MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Mesorhizobium loti MAFF303099 chromosome

Total Repeats: 118665

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_002678	GAA	2	6	239454	239459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13470589
4002	NC_002678	GAG	2	6	239536	239541	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13470589
4003	NC_002678	TGC	2	6	239605	239610	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470589
4004	NC_002678	CGA	2	6	239642	239647	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470589
4005	NC_002678	CGT	2	6	239654	239659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470589
4006	NC_002678	ATG	2	6	239677	239682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13470589
4007	NC_002678	GTC	2	6	239692	239697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470589
4008	NC_002678	TGA	2	6	239716	239721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_002678	GGA	2	6	239747	239752	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4010	NC_002678	TCG	2	6	239897	239902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470590
4011	NC_002678	CGA	2	6	239940	239945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470590
4012	NC_002678	CCT	2	6	240033	240038	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13470590
4013	NC_002678	TGA	2	6	240075	240080	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13470590
4014	NC_002678	CCT	2	6	240360	240365	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4015	NC_002678	TGA	3	9	240383	240391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_002678	CTC	2	6	240393	240398	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4017	NC_002678	CTT	2	6	240468	240473	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13470591
4018	NC_002678	CCG	2	6	240478	240483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470591
4019	NC_002678	CGC	2	6	240566	240571	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470591
4020	NC_002678	CGC	2	6	240593	240598	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470591
4021	NC_002678	CAA	2	6	240629	240634	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13470591
4022	NC_002678	GGC	2	6	240636	240641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470591
4023	NC_002678	GTC	2	6	240651	240656	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470591
4024	NC_002678	GCG	2	6	240676	240681	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470591
4025	NC_002678	ACG	2	6	240687	240692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470591
4026	NC_002678	GCA	2	6	240729	240734	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470591
4027	NC_002678	GCC	2	6	240855	240860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470591
4028	NC_002678	CCG	3	9	240964	240972	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470591
4029	NC_002678	AAG	2	6	240993	240998	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13470591
4030	NC_002678	GCG	2	6	241033	241038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470591
4031	NC_002678	GAC	2	6	241068	241073	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470591
4032	NC_002678	ATC	2	6	241074	241079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13470591
4033	NC_002678	CGG	2	6	241193	241198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470591
4034	NC_002678	GCG	2	6	241215	241220	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470591
4035	NC_002678	TGC	2	6	241324	241329	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470591
4036	NC_002678	GAT	2	6	241338	241343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13470591
4037	NC_002678	CTC	2	6	241446	241451	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13470591
4038	NC_002678	TGC	2	6	241472	241477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470591
4039	NC_002678	AGC	2	6	241553	241558	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470591
4040	NC_002678	TGA	2	6	241585	241590	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13470591
4041	NC_002678	GCG	2	6	241671	241676	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470591
4042	NC_002678	CGC	2	6	241727	241732	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470591
4043	NC_002678	GCG	2	6	241746	241751	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470591
4044	NC_002678	GCG	2	6	241767	241772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470591
4045	NC_002678	CTG	2	6	241824	241829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470591
4046	NC_002678	GCG	2	6	241863	241868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470591
4047	NC_002678	AGC	2	6	242058	242063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470592
4048	NC_002678	CGT	2	6	242071	242076	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470592
4049	NC_002678	GAT	2	6	242078	242083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13470592
4050	NC_002678	TCG	2	6	242199	242204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470592
4051	NC_002678	CGG	2	6	242251	242256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470592
4052	NC_002678	CAT	2	6	242296	242301	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13470592
4053	NC_002678	GGC	2	6	242326	242331	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470592
4054	NC_002678	CGT	2	6	242350	242355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470592
4055	NC_002678	GCG	2	6	242406	242411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470592
4056	NC_002678	GGC	2	6	242525	242530	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470592
4057	NC_002678	AGC	2	6	242631	242636	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470592
4058	NC_002678	CGG	2	6	242689	242694	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470592
4059	NC_002678	GCC	2	6	242735	242740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470592
4060	NC_002678	GAA	2	6	242887	242892	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13470592
4061	NC_002678	ATT	2	6	242982	242987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	13470592
4062	NC_002678	CGA	2	6	243100	243105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470592
4063	NC_002678	GAC	2	6	243109	243114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470592
4064	NC_002678	CGC	2	6	243117	243122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470592
4065	NC_002678	CGC	2	6	243147	243152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470592
4066	NC_002678	CGC	2	6	243243	243248	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470592
4067	NC_002678	GGA	2	6	243319	243324	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13470592
4068	NC_002678	GGC	2	6	243359	243364	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470592
4069	NC_002678	CGC	2	6	243375	243380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470592
4070	NC_002678	CTG	2	6	243422	243427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470592
4071	NC_002678	CGC	2	6	243535	243540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470592
4072	NC_002678	CGG	2	6	243600	243605	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470592
4073	NC_002678	CGA	2	6	243625	243630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470592
4074	NC_002678	CGC	2	6	243646	243651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470592
4075	NC_002678	AAG	2	6	243656	243661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13470592
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4078	NC_002678	CGG	2	6	243751	243756	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470592
