MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Fibrella aestuarina BUZ 2 drat genome

Total Repeats: 4765

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020054	CCGGC	2	10	483	492	0 %	0 %	40 %	60 %	436833392
2	NC_020054	GCCCG	2	10	3653	3662	0 %	0 %	40 %	60 %	436833395
3	NC_020054	CCGAC	2	10	4037	4046	20 %	0 %	20 %	60 %	436833395
4	NC_020054	ACTAA	2	10	4496	4505	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
5	NC_020054	GCAGC	2	10	6759	6768	20 %	0 %	40 %	40 %	436833398
6	NC_020054	GCGTT	2	10	9887	9896	0 %	40 %	40 %	20 %	436833401
7	NC_020054	GTATC	2	10	11003	11012	20 %	40 %	20 %	20 %	436833402
8	NC_020054	ATCGC	2	10	12455	12464	20 %	20 %	20 %	40 %	436833403
9	NC_020054	ACCCA	2	10	15340	15349	40 %	0 %	0 %	60 %	436833407
10	NC_020054	AACAC	2	10	18196	18205	60 %	0 %	0 %	40 %	436833409
11	NC_020054	CAACC	2	10	19920	19929	40 %	0 %	0 %	60 %	436833411
12	NC_020054	TTTGG	2	10	21903	21912	0 %	60 %	40 %	0 %	436833413
13	NC_020054	AATCG	2	10	23117	23126	40 %	20 %	20 %	20 %	436833413
14	NC_020054	AGGCA	2	10	23233	23242	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
15	NC_020054	CCGGC	2	10	23813	23822	0 %	0 %	40 %	60 %	436833414
16	NC_020054	GTGAA	2	10	24813	24822	40 %	20 %	40 %	0 %	436833416
17	NC_020054	AACCC	2	10	26839	26848	40 %	0 %	0 %	60 %	436833419
18	NC_020054	TCGAG	2	10	27117	27126	20 %	20 %	40 %	20 %	436833419
19	NC_020054	GCCGG	2	10	27226	27235	0 %	0 %	60 %	40 %	436833419
20	NC_020054	CAGGG	2	10	29641	29650	20 %	0 %	60 %	20 %	436833421
21	NC_020054	TGGCG	2	10	29661	29670	0 %	20 %	60 %	20 %	436833421
22	NC_020054	CCCGG	2	10	30672	30681	0 %	0 %	40 %	60 %	436833422
23	NC_020054	CCCGA	2	10	31164	31173	20 %	0 %	20 %	60 %	436833423
24	NC_020054	TGAGG	2	10	31670	31679	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020054	CGAGG	2	10	32184	32193	20 %	0 %	60 %	20 %	436833424
26	NC_020054	GTGCC	2	10	32471	32480	0 %	20 %	40 %	40 %	436833424
27	NC_020054	GTCGG	2	10	32829	32838	0 %	20 %	60 %	20 %	436833425
28	NC_020054	GTAGC	2	10	33254	33263	20 %	20 %	40 %	20 %	436833425
29	NC_020054	GTAGT	2	10	33940	33949	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020054	GGTAA	2	10	35042	35051	40 %	20 %	40 %	0 %	436833427
31	NC_020054	ACGAA	2	10	35138	35147	60 %	0 %	20 %	20 %	436833427
32	NC_020054	CGCCC	2	10	36567	36576	0 %	0 %	20 %	80 %	436833428
33	NC_020054	GTTAT	2	10	37044	37053	20 %	60 %	20 %	0 %	436833428
34	NC_020054	GCGCC	2	10	39390	39399	0 %	0 %	40 %	60 %	436833430
35	NC_020054	TGGGT	2	10	40876	40885	0 %	40 %	60 %	0 %	436833432
36	NC_020054	GATCT	2	10	40909	40918	20 %	40 %	20 %	20 %	436833432
37	NC_020054	GTCAG	2	10	43143	43152	20 %	20 %	40 %	20 %	436833433
38	NC_020054	GGCGC	2	10	43430	43439	0 %	0 %	60 %	40 %	436833433
39	NC_020054	TGGTG	2	10	44131	44140	0 %	40 %	60 %	0 %	436833433
40	NC_020054	ACCCC	2	10	44406	44415	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
41	NC_020054	CCCCT	2	10	44419	44428	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
