MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Marinithermus hydrothermalis DSM 14884 chromosome

Total Repeats: 2211

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015387	GCCGC	2	10	468368	468377	0 %	0 %	40 %	60 %	328950018
502	NC_015387	ACCGC	2	10	471315	471324	20 %	0 %	20 %	60 %	328950021
503	NC_015387	GGCGG	2	10	471889	471898	0 %	0 %	80 %	20 %	328950021
504	NC_015387	AGGCC	2	10	472372	472381	20 %	0 %	40 %	40 %	328950022
505	NC_015387	GGGCG	2	10	475016	475025	0 %	0 %	80 %	20 %	328950025
506	NC_015387	CAAGC	2	10	476267	476276	40 %	0 %	20 %	40 %	328950026
507	NC_015387	GGGGC	2	10	478697	478706	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
508	NC_015387	GCGCG	3	15	479133	479147	0 %	0 %	60 %	40 %	328950029
509	NC_015387	GGGGT	2	10	479467	479476	0 %	20 %	80 %	0 %	328950029
510	NC_015387	CGCAC	2	10	479697	479706	20 %	0 %	20 %	60 %	328950030
511	NC_015387	TAGCA	2	10	480765	480774	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
512	NC_015387	GCCCC	2	10	481059	481068	0 %	0 %	20 %	80 %	328950031
513	NC_015387	CCCGA	2	10	482028	482037	20 %	0 %	20 %	60 %	328950033
514	NC_015387	GCACC	2	10	482656	482665	20 %	0 %	20 %	60 %	328950034
515	NC_015387	CCCGC	2	10	482770	482779	0 %	0 %	20 %	80 %	328950034
516	NC_015387	CGCGG	2	10	484814	484823	0 %	0 %	60 %	40 %	328950036
517	NC_015387	GCACG	2	10	485569	485578	20 %	0 %	40 %	40 %	328950036
518	NC_015387	GCGCG	2	10	487497	487506	0 %	0 %	60 %	40 %	328950037
519	NC_015387	GGGGA	2	10	488048	488057	20 %	0 %	80 %	0 %	328950037
520	NC_015387	GGGGC	2	10	490582	490591	0 %	0 %	80 %	20 %	328950042
521	NC_015387	GCCTC	2	10	490840	490849	0 %	20 %	20 %	60 %	328950042
522	NC_015387	TCCTC	2	10	491434	491443	0 %	40 %	0 %	60 %	328950042
523	NC_015387	CGCGG	2	10	491724	491733	0 %	0 %	60 %	40 %	328950042
524	NC_015387	GCGCG	2	10	492131	492140	0 %	0 %	60 %	40 %	328950042
525	NC_015387	GGCGC	2	10	492322	492331	0 %	0 %	60 %	40 %	328950043
526	NC_015387	CGCGG	2	10	492760	492769	0 %	0 %	60 %	40 %	328950043
527	NC_015387	TGCGC	2	10	494664	494673	0 %	20 %	40 %	40 %	328950044
528	NC_015387	TGGGG	2	10	494700	494709	0 %	20 %	80 %	0 %	328950044
529	NC_015387	GCCCC	2	10	499282	499291	0 %	0 %	20 %	80 %	328950048
530	NC_015387	GCCCC	2	10	499965	499974	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
531	NC_015387	GCTCC	2	10	499999	500008	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
532	NC_015387	CCCAG	2	10	500072	500081	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
533	NC_015387	GGCCA	2	10	502514	502523	20 %	0 %	40 %	40 %	328950055
534	NC_015387	CGGCC	2	10	506898	506907	0 %	0 %	40 %	60 %	328950059
535	NC_015387	ACCGC	2	10	510493	510502	20 %	0 %	20 %	60 %	328950064
536	NC_015387	CGCGG	2	10	511188	511197	0 %	0 %	60 %	40 %	328950065
537	NC_015387	CGCGG	2	10	514233	514242	0 %	0 %	60 %	40 %	328950067
538	NC_015387	GGGGC	2	10	516342	516351	0 %	0 %	80 %	20 %	328950068
539	NC_015387	CCAGG	2	10	518369	518378	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
540	NC_015387	AGGGA	2	10	518404	518413	40 %	0 %	60 %	0 %	328950071
541	NC_015387	CGGCT	2	10	518827	518836	0 %	20 %	40 %	40 %	328950071
