MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Mycobacterium tuberculosis H37Ra chromosome

Total Repeats: 3535

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_009525	ATTGG	2	10	2484121	2484130	20 %	40 %	40 %	0 %	148662026
2002	NC_009525	ACGGC	2	10	2484275	2484284	20 %	0 %	40 %	40 %	148662026
2003	NC_009525	TCACC	2	10	2484849	2484858	20 %	20 %	0 %	60 %	148662027
2004	NC_009525	CGGCC	2	10	2486202	2486211	0 %	0 %	40 %	60 %	148662028
2005	NC_009525	ACACC	2	10	2486420	2486429	40 %	0 %	0 %	60 %	148662028
2006	NC_009525	CACGG	2	10	2487571	2487580	20 %	0 %	40 %	40 %	148662029
2007	NC_009525	GCGCA	2	10	2489981	2489990	20 %	0 %	40 %	40 %	148662031
2008	NC_009525	GCGCC	2	10	2492471	2492480	0 %	0 %	40 %	60 %	148662032
2009	NC_009525	CCCGG	2	10	2494420	2494429	0 %	0 %	40 %	60 %	148662033
2010	NC_009525	GGGCT	2	10	2496003	2496012	0 %	20 %	60 %	20 %	148662035
2011	NC_009525	CCGGT	2	10	2497255	2497264	0 %	20 %	40 %	40 %	148662037
2012	NC_009525	CGGCG	2	10	2498008	2498017	0 %	0 %	60 %	40 %	148662038
2013	NC_009525	TCCAG	2	10	2500605	2500614	20 %	20 %	20 %	40 %	148662039
2014	NC_009525	AGTTC	2	10	2501577	2501586	20 %	40 %	20 %	20 %	148662039
2015	NC_009525	TGATC	2	10	2504623	2504632	20 %	40 %	20 %	20 %	148662041
2016	NC_009525	TCCAC	2	10	2506769	2506778	20 %	20 %	0 %	60 %	148662042
2017	NC_009525	CGACC	2	10	2507618	2507627	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
2018	NC_009525	CGTGG	2	10	2507902	2507911	0 %	20 %	60 %	20 %	148662044
2019	NC_009525	CTCGA	2	10	2510648	2510657	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2020	NC_009525	CCACC	2	10	2512053	2512062	20 %	0 %	0 %	80 %	148662048
2021	NC_009525	TCAGC	2	10	2513311	2513320	20 %	20 %	20 %	40 %	148662049
2022	NC_009525	GCGCG	2	10	2513850	2513859	0 %	0 %	60 %	40 %	148662050
2023	NC_009525	GCGTC	2	10	2514366	2514375	0 %	20 %	40 %	40 %	148662050
2024	NC_009525	ACCGC	2	10	2514770	2514779	20 %	0 %	20 %	60 %	148662051
2025	NC_009525	CGAGC	2	10	2514897	2514906	20 %	0 %	40 %	40 %	148662051
2026	NC_009525	CTACC	2	10	2517245	2517254	20 %	20 %	0 %	60 %	148662054
2027	NC_009525	GGCGC	2	10	2518411	2518420	0 %	0 %	60 %	40 %	148662056
2028	NC_009525	ACCGC	2	10	2518592	2518601	20 %	0 %	20 %	60 %	148662056
2029	NC_009525	GGCCG	2	10	2519933	2519942	0 %	0 %	60 %	40 %	148662057
2030	NC_009525	CGCGC	2	10	2520404	2520413	0 %	0 %	40 %	60 %	148662058
2031	NC_009525	CGCTG	2	10	2525916	2525925	0 %	20 %	40 %	40 %	148662063
2032	NC_009525	TCAAC	2	10	2526423	2526432	40 %	20 %	0 %	40 %	148662063
2033	NC_009525	GCACG	2	10	2528946	2528955	20 %	0 %	40 %	40 %	148662066
2034	NC_009525	TGCGC	2	10	2532647	2532656	0 %	20 %	40 %	40 %	148662069
2035	NC_009525	GGCTC	2	10	2532771	2532780	0 %	20 %	40 %	40 %	148662069
2036	NC_009525	GGCAT	2	10	2534368	2534377	20 %	20 %	40 %	20 %	148662070
2037	NC_009525	ATCGA	2	10	2534751	2534760	40 %	20 %	20 %	20 %	148662071
2038	NC_009525	CGATC	2	10	2536683	2536692	20 %	20 %	20 %	40 %	148662072
2039	NC_009525	ACACC	2	10	2539712	2539721	40 %	0 %	0 %	60 %	148662078
2040	NC_009525	ACGTC	2	10	2539724	2539733	20 %	20 %	20 %	40 %	148662078
2041	NC_009525	AGCCC	2	10	2540117	2540126	20 %	0 %	20 %	60 %	148662079
2042	NC_009525	CCGGC	2	10	2541501	2541510	0 %	0 %	40 %	60 %	148662080