42	NC_020054	AGGGG	2	10	44436	44445	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020054	TATTT	2	10	45053	45062	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020054	CAGGC	2	10	45624	45633	20 %	0 %	40 %	40 %	436833436
45	NC_020054	GAACT	2	10	47616	47625	40 %	20 %	20 %	20 %	436833436
46	NC_020054	TTAAC	2	10	50508	50517	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
47	NC_020054	CCCCG	2	10	53345	53354	0 %	0 %	20 %	80 %	436833440
48	NC_020054	GTCGG	2	10	53817	53826	0 %	20 %	60 %	20 %	436833440
49	NC_020054	CTGGC	2	10	54072	54081	0 %	20 %	40 %	40 %	436833440
50	NC_020054	GGGCG	2	10	54533	54542	0 %	0 %	80 %	20 %	436833441
51	NC_020054	CCAAA	2	10	54837	54846	60 %	0 %	0 %	40 %	436833442
52	NC_020054	CACGC	2	10	55776	55785	20 %	0 %	20 %	60 %	436833443
53	NC_020054	GCGTT	2	10	56393	56402	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
54	NC_020054	TCGCC	2	10	56527	56536	0 %	20 %	20 %	60 %	436833444
55	NC_020054	CGCGT	2	10	57394	57403	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
56	NC_020054	TGGCT	2	10	61289	61298	0 %	40 %	40 %	20 %	436833447
57	NC_020054	AATGG	2	10	61590	61599	40 %	20 %	40 %	0 %	436833447
58	NC_020054	CCCGC	2	10	63753	63762	0 %	0 %	20 %	80 %	436833449
59	NC_020054	CAAAG	2	10	63788	63797	60 %	0 %	20 %	20 %	436833449
60	NC_020054	ACCCG	2	10	65767	65776	20 %	0 %	20 %	60 %	436833451
61	NC_020054	CGCCC	2	10	69265	69274	0 %	0 %	20 %	80 %	436833455
62	NC_020054	GCCCC	2	10	69647	69656	0 %	0 %	20 %	80 %	436833455
63	NC_020054	GATCC	2	10	70356	70365	20 %	20 %	20 %	40 %	436833456
64	NC_020054	TGCTC	2	10	73638	73647	0 %	40 %	20 %	40 %	436833457
65	NC_020054	TGACC	2	10	78264	78273	20 %	20 %	20 %	40 %	436833460
66	NC_020054	TCCTG	2	10	78383	78392	0 %	40 %	20 %	40 %	436833460
67	NC_020054	GTACG	2	10	79460	79469	20 %	20 %	40 %	20 %	436833461
68	NC_020054	ACCGC	2	10	82456	82465	20 %	0 %	20 %	60 %	436833462
69	NC_020054	GTCGG	2	10	84295	84304	0 %	20 %	60 %	20 %	436833464
70	NC_020054	ACCGA	2	10	86929	86938	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
71	NC_020054	GTTGG	2	10	92012	92021	0 %	40 %	60 %	0 %	436833470
72	NC_020054	GCTGG	2	10	92249	92258	0 %	20 %	60 %	20 %	436833470
73	NC_020054	AGCGT	2	10	92823	92832	20 %	20 %	40 %	20 %	436833470
74	NC_020054	CGTAC	2	10	99776	99785	20 %	20 %	20 %	40 %	436833474
75	NC_020054	GGCGC	2	10	102028	102037	0 %	0 %	60 %	40 %	436833475
76	NC_020054	CACGG	2	10	103370	103379	20 %	0 %	40 %	40 %	436833476
77	NC_020054	CCCCG	2	10	103429	103438	0 %	0 %	20 %	80 %	436833476
78	NC_020054	ACGCT	2	10	104267	104276	20 %	20 %	20 %	40 %	436833477
79	NC_020054	CTCGA	2	10	105178	105187	20 %	20 %	20 %	40 %	436833478
80	NC_020054	AGCGC	2	10	105552	105561	20 %	0 %	40 %	40 %	436833478
81	NC_020054	AGTGC	2	10	106245	106254	20 %	20 %	40 %	20 %	436833479
82	NC_020054	GCAAG	2	10	107785	107794	40 %	0 %	40 %	20 %	436833480
83	NC_020054	CCAAC	2	10	108736	108745	40 %	0 %	0 %	60 %	436833480
84	NC_020054	GTTGG	2	10	109758	109767	0 %	40 %	60 %	0 %	436833481
85	NC_020054	CTTCC	2	10	111048	111057	0 %	40 %	0 %	60 %	436833481
