MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Fibrella aestuarina BUZ 2 drat genome

Total Repeats: 4765

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_020054	GTTCG	2	10	714891	714900	0 %	40 %	40 %	20 %	436833954
502	NC_020054	TGAAA	2	10	715598	715607	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
503	NC_020054	TGCCC	2	10	717761	717770	0 %	20 %	20 %	60 %	436833958
504	NC_020054	AGCGC	2	10	719318	719327	20 %	0 %	40 %	40 %	436833958
505	NC_020054	AAATG	2	10	720630	720639	60 %	20 %	20 %	0 %	436833959
506	NC_020054	CGGGC	2	10	724798	724807	0 %	0 %	60 %	40 %	436833962
507	NC_020054	TCGGT	2	10	727019	727028	0 %	40 %	40 %	20 %	436833964
508	NC_020054	TCGGT	2	10	727802	727811	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
509	NC_020054	CCATC	2	10	728442	728451	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
510	NC_020054	GTGCG	2	10	729351	729360	0 %	20 %	60 %	20 %	436833967
511	NC_020054	ACAAA	2	10	735531	735540	80 %	0 %	0 %	20 %	436833973
512	NC_020054	TACCT	2	10	735664	735673	20 %	40 %	0 %	40 %	436833974
513	NC_020054	CCAGG	2	10	737930	737939	20 %	0 %	40 %	40 %	436833976
514	NC_020054	AAGCT	2	10	738018	738027	40 %	20 %	20 %	20 %	436833976
515	NC_020054	GCCCG	2	10	738438	738447	0 %	0 %	40 %	60 %	436833976
516	NC_020054	TCGAC	2	10	740764	740773	20 %	20 %	20 %	40 %	436833978
517	NC_020054	CGGCC	2	10	741942	741951	0 %	0 %	40 %	60 %	436833979
518	NC_020054	AACGA	2	10	745151	745160	60 %	0 %	20 %	20 %	436833982
519	NC_020054	TCAAC	2	10	745702	745711	40 %	20 %	0 %	40 %	436833982
520	NC_020054	GGCTG	2	10	746076	746085	0 %	20 %	60 %	20 %	436833982
521	NC_020054	CCATA	2	10	746570	746579	40 %	20 %	0 %	40 %	436833983
522	NC_020054	GTCGG	2	10	746822	746831	0 %	20 %	60 %	20 %	436833983
523	NC_020054	GCCGC	2	10	748168	748177	0 %	0 %	40 %	60 %	436833983
524	NC_020054	GGGTC	2	10	748400	748409	0 %	20 %	60 %	20 %	436833983
525	NC_020054	TGGGC	2	10	749153	749162	0 %	20 %	60 %	20 %	436833983
526	NC_020054	TGGTC	2	10	749468	749477	0 %	40 %	40 %	20 %	436833983
527	NC_020054	CGGTA	2	10	750423	750432	20 %	20 %	40 %	20 %	436833983
528	NC_020054	TCTGA	2	10	750589	750598	20 %	40 %	20 %	20 %	436833983
529	NC_020054	CCTGG	2	10	751297	751306	0 %	20 %	40 %	40 %	436833984
530	NC_020054	CTGGC	2	10	754111	754120	0 %	20 %	40 %	40 %	436833988
531	NC_020054	ACTTC	2	10	756276	756285	20 %	40 %	0 %	40 %	436833989
532	NC_020054	CGAAT	2	10	762683	762692	40 %	20 %	20 %	20 %	436833997
533	NC_020054	GGCCG	2	10	764324	764333	0 %	0 %	60 %	40 %	436833998
534	NC_020054	GCTGC	2	10	764382	764391	0 %	20 %	40 %	40 %	436833998
535	NC_020054	CGGGG	2	10	764633	764642	0 %	0 %	80 %	20 %	436833998
536	NC_020054	GAAAC	2	10	765319	765328	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
537	NC_020054	GCCGT	2	10	766475	766484	0 %	20 %	40 %	40 %	436834001
538	NC_020054	CGTTG	2	10	766660	766669	0 %	40 %	40 %	20 %	436834001
539	NC_020054	TGGCG	2	10	769895	769904	0 %	20 %	60 %	20 %	436834003
540	NC_020054	GCTCA	2	10	771823	771832	20 %	20 %	20 %	40 %	436834005
541	NC_020054	GATTG	2	10	772361	772370	20 %	40 %	40 %	0 %	436834005
542	NC_020054	GGGGT	2	10	777121	777130	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
543	NC_020054	GACCT	2	10	777320	777329	20 %	20 %	20 %	40 %	436834009
544	NC_020054	CACAT	2	10	777590	777599	40 %	20 %	0 %	40 %	436834009