2043	NC_009525	TCGCT	2	10	2541820	2541829	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
2044	NC_009525	TCGCT	2	10	2541873	2541882	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
2045	NC_009525	TCGCT	2	10	2541926	2541935	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
2046	NC_009525	TCGCT	2	10	2541979	2541988	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
2047	NC_009525	TCGCT	2	10	2542032	2542041	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
2048	NC_009525	TCGCT	2	10	2542085	2542094	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
2049	NC_009525	GACCT	2	10	2542281	2542290	20 %	20 %	20 %	40 %	148662081
2050	NC_009525	TGCGG	2	10	2543560	2543569	0 %	20 %	60 %	20 %	148662082
2051	NC_009525	CACCC	2	10	2544962	2544971	20 %	0 %	0 %	80 %	148662084
2052	NC_009525	ACCGC	2	10	2545054	2545063	20 %	0 %	20 %	60 %	148662084
2053	NC_009525	CGCAA	2	10	2554264	2554273	40 %	0 %	20 %	40 %	148662091
2054	NC_009525	CCGGC	2	10	2554380	2554389	0 %	0 %	40 %	60 %	148662091
2055	NC_009525	GGCGC	2	10	2555256	2555265	0 %	0 %	60 %	40 %	148662093
2056	NC_009525	CCTGG	2	10	2555718	2555727	0 %	20 %	40 %	40 %	148662094
2057	NC_009525	GGCTG	2	10	2556146	2556155	0 %	20 %	60 %	20 %	148662095
2058	NC_009525	CTGCA	2	10	2558085	2558094	20 %	20 %	20 %	40 %	148662098
2059	NC_009525	GTCAC	2	10	2559338	2559347	20 %	20 %	20 %	40 %	148662099
2060	NC_009525	GCTGA	2	10	2560185	2560194	20 %	20 %	40 %	20 %	148662100
2061	NC_009525	GTCGA	2	10	2560358	2560367	20 %	20 %	40 %	20 %	148662101
2062	NC_009525	TCAGA	2	10	2561235	2561244	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2063	NC_009525	CGCAG	2	10	2561433	2561442	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
2064	NC_009525	CCTCG	2	10	2564693	2564702	0 %	20 %	20 %	60 %	148662103
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2067	NC_009525	ACGCA	2	10	2567292	2567301	40 %	0 %	20 %	40 %	148662106
2068	NC_009525	CGGCC	2	10	2570152	2570161	0 %	0 %	40 %	60 %	148662109
2069	NC_009525	CGCGG	2	10	2570699	2570708	0 %	0 %	60 %	40 %	148662109
2070	NC_009525	GGAGT	2	10	2573884	2573893	20 %	20 %	60 %	0 %	148662113
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2073	NC_009525	CGGCG	2	10	2578202	2578211	0 %	0 %	60 %	40 %	148662118
2074	NC_009525	CTGGC	2	10	2579751	2579760	0 %	20 %	40 %	40 %	148662120
2075	NC_009525	CTTCG	2	10	2582772	2582781	0 %	40 %	20 %	40 %	148662122
2076	NC_009525	CAAGA	2	10	2583695	2583704	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
2077	NC_009525	GGCGG	2	10	2585010	2585019	0 %	0 %	80 %	20 %	148662126
2078	NC_009525	CAGGC	2	10	2585662	2585671	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
2079	NC_009525	GCTCA	2	10	2587683	2587692	20 %	20 %	20 %	40 %	148662128
2080	NC_009525	GCCCA	2	10	2589238	2589247	20 %	0 %	20 %	60 %	148662130
2081	NC_009525	CAGCC	2	10	2592847	2592856	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
2082	NC_009525	GCTGC	2	10	2593345	2593354	0 %	20 %	40 %	40 %	148662137
2083	NC_009525	CAGGC	2	10	2593798	2593807	20 %	0 %	40 %	40 %	148662138
2084	NC_009525	CCCAG	2	10	2595450	2595459	20 %	0 %	20 %	60 %	148662140
2085	NC_009525	GGTCG	2	10	2596064	2596073	0 %	20 %	60 %	20 %	148662141
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2087	NC_009525	TCGGC	2	10	2601095	2601104	0 %	20 %	40 %	40 %	148662145
