MICAS: Microsatellite Analysis Server

Penta-nucleotide Repeats of Marinithermus hydrothermalis DSM 14884 chromosome

Total Repeats: 2211

Go To Repeat Summary Page

< Previous 1 2 3 45Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_015387	CCCGA	2	10	2039178	2039187	20 %	0 %	20 %	60 %	328951531
2002	NC_015387	AGGCG	2	10	2039443	2039452	20 %	0 %	60 %	20 %	328951532
2003	NC_015387	CCCGC	2	10	2040116	2040125	0 %	0 %	20 %	80 %	328951533
2004	NC_015387	ACGGC	2	10	2041862	2041871	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
2005	NC_015387	GATCG	2	10	2042468	2042477	20 %	20 %	40 %	20 %	328951536
2006	NC_015387	GCACG	2	10	2042650	2042659	20 %	0 %	40 %	40 %	328951536
2007	NC_015387	AGCGA	2	10	2042954	2042963	40 %	0 %	40 %	20 %	328951536
2008	NC_015387	ACGCA	2	10	2044345	2044354	40 %	0 %	20 %	40 %	328951537
2009	NC_015387	CGGGC	2	10	2044996	2045005	0 %	0 %	60 %	40 %	328951538
2010	NC_015387	CCGGG	2	10	2045291	2045300	0 %	0 %	60 %	40 %	328951538
2011	NC_015387	CGCGC	2	10	2045462	2045471	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
2012	NC_015387	CTACC	2	10	2045654	2045663	20 %	20 %	0 %	60 %	328951539
2013	NC_015387	CCGCG	2	10	2045870	2045879	0 %	0 %	40 %	60 %	328951539
2014	NC_015387	GCGCG	2	10	2046566	2046575	0 %	0 %	60 %	40 %	328951539
2015	NC_015387	GCGGT	2	10	2046699	2046708	0 %	20 %	60 %	20 %	328951539
2016	NC_015387	GGTGG	2	10	2047522	2047531	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
2017	NC_015387	GCTCG	2	10	2048083	2048092	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
2018	NC_015387	TTCGG	2	10	2048556	2048565	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
2019	NC_015387	CCCCT	2	10	2048574	2048583	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
2020	NC_015387	GCCTA	2	10	2048983	2048992	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2021	NC_015387	CTCCC	2	10	2049940	2049949	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
2022	NC_015387	AGGAG	2	10	2050824	2050833	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
2023	NC_015387	CGCGG	2	10	2051570	2051579	0 %	0 %	60 %	40 %	328951542
2024	NC_015387	AGCCC	2	10	2054270	2054279	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
2025	NC_015387	ACCGC	2	10	2055900	2055909	20 %	0 %	20 %	60 %	328951545
2026	NC_015387	ATGCC	2	10	2056408	2056417	20 %	20 %	20 %	40 %	328951545
2027	NC_015387	AGGGG	2	10	2058299	2058308	20 %	0 %	80 %	0 %	328951548
2028	NC_015387	CCCCG	2	10	2059740	2059749	0 %	0 %	20 %	80 %	328951549
2029	NC_015387	CTACG	2	10	2059837	2059846	20 %	20 %	20 %	40 %	328951549
2030	NC_015387	GTTCG	2	10	2059986	2059995	0 %	40 %	40 %	20 %	328951549
2031	NC_015387	CCGCG	2	10	2062010	2062019	0 %	0 %	40 %	60 %	328951551