545	NC_020054	TTGTA	2	10	779156	779165	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
546	NC_020054	GTTGA	2	10	781489	781498	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
547	NC_020054	CGGCG	2	10	783241	783250	0 %	0 %	60 %	40 %	436834012
548	NC_020054	TTTCG	2	10	784195	784204	0 %	60 %	20 %	20 %	436834012
549	NC_020054	CGCGC	2	10	785818	785827	0 %	0 %	40 %	60 %	436834012
550	NC_020054	GGGCA	2	10	788852	788861	20 %	0 %	60 %	20 %	436834014
551	NC_020054	TGCTC	2	10	789106	789115	0 %	40 %	20 %	40 %	436834015
552	NC_020054	GGGGC	2	10	789410	789419	0 %	0 %	80 %	20 %	436834015
553	NC_020054	ATTTC	2	10	791687	791696	20 %	60 %	0 %	20 %	436834016
554	NC_020054	TCGTG	2	10	794926	794935	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
555	NC_020054	GGGCA	2	10	795950	795959	20 %	0 %	60 %	20 %	436834018
556	NC_020054	CAACG	2	10	796378	796387	40 %	0 %	20 %	40 %	436834018
557	NC_020054	GGGAC	2	10	799692	799701	20 %	0 %	60 %	20 %	436834020
558	NC_020054	GATCT	2	10	800550	800559	20 %	40 %	20 %	20 %	436834021
559	NC_020054	ATGCC	2	10	801742	801751	20 %	20 %	20 %	40 %	436834021
560	NC_020054	GCCCG	2	10	801769	801778	0 %	0 %	40 %	60 %	436834021
561	NC_020054	CCCCG	2	10	803146	803155	0 %	0 %	20 %	80 %	436834022
562	NC_020054	GCCCG	2	10	804262	804271	0 %	0 %	40 %	60 %	436834023
563	NC_020054	GTAGG	2	10	804417	804426	20 %	20 %	60 %	0 %	436834023
564	NC_020054	GGTGG	2	10	806310	806319	0 %	20 %	80 %	0 %	436834025
565	NC_020054	GTTCG	2	10	807604	807613	0 %	40 %	40 %	20 %	436834025
566	NC_020054	GATCA	2	10	808401	808410	40 %	20 %	20 %	20 %	436834025
567	NC_020054	GGCTA	2	10	813637	813646	20 %	20 %	40 %	20 %	436834031
568	NC_020054	TGACG	2	10	814318	814327	20 %	20 %	40 %	20 %	436834031
569	NC_020054	ACCGA	2	10	814992	815001	40 %	0 %	20 %	40 %	436834031
570	NC_020054	GGCGG	2	10	815941	815950	0 %	0 %	80 %	20 %	436834031
571	NC_020054	AATAA	2	10	816161	816170	80 %	20 %	0 %	0 %	436834031
572	NC_020054	CCGTA	2	10	820836	820845	20 %	20 %	20 %	40 %	436834037
573	NC_020054	AAAAG	2	10	821120	821129	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
574	NC_020054	CGGCC	2	10	823486	823495	0 %	0 %	40 %	60 %	436834040
575	NC_020054	GACCT	2	10	828235	828244	20 %	20 %	20 %	40 %	436834042
576	NC_020054	CGAAC	2	10	828884	828893	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
577	NC_020054	CGCAA	2	10	830132	830141	40 %	0 %	20 %	40 %	436834044
578	NC_020054	GCCGC	2	10	831736	831745	0 %	0 %	40 %	60 %	436834046
579	NC_020054	TCGCC	2	10	833025	833034	0 %	20 %	20 %	60 %	436834047
580	NC_020054	CCGAT	2	10	833744	833753	20 %	20 %	20 %	40 %	436834048
581	NC_020054	GCCCC	2	10	834865	834874	0 %	0 %	20 %	80 %	436834049
582	NC_020054	TGAGT	2	10	836366	836375	20 %	40 %	40 %	0 %	436834051
583	NC_020054	GCCGC	2	10	836876	836885	0 %	0 %	40 %	60 %	436834051
584	NC_020054	GGTTA	2	10	837311	837320	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
585	NC_020054	GCGGG	2	10	840925	840934	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
586	NC_020054	TCCGC	2	10	843093	843102	0 %	20 %	20 %	60 %	436834057
587	NC_020054	CTGGG	2	10	843491	843500	0 %	20 %	60 %	20 %	436834058
588	NC_020054	GCCCA	2	10	844210	844219	20 %	0 %	20 %	60 %	436834058
589	NC_020054	GCTGA	2	10	844835	844844	20 %	20 %	40 %	20 %	436834059
590	NC_020054	TTCGA	2	10	845681	845690	20 %	40 %	20 %	20 %	436834061
