MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Microcoleus sp. PCC 7113 chromosome

Total Repeats: 2768

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2501	NC_019738	ATCTTC	2	12	6726706	6726717	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	428313800
2502	NC_019738	ACTGAC	2	12	6736458	6736469	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428313810
2503	NC_019738	ATCCGC	2	12	6742423	6742434	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	428313814
2504	NC_019738	AAAGCC	2	12	6748834	6748845	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	428313820
2505	NC_019738	ATGGGG	2	12	6749342	6749353	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	428313821
2506	NC_019738	CAGCAT	2	12	6755627	6755638	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428313827
2507	NC_019738	CGACAT	2	12	6758401	6758412	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428313830
2508	NC_019738	CCAAAT	2	12	6764875	6764886	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	428313835
2509	NC_019738	TAACTC	2	12	6764895	6764906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2510	NC_019738	GATGAA	2	12	6769164	6769175	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2511	NC_019738	GTTTGA	2	12	6771802	6771813	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2512	NC_019738	TATCTG	2	12	6775833	6775844	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2513	NC_019738	TGGCTT	2	12	6776642	6776653	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2514	NC_019738	AGTGCT	2	12	6780783	6780794	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	428313850
2515	NC_019738	TCAAAT	2	12	6786636	6786647	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	428313854
2516	NC_019738	GGAGAG	2	12	6788497	6788508	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428313856
2517	NC_019738	AAGTTC	2	12	6789614	6789625	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	428313857
2518	NC_019738	GTTCAG	2	12	6794618	6794629	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	428313862
2519	NC_019738	ATCCTT	2	12	6798868	6798879	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2520	NC_019738	CAGTGC	2	12	6799128	6799139	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	428313865
2521	NC_019738	TAAGGG	2	12	6804793	6804804	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	428313868
2522	NC_019738	AGCCTT	2	12	6807352	6807363	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	428313869
2523	NC_019738	GCTGTG	2	12	6817359	6817370	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	428313879
2524	NC_019738	AACTCA	2	12	6822387	6822398	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	428313883
2525	NC_019738	TGCCTG	4	24	6824581	6824604	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428313885
2526	NC_019738	GTGCCT	3	18	6824622	6824639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428313885
2527	NC_019738	TGCCTG	2	12	6824782	6824793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428313885
2528	NC_019738	CCTGTG	2	12	6824841	6824852	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428313885
2529	NC_019738	TGCCTG	2	12	6824941	6824952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428313885
2530	NC_019738	GTGCCC	2	12	6824958	6824969	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	428313885
2531	NC_019738	TGCCCG	2	12	6825004	6825015	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	428313885
2532	NC_019738	CGTGAT	2	12	6827869	6827880	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	428313886
2533	NC_019738	GATTCG	2	12	6833390	6833401	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	428313889
2534	NC_019738	GCGTCG	2	12	6835384	6835395	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	428313890
2535	NC_019738	AGTCTA	2	12	6845579	6845590	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	428313899
2536	NC_019738	GTTTGA	2	12	6847076	6847087	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2537	NC_019738	CTAGAA	2	12	6851403	6851414	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	428313906
2538	NC_019738	GACTCC	2	12	6856841	6856852	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	428313907
2539	NC_019738	CTGAAC	2	12	6859328	6859339	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428313908
2540	NC_019738	TAAATT	2	12	6863444	6863455	50 %	50 %	0 %	0 %	428313912
2541	NC_019738	TTGCAG	2	12	6864421	6864432	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	428313913
2542	NC_019738	GACGAT	2	12	6874398	6874409	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	428313919
2543	NC_019738	CGAGAA	2	12	6875890	6875901	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	428313920
2544	NC_019738	AACCCT	2	12	6881234	6881245	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	428313924
2545	NC_019738	CAGTTT	2	12	6886942	6886953	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2546	NC_019738	CCGCGA	2	12	6894128	6894139	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	428313931
2547	NC_019738	TTCATC	2	12	6896613	6896624	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2548	NC_019738	GGAGGG	2	12	6897664	6897675	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	428313932
2549	NC_019738	CACGAA	2	12	6897826	6897837	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	428313932
