MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Marinithermus hydrothermalis DSM 14884 chromosome

Total Repeats: 2211

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015387	ACTCG	2	10	2827	2836	20 %	20 %	20 %	40 %	328949543
2	NC_015387	CGGCC	2	10	4085	4094	0 %	0 %	40 %	60 %	328949544
3	NC_015387	GACGG	2	10	4956	4965	20 %	0 %	60 %	20 %	328949544
4	NC_015387	GAACC	2	10	5097	5106	40 %	0 %	20 %	40 %	328949544
5	NC_015387	GCTTC	2	10	5566	5575	0 %	40 %	20 %	40 %	328949545
6	NC_015387	CCTTC	2	10	6538	6547	0 %	40 %	0 %	60 %	328949546
7	NC_015387	TAAGC	2	10	8206	8215	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_015387	GGGGT	2	10	8345	8354	0 %	20 %	80 %	0 %	328949547
9	NC_015387	CGGAC	2	10	8430	8439	20 %	0 %	40 %	40 %	328949547
10	NC_015387	GGGCT	2	10	8549	8558	0 %	20 %	60 %	20 %	328949547
11	NC_015387	CGGGC	2	10	11800	11809	0 %	0 %	60 %	40 %	328949552
12	NC_015387	GCGCC	2	10	12690	12699	0 %	0 %	40 %	60 %	328949553
13	NC_015387	TGGGG	2	10	13566	13575	0 %	20 %	80 %	0 %	328949553
14	NC_015387	CGGCG	2	10	13808	13817	0 %	0 %	60 %	40 %	328949554
15	NC_015387	ACTGG	2	10	14983	14992	20 %	20 %	40 %	20 %	328949555
16	NC_015387	CGCCA	2	10	15874	15883	20 %	0 %	20 %	60 %	328949556
17	NC_015387	ACCCC	2	10	16165	16174	20 %	0 %	0 %	80 %	328949557
18	NC_015387	CTCGG	2	10	17162	17171	0 %	20 %	40 %	40 %	328949558
19	NC_015387	TAGGG	2	10	17478	17487	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
20	NC_015387	CGGCG	2	10	18354	18363	0 %	0 %	60 %	40 %	328949559
21	NC_015387	CGTGC	2	10	18915	18924	0 %	20 %	40 %	40 %	328949559
22	NC_015387	CAGGC	2	10	19632	19641	20 %	0 %	40 %	40 %	328949559
23	NC_015387	AGCGC	2	10	19739	19748	20 %	0 %	40 %	40 %	328949559
24	NC_015387	TGGCC	2	10	19785	19794	0 %	20 %	40 %	40 %	328949559
25	NC_015387	TGCGC	2	10	20039	20048	0 %	20 %	40 %	40 %	328949559
26	NC_015387	TACCG	2	10	20199	20208	20 %	20 %	20 %	40 %	328949559
27	NC_015387	CGCTG	2	10	20448	20457	0 %	20 %	40 %	40 %	328949559
28	NC_015387	CCCAG	2	10	24265	24274	20 %	0 %	20 %	60 %	328949563
29	NC_015387	AGGTG	2	10	25612	25621	20 %	20 %	60 %	0 %	328949563
30	NC_015387	CGCCC	2	10	26258	26267	0 %	0 %	20 %	80 %	328949564
31	NC_015387	TGCGG	2	10	27337	27346	0 %	20 %	60 %	20 %	328949565
32	NC_015387	GGGGT	2	10	27946	27955	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
33	NC_015387	CCCGT	2	10	31441	31450	0 %	20 %	20 %	60 %	328949570
34	NC_015387	CTTCA	2	10	31899	31908	20 %	40 %	0 %	40 %	328949571
35	NC_015387	CGCGC	2	10	33023	33032	0 %	0 %	40 %	60 %	328949573
36	NC_015387	GGGGC	2	10	35335	35344	0 %	0 %	80 %	20 %	328949575
37	NC_015387	GGCTG	2	10	35619	35628	0 %	20 %	60 %	20 %	328949575
38	NC_015387	GCGCC	2	10	35776	35785	0 %	0 %	40 %	60 %	328949575
39	NC_015387	CGGTG	2	10	36051	36060	0 %	20 %	60 %	20 %	328949576
40	NC_015387	GCCGG	2	10	39053	39062	0 %	0 %	60 %	40 %	328949579
41	NC_015387	CCCTC	2	10	40195	40204	0 %	20 %	0 %	80 %	328949580
42	NC_015387	GCTAC	2	10	40395	40404	20 %	20 %	20 %	40 %	328949580
43	NC_015387	GGGGT	2	10	40445	40454	0 %	20 %	80 %	0 %	328949580
44	NC_015387	CGGCG	2	10	41481	41490	0 %	0 %	60 %	40 %	328949581
45	NC_015387	CGGAC	2	10	42966	42975	20 %	0 %	40 %	40 %	328949583
46	NC_015387	CGTAT	2	10	45159	45168	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
