MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Mycobacterium tuberculosis H37Ra chromosome

Total Repeats: 3535

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_009525	CATGC	2	10	617384	617393	20 %	20 %	20 %	40 %	148660293
502	NC_009525	CGGCG	2	10	617634	617643	0 %	0 %	60 %	40 %	148660294
503	NC_009525	ATCGC	2	10	617695	617704	20 %	20 %	20 %	40 %	148660294
504	NC_009525	GCAGA	2	10	618158	618167	40 %	0 %	40 %	20 %	148660295
505	NC_009525	GTCGG	2	10	618776	618785	0 %	20 %	60 %	20 %	148660295
506	NC_009525	CTGGT	2	10	618870	618879	0 %	40 %	40 %	20 %	148660296
507	NC_009525	GTTCG	2	10	619402	619411	0 %	40 %	40 %	20 %	148660296
508	NC_009525	TCGTG	2	10	619530	619539	0 %	40 %	40 %	20 %	148660296
509	NC_009525	ACCTG	2	10	621544	621553	20 %	20 %	20 %	40 %	148660298
510	NC_009525	GTGCG	2	10	623271	623280	0 %	20 %	60 %	20 %	148660299
511	NC_009525	CAGCG	2	10	623728	623737	20 %	0 %	40 %	40 %	148660300
512	NC_009525	GGTCG	2	10	626040	626049	0 %	20 %	60 %	20 %	148660302
513	NC_009525	GCCGT	2	10	627962	627971	0 %	20 %	40 %	40 %	148660304
514	NC_009525	GAAGC	2	10	629986	629995	40 %	0 %	40 %	20 %	148660306
515	NC_009525	GGCCG	2	10	631106	631115	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
516	NC_009525	CACCG	2	10	632585	632594	20 %	0 %	20 %	60 %	148660307
517	NC_009525	CCAAC	2	10	632874	632883	40 %	0 %	0 %	60 %	148660307
518	NC_009525	GCCGG	2	10	633729	633738	0 %	0 %	60 %	40 %	148660309
519	NC_009525	CGATC	2	10	635192	635201	20 %	20 %	20 %	40 %	148660310
520	NC_009525	CGGCG	2	10	635565	635574	0 %	0 %	60 %	40 %	148660310
521	NC_009525	GCAGG	2	10	636820	636829	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
522	NC_009525	GCCGA	2	10	638232	638241	20 %	0 %	40 %	40 %	148660314
523	NC_009525	CAGCG	2	10	640204	640213	20 %	0 %	40 %	40 %	148660316
524	NC_009525	CAGAT	2	10	642363	642372	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
525	NC_009525	CGTCT	2	10	642844	642853	0 %	40 %	20 %	40 %	148660320
526	NC_009525	CGGCC	2	10	644516	644525	0 %	0 %	40 %	60 %	148660321
527	NC_009525	CGCGG	2	10	646474	646483	0 %	0 %	60 %	40 %	148660322
528	NC_009525	CGGCC	2	10	647569	647578	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
529	NC_009525	GCCGG	2	10	648198	648207	0 %	0 %	60 %	40 %	148660324
530	NC_009525	CCCCG	2	10	648896	648905	0 %	0 %	20 %	80 %	148660324
531	NC_009525	CGGAT	2	10	649525	649534	20 %	20 %	40 %	20 %	148660325
532	NC_009525	CGCAC	2	10	650780	650789	20 %	0 %	20 %	60 %	148660326
533	NC_009525	TGACC	2	10	651070	651079	20 %	20 %	20 %	40 %	148660327
534	NC_009525	GTTGC	2	10	651825	651834	0 %	40 %	40 %	20 %	148660328
535	NC_009525	CAAGC	2	10	651902	651911	40 %	0 %	20 %	40 %	148660328
536	NC_009525	CGTGC	2	10	655576	655585	0 %	20 %	40 %	40 %	148660332
537	NC_009525	CGGAT	2	10	655972	655981	20 %	20 %	40 %	20 %	148660332
538	NC_009525	CGATG	2	10	656423	656432	20 %	20 %	40 %	20 %	148660333
539	NC_009525	CGGAT	2	10	659644	659653	20 %	20 %	40 %	20 %	148660336