4079	NC_002678	GCC	2	6	243832	243837	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470592
4080	NC_002678	GGA	2	6	243982	243987	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13470592
4081	NC_002678	CGG	2	6	243997	244002	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4082	NC_002678	TGT	2	6	244043	244048	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	13470593
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4088	NC_002678	CGA	2	6	244166	244171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470593
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4090	NC_002678	CGC	2	6	244316	244321	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470593
4091	NC_002678	GCC	2	6	244353	244358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470593
4092	NC_002678	TGA	2	6	244373	244378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13470593
4093	NC_002678	AAC	2	6	244414	244419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13470593
4094	NC_002678	CCA	2	6	244444	244449	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13470593
4095	NC_002678	CGA	2	6	244487	244492	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470593
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4100	NC_002678	CGT	2	6	244718	244723	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470593
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4102	NC_002678	AGG	2	6	244831	244836	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13470593
4103	NC_002678	GGA	2	6	244899	244904	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13470593
4104	NC_002678	TCG	2	6	244907	244912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470593
4105	NC_002678	GCC	2	6	244926	244931	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470593
4106	NC_002678	CGG	2	6	244940	244945	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470593
4107	NC_002678	CAC	2	6	244971	244976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	13470593
4108	NC_002678	AGG	2	6	245000	245005	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	13470593
4109	NC_002678	CGC	2	6	245054	245059	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470593
4110	NC_002678	CCG	2	6	245140	245145	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470593
4111	NC_002678	CCT	2	6	245159	245164	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	13470593
4112	NC_002678	GAT	2	6	245196	245201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13470593
4113	NC_002678	TGA	2	6	245237	245242	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13470593
4114	NC_002678	CCG	2	6	245272	245277	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470593
4115	NC_002678	GAC	2	6	245340	245345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470593
4116	NC_002678	TCT	2	6	245366	245371	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13470593
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4118	NC_002678	TCG	2	6	245431	245436	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470593
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4120	NC_002678	GCC	2	6	245505	245510	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470593
4121	NC_002678	GCT	2	6	245586	245591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470593
4122	NC_002678	ATG	2	6	245601	245606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13470593
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4125	NC_002678	ATG	2	6	245813	245818	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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4128	NC_002678	AGA	2	6	245946	245951	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4129	NC_002678	GCT	2	6	246034	246039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470594
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4154	NC_002678	GGC	2	6	247442	247447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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4364	NC_002678	CTG	2	6	260263	260268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470608
4365	NC_002678	GCC	2	6	260392	260397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470608
4366	NC_002678	AGC	2	6	260474	260479	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470608
4367	NC_002678	CCG	2	6	260509	260514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	13470608
4368	NC_002678	TCG	2	6	260570	260575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470608
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4370	NC_002678	ATG	2	6	260671	260676	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	13470608
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4391	NC_002678	CGG	2	6	261540	261545	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470608
4392	NC_002678	TCG	3	9	261572	261580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470608
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4399	NC_002678	GGC	2	6	262159	262164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4400	NC_002678	CCT	2	6	262206	262211	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4401	NC_002678	TCA	2	6	262287	262292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4402	NC_002678	GCC	2	6	262318	262323	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4403	NC_002678	CAA	2	6	262358	262363	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4404	NC_002678	CTT	2	6	262486	262491	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	13470609
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4424	NC_002678	TGA	2	6	263799	263804	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4425	NC_002678	TGC	2	6	263879	263884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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4427	NC_002678	TTC	2	6	263974	263979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4430	NC_002678	CCG	2	6	264177	264182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4431	NC_002678	GAG	2	6	264209	264214	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4432	NC_002678	AGG	2	6	264258	264263	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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4438	NC_002678	ATG	2	6	264586	264591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4439	NC_002678	TCG	3	9	264705	264713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470611
4440	NC_002678	CTG	2	6	264748	264753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470611
4441	NC_002678	TCG	2	6	264843	264848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470611
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4443	NC_002678	TGC	2	6	265042	265047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	13470611
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4473	NC_002678	AGA	2	6	266565	266570	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	13470613
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4477	NC_002678	ACA	2	6	266728	266733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	13470613
4478	NC_002678	GCA	2	6	266813	266818	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470613
4479	NC_002678	CAT	2	6	266826	266831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13470613
4480	NC_002678	CAT	2	6	266853	266858	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	13470613
4481	NC_002678	GGC	2	6	266878	266883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	13470613
4482	NC_002678	ACG	2	6	266936	266941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	13470613
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