86	NC_020054	CTACC	2	10	111494	111503	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
87	NC_020054	TGGCG	2	10	111641	111650	0 %	20 %	60 %	20 %	436833482
88	NC_020054	GCCAA	2	10	113091	113100	40 %	0 %	20 %	40 %	436833483
89	NC_020054	TTGCT	2	10	113597	113606	0 %	60 %	20 %	20 %	436833483
90	NC_020054	CCCCG	2	10	113936	113945	0 %	0 %	20 %	80 %	436833483
91	NC_020054	GCCAC	2	10	115123	115132	20 %	0 %	20 %	60 %	436833483
92	NC_020054	ATCGA	2	10	116539	116548	40 %	20 %	20 %	20 %	436833485
93	NC_020054	CCGAC	2	10	117324	117333	20 %	0 %	20 %	60 %	436833485
94	NC_020054	ACGGC	2	10	126409	126418	20 %	0 %	40 %	40 %	436833491
95	NC_020054	GTGTA	2	10	126609	126618	20 %	40 %	40 %	0 %	436833491
96	NC_020054	AACCG	2	10	127284	127293	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
97	NC_020054	CCCTG	2	10	128921	128930	0 %	20 %	20 %	60 %	436833493
98	NC_020054	CCGTT	2	10	130600	130609	0 %	40 %	20 %	40 %	436833496
99	NC_020054	CGACC	2	10	131487	131496	20 %	0 %	20 %	60 %	436833496
100	NC_020054	CGCCC	2	10	132940	132949	0 %	0 %	20 %	80 %	436833497
101	NC_020054	CCAGC	2	10	133960	133969	20 %	0 %	20 %	60 %	436833498
102	NC_020054	CCAGG	2	10	136446	136455	20 %	0 %	40 %	40 %	436833500
103	NC_020054	CAGGT	2	10	137224	137233	20 %	20 %	40 %	20 %	436833500
104	NC_020054	CTCAA	2	10	138182	138191	40 %	20 %	0 %	40 %	436833501
105	NC_020054	CCCGG	2	10	138469	138478	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
106	NC_020054	CGACC	2	10	138807	138816	20 %	0 %	20 %	60 %	436833502
107	NC_020054	ATGCC	2	10	139201	139210	20 %	20 %	20 %	40 %	436833502
108	NC_020054	CGGCC	2	10	139583	139592	0 %	0 %	40 %	60 %	436833502
109	NC_020054	GCCGT	2	10	144090	144099	0 %	20 %	40 %	40 %	436833506
110	NC_020054	CTTTT	2	10	147296	147305	0 %	80 %	0 %	20 %	436833509
111	NC_020054	GCAAT	2	10	147902	147911	40 %	20 %	20 %	20 %	436833510
112	NC_020054	TGCCC	2	10	150679	150688	0 %	20 %	20 %	60 %	436833512
113	NC_020054	CCGAA	2	10	151453	151462	40 %	0 %	20 %	40 %	436833512
114	NC_020054	TTCGT	2	10	154130	154139	0 %	60 %	20 %	20 %	436833513
115	NC_020054	ACCCG	2	10	154184	154193	20 %	0 %	20 %	60 %	436833513
116	NC_020054	GGTTC	2	10	156179	156188	0 %	40 %	40 %	20 %	436833515
117	NC_020054	ACCGC	2	10	156673	156682	20 %	0 %	20 %	60 %	436833515
118	NC_020054	CGGCG	2	10	156755	156764	0 %	0 %	60 %	40 %	436833515
119	NC_020054	CCGGC	2	10	158569	158578	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
120	NC_020054	GGTGC	2	10	158582	158591	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
121	NC_020054	CAGTT	2	10	158909	158918	20 %	40 %	20 %	20 %	436833517
122	NC_020054	ACGCC	2	10	159488	159497	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
123	NC_020054	ACCGA	2	10	159502	159511	40 %	0 %	20 %	40 %	436833518
124	NC_020054	TGATC	2	10	161102	161111	20 %	40 %	20 %	20 %	436833520
125	NC_020054	GGACG	2	10	161837	161846	20 %	0 %	60 %	20 %	436833520
126	NC_020054	TTCAG	2	10	165284	165293	20 %	40 %	20 %	20 %	436833523
127	NC_020054	TCTGG	2	10	168412	168421	0 %	40 %	40 %	20 %	436833525
128	NC_020054	ACAGG	2	10	170762	170771	40 %	0 %	40 %	20 %	436833526