2032	NC_015387	GCAAG	2	10	2064231	2064240	40 %	0 %	40 %	20 %	328951554
2033	NC_015387	GCGCG	2	10	2064843	2064852	0 %	0 %	60 %	40 %	328951554
2034	NC_015387	CGCGC	2	10	2067516	2067525	0 %	0 %	40 %	60 %	328951557
2035	NC_015387	GCCGC	2	10	2069156	2069165	0 %	0 %	40 %	60 %	328951558
2036	NC_015387	GCCCC	2	10	2069753	2069762	0 %	0 %	20 %	80 %	328951558
2037	NC_015387	CGGGG	2	10	2069965	2069974	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
2038	NC_015387	GCGCG	2	10	2070101	2070110	0 %	0 %	60 %	40 %	328951559
2039	NC_015387	ACCGC	2	10	2070510	2070519	20 %	0 %	20 %	60 %	328951559
2040	NC_015387	CCCCG	2	10	2070568	2070577	0 %	0 %	20 %	80 %	328951559
2041	NC_015387	TCCCT	2	10	2070841	2070850	0 %	40 %	0 %	60 %	328951560
2042	NC_015387	ACCCC	2	10	2072070	2072079	20 %	0 %	0 %	80 %	328951561
2043	NC_015387	GGCGG	2	10	2074702	2074711	0 %	0 %	80 %	20 %	328951564
2044	NC_015387	GCCGC	2	10	2075011	2075020	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
2045	NC_015387	ACCCA	2	10	2075432	2075441	40 %	0 %	0 %	60 %	328951565
2046	NC_015387	CCTGC	2	10	2077096	2077105	0 %	20 %	20 %	60 %	328951566
2047	NC_015387	GGCCC	2	10	2079368	2079377	0 %	0 %	40 %	60 %	328951568
2048	NC_015387	GCCCT	2	10	2080242	2080251	0 %	20 %	20 %	60 %	328951568
2049	NC_015387	TTCAG	2	10	2082142	2082151	20 %	40 %	20 %	20 %	328951570
2050	NC_015387	ACCTG	2	10	2083184	2083193	20 %	20 %	20 %	40 %	328951571
2051	NC_015387	CTTCC	2	10	2083452	2083461	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
2052	NC_015387	CATTC	2	10	2087752	2087761	20 %	40 %	0 %	40 %	328951573
2053	NC_015387	GGGGC	2	10	2088059	2088068	0 %	0 %	80 %	20 %	328951574
2054	NC_015387	GGGTA	2	10	2089927	2089936	20 %	20 %	60 %	0 %	328951574
2055	NC_015387	CGGCG	2	10	2090287	2090296	0 %	0 %	60 %	40 %	328951575
2056	NC_015387	CACGC	2	10	2092173	2092182	20 %	0 %	20 %	60 %	328951576
2057	NC_015387	GCGCC	2	10	2094054	2094063	0 %	0 %	40 %	60 %	328951578
2058	NC_015387	TGCGT	2	10	2094163	2094172	0 %	40 %	40 %	20 %	328951578
2059	NC_015387	AGGTG	2	10	2094420	2094429	20 %	20 %	60 %	0 %	328951578
2060	NC_015387	GTTTA	2	10	2094462	2094471	20 %	60 %	20 %	0 %	328951579
2061	NC_015387	GCCTC	2	10	2097791	2097800	0 %	20 %	20 %	60 %	328951582
2062	NC_015387	CGCGC	2	10	2097991	2098000	0 %	0 %	40 %	60 %	328951582
2063	NC_015387	CGGGC	2	10	2098444	2098453	0 %	0 %	60 %	40 %	328951583
2064	NC_015387	GCCGC	2	10	2099887	2099896	0 %	0 %	40 %	60 %	328951585
2065	NC_015387	ACCCC	2	10	2101068	2101077	20 %	0 %	0 %	80 %	328951586
2066	NC_015387	GCGCG	2	10	2101234	2101243	0 %	0 %	60 %	40 %	328951586
2067	NC_015387	CCGAG	2	10	2101348	2101357	20 %	0 %	40 %	40 %	328951586