540	NC_009525	GGCCG	2	10	661113	661122	0 %	0 %	60 %	40 %	148660337
541	NC_009525	TCCGG	2	10	661245	661254	0 %	20 %	40 %	40 %	148660337
542	NC_009525	GCGGT	2	10	663850	663859	0 %	20 %	60 %	20 %	148660339
543	NC_009525	CTGAC	2	10	671969	671978	20 %	20 %	20 %	40 %	148660345
544	NC_009525	AGGCA	2	10	672497	672506	40 %	0 %	40 %	20 %	148660346
545	NC_009525	GCCCC	2	10	674177	674186	0 %	0 %	20 %	80 %	148660347
546	NC_009525	CCGGC	2	10	674769	674778	0 %	0 %	40 %	60 %	148660347
547	NC_009525	CAGGT	2	10	677236	677245	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
548	NC_009525	TCGTC	2	10	679755	679764	0 %	40 %	20 %	40 %	148660351
549	NC_009525	GTTGA	2	10	679780	679789	20 %	40 %	40 %	0 %	148660351
550	NC_009525	GCTCG	2	10	680898	680907	0 %	20 %	40 %	40 %	148660353
551	NC_009525	GACCT	2	10	682768	682777	20 %	20 %	20 %	40 %	148660353
552	NC_009525	GCCGC	2	10	682825	682834	0 %	0 %	40 %	60 %	148660353
553	NC_009525	CGAGG	2	10	683381	683390	20 %	0 %	60 %	20 %	148660354
554	NC_009525	TGATC	2	10	684142	684151	20 %	40 %	20 %	20 %	148660354
555	NC_009525	GAACG	2	10	686080	686089	40 %	0 %	40 %	20 %	148660355
556	NC_009525	CGATG	2	10	686831	686840	20 %	20 %	40 %	20 %	148660356
557	NC_009525	CGGGA	2	10	687221	687230	20 %	0 %	60 %	20 %	148660356
558	NC_009525	GGGCT	2	10	688285	688294	0 %	20 %	60 %	20 %	148660358
559	NC_009525	TGGGC	2	10	688667	688676	0 %	20 %	60 %	20 %	148660358
560	NC_009525	CGGGC	2	10	689489	689498	0 %	0 %	60 %	40 %	148660359
561	NC_009525	GACGG	2	10	691788	691797	20 %	0 %	60 %	20 %	148660361
562	NC_009525	CACTA	2	10	692671	692680	40 %	20 %	0 %	40 %	148660362
563	NC_009525	CCTAC	2	10	693818	693827	20 %	20 %	0 %	60 %	148660363
564	NC_009525	GCACC	2	10	695562	695571	20 %	0 %	20 %	60 %	148660364
565	NC_009525	GCCAG	2	10	695797	695806	20 %	0 %	40 %	40 %	148660364
566	NC_009525	GGTGT	2	10	696020	696029	0 %	40 %	60 %	0 %	148660364
567	NC_009525	CGGCG	2	10	697041	697050	0 %	0 %	60 %	40 %	148660367
568	NC_009525	CGGCG	2	10	697721	697730	0 %	0 %	60 %	40 %	148660367
569	NC_009525	GCGCA	2	10	699859	699868	20 %	0 %	40 %	40 %	148660371
570	NC_009525	GCGCG	2	10	700106	700115	0 %	0 %	60 %	40 %	148660371
571	NC_009525	CCGCG	2	10	700794	700803	0 %	0 %	40 %	60 %	148660372
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573	NC_009525	CGGTC	2	10	702042	702051	0 %	20 %	40 %	40 %	148660374
574	NC_009525	CACGG	2	10	702615	702624	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
575	NC_009525	CCCGG	2	10	702823	702832	0 %	0 %	40 %	60 %	148660375
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579	NC_009525	CGGCG	2	10	708350	708359	0 %	0 %	60 %	40 %	148660385
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581	NC_009525	CGCGG	2	10	709490	709499	0 %	0 %	60 %	40 %	148660385
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583	NC_009525	CGCGC	2	10	709738	709747	0 %	0 %	40 %	60 %	148660385
