MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Mesorhizobium loti MAFF303099 chromosome

Total Repeats: 118665

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_002678	GCC	2	6	30030	30035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470357
502	NC_002678	TCT	2	6	30074	30079	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13470357
503	NC_002678	CTC	2	6	30090	30095	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13470357
504	NC_002678	TCG	2	6	30106	30111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470357
505	NC_002678	TCG	2	6	30119	30124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470357
506	NC_002678	TGG	2	6	30188	30193	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13470357
507	NC_002678	TGA	2	6	30266	30271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13470357
508	NC_002678	GAT	2	6	30279	30284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13470357
509	NC_002678	TCG	2	6	30295	30300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470357
510	NC_002678	CGA	2	6	30311	30316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470357
511	NC_002678	GCG	2	6	30430	30435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
512	NC_002678	GCT	2	6	30460	30465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_002678	GGC	2	6	30650	30655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
514	NC_002678	GCG	2	6	30670	30675	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470358
515	NC_002678	GCC	2	6	30677	30682	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470358
516	NC_002678	TGT	2	6	30736	30741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	13470358
517	NC_002678	GGC	3	9	30845	30853	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470358
518	NC_002678	GTG	2	6	30894	30899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13470358
519	NC_002678	TCG	2	6	30907	30912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470358
520	NC_002678	CGA	2	6	30920	30925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470358
521	NC_002678	GAA	2	6	31177	31182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13470358
522	NC_002678	ACG	2	6	31308	31313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470358
523	NC_002678	GAC	2	6	31331	31336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470358
524	NC_002678	GGT	2	6	31373	31378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13470358
525	NC_002678	CGT	2	6	31522	31527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470358
526	NC_002678	CCT	2	6	31645	31650	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
527	NC_002678	GAT	2	6	31807	31812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
528	NC_002678	GCA	2	6	31995	32000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
529	NC_002678	CCG	2	6	32045	32050	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
530	NC_002678	ATC	2	6	32177	32182	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
531	NC_002678	CGG	2	6	32220	32225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470359
532	NC_002678	ATC	2	6	32233	32238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13470359
533	NC_002678	TCG	2	6	32240	32245	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470359
534	NC_002678	CGC	3	9	32358	32366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470359
535	NC_002678	CGA	2	6	32406	32411	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470359
536	NC_002678	CCA	2	6	32450	32455	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13470359
537	NC_002678	TGC	2	6	32513	32518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470359
538	NC_002678	CGA	2	6	32604	32609	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470359
539	NC_002678	GCT	2	6	32667	32672	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470359
540	NC_002678	GAA	2	6	32758	32763	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13470359
541	NC_002678	GAA	2	6	32829	32834	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13470359
542	NC_002678	TGC	2	6	32903	32908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470359
543	NC_002678	CAT	2	6	32913	32918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13470359
544	NC_002678	GAT	2	6	32974	32979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13470359
545	NC_002678	GGC	2	6	32984	32989	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470359
546	NC_002678	GCC	2	6	32995	33000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470359
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549	NC_002678	GGC	2	6	33076	33081	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470359
550	NC_002678	CGG	2	6	33133	33138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470360
551	NC_002678	TGC	2	6	33147	33152	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470360
552	NC_002678	GGA	2	6	33229	33234	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13470360
553	NC_002678	CGG	2	6	33390	33395	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470360
554	NC_002678	CGG	3	9	33402	33410	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470360
555	NC_002678	TGG	2	6	33519	33524	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13470360
556	NC_002678	CGA	2	6	33577	33582	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470360
557	NC_002678	GCT	2	6	33760	33765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470360
558	NC_002678	GCC	2	6	33766	33771	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470360
559	NC_002678	GCG	2	6	33947	33952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_002678	GCT	2	6	33961	33966	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57165209
561	NC_002678	TGC	2	6	33986	33991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57165209
562	NC_002678	CGA	2	6	34067	34072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57165209
563	NC_002678	CGA	2	6	34109	34114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57165209
564	NC_002678	CGC	2	6	34452	34457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	57165209
565	NC_002678	GGC	2	6	34641	34646	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	57165209
566	NC_002678	GCG	2	6	34657	34662	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	57165209
567	NC_002678	CCT	2	6	34730	34735	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	57165209
568	NC_002678	GCC	2	6	34780	34785	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	57165209
569	NC_002678	GAT	2	6	34866	34871	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	57165209
570	NC_002678	TCG	2	6	34895	34900	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57165209
571	NC_002678	GCA	2	6	34955	34960	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57165209
572	NC_002678	CGC	2	6	34965	34970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	57165209
573	NC_002678	CGG	2	6	34986	34991	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	57165209
574	NC_002678	CGA	2	6	35072	35077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57165209
575	NC_002678	GCA	2	6	35105	35110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	57165209
576	NC_002678	CTG	2	6	35119	35124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	57165209
577	NC_002678	GCC	2	6	35230	35235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	57165209
578	NC_002678	CGG	2	6	35309	35314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	57165209
579	NC_002678	CGA	2	6	35390	35395	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_002678	CCG	3	9	35464	35472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
581	NC_002678	GCG	2	6	35477	35482	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
582	NC_002678	CAG	2	6	35533	35538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470361
583	NC_002678	GCC	2	6	35542	35547	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470361
584	NC_002678	GCG	2	6	35570	35575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470361
585	NC_002678	AGC	2	6	35636	35641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470361
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588	NC_002678	GCC	2	6	35850	35855	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470362
589	NC_002678	GAT	2	6	35875	35880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13470362
590	NC_002678	GAA	2	6	35980	35985	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13470362
591	NC_002678	CTT	2	6	35986	35991	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13470362
592	NC_002678	CTC	2	6	36005	36010	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13470362
593	NC_002678	CGT	2	6	36069	36074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
594	NC_002678	GCC	2	6	36144	36149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
595	NC_002678	CCG	2	6	36246	36251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
596	NC_002678	AGG	2	6	36296	36301	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
597	NC_002678	CCG	2	6	36397	36402	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470363
598	NC_002678	GCC	2	6	36423	36428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470363
599	NC_002678	CAA	2	6	36442	36447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13470363
600	NC_002678	CCG	2	6	36595	36600	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470363
601	NC_002678	GTC	2	6	36656	36661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470363
602	NC_002678	CGC	2	6	36691	36696	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470363
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606	NC_002678	GGC	2	6	37020	37025	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_002678	TTG	2	6	37030	37035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
608	NC_002678	TGC	2	6	37119	37124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_002678	CAA	2	6	37204	37209	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13470364
610	NC_002678	GCT	2	6	37222	37227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470364
611	NC_002678	TGG	2	6	37263	37268	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13470364
612	NC_002678	GGC	2	6	37301	37306	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470364
613	NC_002678	GCT	2	6	37357	37362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470364
614	NC_002678	GGT	2	6	37486	37491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13470364
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616	NC_002678	GCG	2	6	37543	37548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470364
617	NC_002678	GAG	2	6	37574	37579	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13470364
618	NC_002678	CCA	2	6	37603	37608	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13470364
619	NC_002678	CTT	2	6	37630	37635	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13470364
620	NC_002678	GGC	2	6	37652	37657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470364
621	NC_002678	CGC	2	6	37663	37668	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470364
622	NC_002678	GCC	2	6	37672	37677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470364
623	NC_002678	GCT	2	6	37681	37686	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470364
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