2068	NC_015387	CGGCG	2	10	2102435	2102444	0 %	0 %	60 %	40 %	328951588
2069	NC_015387	CGGGC	2	10	2104219	2104228	0 %	0 %	60 %	40 %	328951590
2070	NC_015387	GAACG	2	10	2104448	2104457	40 %	0 %	40 %	20 %	328951591
2071	NC_015387	ACCCC	2	10	2105635	2105644	20 %	0 %	0 %	80 %	328951592
2072	NC_015387	CCACC	2	10	2105996	2106005	20 %	0 %	0 %	80 %	328951592
2073	NC_015387	GTGCC	2	10	2106790	2106799	0 %	20 %	40 %	40 %	328951592
2074	NC_015387	CCGCC	2	10	2107564	2107573	0 %	0 %	20 %	80 %	328951593
2075	NC_015387	TCCCT	2	10	2108103	2108112	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
2076	NC_015387	GCTCC	2	10	2110933	2110942	0 %	20 %	20 %	60 %	328951595
2077	NC_015387	ACCGC	2	10	2114143	2114152	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
2078	NC_015387	CCCCT	2	10	2115027	2115036	0 %	20 %	0 %	80 %	328951599
2079	NC_015387	ACCCT	2	10	2117077	2117086	20 %	20 %	0 %	60 %	328951600
2080	NC_015387	GGGGT	2	10	2118822	2118831	0 %	20 %	80 %	0 %	328951602
2081	NC_015387	ACCCC	2	10	2120846	2120855	20 %	0 %	0 %	80 %	328951605
2082	NC_015387	GGTCG	2	10	2121369	2121378	0 %	20 %	60 %	20 %	328951606
2083	NC_015387	CGCGG	2	10	2122839	2122848	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
2084	NC_015387	TGGCG	2	10	2123922	2123931	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
2085	NC_015387	GGCCG	2	10	2126499	2126508	0 %	0 %	60 %	40 %	328951610
2086	NC_015387	GGACG	2	10	2129837	2129846	20 %	0 %	60 %	20 %	328951612
2087	NC_015387	GGGCG	2	10	2131941	2131950	0 %	0 %	80 %	20 %	328951614
2088	NC_015387	GCCCG	2	10	2132264	2132273	0 %	0 %	40 %	60 %	328951615
2089	NC_015387	TGGGG	2	10	2132370	2132379	0 %	20 %	80 %	0 %	328951615
2090	NC_015387	CCACC	2	10	2133297	2133306	20 %	0 %	0 %	80 %	328951617
2091	NC_015387	CGCAG	2	10	2133406	2133415	20 %	0 %	40 %	40 %	328951617
2092	NC_015387	CGCGC	3	15	2134761	2134775	0 %	0 %	40 %	60 %	328951619
2093	NC_015387	GCCGC	2	10	2138036	2138045	0 %	0 %	40 %	60 %	328951622
2094	NC_015387	CGTAC	2	10	2139289	2139298	20 %	20 %	20 %	40 %	328951623
2095	NC_015387	TGGCG	2	10	2140944	2140953	0 %	20 %	60 %	20 %	328951625
2096	NC_015387	TGAGG	2	10	2142413	2142422	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
2097	NC_015387	GTGGG	2	10	2142448	2142457	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
2098	NC_015387	CACGA	2	10	2142962	2142971	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
2099	NC_015387	GCCCA	2	10	2143191	2143200	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
2100	NC_015387	CCGCG	2	10	2146688	2146697	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
2101	NC_015387	CCCCA	2	10	2148162	2148171	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
