738	GATTAA	2	12	4414635	4414646	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	428311950
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1630	NC_019738	TCGGAT	2	12	4453825	4453836	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1631	NC_019738	ACCCAA	2	12	4475155	4475166	50 %	0 %	0 %	50 %	428312003
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1701	NC_019738	TACGAT	2	12	4628254	4628265	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	428312117
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1709	NC_019738	ACTGAT	2	12	4640771	4640782	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	428312127
1710	NC_019738	TGGATT	2	12	4643640	4643651	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	428312131
1711	NC_019738	GGACAA	2	12	4647938	4647949	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	428312135
1712	NC_019738	TCAAGG	2	12	4648924	4648935	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	428312135
1713	NC_019738	GGTTAA	2	12	4652669	4652680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428312138
1714	NC_019738	TCCCCA	2	12	4656918	4656929	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	428312139
1715	NC_019738	TCGCTG	2	12	4664116	4664127	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428312144
1716	NC_019738	AAACAA	2	12	4664313	4664324	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	428312144
1717	NC_019738	ATGTCA	2	12	4668336	4668347	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
1718	NC_019738	CCAAGC	5	30	4677048	4677077	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	428312147
1719	NC_019738	CCAGCC	2	12	4677286	4677297	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	428312147
1720	NC_019738	CCACAA	2	12	4677329	4677340	50 %	0 %	0 %	50 %	428312147
1721	NC_019738	AAATTT	2	12	4678625	4678636	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1722	NC_019738	TCGCGA	2	12	4679807	4679818	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	428312150
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1833	NC_019738	ATCCCC	2	12	4969785	4969796	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1834	NC_019738	ATACGA	2	12	4972750	4972761	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	428312372
1835	NC_019738	GACACC	2	12	4973533	4973544	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	428312373
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1837	NC_019738	CAATTC	2	12	4983268	4983279	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428312380
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1839	NC_019738	TGCTCA	2	12	4995354	4995365	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
1840	NC_019738	AGAAAA	2	12	4996309	4996320	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	428312394
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1842	NC_019738	GCTACA	2	12	5001056	5001067	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428312399
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1939	NC_019738	GTTCCT	2	12	5270203	5270214	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	428312616
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1942	NC_019738	TGATGG	2	12	5284314	5284325	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	428312623
1943	NC_019738	TATCAG	2	12	5284477	5284488	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	428312623
1944	NC_019738	CCCAAG	2	12	5286901	5286912	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	428312626
1945	NC_019738	AACATC	2	12	5287451	5287462	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	428312628
1946	NC_019738	CAGTTA	2	12	5288758	5288769	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	428312631
1947	NC_019738	ATCTCA	2	12	5289540	5289551	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428312631
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1950	NC_019738	GGATTG	2	12	5298987	5298998	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	428312641
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1961	NC_019738	CATTGC	2	12	5319460	5319471	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	428312656
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1971	NC_019738	GATTCA	2	12	5340317	5340328	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	428312676
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1982	NC_019738	AGGATG	2	12	5371225	5371236	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1992	NC_019738	ATCTTG	2	12	5389380	5389391	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	428312704
1993	NC_019738	TCACGA	2	12	5393385	5393396	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428312706
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1996	NC_019738	ACCACA	2	12	5408128	5408139	50 %	0 %	0 %	50 %	428312721
1997	NC_019738	ATCTAA	2	12	5408364	5408375	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
1998	NC_019738	CGGCAA	2	12	5410130	5410141	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428312724
1999	NC_019738	GACGCC	2	12	5410751	5410762	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	428312724
2000	NC_019738	GCTAAG	2	12	5411695	5411706	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	428312724

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