MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Mesorhizobium loti MAFF303099 chromosome

Total Repeats: 118665

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_002678	GCG	2	6	181935	181940	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470525
3002	NC_002678	GCC	2	6	181954	181959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470525
3003	NC_002678	CGG	2	6	181997	182002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3004	NC_002678	TCG	2	6	182062	182067	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3005	NC_002678	TTG	2	6	182119	182124	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3006	NC_002678	CGC	2	6	182175	182180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3007	NC_002678	AAC	2	6	182189	182194	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3008	NC_002678	GCC	2	6	182236	182241	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3009	NC_002678	CGG	2	6	182320	182325	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3010	NC_002678	CCA	2	6	182411	182416	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3011	NC_002678	AGC	3	9	182528	182536	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3012	NC_002678	TGC	2	6	182688	182693	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470526
3013	NC_002678	CGA	2	6	182725	182730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470526
3014	NC_002678	GCG	2	6	182742	182747	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470526
3015	NC_002678	GCG	2	6	182823	182828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470526
3016	NC_002678	GCC	2	6	182924	182929	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470526
3017	NC_002678	GCC	2	6	182933	182938	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470526
3018	NC_002678	GCC	2	6	182945	182950	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470526
3019	NC_002678	GGT	2	6	182960	182965	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13470526
3020	NC_002678	GCG	2	6	182967	182972	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470526
3021	NC_002678	ATC	2	6	183063	183068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13470527
3022	NC_002678	GCC	2	6	183086	183091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470527
3023	NC_002678	TCC	2	6	183125	183130	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13470527
3024	NC_002678	CAA	2	6	183156	183161	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13470527
3025	NC_002678	ATC	2	6	183255	183260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13470528
3026	NC_002678	GCA	2	6	183298	183303	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470528
3027	NC_002678	CAA	2	6	183311	183316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13470528
3028	NC_002678	CGG	2	6	183371	183376	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470528
3029	NC_002678	TCG	2	6	183436	183441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470528
3030	NC_002678	GGT	2	6	183443	183448	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13470528
3031	NC_002678	CGG	2	6	183587	183592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3032	NC_002678	GAA	2	6	183696	183701	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13470529
3033	NC_002678	GGC	2	6	183753	183758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470529
3034	NC_002678	CGT	2	6	183833	183838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3035	NC_002678	CGA	2	6	183920	183925	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470530
3036	NC_002678	CCA	3	9	183977	183985	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13470530
3037	NC_002678	CAG	2	6	184032	184037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470530
3038	NC_002678	CAG	2	6	184164	184169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470530
3039	NC_002678	CAC	3	9	184236	184244	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13470530
3040	NC_002678	CGG	2	6	184247	184252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470530
3041	NC_002678	ATC	2	6	184264	184269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13470530
3042	NC_002678	CAG	2	6	184341	184346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470530
3043	NC_002678	CCA	2	6	184382	184387	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13470530
3044	NC_002678	GCC	2	6	184431	184436	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470530
3045	NC_002678	CAG	2	6	184476	184481	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470530
3046	NC_002678	CGC	2	6	184554	184559	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470530
3047	NC_002678	GCA	2	6	184580	184585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470530
3048	NC_002678	CAG	2	6	184626	184631	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470530
3049	NC_002678	AAC	2	6	184633	184638	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13470530
3050	NC_002678	GCC	2	6	184660	184665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470530
3051	NC_002678	TCA	2	6	184718	184723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13470530
3052	NC_002678	CGG	2	6	184823	184828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3053	NC_002678	CCG	2	6	184829	184834	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3054	NC_002678	CGG	2	6	185182	185187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470532
3055	NC_002678	GCG	2	6	185235	185240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470532
3056	NC_002678	GAA	2	6	185348	185353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13470532
3057	NC_002678	TGG	2	6	185392	185397	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13470532
3058	NC_002678	GCC	2	6	185403	185408	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470532
3059	NC_002678	GTG	2	6	185475	185480	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13470532
3060	NC_002678	CGA	2	6	185504	185509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470532
3061	NC_002678	GCT	2	6	185516	185521	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470532
3062	NC_002678	GAA	2	6	185558	185563	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13470532
3063	NC_002678	CGA	2	6	185576	185581	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470532
3064	NC_002678	CAA	2	6	185627	185632	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13470532
3065	NC_002678	GCG	2	6	185788	185793	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470532
3066	NC_002678	GAG	2	6	185808	185813	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13470532