584	NC_009525	GCCGA	2	10	710592	710601	20 %	0 %	40 %	40 %	148660385
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589	NC_009525	GCCAC	2	10	712852	712861	20 %	0 %	20 %	60 %	148660390
590	NC_009525	ACCGC	2	10	713417	713426	20 %	0 %	20 %	60 %	148660390
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592	NC_009525	TGCGC	2	10	714640	714649	0 %	20 %	40 %	40 %	148660392
593	NC_009525	CCGAT	2	10	714741	714750	20 %	20 %	20 %	40 %	148660392
594	NC_009525	GTCGA	2	10	715992	716001	20 %	20 %	40 %	20 %	148660393
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598	NC_009525	CCGGT	2	10	724170	724179	0 %	20 %	40 %	40 %	148660402
599	NC_009525	GGCCG	2	10	724190	724199	0 %	0 %	60 %	40 %	148660402
600	NC_009525	CGCTG	2	10	724886	724895	0 %	20 %	40 %	40 %	148660402
601	NC_009525	CAGGC	2	10	728949	728958	20 %	0 %	40 %	40 %	148660403
602	NC_009525	AGCCG	2	10	728979	728988	20 %	0 %	40 %	40 %	148660403
603	NC_009525	CGGCC	2	10	729438	729447	0 %	0 %	40 %	60 %	148660403
604	NC_009525	ATCAG	2	10	730601	730610	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
605	NC_009525	CGCGG	2	10	730745	730754	0 %	0 %	60 %	40 %	148660405
606	NC_009525	CTGGT	2	10	734802	734811	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
607	NC_009525	GGCCA	2	10	736379	736388	20 %	0 %	40 %	40 %	148660414
608	NC_009525	CGGCG	2	10	737389	737398	0 %	0 %	60 %	40 %	148660415
609	NC_009525	TCGGG	2	10	738390	738399	0 %	20 %	60 %	20 %	148660416
610	NC_009525	GCCCC	2	10	741264	741273	0 %	0 %	20 %	80 %	148660419
611	NC_009525	GGACC	2	10	742188	742197	20 %	0 %	40 %	40 %	148660420
612	NC_009525	GCCGG	2	10	743449	743458	0 %	0 %	60 %	40 %	148660421
613	NC_009525	GCTGG	2	10	745137	745146	0 %	20 %	60 %	20 %	148660422
614	NC_009525	CGAGA	2	10	746167	746176	40 %	0 %	40 %	20 %	148660422
615	NC_009525	GCCGC	2	10	746248	746257	0 %	0 %	40 %	60 %	148660422
616	NC_009525	CGACG	2	10	747971	747980	20 %	0 %	40 %	40 %	148660423
617	NC_009525	GCGAC	2	10	749269	749278	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
618	NC_009525	GACCG	2	10	749335	749344	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
619	NC_009525	CGCAG	2	10	749620	749629	20 %	0 %	40 %	40 %	148660425
620	NC_009525	CGGCC	2	10	751607	751616	0 %	0 %	40 %	60 %	148660428
621	NC_009525	CGGTG	2	10	752397	752406	0 %	20 %	60 %	20 %	148660428
622	NC_009525	GGGGA	2	10	759823	759832	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
623	NC_009525	GCTGG	2	10	761814	761823	0 %	20 %	60 %	20 %	148660441
624	NC_009525	CCGGG	2	10	765850	765859	0 %	0 %	60 %	40 %	148660442
625	NC_009525	AAGGC	2	10	766228	766237	40 %	0 %	40 %	20 %	148660442
626	NC_009525	GCGAT	2	10	768666	768675	20 %	20 %	40 %	20 %	148660443
627	NC_009525	GTTTA	2	10	768863	768872	20 %	60 %	20 %	0 %	148660443
628	NC_009525	CAGCT	2	10	769372	769381	20 %	20 %	20 %	40 %	148660444
629	NC_009525	CGCTC	2	10	770022	770031	0 %	20 %	20 %	60 %	148660444
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