129	NC_020054	GACCT	2	10	171168	171177	20 %	20 %	20 %	40 %	436833526
130	NC_020054	ACCCC	2	10	172011	172020	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
131	NC_020054	CCCCT	2	10	172024	172033	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
132	NC_020054	AGGGG	2	10	172040	172049	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
133	NC_020054	CCCCT	2	10	172174	172183	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
134	NC_020054	AGGGG	2	10	172190	172199	20 %	0 %	80 %	0 %	436833527
135	NC_020054	TGGGG	2	10	172201	172210	0 %	20 %	80 %	0 %	436833527
136	NC_020054	AAATC	2	10	173747	173756	60 %	20 %	0 %	20 %	436833529
137	NC_020054	CTCAC	2	10	174742	174751	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
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160	NC_020054	AGTCG	2	10	203205	203214	20 %	20 %	40 %	20 %	436833548
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174	NC_020054	GGGGC	2	10	218419	218428	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
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176	NC_020054	AGCCC	2	10	218665	218674	20 %	0 %	20 %	60 %	436833560
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181	NC_020054	CCCCG	2	10	229567	229576	0 %	0 %	20 %	80 %	436833570
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263	NC_020054	ACCTT	2	10	367009	367018	20 %	40 %	0 %	40 %	436833666
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267	NC_020054	GTGAA	2	10	373141	373150	40 %	20 %	40 %	0 %	436833669
268	NC_020054	ACAAT	2	10	374203	374212	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
269	NC_020054	TCAAT	2	10	378877	378886	40 %	40 %	0 %	20 %	436833673
270	NC_020054	CGTGG	2	10	378917	378926	0 %	20 %	60 %	20 %	436833673
271	NC_020054	GACAC	2	10	379331	379340	40 %	0 %	20 %	40 %	436833673
272	NC_020054	CGAAC	2	10	383730	383739	40 %	0 %	20 %	40 %	436833675
273	NC_020054	ATTAT	2	10	385974	385983	40 %	60 %	0 %	0 %	436833677
274	NC_020054	AATGA	2	10	386405	386414	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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279	NC_020054	GTTAG	2	10	394751	394760	20 %	40 %	40 %	0 %	436833685
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283	NC_020054	TATCG	2	10	397002	397011	20 %	40 %	20 %	20 %	436833686
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302	NC_020054	TCAAC	2	10	420654	420663	40 %	20 %	0 %	40 %	436833706
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382	NC_020054	GCAAA	2	10	542808	542817	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
383	NC_020054	GGCCA	2	10	547178	547187	20 %	0 %	40 %	40 %	436833813
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386	NC_020054	CTTAC	2	10	550078	550087	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
387	NC_020054	CGTTA	2	10	550358	550367	20 %	40 %	20 %	20 %	436833816
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398	NC_020054	GGTTT	2	10	563746	563755	0 %	60 %	40 %	0 %	436833824
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