542	NC_015387	CCACC	2	10	518859	518868	20 %	0 %	0 %	80 %	328950071
543	NC_015387	GCGCG	2	10	520820	520829	0 %	0 %	60 %	40 %	328950074
544	NC_015387	CGCGC	2	10	521249	521258	0 %	0 %	40 %	60 %	328950074
545	NC_015387	GAGGG	2	10	521328	521337	20 %	0 %	80 %	0 %	328950074
546	NC_015387	TGGCG	2	10	522669	522678	0 %	20 %	60 %	20 %	328950076
547	NC_015387	CGGGG	2	10	523300	523309	0 %	0 %	80 %	20 %	328950076
548	NC_015387	GCCCG	2	10	525436	525445	0 %	0 %	40 %	60 %	328950078
549	NC_015387	CGCGG	2	10	527549	527558	0 %	0 %	60 %	40 %	328950080
550	NC_015387	TGCGG	2	10	532436	532445	0 %	20 %	60 %	20 %	328950085
551	NC_015387	ACCGT	2	10	532892	532901	20 %	20 %	20 %	40 %	328950086
552	NC_015387	AACCG	2	10	532904	532913	40 %	0 %	20 %	40 %	328950086
553	NC_015387	GCGTC	2	10	533629	533638	0 %	20 %	40 %	40 %	328950087
554	NC_015387	TCGCG	2	10	533860	533869	0 %	20 %	40 %	40 %	328950087
555	NC_015387	CGCGG	2	10	538801	538810	0 %	0 %	60 %	40 %	328950092
556	NC_015387	AAGGA	2	10	539958	539967	60 %	0 %	40 %	0 %	328950093
557	NC_015387	ACCGC	2	10	540037	540046	20 %	0 %	20 %	60 %	328950093
558	NC_015387	TCCAC	2	10	540193	540202	20 %	20 %	0 %	60 %	328950093
559	NC_015387	CGCCT	2	10	540658	540667	0 %	20 %	20 %	60 %	328950094
560	NC_015387	CGCGG	2	10	545047	545056	0 %	0 %	60 %	40 %	328950096
561	NC_015387	CCGCG	2	10	547305	547314	0 %	0 %	40 %	60 %	328950098
562	NC_015387	GGCGG	2	10	547831	547840	0 %	0 %	80 %	20 %	328950098
563	NC_015387	GCGGG	2	10	548058	548067	0 %	0 %	80 %	20 %	328950098
564	NC_015387	CTTTC	2	10	548292	548301	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
565	NC_015387	GGGGC	2	10	549289	549298	0 %	0 %	80 %	20 %	328950099
566	NC_015387	GCCAC	2	10	549694	549703	20 %	0 %	20 %	60 %	328950100
567	NC_015387	CGCGG	2	10	551855	551864	0 %	0 %	60 %	40 %	328950101
568	NC_015387	CGCGT	2	10	552155	552164	0 %	20 %	40 %	40 %	328950101
569	NC_015387	GGACG	2	10	553354	553363	20 %	0 %	60 %	20 %	328950103
570	NC_015387	GCCCG	2	10	554291	554300	0 %	0 %	40 %	60 %	328950103
571	NC_015387	CCGGC	2	10	555106	555115	0 %	0 %	40 %	60 %	328950103
572	NC_015387	GAGCC	2	10	555173	555182	20 %	0 %	40 %	40 %	328950103
573	NC_015387	GGGGT	2	10	555730	555739	0 %	20 %	80 %	0 %	328950104
574	NC_015387	CGCGG	2	10	556016	556025	0 %	0 %	60 %	40 %	328950105
575	NC_015387	TCCTG	2	10	557490	557499	0 %	40 %	20 %	40 %	328950107
576	NC_015387	AAGCC	2	10	558175	558184	40 %	0 %	20 %	40 %	328950108
577	NC_015387	CTGGA	2	10	558600	558609	20 %	20 %	40 %	20 %	328950109
578	NC_015387	CTTCC	2	10	559293	559302	0 %	40 %	0 %	60 %	328950109
579	NC_015387	GGCTT	2	10	561084	561093	0 %	40 %	40 %	20 %	328950112
580	NC_015387	CCCGC	2	10	563470	563479	0 %	0 %	20 %	80 %	328950114
581	NC_015387	CTGGA	2	10	563913	563922	20 %	20 %	40 %	20 %	328950115
582	NC_015387	CACGC	2	10	564250	564259	20 %	0 %	20 %	60 %	328950115
583	NC_015387	GGTGG	2	10	565289	565298	0 %	20 %	80 %	0 %	328950116
584	NC_015387	AACCC	2	10	569639	569648	40 %	0 %	0 %	60 %	328950121
585	NC_015387	GTGCA	2	10	570129	570138	20 %	20 %	40 %	20 %	328950122
586	NC_015387	GGTTT	2	10	571112	571121	0 %	60 %	40 %	0 %	328950122
