MICAS: Microsatellite Analysis Server

Penta-nucleotide Repeats of Methanocaldococcus fervens AG86 chromosome

Total Repeats: 1579

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_013156	GTTAT	2	10	1408396	1408405	20 %	60 %	20 %	0 %	256811429
1502	NC_013156	GAGCT	2	10	1408591	1408600	20 %	20 %	40 %	20 %	256811429
1503	NC_013156	TTTTG	2	10	1410512	1410521	0 %	80 %	20 %	0 %	256811433
1504	NC_013156	TGGCT	2	10	1410997	1411006	0 %	40 %	40 %	20 %	256811433
1505	NC_013156	ATCTC	2	10	1411463	1411472	20 %	40 %	0 %	40 %	256811433
1506	NC_013156	CTATA	2	10	1412506	1412515	40 %	40 %	0 %	20 %	256811436
1507	NC_013156	ATTAC	2	10	1415062	1415071	40 %	40 %	0 %	20 %	256811437
1508	NC_013156	TAATT	2	10	1415082	1415091	40 %	60 %	0 %	0 %	256811437
1509	NC_013156	AAGAA	2	10	1415803	1415812	80 %	0 %	20 %	0 %	256811438
1510	NC_013156	ATATA	2	10	1419992	1420001	60 %	40 %	0 %	0 %	256811443
1511	NC_013156	CCAAC	2	10	1420471	1420480	40 %	0 %	0 %	60 %	256811444
1512	NC_013156	ATATT	2	10	1420591	1420600	40 %	60 %	0 %	0 %	256811444
1513	NC_013156	CTCTC	2	10	1420796	1420805	0 %	40 %	0 %	60 %	256811444
1514	NC_013156	CTTTT	2	10	1421404	1421413	0 %	80 %	0 %	20 %	256811445
1515	NC_013156	TTTAA	2	10	1421441	1421450	40 %	60 %	0 %	0 %	256811445
1516	NC_013156	CATTG	2	10	1422760	1422769	20 %	40 %	20 %	20 %	256811446
1517	NC_013156	TATAA	2	10	1422945	1422954	60 %	40 %	0 %	0 %	256811446
1518	NC_013156	ATTTT	2	10	1424632	1424641	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1519	NC_013156	TATTT	2	10	1424642	1424651	20 %	80 %	0 %	0 %	256811447
1520	NC_013156	TACTC	2	10	1425359	1425368	20 %	40 %	0 %	40 %	256811448
1521	NC_013156	GTTGA	2	10	1426353	1426362	20 %	40 %	40 %	0 %	256811449
1522	NC_013156	AAAAT	2	10	1426875	1426884	80 %	20 %	0 %	0 %	256811449
1523	NC_013156	AATAA	2	10	1426932	1426941	80 %	20 %	0 %	0 %	256811449
1524	NC_013156	TGGTT	2	10	1427270	1427279	0 %	60 %	40 %	0 %	256811449
1525	NC_013156	AGAGG	2	10	1428488	1428497	40 %	0 %	60 %	0 %	256811450
1526	NC_013156	GATAA	2	10	1428572	1428581	60 %	20 %	20 %	0 %	256811450
1527	NC_013156	ACCAA	2	10	1433767	1433776	60 %	0 %	0 %	40 %	256811455
1528	NC_013156	GAATA	2	10	1433919	1433928	60 %	20 %	20 %	0 %	256811455
1529	NC_013156	GAATG	2	10	1434161	1434170	40 %	20 %	40 %	0 %	256811455
1530	NC_013156	TAATG	2	10	1435039	1435048	40 %	40 %	20 %	0 %	256811457
1531	NC_013156	GAAAA	2	10	1435597	1435606	80 %	0 %	20 %	0 %	256811457
1532	NC_013156	CTAAT	2	10	1437471	1437480	40 %	40 %	0 %	20 %	256811460
1533	NC_013156	TATCT	2	10	1437745	1437754	20 %	60 %	0 %	20 %	256811460
1534	NC_013156	TTATT	2	10	1438254	1438263	20 %	80 %	0 %	0 %	256811460
1535	NC_013156	ATAAC	2	10	1438560	1438569	60 %	20 %	0 %	20 %	256811461
1536	NC_013156	TTCTA	2	10	1439818	1439827	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
1537	NC_013156	TTATT	2	10	1440544	1440553	20 %	80 %	0 %	0 %	256811465
1538	NC_013156	TGGAT	2	10	1440949	1440958	20 %	40 %	40 %	0 %	256811465
1539	NC_013156	TAAAA	2	10	1441003	1441012	80 %	20 %	0 %	0 %	256811465