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2092	NC_009525	GAACG	2	10	2609678	2609687	40 %	0 %	40 %	20 %	148662153
2093	NC_009525	GCCGG	2	10	2610359	2610368	0 %	0 %	60 %	40 %	148662154
2094	NC_009525	GCGCC	2	10	2611206	2611215	0 %	0 %	40 %	60 %	148662155
2095	NC_009525	TTGCT	2	10	2611275	2611284	0 %	60 %	20 %	20 %	148662155
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2097	NC_009525	CGAGC	2	10	2613614	2613623	20 %	0 %	40 %	40 %	148662157
2098	NC_009525	TCGGG	2	10	2616097	2616106	0 %	20 %	60 %	20 %	148662160
2099	NC_009525	ATCGC	2	10	2616125	2616134	20 %	20 %	20 %	40 %	148662160
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2105	NC_009525	TCGCA	2	10	2623962	2623971	20 %	20 %	20 %	40 %	148662166
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2107	NC_009525	CCGGC	2	10	2625811	2625820	0 %	0 %	40 %	60 %	148662167
2108	NC_009525	GCCGG	2	10	2629153	2629162	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
2109	NC_009525	GGGTC	2	10	2630907	2630916	0 %	20 %	60 %	20 %	148662171
2110	NC_009525	CGCTG	2	10	2630966	2630975	0 %	20 %	40 %	40 %	148662171
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2112	NC_009525	GCGCA	2	10	2633971	2633980	20 %	0 %	40 %	40 %	148662173
2113	NC_009525	CCCGG	2	10	2634684	2634693	0 %	0 %	40 %	60 %	148662173
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2115	NC_009525	CCAGG	2	10	2636896	2636905	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
2116	NC_009525	CACCG	2	10	2637658	2637667	20 %	0 %	20 %	60 %	148662177
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2118	NC_009525	CCAGG	2	10	2641602	2641611	20 %	0 %	40 %	40 %	148662179
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2120	NC_009525	CTCAG	2	10	2642022	2642031	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
2121	NC_009525	GCTGA	2	10	2647812	2647821	20 %	20 %	40 %	20 %	148662186
2122	NC_009525	GTCGA	2	10	2647985	2647994	20 %	20 %	40 %	20 %	148662187
2123	NC_009525	TCAGA	2	10	2648862	2648871	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
2124	NC_009525	GACCC	2	10	2651329	2651338	20 %	0 %	20 %	60 %	148662188
2125	NC_009525	TCGGT	2	10	2652155	2652164	0 %	40 %	40 %	20 %	148662189
2126	NC_009525	CGGCG	2	10	2653726	2653735	0 %	0 %	60 %	40 %	148662191
2127	NC_009525	CCGGT	2	10	2654526	2654535	0 %	20 %	40 %	40 %	148662192
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2233	NC_009525	TTCCT	2	10	2797963	2797972	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
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2247	NC_009525	CCGGC	2	10	2817066	2817075	0 %	0 %	40 %	60 %	148662325
2248	NC_009525	CCCGC	2	10	2817588	2817597	0 %	0 %	20 %	80 %	148662325
2249	NC_009525	CCGCG	2	10	2818675	2818684	0 %	0 %	40 %	60 %	148662327
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2371	NC_009525	CCACC	2	10	2952680	2952689	20 %	0 %	0 %	80 %	148662453
2372	NC_009525	CCGCG	2	10	2955111	2955120	0 %	0 %	40 %	60 %	148662454
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2498	NC_009525	GTGGC	2	10	3120756	3120765	0 %	20 %	60 %	20 %	148662642
2499	NC_009525	CCGCG	2	10	3121018	3121027	0 %	0 %	40 %	60 %	148662642
2500	NC_009525	TGTGC	2	10	3121646	3121655	0 %	40 %	40 %	20 %	148662642

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