47	NC_015387	CCGCG	2	10	46493	46502	0 %	0 %	40 %	60 %	328949585
48	NC_015387	GACAA	2	10	47386	47395	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
49	NC_015387	TGGGG	2	10	48565	48574	0 %	20 %	80 %	0 %	328949586
50	NC_015387	CAGGG	2	10	48881	48890	20 %	0 %	60 %	20 %	328949586
51	NC_015387	GCACC	2	10	50447	50456	20 %	0 %	20 %	60 %	328949588
52	NC_015387	TACGC	2	10	50617	50626	20 %	20 %	20 %	40 %	328949588
53	NC_015387	GCAGG	2	10	50639	50648	20 %	0 %	60 %	20 %	328949588
54	NC_015387	CAGGC	2	10	50771	50780	20 %	0 %	40 %	40 %	328949588
55	NC_015387	CCGCG	2	10	52983	52992	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
56	NC_015387	GGTAG	2	10	54398	54407	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
57	NC_015387	GCGCG	2	10	55111	55120	0 %	0 %	60 %	40 %	328949590
58	NC_015387	GGAGC	2	10	55487	55496	20 %	0 %	60 %	20 %	328949590
59	NC_015387	GGGGC	2	10	56130	56139	0 %	0 %	80 %	20 %	328949591
60	NC_015387	GGGGC	2	10	56269	56278	0 %	0 %	80 %	20 %	328949591
61	NC_015387	CGGGC	2	10	56317	56326	0 %	0 %	60 %	40 %	328949591
62	NC_015387	GGCGG	2	10	56742	56751	0 %	0 %	80 %	20 %	328949591
63	NC_015387	AGGCC	2	10	56917	56926	20 %	0 %	40 %	40 %	328949591
64	NC_015387	GCCAG	2	10	57904	57913	20 %	0 %	40 %	40 %	328949593
65	NC_015387	GGGGT	2	10	58338	58347	0 %	20 %	80 %	0 %	328949593
66	NC_015387	CGGGG	2	10	58648	58657	0 %	0 %	80 %	20 %	328949593
67	NC_015387	GGCGA	2	10	58836	58845	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
68	NC_015387	GGCGT	2	10	59009	59018	0 %	20 %	60 %	20 %	328949594
69	NC_015387	CTGGG	2	10	59465	59474	0 %	20 %	60 %	20 %	328949594
70	NC_015387	CGGCG	2	10	59551	59560	0 %	0 %	60 %	40 %	328949594
71	NC_015387	GGCCA	2	10	60019	60028	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
72	NC_015387	GATGC	2	10	60452	60461	20 %	20 %	40 %	20 %	328949595
73	NC_015387	AACCA	2	10	60704	60713	60 %	0 %	0 %	40 %	328949595
74	NC_015387	CGCAC	2	10	61273	61282	20 %	0 %	20 %	60 %	328949596
75	NC_015387	CGCGC	2	10	61347	61356	0 %	0 %	40 %	60 %	328949596
76	NC_015387	GAAGC	2	10	63502	63511	40 %	0 %	40 %	20 %	328949598
77	NC_015387	CCTGG	2	10	65523	65532	0 %	20 %	40 %	40 %	328949600
78	NC_015387	GGACC	2	10	66267	66276	20 %	0 %	40 %	40 %	328949601
79	NC_015387	CGCGG	2	10	67279	67288	0 %	0 %	60 %	40 %	328949602
80	NC_015387	GGGCC	2	10	68006	68015	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
81	NC_015387	CGGCC	2	10	70841	70850	0 %	0 %	40 %	60 %	328949605
82	NC_015387	CACGC	2	10	71776	71785	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
83	NC_015387	GCTTC	2	10	72365	72374	0 %	40 %	20 %	40 %	328949607
84	NC_015387	GCCGC	2	10	73012	73021	0 %	0 %	40 %	60 %	328949607
85	NC_015387	AGCCC	2	10	74320	74329	20 %	0 %	20 %	60 %	328949609
86	NC_015387	CCGCG	2	10	74452	74461	0 %	0 %	40 %	60 %	328949609
87	NC_015387	CCTCG	2	10	75978	75987	0 %	20 %	20 %	60 %	328949611
88	NC_015387	GTGAG	2	10	76269	76278	20 %	20 %	60 %	0 %	328949612
89	NC_015387	AAGCC	2	10	77802	77811	40 %	0 %	20 %	40 %	328949613
90	NC_015387	GCGCG	2	10	78421	78430	0 %	0 %	60 %	40 %	328949614
91	NC_015387	CGTAC	2	10	78924	78933	20 %	20 %	20 %	40 %	328949615
92	NC_015387	CGGGG	2	10	79559	79568	0 %	0 %	80 %	20 %	328949615
93	NC_015387	GGGGC	2	10	79908	79917	0 %	0 %	80 %	20 %	328949615
94	NC_015387	CCACC	2	10	79918	79927	20 %	0 %	0 %	80 %	328949615