2102	NC_015387	ACGGC	2	10	2151446	2151455	20 %	0 %	40 %	40 %	328951633
2103	NC_015387	GACGG	2	10	2152179	2152188	20 %	0 %	60 %	20 %	328951634
2104	NC_015387	CCAGC	2	10	2153600	2153609	20 %	0 %	20 %	60 %	328951636
2105	NC_015387	GCCGG	2	10	2156501	2156510	0 %	0 %	60 %	40 %	328951638
2106	NC_015387	GAGGG	2	10	2156805	2156814	20 %	0 %	80 %	0 %	328951638
2107	NC_015387	CGGCC	2	10	2157995	2158004	0 %	0 %	40 %	60 %	328951640
2108	NC_015387	CGGGC	2	10	2158895	2158904	0 %	0 %	60 %	40 %	328951641
2109	NC_015387	GGCGA	2	10	2160834	2160843	20 %	0 %	60 %	20 %	328951641
2110	NC_015387	GGGCC	2	10	2161853	2161862	0 %	0 %	60 %	40 %	328951642
2111	NC_015387	CCGGC	2	10	2162747	2162756	0 %	0 %	40 %	60 %	328951643
2112	NC_015387	GCCCT	2	10	2164255	2164264	0 %	20 %	20 %	60 %	328951644
2113	NC_015387	CCTCG	2	10	2164981	2164990	0 %	20 %	20 %	60 %	328951645
2114	NC_015387	CCGGG	2	10	2165002	2165011	0 %	0 %	60 %	40 %	328951645
2115	NC_015387	TGGCC	2	10	2166050	2166059	0 %	20 %	40 %	40 %	328951647
2116	NC_015387	TCGGC	2	10	2166289	2166298	0 %	20 %	40 %	40 %	328951647
2117	NC_015387	GCCCA	2	10	2170065	2170074	20 %	0 %	20 %	60 %	328951651
2118	NC_015387	CCCCG	2	10	2171169	2171178	0 %	0 %	20 %	80 %	328951652
2119	NC_015387	CGCAC	2	10	2171232	2171241	20 %	0 %	20 %	60 %	328951652
2120	NC_015387	CGGCG	2	10	2171421	2171430	0 %	0 %	60 %	40 %	328951652
2121	NC_015387	GACTG	2	10	2172014	2172023	20 %	20 %	40 %	20 %	328951653
2122	NC_015387	GTGGA	2	10	2173223	2173232	20 %	20 %	60 %	0 %	328951654
2123	NC_015387	AAGGA	2	10	2174386	2174395	60 %	0 %	40 %	0 %	328951655
2124	NC_015387	CGGCG	2	10	2176167	2176176	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
2125	NC_015387	GGCCC	2	10	2176248	2176257	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
2126	NC_015387	GCGCT	2	10	2176267	2176276	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
2127	NC_015387	GCGGT	2	10	2177515	2177524	0 %	20 %	60 %	20 %	328951658
2128	NC_015387	GCCCG	2	10	2180035	2180044	0 %	0 %	40 %	60 %	328951662
2129	NC_015387	ACGGG	2	10	2180253	2180262	20 %	0 %	60 %	20 %	328951662
2130	NC_015387	CTCAA	2	10	2181221	2181230	40 %	20 %	0 %	40 %	328951662
2131	NC_015387	AGGCG	2	10	2181693	2181702	20 %	0 %	60 %	20 %	328951662
2132	NC_015387	CCGTC	2	10	2183211	2183220	0 %	20 %	20 %	60 %	328951664
2133	NC_015387	CGGGC	2	10	2185703	2185712	0 %	0 %	60 %	40 %	328951666
2134	NC_015387	CCGCG	2	10	2186767	2186776	0 %	0 %	40 %	60 %	328951667
2135	NC_015387	CAGCG	2	10	2187305	2187314	20 %	0 %	40 %	40 %	328951667
2136	NC_015387	GCCAG	2	10	2187830	2187839	20 %	0 %	40 %	40 %	328951668
2137	NC_015387	CGGCT	2	10	2189672	2189681	0 %	20 %	40 %	40 %	328951671
2138	NC_015387	GGGCC	2	10	2190554	2190563	0 %	0 %	60 %	40 %	328951672