1540	NC_013156	TAAAA	2	10	1441517	1441526	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1541	NC_013156	TTGTT	2	10	1443642	1443651	0 %	80 %	20 %	0 %	256811468
1542	NC_013156	TCTCT	2	10	1443985	1443994	0 %	60 %	0 %	40 %	256811468
1543	NC_013156	ATAAA	2	10	1444501	1444510	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
1544	NC_013156	GAATT	2	10	1444564	1444573	40 %	40 %	20 %	0 %	256811469
1545	NC_013156	AATTA	2	10	1444718	1444727	60 %	40 %	0 %	0 %	256811469
1546	NC_013156	AATTA	2	10	1445504	1445513	60 %	40 %	0 %	0 %	256811469
1547	NC_013156	ATTTT	2	10	1445571	1445580	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1548	NC_013156	TTTAT	2	10	1445581	1445590	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
1549	NC_013156	AAATA	2	10	1445741	1445750	80 %	20 %	0 %	0 %	256811470
1550	NC_013156	CCCCT	2	10	1446540	1446549	0 %	20 %	0 %	80 %	256811471
1551	NC_013156	TCCTT	2	10	1447781	1447790	0 %	60 %	0 %	40 %	256811472
1552	NC_013156	AGCCA	2	10	1449315	1449324	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
1553	NC_013156	CCAAA	2	10	1449803	1449812	60 %	0 %	0 %	40 %	256811474
1554	NC_013156	CTTGC	2	10	1450263	1450272	0 %	40 %	20 %	40 %	256811475
1555	NC_013156	GAATT	2	10	1451421	1451430	40 %	40 %	20 %	0 %	256811475
1556	NC_013156	GAAAG	2	10	1455637	1455646	60 %	0 %	40 %	0 %	256811482
1557	NC_013156	TTGAC	2	10	1459021	1459030	20 %	40 %	20 %	20 %	256811487
1558	NC_013156	TTAGT	2	10	1459684	1459693	20 %	60 %	20 %	0 %	256811489
1559	NC_013156	GAATG	2	10	1459785	1459794	40 %	20 %	40 %	0 %	256811489
1560	NC_013156	AATAA	2	10	1460281	1460290	80 %	20 %	0 %	0 %	256811490
1561	NC_013156	TGAAT	2	10	1462023	1462032	40 %	40 %	20 %	0 %	256811490
1562	NC_013156	TGATT	2	10	1462077	1462086	20 %	60 %	20 %	0 %	256811490
1563	NC_013156	AGAAA	2	10	1462258	1462267	80 %	0 %	20 %	0 %	256811490
1564	NC_013156	ACAAT	2	10	1462795	1462804	60 %	20 %	0 %	20 %	256811491
1565	NC_013156	ACCAA	2	10	1462857	1462866	60 %	0 %	0 %	40 %	256811491
1566	NC_013156	TACAA	2	10	1463274	1463283	60 %	20 %	0 %	20 %	256811492
1567	NC_013156	CAATT	2	10	1468355	1468364	40 %	40 %	0 %	20 %	256811497
1568	NC_013156	ATAAA	2	10	1468882	1468891	80 %	20 %	0 %	0 %	256811498
1569	NC_013156	CAATC	2	10	1469477	1469486	40 %	20 %	0 %	40 %	256811501
1570	NC_013156	TAAAA	2	10	1472614	1472623	80 %	20 %	0 %	0 %	256811506
1571	NC_013156	ATTAT	2	10	1472683	1472692	40 %	60 %	0 %	0 %	256811506
1572	NC_013156	TGATG	2	10	1473556	1473565	20 %	40 %	40 %	0 %	256811508
1573	NC_013156	TCTTT	2	10	1474004	1474013	0 %	80 %	0 %	20 %	256811509
1574	NC_013156	TTTTA	2	10	1474566	1474575	20 %	80 %	0 %	0 %	256811509
1575	NC_013156	AGATA	2	10	1478373	1478382	60 %	20 %	20 %	0 %	256811513
1576	NC_013156	AGAGG	2	10	1479510	1479519	40 %	0 %	60 %	0 %	256811516
1577	NC_013156	GTGTG	2	10	1480529	1480538	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
1578	NC_013156	TTAAC	2	10	1482989	1482998	40 %	40 %	0 %	20 %	256811518
1579	NC_013156	CTTTC	2	10	1483970	1483979	0 %	60 %	0 %	40 %	256811519

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