95	NC_015387	GCCCG	2	10	80205	80214	0 %	0 %	40 %	60 %	328949616
96	NC_015387	CGGGG	2	10	80451	80460	0 %	0 %	80 %	20 %	328949616
97	NC_015387	GCCGG	2	10	81365	81374	0 %	0 %	60 %	40 %	328949617
98	NC_015387	CCGCG	2	10	81395	81404	0 %	0 %	40 %	60 %	328949617
99	NC_015387	GCCGA	2	10	83396	83405	20 %	0 %	40 %	40 %	328949619
100	NC_015387	GCGGG	2	10	83658	83667	0 %	0 %	80 %	20 %	328949619
101	NC_015387	TCCGC	2	10	86997	87006	0 %	20 %	20 %	60 %	328949623
102	NC_015387	GAACG	2	10	87225	87234	40 %	0 %	40 %	20 %	328949624
103	NC_015387	CCACC	2	10	87505	87514	20 %	0 %	0 %	80 %	328949625
104	NC_015387	GGCCC	2	10	89052	89061	0 %	0 %	40 %	60 %	328949627
105	NC_015387	CGGCG	2	10	90444	90453	0 %	0 %	60 %	40 %	328949628
106	NC_015387	GGGGC	2	10	90805	90814	0 %	0 %	80 %	20 %	328949628
107	NC_015387	GCGCC	2	10	91265	91274	0 %	0 %	40 %	60 %	328949629
108	NC_015387	CTGGT	2	10	94360	94369	0 %	40 %	40 %	20 %	328949632
109	NC_015387	GTTCC	2	10	95165	95174	0 %	40 %	20 %	40 %	328949633
110	NC_015387	GCTCC	2	10	96433	96442	0 %	20 %	20 %	60 %	328949636
111	NC_015387	GCGCG	2	10	96825	96834	0 %	0 %	60 %	40 %	328949637
112	NC_015387	CGCGC	2	10	98137	98146	0 %	0 %	40 %	60 %	328949638
113	NC_015387	CCGTG	2	10	101757	101766	0 %	20 %	40 %	40 %	328949642
114	NC_015387	GCACG	2	10	102564	102573	20 %	0 %	40 %	40 %	328949642
115	NC_015387	GCCCT	2	10	103399	103408	0 %	20 %	20 %	60 %	328949643
116	NC_015387	GGCCC	2	10	105675	105684	0 %	0 %	40 %	60 %	328949648
117	NC_015387	AGCCG	2	10	106967	106976	20 %	0 %	40 %	40 %	328949648
118	NC_015387	CCCGC	2	10	107297	107306	0 %	0 %	20 %	80 %	328949648
119	NC_015387	TCGCC	2	10	107531	107540	0 %	20 %	20 %	60 %	328949648
120	NC_015387	GCGCG	2	10	108091	108100	0 %	0 %	60 %	40 %	328949649
121	NC_015387	AGGCC	2	10	108274	108283	20 %	0 %	40 %	40 %	328949649
122	NC_015387	GACGT	2	10	111368	111377	20 %	20 %	40 %	20 %	328949654
123	NC_015387	CCTCG	2	10	112347	112356	0 %	20 %	20 %	60 %	328949656
124	NC_015387	GTGCG	2	10	114920	114929	0 %	20 %	60 %	20 %	328949658
125	NC_015387	GGCTC	2	10	115180	115189	0 %	20 %	40 %	40 %	328949659
126	NC_015387	TGGGG	2	10	116338	116347	0 %	20 %	80 %	0 %	328949660
127	NC_015387	GCGGT	2	10	120007	120016	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
128	NC_015387	GGTGG	2	10	120520	120529	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
129	NC_015387	GGGAG	2	10	121068	121077	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
130	NC_015387	TAGGC	2	10	122025	122034	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
131	NC_015387	AGGGG	2	10	122434	122443	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
132	NC_015387	CCGAA	2	10	122452	122461	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
133	NC_015387	CGAGC	2	10	122925	122934	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
134	NC_015387	CCACC	2	10	123486	123495	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
135	NC_015387	CAGTA	2	10	123734	123743	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
136	NC_015387	CCTCG	2	10	123868	123877	0 %	20 %	20 %	60 %	328949666
137	NC_015387	CTACC	2	10	125177	125186	20 %	20 %	0 %	60 %	328949667
138	NC_015387	GCCGC	2	10	125371	125380	0 %	0 %	40 %	60 %	328949667
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