587	NC_015387	GGCGG	2	10	571717	571726	0 %	0 %	80 %	20 %	328950122
588	NC_015387	CGCGG	2	10	571769	571778	0 %	0 %	60 %	40 %	328950122
589	NC_015387	CGGCG	2	10	572281	572290	0 %	0 %	60 %	40 %	328950122
590	NC_015387	GTTCG	2	10	574848	574857	0 %	40 %	40 %	20 %	328950125
591	NC_015387	GCCCG	2	10	574950	574959	0 %	0 %	40 %	60 %	328950125
592	NC_015387	GCGCG	2	10	575676	575685	0 %	0 %	60 %	40 %	328950125
593	NC_015387	ACGGA	2	10	575998	576007	40 %	0 %	40 %	20 %	328950125
594	NC_015387	GCGAC	2	10	577641	577650	20 %	0 %	40 %	40 %	328950127
595	NC_015387	GGGGC	2	10	577720	577729	0 %	0 %	80 %	20 %	328950127
596	NC_015387	CCGAC	2	10	578181	578190	20 %	0 %	20 %	60 %	328950127
597	NC_015387	AGGGG	2	10	578900	578909	20 %	0 %	80 %	0 %	328950128
598	NC_015387	GGACG	2	10	579574	579583	20 %	0 %	60 %	20 %	328950129
599	NC_015387	CGGAT	2	10	580572	580581	20 %	20 %	40 %	20 %	328950130
600	NC_015387	CCCGG	2	10	581786	581795	0 %	0 %	40 %	60 %	328950131
601	NC_015387	GCGCT	2	10	582580	582589	0 %	20 %	40 %	40 %	328950132
602	NC_015387	GGGGC	2	10	582626	582635	0 %	0 %	80 %	20 %	328950132
603	NC_015387	CACCT	2	10	583233	583242	20 %	20 %	0 %	60 %	328950132
604	NC_015387	GCCCG	2	10	584450	584459	0 %	0 %	40 %	60 %	328950132
605	NC_015387	GCCCA	2	10	586087	586096	20 %	0 %	20 %	60 %	328950133
606	NC_015387	CCTGC	2	10	588565	588574	0 %	20 %	20 %	60 %	328950135
607	NC_015387	GTGAC	2	10	591082	591091	20 %	20 %	40 %	20 %	328950137
608	NC_015387	GGCGG	2	10	591124	591133	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
609	NC_015387	TGGCG	2	10	592738	592747	0 %	20 %	60 %	20 %	328950139
610	NC_015387	CGCGG	2	10	596003	596012	0 %	0 %	60 %	40 %	328950142
611	NC_015387	CCACC	2	10	597502	597511	20 %	0 %	0 %	80 %	328950142
612	NC_015387	GCGCC	2	10	597515	597524	0 %	0 %	40 %	60 %	328950142
613	NC_015387	CCCCG	2	10	598210	598219	0 %	0 %	20 %	80 %	328950143
614	NC_015387	GCCTG	2	10	598482	598491	0 %	20 %	40 %	40 %	328950143
615	NC_015387	TACCC	2	10	599815	599824	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
616	NC_015387	CGGTG	2	10	600065	600074	0 %	20 %	60 %	20 %	328950145
617	NC_015387	GGGGC	2	10	600214	600223	0 %	0 %	80 %	20 %	328950145
618	NC_015387	GCTTC	2	10	600359	600368	0 %	40 %	20 %	40 %	328950145
619	NC_015387	TCCCT	2	10	600635	600644	0 %	40 %	0 %	60 %	328950145
620	NC_015387	GCGTC	2	10	602589	602598	0 %	20 %	40 %	40 %	328950147
621	NC_015387	CGTGG	2	10	605760	605769	0 %	20 %	60 %	20 %	328950149
622	NC_015387	CTGGC	2	10	605890	605899	0 %	20 %	40 %	40 %	328950149
623	NC_015387	AGGGT	2	10	607937	607946	20 %	20 %	60 %	0 %	328950151
624	NC_015387	CGGCT	2	10	607988	607997	0 %	20 %	40 %	40 %	328950151
625	NC_015387	GCGCC	2	10	608671	608680	0 %	0 %	40 %	60 %	328950151
626	NC_015387	CCCTT	2	10	609283	609292	0 %	40 %	0 %	60 %	328950152
627	NC_015387	GAAGG	2	10	611582	611591	40 %	0 %	60 %	0 %	328950156
628	NC_015387	CGCGG	2	10	614560	614569	0 %	0 %	60 %	40 %	328950159
629	NC_015387	AAACG	2	10	616167	616176	60 %	0 %	20 %	20 %	328950161
630	NC_015387	GCCCA	2	10	617760	617769	20 %	0 %	20 %	60 %	328950164
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