MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Fibrella aestuarina BUZ 2 drat genome

Total Repeats: 4765

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_020054	TTTAC	2	10	1428190	1428199	20 %	60 %	0 %	20 %	436834536
1002	NC_020054	CATAT	2	10	1430820	1430829	40 %	40 %	0 %	20 %	436834537
1003	NC_020054	GCAAC	2	10	1431124	1431133	40 %	0 %	20 %	40 %	436834538
1004	NC_020054	GTGAA	2	10	1435542	1435551	40 %	20 %	40 %	0 %	436834541
1005	NC_020054	GCAAC	2	10	1435762	1435771	40 %	0 %	20 %	40 %	436834541
1006	NC_020054	CGGGC	2	10	1437099	1437108	0 %	0 %	60 %	40 %	436834541
1007	NC_020054	ACGAA	2	10	1437778	1437787	60 %	0 %	20 %	20 %	436834542
1008	NC_020054	GATCG	2	10	1438594	1438603	20 %	20 %	40 %	20 %	436834542
1009	NC_020054	GGCGA	2	10	1439579	1439588	20 %	0 %	60 %	20 %	436834543
1010	NC_020054	ACCCC	2	10	1442242	1442251	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
1011	NC_020054	CCCCT	2	10	1442255	1442264	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
1012	NC_020054	AGGGG	2	10	1442271	1442280	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_020054	CTCCC	2	10	1442325	1442334	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
1014	NC_020054	AGGGG	2	10	1442343	1442352	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
1015	NC_020054	CCAAA	2	10	1442612	1442621	60 %	0 %	0 %	40 %	436834544
1016	NC_020054	GTGGC	2	10	1443907	1443916	0 %	20 %	60 %	20 %	436834545
1017	NC_020054	AACGG	2	10	1444584	1444593	40 %	0 %	40 %	20 %	436834545
1018	NC_020054	CGGAT	2	10	1445134	1445143	20 %	20 %	40 %	20 %	436834546
1019	NC_020054	GCACC	2	10	1446748	1446757	20 %	0 %	20 %	60 %	436834547
1020	NC_020054	GCCCT	2	10	1447707	1447716	0 %	20 %	20 %	60 %	436834548
1021	NC_020054	GGCCC	2	10	1451145	1451154	0 %	0 %	40 %	60 %	436834552
1022	NC_020054	GTTGT	2	10	1452108	1452117	0 %	60 %	40 %	0 %	436834553
1023	NC_020054	GCAGG	2	10	1454146	1454155	20 %	0 %	60 %	20 %	436834556
1024	NC_020054	ACGTC	2	10	1454172	1454181	20 %	20 %	20 %	40 %	436834556
1025	NC_020054	CTTTG	2	10	1454413	1454422	0 %	60 %	20 %	20 %	436834556
1026	NC_020054	CGTAG	2	10	1463155	1463164	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
1027	NC_020054	GAAAA	2	10	1463830	1463839	80 %	0 %	20 %	0 %	436834563
1028	NC_020054	AAAGC	2	10	1466560	1466569	60 %	0 %	20 %	20 %	436834568
1029	NC_020054	TGTTC	2	10	1470593	1470602	0 %	60 %	20 %	20 %	436834572
1030	NC_020054	ATCAA	2	10	1471546	1471555	60 %	20 %	0 %	20 %	436834573
1031	NC_020054	AACGG	2	10	1474389	1474398	40 %	0 %	40 %	20 %	436834574
1032	NC_020054	CCGGC	2	10	1476171	1476180	0 %	0 %	40 %	60 %	436834575
1033	NC_020054	CCAAA	2	10	1476293	1476302	60 %	0 %	0 %	40 %	436834575
1034	NC_020054	CCGAA	2	10	1477954	1477963	40 %	0 %	20 %	40 %	436834578
1035	NC_020054	GGGCG	2	10	1479517	1479526	0 %	0 %	80 %	20 %	436834579
1036	NC_020054	GGGCG	2	10	1479736	1479745	0 %	0 %	80 %	20 %	436834579
1037	NC_020054	GGCTG	2	10	1479749	1479758	0 %	20 %	60 %	20 %	436834579
1038	NC_020054	GGTTG	2	10	1479934	1479943	0 %	40 %	60 %	0 %	436834579
1039	NC_020054	GGGGC	2	10	1480331	1480340	0 %	0 %	80 %	20 %	436834579
1040	NC_020054	ATTAC	2	10	1483385	1483394	40 %	40 %	0 %	20 %	436834582
1041	NC_020054	CCGGG	2	10	1483734	1483743	0 %	0 %	60 %	40 %	436834582
1042	NC_020054	GAATC	2	10	1484981	1484990	40 %	20 %	20 %	20 %	436834583
1043	NC_020054	CTGCT	2	10	1486819	1486828	0 %	40 %	20 %	40 %	436834584