3067	NC_002678	ATC	2	6	185820	185825	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13470532
3068	NC_002678	GAC	2	6	185846	185851	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470532
3069	NC_002678	GCT	2	6	185879	185884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470532
3070	NC_002678	ACA	2	6	185905	185910	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13470532
3071	NC_002678	TGC	2	6	185920	185925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470532
3072	NC_002678	AAG	2	6	185994	185999	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13470532
3073	NC_002678	TTC	2	6	186054	186059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13470532
3074	NC_002678	ACG	2	6	186090	186095	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470532
3075	NC_002678	ACA	2	6	186151	186156	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13470532
3076	NC_002678	TCG	2	6	186250	186255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470532
3077	NC_002678	AAT	2	6	186268	186273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	13470532
3078	NC_002678	GCC	2	6	186319	186324	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3079	NC_002678	CGC	2	6	186340	186345	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3080	NC_002678	CGC	2	6	186385	186390	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3081	NC_002678	TGG	2	6	186462	186467	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13470533
3082	NC_002678	CCG	2	6	186555	186560	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470533
3083	NC_002678	CGT	2	6	186572	186577	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470533
3084	NC_002678	GCA	2	6	186580	186585	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470533
3085	NC_002678	CGG	2	6	186625	186630	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470533
3086	NC_002678	CGG	2	6	186643	186648	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470533
3087	NC_002678	GCT	2	6	186659	186664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470533
3088	NC_002678	CGT	3	9	186704	186712	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470533
3089	NC_002678	CGG	2	6	186722	186727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470533
3090	NC_002678	GAT	2	6	186758	186763	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13470533
3091	NC_002678	GAA	2	6	186827	186832	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13470533
3092	NC_002678	ACA	2	6	186841	186846	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13470533
3093	NC_002678	TGA	2	6	186881	186886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13470533
3094	NC_002678	CGG	2	6	186926	186931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470533
3095	NC_002678	CCG	2	6	186935	186940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470533
3096	NC_002678	CCA	2	6	186971	186976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13470533
3097	NC_002678	CAC	3	9	186980	186988	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13470533
3098	NC_002678	GCT	2	6	187004	187009	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470533
3099	NC_002678	ACC	2	6	187017	187022	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13470533
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3101	NC_002678	GGT	2	6	187064	187069	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13470533
3102	NC_002678	ATG	2	6	187179	187184	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13470533
3103	NC_002678	CGA	2	6	187223	187228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470533
3104	NC_002678	GCA	2	6	187453	187458	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470533
3105	NC_002678	CGG	2	6	187495	187500	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470533
3106	NC_002678	CGC	2	6	187522	187527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470533
3107	NC_002678	GGC	2	6	187616	187621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470533
3108	NC_002678	TCG	2	6	187675	187680	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470533
3109	NC_002678	CGG	2	6	187787	187792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470533
3110	NC_002678	GAG	2	6	187872	187877	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13470533
3111	NC_002678	GAC	2	6	187967	187972	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470533
3112	NC_002678	GCC	2	6	188051	188056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470533
3113	NC_002678	TCG	2	6	188153	188158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3114	NC_002678	GGA	2	6	188178	188183	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3115	NC_002678	ATC	2	6	188323	188328	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13470534
3116	NC_002678	TGG	2	6	188363	188368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	13470534
3117	NC_002678	CAT	2	6	188418	188423	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13470534
3118	NC_002678	GAA	2	6	188442	188447	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13470534
3119	NC_002678	GCC	2	6	188452	188457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470534
3120	NC_002678	CGA	2	6	188486	188491	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470534
3121	NC_002678	CGC	2	6	188653	188658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470534
3122	NC_002678	GCC	2	6	188679	188684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3123	NC_002678	CGT	2	6	188802	188807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470535
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3128	NC_002678	CTG	2	6	189396	189401	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3244	NC_002678	CGT	2	6	196238	196243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470542
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3484	NC_002678	AAG	2	6	210419	210424	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13470552
3485	NC_002678	CAG	2	6	210425	210430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470552
3486	NC_002678	CGG	3	9	210544	210552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470552
3487	NC_002678	GTC	2	6	210569	210574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470552
3488	NC_002678	ATC	2	6	210659	210664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13470552
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3491	NC_002678	TGC	2	6	210816	210821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470552
3492	NC_002678	GCC	2	6	210881	210886	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470552
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