2550	NC_019738	AGATGC	2	12	6905079	6905090	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	428313937
2551	NC_019738	AATGAG	2	12	6906516	6906527	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	428313939
2552	NC_019738	TGAGAG	2	12	6908554	6908565	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	428313941
2553	NC_019738	ATTGGA	2	12	6909488	6909499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2554	NC_019738	TAGTCG	2	12	6909846	6909857	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	428313943
2555	NC_019738	CACCGA	2	12	6911093	6911104	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	428313945
2556	NC_019738	TTAATT	2	12	6911928	6911939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2557	NC_019738	TCAGAA	2	12	6914510	6914521	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	428313948
2558	NC_019738	AAATTT	2	12	6917033	6917044	50 %	50 %	0 %	0 %	428313951
2559	NC_019738	CTGTAA	2	12	6918678	6918689	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	428313953
2560	NC_019738	AGTGCT	2	12	6919411	6919422	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	428313953
2561	NC_019738	TCTAAA	2	12	6919517	6919528	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2562	NC_019738	TACCAA	2	12	6920207	6920218	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	428313954
2563	NC_019738	ATTTTG	2	12	6921468	6921479	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	428313954
2564	NC_019738	TTTACG	2	12	6928146	6928157	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	428313960
2565	NC_019738	GAAGGC	2	12	6931439	6931450	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	428313964
2566	NC_019738	GAATCC	2	12	6943593	6943604	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428313977
2567	NC_019738	GTTTCA	2	12	6944809	6944820	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2568	NC_019738	AGTCGC	2	12	6947356	6947367	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	428313981
2569	NC_019738	TTCTGG	2	12	6947645	6947656	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	428313981
2570	NC_019738	GTTTGA	2	12	6948084	6948095	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	428313981
2571	NC_019738	AACTTT	2	12	6950738	6950749	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	428313983
2572	NC_019738	GAGTTG	2	12	6950756	6950767	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	428313983
2573	NC_019738	TGGAAA	2	12	6954511	6954522	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	428313985
2574	NC_019738	GACTGA	2	12	6955519	6955530	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	428313985
2575	NC_019738	TTTGAG	2	12	6957048	6957059	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	428313986
2576	NC_019738	TGGCAA	2	12	6959874	6959885	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	428313987
2577	NC_019738	GGCTGA	2	12	6960191	6960202	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	428313987
2578	NC_019738	CAAAGC	2	12	6961172	6961183	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	428313987
2579	NC_019738	ATCAAC	2	12	6961923	6961934	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	428313989
2580	NC_019738	TGAGGA	2	12	6964220	6964231	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
2581	NC_019738	GGGTCA	2	12	6967491	6967502	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	428313992
2582	NC_019738	CTTGTG	2	12	6968568	6968579	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	428313993
2583	NC_019738	TGAACT	2	12	6970279	6970290	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
2584	NC_019738	TGGTGT	2	12	6977963	6977974	0 %	50 %	50 %	0 %	428313997
2585	NC_019738	AAGGAG	2	12	6978518	6978529	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2586	NC_019738	TAGAAC	2	12	6978702	6978713	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	428313998
2587	NC_019738	TTGACA	2	12	6980190	6980201	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	428314001
2588	NC_019738	CGCTCT	2	12	6982846	6982857	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	428314003
2589	NC_019738	ACTCTC	2	12	6986043	6986054	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	428314003
2590	NC_019738	TAGGGT	2	12	6986546	6986557	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	428314003
2591	NC_019738	ACTGAA	2	12	6987222	6987233	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	428314003
2592	NC_019738	TCCTCT	2	12	6989349	6989360	0 %	50 %	0 %	50 %	428314006
2593	NC_019738	GGTTAG	2	12	6995232	6995243	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	428314008
2594	NC_019738	CGCTTT	2	12	6998278	6998289	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	428314010
2595	NC_019738	GGGAAG	2	12	7003696	7003707	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	428314012
2596	NC_019738	CATCTA	2	12	7006648	7006659	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314013
2597	NC_019738	GGGGTG	2	12	7016295	7016306	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	428314024
2598	NC_019738	ACCCTA	2	12	7021571	7021582	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	428314027
2599	NC_019738	GTTTCA	2	12	7029032	7029043	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	428314032