1044	NC_020054	CCCCT	2	10	1488811	1488820	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
1045	NC_020054	AGGGG	2	10	1488827	1488836	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
1046	NC_020054	CCCCT	2	10	1488951	1488960	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
1047	NC_020054	GCCGG	2	10	1488972	1488981	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1048	NC_020054	CGGGC	2	10	1489899	1489908	0 %	0 %	60 %	40 %	436834586
1049	NC_020054	TCGAT	2	10	1490289	1490298	20 %	40 %	20 %	20 %	436834586
1050	NC_020054	TTCGC	2	10	1491157	1491166	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1051	NC_020054	CGGCC	2	10	1492625	1492634	0 %	0 %	40 %	60 %	436834588
1052	NC_020054	CCAAG	2	10	1493775	1493784	40 %	0 %	20 %	40 %	436834589
1053	NC_020054	AACGT	2	10	1500308	1500317	40 %	20 %	20 %	20 %	436834593
1054	NC_020054	CCGAC	2	10	1502250	1502259	20 %	0 %	20 %	60 %	436834595
1055	NC_020054	CAATA	2	10	1502384	1502393	60 %	20 %	0 %	20 %	436834595
1056	NC_020054	CAACT	2	10	1502513	1502522	40 %	20 %	0 %	40 %	436834595
1057	NC_020054	TTGGC	2	10	1505084	1505093	0 %	40 %	40 %	20 %	436834598
1058	NC_020054	CGCAG	2	10	1505841	1505850	20 %	0 %	40 %	40 %	436834599
1059	NC_020054	CCAAC	2	10	1505914	1505923	40 %	0 %	0 %	60 %	436834599
1060	NC_020054	CTGAA	2	10	1507326	1507335	40 %	20 %	20 %	20 %	436834600
1061	NC_020054	GCTCT	2	10	1507924	1507933	0 %	40 %	20 %	40 %	436834601
1062	NC_020054	GTCAG	2	10	1508138	1508147	20 %	20 %	40 %	20 %	436834601
1063	NC_020054	TGCTT	2	10	1508652	1508661	0 %	60 %	20 %	20 %	436834602
1064	NC_020054	GTCAG	2	10	1508813	1508822	20 %	20 %	40 %	20 %	436834602
1065	NC_020054	CGTTG	2	10	1509205	1509214	0 %	40 %	40 %	20 %	436834602
1066	NC_020054	ACCAG	2	10	1509342	1509351	40 %	0 %	20 %	40 %	436834602
1067	NC_020054	TTGAA	2	10	1511410	1511419	40 %	40 %	20 %	0 %	436834603
1068	NC_020054	CCCAT	2	10	1514438	1514447	20 %	20 %	0 %	60 %	436834605
1069	NC_020054	TGCTT	2	10	1518028	1518037	0 %	60 %	20 %	20 %	436834609
1070	NC_020054	CTGGT	2	10	1519020	1519029	0 %	40 %	40 %	20 %	436834610
1071	NC_020054	GCCCA	2	10	1519424	1519433	20 %	0 %	20 %	60 %	436834611
1072	NC_020054	CAGGC	2	10	1522607	1522616	20 %	0 %	40 %	40 %	436834613
1073	NC_020054	CTGAT	2	10	1523641	1523650	20 %	40 %	20 %	20 %	436834614
1074	NC_020054	GCACA	2	10	1525878	1525887	40 %	0 %	20 %	40 %	436834615
1075	NC_020054	CGCGG	2	10	1528990	1528999	0 %	0 %	60 %	40 %	436834618
1076	NC_020054	TCGCC	2	10	1529665	1529674	0 %	20 %	20 %	60 %	436834619
1077	NC_020054	AGCCC	2	10	1530283	1530292	20 %	0 %	20 %	60 %	436834619
1078	NC_020054	CAGAA	2	10	1531513	1531522	60 %	0 %	20 %	20 %	436834621
1079	NC_020054	CACAA	2	10	1533730	1533739	60 %	0 %	0 %	40 %	436834623
1080	NC_020054	GGCAA	2	10	1534198	1534207	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
1081	NC_020054	AACCC	2	10	1535496	1535505	40 %	0 %	0 %	60 %	436834624
1082	NC_020054	TGGCC	2	10	1536203	1536212	0 %	20 %	40 %	40 %	436834624
1083	NC_020054	GTTAT	2	10	1536663	1536672	20 %	60 %	20 %	0 %	436834624
1084	NC_020054	AGCGG	2	10	1543369	1543378	20 %	0 %	60 %	20 %	436834630
1085	NC_020054	CTTCG	2	10	1543539	1543548	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
1086	NC_020054	CCTGA	2	10	1548491	1548500	20 %	20 %	20 %	40 %	436834634
1087	NC_020054	CCAGC	2	10	1548711	1548720	20 %	0 %	20 %	60 %	436834634
1088	NC_020054	CGTTC	2	10	1549069	1549078	0 %	40 %	20 %	40 %	436834634