2139	NC_015387	CTTCG	2	10	2191022	2191031	0 %	40 %	20 %	40 %	328951672
2140	NC_015387	GCCGC	2	10	2191629	2191638	0 %	0 %	40 %	60 %	328951673
2141	NC_015387	CGGAG	2	10	2192891	2192900	20 %	0 %	60 %	20 %	328951674
2142	NC_015387	AGGGC	2	10	2193248	2193257	20 %	0 %	60 %	20 %	328951674
2143	NC_015387	CCGCC	2	10	2194523	2194532	0 %	0 %	20 %	80 %	328951676
2144	NC_015387	GATCG	2	10	2194565	2194574	20 %	20 %	40 %	20 %	328951676
2145	NC_015387	GCCCG	2	10	2196229	2196238	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
2146	NC_015387	GCCCC	2	10	2196682	2196691	0 %	0 %	20 %	80 %	328951678
2147	NC_015387	CGCGC	2	10	2196986	2196995	0 %	0 %	40 %	60 %	328951678
2148	NC_015387	GTTTT	2	10	2197573	2197582	0 %	80 %	20 %	0 %	328951679
2149	NC_015387	CCGCG	2	10	2198719	2198728	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
2150	NC_015387	GAGGG	2	10	2200176	2200185	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
2151	NC_015387	GCCGC	2	10	2201359	2201368	0 %	0 %	40 %	60 %	328951683
2152	NC_015387	CTGCG	2	10	2201805	2201814	0 %	20 %	40 %	40 %	328951683
2153	NC_015387	CGGCG	2	10	2204229	2204238	0 %	0 %	60 %	40 %	328951685
2154	NC_015387	GCGGG	2	10	2205541	2205550	0 %	0 %	80 %	20 %	328951685
2155	NC_015387	CCCCG	2	10	2208625	2208634	0 %	0 %	20 %	80 %	328951688
2156	NC_015387	GCCTC	2	10	2208649	2208658	0 %	20 %	20 %	60 %	328951688
2157	NC_015387	GCCCT	2	10	2209713	2209722	0 %	20 %	20 %	60 %	328951689
2158	NC_015387	GCGAA	2	10	2211538	2211547	40 %	0 %	40 %	20 %	328951690
2159	NC_015387	CCCGT	2	10	2214240	2214249	0 %	20 %	20 %	60 %	328951694
2160	NC_015387	GGCCG	2	10	2215410	2215419	0 %	0 %	60 %	40 %	328951695
2161	NC_015387	ATCCC	2	10	2216095	2216104	20 %	20 %	0 %	60 %	328951697
2162	NC_015387	CTTGG	2	10	2216370	2216379	0 %	40 %	40 %	20 %	328951697
2163	NC_015387	CCCAC	2	10	2217539	2217548	20 %	0 %	0 %	80 %	328951697
2164	NC_015387	CCGCG	2	10	2219755	2219764	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
2165	NC_015387	AACCC	2	10	2222737	2222746	40 %	0 %	0 %	60 %	328951702
2166	NC_015387	CCCCG	2	10	2223893	2223902	0 %	0 %	20 %	80 %	328951704
2167	NC_015387	AGGGC	2	10	2223943	2223952	20 %	0 %	60 %	20 %	328951704
2168	NC_015387	CGGTG	2	10	2225930	2225939	0 %	20 %	60 %	20 %	328951706
2169	NC_015387	CCGCC	2	10	2226583	2226592	0 %	0 %	20 %	80 %	328951706
2170	NC_015387	GCCCT	2	10	2226946	2226955	0 %	20 %	20 %	60 %	328951707
2171	NC_015387	CGCGG	2	10	2229344	2229353	0 %	0 %	60 %	40 %	328951710
2172	NC_015387	CCGCG	2	10	2230467	2230476	0 %	0 %	40 %	60 %	328951711
2173	NC_015387	CCATC	2	10	2231525	2231534	20 %	20 %	0 %	60 %	328951712
2174	NC_015387	GCGCC	2	10	2231678	2231687	0 %	0 %	40 %	60 %	328951712