591	NC_020054	GCGAC	2	10	845721	845730	20 %	0 %	40 %	40 %	436834061
592	NC_020054	GACCG	2	10	847236	847245	20 %	0 %	40 %	40 %	436834062
593	NC_020054	GCAGG	2	10	848788	848797	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
594	NC_020054	AGGTC	2	10	848913	848922	20 %	20 %	40 %	20 %	436834063
595	NC_020054	GTTGA	2	10	848992	849001	20 %	40 %	40 %	0 %	436834063
596	NC_020054	AAAAC	2	10	849857	849866	80 %	0 %	0 %	20 %	436834064
597	NC_020054	CTGAA	2	10	850768	850777	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
598	NC_020054	CGGGG	2	10	852238	852247	0 %	0 %	80 %	20 %	436834068
599	NC_020054	CGCGG	2	10	852636	852645	0 %	0 %	60 %	40 %	436834068
600	NC_020054	GACGT	2	10	853551	853560	20 %	20 %	40 %	20 %	436834069
601	NC_020054	CACCC	2	10	854522	854531	20 %	0 %	0 %	80 %	436834070
602	NC_020054	AAAGC	2	10	855569	855578	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
603	NC_020054	ACCGC	2	10	857274	857283	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
604	NC_020054	CGGGG	2	10	858073	858082	0 %	0 %	80 %	20 %	436834073
605	NC_020054	GCGGG	2	10	859525	859534	0 %	0 %	80 %	20 %	436834075
606	NC_020054	CAGCA	2	10	859596	859605	40 %	0 %	20 %	40 %	436834075
607	NC_020054	CGGTC	2	10	860582	860591	0 %	20 %	40 %	40 %	436834075
608	NC_020054	GAACC	2	10	861097	861106	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
609	NC_020054	AGCGG	2	10	861151	861160	20 %	0 %	60 %	20 %	436834076
610	NC_020054	ACCCA	2	10	865760	865769	40 %	0 %	0 %	60 %	436834078
611	NC_020054	GCAAA	2	10	868292	868301	60 %	0 %	20 %	20 %	436834079
612	NC_020054	GGCAG	2	10	869801	869810	20 %	0 %	60 %	20 %	436834079
613	NC_020054	CTGGG	2	10	874093	874102	0 %	20 %	60 %	20 %	436834085
614	NC_020054	CGGCA	2	10	876349	876358	20 %	0 %	40 %	40 %	436834087
615	NC_020054	GCCCG	2	10	876784	876793	0 %	0 %	40 %	60 %	436834088
616	NC_020054	GACCT	2	10	877326	877335	20 %	20 %	20 %	40 %	436834088
617	NC_020054	CGTTG	2	10	880601	880610	0 %	40 %	40 %	20 %	436834088
618	NC_020054	CGCTT	2	10	881183	881192	0 %	40 %	20 %	40 %	436834088
619	NC_020054	GGTCA	2	10	881462	881471	20 %	20 %	40 %	20 %	436834088
620	NC_020054	AGCAG	2	10	884110	884119	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
621	NC_020054	CCAGG	2	10	885385	885394	20 %	0 %	40 %	40 %	436834091
622	NC_020054	TCGAG	2	10	887196	887205	20 %	20 %	40 %	20 %	436834092
623	NC_020054	TGTAT	2	10	889656	889665	20 %	60 %	20 %	0 %	436834094
624	NC_020054	CGAGA	2	10	891370	891379	40 %	0 %	40 %	20 %	436834094
625	NC_020054	CGATC	2	10	891996	892005	20 %	20 %	20 %	40 %	436834094
626	NC_020054	CGGGG	2	10	892334	892343	0 %	0 %	80 %	20 %	436834094
627	NC_020054	GCGAA	2	10	893829	893838	40 %	0 %	40 %	20 %	436834094
628	NC_020054	GGCAC	2	10	895204	895213	20 %	0 %	40 %	40 %	436834094
629	NC_020054	CCCGG	2	10	898052	898061	0 %	0 %	40 %	60 %	436834099
630	NC_020054	ACGTC	2	10	898596	898605	20 %	20 %	20 %	40 %	436834100
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632	NC_020054	GGGGC	2	10	904319	904328	0 %	0 %	80 %	20 %	436834105
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997	NC_020054	AGAAA	2	10	1426601	1426610	80 %	0 %	20 %	0 %	436834534
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999	NC_020054	GGTTG	2	10	1427521	1427530	0 %	40 %	60 %	0 %	436834535
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