1089	NC_020054	CAGCG	2	10	1551649	1551658	20 %	0 %	40 %	40 %	436834635
1090	NC_020054	TGTGC	2	10	1554461	1554470	0 %	40 %	40 %	20 %	436834638
1091	NC_020054	GTCGG	2	10	1557611	1557620	0 %	20 %	60 %	20 %	436834642
1092	NC_020054	AACGT	2	10	1558580	1558589	40 %	20 %	20 %	20 %	436834643
1093	NC_020054	GGCGG	2	10	1559339	1559348	0 %	0 %	80 %	20 %	436834643
1094	NC_020054	CAGCG	2	10	1561448	1561457	20 %	0 %	40 %	40 %	436834645
1095	NC_020054	AGCGC	2	10	1561949	1561958	20 %	0 %	40 %	40 %	436834645
1096	NC_020054	CTCAA	2	10	1562170	1562179	40 %	20 %	0 %	40 %	436834645
1097	NC_020054	GAGCC	2	10	1564883	1564892	20 %	0 %	40 %	40 %	436834647
1098	NC_020054	TTGGT	2	10	1564952	1564961	0 %	60 %	40 %	0 %	436834647
1099	NC_020054	TTGAC	2	10	1568286	1568295	20 %	40 %	20 %	20 %	436834651
1100	NC_020054	CCGAA	2	10	1569084	1569093	40 %	0 %	20 %	40 %	436834652
1101	NC_020054	TGGCG	2	10	1575571	1575580	0 %	20 %	60 %	20 %	436834657
1102	NC_020054	GCGGA	2	10	1579493	1579502	20 %	0 %	60 %	20 %	436834664
1103	NC_020054	TCCAC	2	10	1579594	1579603	20 %	20 %	0 %	60 %	436834664
1104	NC_020054	TCGGT	2	10	1584912	1584921	0 %	40 %	40 %	20 %	436834667
1105	NC_020054	TTTGT	2	10	1587108	1587117	0 %	80 %	20 %	0 %	436834668
1106	NC_020054	AAACC	2	10	1588009	1588018	60 %	0 %	0 %	40 %	436834669
1107	NC_020054	CCAGG	2	10	1588519	1588528	20 %	0 %	40 %	40 %	436834670
1108	NC_020054	ACGAA	2	10	1588607	1588616	60 %	0 %	20 %	20 %	436834670
1109	NC_020054	GCGCG	2	10	1593059	1593068	0 %	0 %	60 %	40 %	436834673
1110	NC_020054	GGTTG	2	10	1594185	1594194	0 %	40 %	60 %	0 %	436834673
1111	NC_020054	TAGTC	2	10	1594451	1594460	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
1112	NC_020054	ACATC	2	10	1594790	1594799	40 %	20 %	0 %	40 %	436834674
1113	NC_020054	TCACT	2	10	1594940	1594949	20 %	40 %	0 %	40 %	436834674
1114	NC_020054	TGCGC	2	10	1597395	1597404	0 %	20 %	40 %	40 %	436834677
1115	NC_020054	CAGGC	2	10	1598189	1598198	20 %	0 %	40 %	40 %	436834677
1116	NC_020054	CCCCG	2	10	1598919	1598928	0 %	0 %	20 %	80 %	436834677
1117	NC_020054	ACGTC	2	10	1601801	1601810	20 %	20 %	20 %	40 %	436834680
1118	NC_020054	AAATC	2	10	1602041	1602050	60 %	20 %	0 %	20 %	436834680
1119	NC_020054	CAAAG	2	10	1603378	1603387	60 %	0 %	20 %	20 %	436834681
1120	NC_020054	AAGGC	2	10	1605844	1605853	40 %	0 %	40 %	20 %	436834684
1121	NC_020054	TGGGT	2	10	1605882	1605891	0 %	40 %	60 %	0 %	436834684
1122	NC_020054	TGATC	2	10	1610479	1610488	20 %	40 %	20 %	20 %	436834688
1123	NC_020054	CAAAA	2	10	1613242	1613251	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
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1125	NC_020054	GGTCG	2	10	1614307	1614316	0 %	20 %	60 %	20 %	436834691
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1289	NC_020054	AGGGG	2	10	1854524	1854533	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
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1295	NC_020054	TGAGA	2	10	1866003	1866012	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
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1322	NC_020054	CGGGA	2	10	1899032	1899041	20 %	0 %	60 %	20 %	436834915
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1370	NC_020054	CCAGC	2	10	1967534	1967543	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
1371	NC_020054	TAAAG	2	10	1968468	1968477	60 %	20 %	20 %	0 %	436834968
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