2175	NC_015387	CCCCA	2	10	2231811	2231820	20 %	0 %	0 %	80 %	328951712
2176	NC_015387	GGCGC	2	10	2232391	2232400	0 %	0 %	60 %	40 %	328951713
2177	NC_015387	CCGGT	2	10	2233682	2233691	0 %	20 %	40 %	40 %	328951713
2178	NC_015387	GGAAG	2	10	2235370	2235379	40 %	0 %	60 %	0 %	328951715
2179	NC_015387	GGGAA	2	10	2237175	2237184	40 %	0 %	60 %	0 %	328951716
2180	NC_015387	GGGCG	2	10	2237485	2237494	0 %	0 %	80 %	20 %	328951716
2181	NC_015387	GGCGC	2	10	2238002	2238011	0 %	0 %	60 %	40 %	328951717
2182	NC_015387	CCGCC	2	10	2239449	2239458	0 %	0 %	20 %	80 %	328951719
2183	NC_015387	CGGCG	2	10	2241241	2241250	0 %	0 %	60 %	40 %	328951721
2184	NC_015387	CGGGG	2	10	2242060	2242069	0 %	0 %	80 %	20 %	328951721
2185	NC_015387	CTGGG	2	10	2243033	2243042	0 %	20 %	60 %	20 %	328951721
2186	NC_015387	GCCGC	2	10	2243061	2243070	0 %	0 %	40 %	60 %	328951721
2187	NC_015387	GCCCC	2	10	2245285	2245294	0 %	0 %	20 %	80 %	328951723
2188	NC_015387	CGCCC	2	10	2245353	2245362	0 %	0 %	20 %	80 %	328951723
2189	NC_015387	GCCGG	2	10	2245608	2245617	0 %	0 %	60 %	40 %	328951723
2190	NC_015387	TCGTC	2	10	2245856	2245865	0 %	40 %	20 %	40 %	328951723
2191	NC_015387	AGTCC	2	10	2248834	2248843	20 %	20 %	20 %	40 %	328951727
2192	NC_015387	AGGCC	2	10	2249255	2249264	20 %	0 %	40 %	40 %	328951727
2193	NC_015387	CGCTC	2	10	2250143	2250152	0 %	20 %	20 %	60 %	328951728
2194	NC_015387	GCGCC	2	10	2250612	2250621	0 %	0 %	40 %	60 %	328951728
2195	NC_015387	GGCCC	2	10	2251014	2251023	0 %	0 %	40 %	60 %	328951728
2196	NC_015387	CCACC	2	10	2251619	2251628	20 %	0 %	0 %	80 %	328951728
2197	NC_015387	CCAGG	2	10	2252186	2252195	20 %	0 %	40 %	40 %	328951729
2198	NC_015387	ACGCT	2	10	2252578	2252587	20 %	20 %	20 %	40 %	328951729
2199	NC_015387	CAAGG	2	10	2253507	2253516	40 %	0 %	40 %	20 %	328951731
2200	NC_015387	GCGCG	2	10	2253702	2253711	0 %	0 %	60 %	40 %	328951731
2201	NC_015387	CCGCG	2	10	2255024	2255033	0 %	0 %	40 %	60 %	328951731
2202	NC_015387	AGCGG	2	10	2257708	2257717	20 %	0 %	60 %	20 %	328951735
2203	NC_015387	CGAAC	2	10	2259060	2259069	40 %	0 %	20 %	40 %	328951736
2204	NC_015387	GCGCG	2	10	2260123	2260132	0 %	0 %	60 %	40 %	328951737
2205	NC_015387	GGCGC	2	10	2260561	2260570	0 %	0 %	60 %	40 %	328951737
2206	NC_015387	GTTCG	2	10	2260838	2260847	0 %	40 %	40 %	20 %	328951737
2207	NC_015387	AGCCT	2	10	2262673	2262682	20 %	20 %	20 %	40 %	328951739
2208	NC_015387	GGGGT	2	10	2264077	2264086	0 %	20 %	80 %	0 %	328951741
2209	NC_015387	GGGCG	2	10	2266396	2266405	0 %	0 %	80 %	20 %	328951743
2210	NC_015387	CCCCA	2	10	2266720	2266729	20 %	0 %	0 %	80 %	328951743
2211	NC_015387	CCGCG	2	10	2266899	2266908	0 %	0 %	40 %	60 %	328951744

< Previous 1 2 3 45Next >