2600	NC_019738	AACCTG	2	12	7031077	7031088	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428314032
2601	NC_019738	GTGTAA	2	12	7042687	7042698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314044
2602	NC_019738	TTCTGG	2	12	7046004	7046015	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	428314047
2603	NC_019738	GCTCTA	2	12	7049146	7049157	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	428314050
2604	NC_019738	ATCGCC	2	12	7049542	7049553	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	428314050
2605	NC_019738	AGTTTT	2	12	7049940	7049951	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
2606	NC_019738	TTTGCA	2	12	7056887	7056898	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	428314059
2607	NC_019738	CAAGAA	2	12	7057103	7057114	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	428314059
2608	NC_019738	GGCAAA	2	12	7060822	7060833	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	428314063
2609	NC_019738	CTGGCA	2	12	7064977	7064988	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	428314067
2610	NC_019738	AACCGA	2	12	7074542	7074553	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	428314073
2611	NC_019738	TTCAAC	2	12	7074759	7074770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	428314073
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2703	NC_019738	TGCGAT	2	12	7301302	7301313	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	428314262
2704	NC_019738	CCCTTT	2	12	7301776	7301787	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2705	NC_019738	CAGTTC	2	12	7302274	7302285	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	428314263
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2712	NC_019738	GTCTTT	2	12	7311003	7311014	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	428314269
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2715	NC_019738	ATTGAG	2	12	7315187	7315198	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	428314274
2716	NC_019738	GAATAC	2	12	7317794	7317805	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	428314276
2717	NC_019738	CCAGTA	2	12	7319807	7319818	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	428314278
2718	NC_019738	GGATTT	2	12	7321663	7321674	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	428314280
2719	NC_019738	GAACCC	2	12	7322076	7322087	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	428314281
2720	NC_019738	GCAACG	2	12	7322880	7322891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	428314282
2721	NC_019738	AAAATC	2	12	7323146	7323157	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	428314282
2722	NC_019738	CCCAGC	2	12	7329278	7329289	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	428314287
2723	NC_019738	CATCGA	2	12	7333350	7333361	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
2724	NC_019738	GATTGT	2	12	7333872	7333883	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	428314291
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2727	NC_019738	TAAACA	2	12	7344223	7344234	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2728	NC_019738	GATCGC	2	12	7349681	7349692	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	428314303
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2731	NC_019738	ATCGCG	2	12	7358165	7358176	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	428314311
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2734	NC_019738	ATATTG	2	12	7366272	7366283	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
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2746	NC_019738	TGGCTC	2	12	7398342	7398353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	428314353
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2749	NC_019738	AATATC	2	12	7410242	7410253	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	428314368
2750	NC_019738	TCCATC	2	12	7412059	7412070	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	428314369
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2752	NC_019738	GAAAAC	2	12	7415062	7415073	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	428314371
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2754	NC_019738	GATATC	2	12	7420381	7420392	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	428314372
2755	NC_019738	GCGATC	2	12	7422994	7423005	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	428314373
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2760	NC_019738	GTCCCA	2	12	7447421	7447432	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	428314392
2761	NC_019738	TCTTCC	2	12	7451678	7451689	0 %	50 %	0 %	50 %	428314394
2762	NC_019738	TTACCG	2	12	7452856	7452867	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
2763	NC_019738	TTTATT	2	12	7454826	7454837	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	428314396
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2765	NC_019738	ACCCGC	2	12	7457301	7457312	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	428314399
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2767	NC_019738	GTTGAA	2	12	7462004	7462015	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2768	NC_019738	TCGCTT	2	12	7464288	7464299	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding

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