MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 4551

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_013205	GCC	2	6	2664354	2664359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4002	NC_013205	CCA	2	6	2664561	2664566	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4003	NC_013205	CTT	2	6	2664754	2664759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4004	NC_013205	GCC	2	6	2664800	2664805	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4005	NC_013205	GTC	2	6	2664868	2664873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4006	NC_013205	CCA	2	6	2664893	2664898	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4007	NC_013205	ACC	2	6	2665008	2665013	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4008	NC_013205	GGT	2	6	2665021	2665026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4009	NC_013205	TCG	2	6	2665159	2665164	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4010	NC_013205	CGG	2	6	2665262	2665267	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4011	NC_013205	CCA	2	6	2665285	2665290	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4012	NC_013205	TCA	2	6	2665503	2665508	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4013	NC_013205	CTT	2	6	2665513	2665518	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4014	NC_013205	GTC	2	6	2665530	2665535	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4015	NC_013205	GGA	2	6	2665567	2665572	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4016	NC_013205	CGC	2	6	2665960	2665965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4017	NC_013205	GCG	2	6	2665969	2665974	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4018	NC_013205	CGG	2	6	2665975	2665980	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4019	NC_013205	CTC	2	6	2666872	2666877	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4020	NC_013205	GCG	2	6	2668582	2668587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4021	NC_013205	GCC	2	6	2670469	2670474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4022	NC_013205	AGG	2	6	2670582	2670587	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4023	NC_013205	ACC	2	6	2670814	2670819	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4024	NC_013205	GCG	2	6	2670829	2670834	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4025	NC_013205	GTG	2	6	2670847	2670852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4026	NC_013205	CAG	2	6	2670856	2670861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4027	NC_013205	GCA	2	6	2670872	2670877	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4028	NC_013205	GCC	2	6	2670883	2670888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4029	NC_013205	CTT	2	6	2670915	2670920	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4030	NC_013205	ACA	2	6	2673968	2673973	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4031	NC_013205	ACC	2	6	2673991	2673996	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4032	NC_013205	TCG	2	6	2674194	2674199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4033	NC_013205	GCG	2	6	2675309	2675314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4034	NC_013205	CCT	2	6	2676053	2676058	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4035	NC_013205	GCC	2	6	2676078	2676083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4036	NC_013205	GGA	2	6	2676890	2676895	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4037	NC_013205	CGC	2	6	2677423	2677428	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4038	NC_013205	CGG	2	6	2680707	2680712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4039	NC_013205	CGC	2	6	2682580	2682585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4040	NC_013205	CCG	2	6	2682606	2682611	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4041	NC_013205	GGA	2	6	2682618	2682623	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4042	NC_013205	GAA	2	6	2682635	2682640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4043	NC_013205	CGC	2	6	2688565	2688570	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4044	NC_013205	TAC	2	6	2688582	2688587	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4045	NC_013205	CAA	2	6	2688590	2688595	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4046	NC_013205	CGG	2	6	2688703	2688708	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4047	NC_013205	CGG	2	6	2688803	2688808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4048	NC_013205	CTT	2	6	2689286	2689291	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4049	NC_013205	CTC	2	6	2689350	2689355	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4050	NC_013205	TCA	2	6	2692941	2692946	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4051	NC_013205	CGA	2	6	2692958	2692963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4052	NC_013205	GCC	2	6	2693518	2693523	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4053	NC_013205	CTT	2	6	2694598	2694603	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4054	NC_013205	CGG	2	6	2694730	2694735	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4055	NC_013205	GAT	2	6	2696149	2696154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4056	NC_013205	CCT	2	6	2701097	2701102	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4057	NC_013205	AGA	2	6	2701180	2701185	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4058	NC_013205	GTC	2	6	2701200	2701205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4059	NC_013205	GAG	2	6	2701223	2701228	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4060	NC_013205	CCT	2	6	2701499	2701504	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4061	NC_013205	TGA	2	6	2701506	2701511	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4062	NC_013205	GAG	2	6	2701673	2701678	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4063	NC_013205	AGC	2	6	2703351	2703356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4064	NC_013205	GAT	2	6	2703363	2703368	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_013205	AGG	2	6	2703374	2703379	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_013205	GGT	2	6	2705980	2705985	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4067	NC_013205	CCT	2	6	2709924	2709929	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4068	NC_013205	TCA	2	6	2709934	2709939	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4069	NC_013205	CGC	2	6	2709948	2709953	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4070	NC_013205	GAG	2	6	2710101	2710106	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4071	NC_013205	ACG	2	6	2712899	2712904	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4072	NC_013205	AAG	2	6	2712908	2712913	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4073	NC_013205	TCC	2	6	2713204	2713209	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4074	NC_013205	TAC	2	6	2713235	2713240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4075	NC_013205	GCC	2	6	2713251	2713256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4076	NC_013205	ACC	2	6	2714718	2714723	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4077	NC_013205	TCC	2	6	2714724	2714729	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4078	NC_013205	GGA	2	6	2714743	2714748	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4079	NC_013205	GGC	2	6	2714752	2714757	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4080	NC_013205	ACG	2	6	2714768	2714773	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4081	NC_013205	CGG	2	6	2716481	2716486	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4082	NC_013205	CCA	2	6	2716610	2716615	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4083	NC_013205	CGA	2	6	2716636	2716641	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4084	NC_013205	GAG	2	6	2716728	2716733	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4085	NC_013205	GGC	2	6	2717837	2717842	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4086	NC_013205	GCC	2	6	2717852	2717857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4087	NC_013205	CCT	2	6	2720514	2720519	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4088	NC_013205	CGT	2	6	2720569	2720574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4089	NC_013205	GCC	2	6	2720626	2720631	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4090	NC_013205	GCG	2	6	2720639	2720644	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4091	NC_013205	CGG	2	6	2720652	2720657	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4092	NC_013205	TCC	2	6	2721080	2721085	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4093	NC_013205	TGA	2	6	2721102	2721107	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4094	NC_013205	CCT	2	6	2721448	2721453	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4095	NC_013205	CCG	2	6	2721477	2721482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4096	NC_013205	CGA	2	6	2721490	2721495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4097	NC_013205	CGA	2	6	2721571	2721576	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4098	NC_013205	ATC	2	6	2721594	2721599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4099	NC_013205	AAG	2	6	2721608	2721613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4100	NC_013205	GAT	2	6	2722433	2722438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4101	NC_013205	GAG	2	6	2722473	2722478	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_013205	CTT	2	6	2730063	2730068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4103	NC_013205	CAT	2	6	2730112	2730117	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4104	NC_013205	CTC	2	6	2730143	2730148	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4105	NC_013205	GTC	2	6	2730373	2730378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4106	NC_013205	GTT	2	6	2730453	2730458	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_013205	ACG	2	6	2730592	2730597	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4108	NC_013205	AGC	2	6	2730801	2730806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4109	NC_013205	CTC	2	6	2732871	2732876	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4110	NC_013205	TCT	2	6	2732889	2732894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4111	NC_013205	GTG	2	6	2732996	2733001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4112	NC_013205	CAC	2	6	2733103	2733108	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4113	NC_013205	ATG	2	6	2733136	2733141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4114	NC_013205	TGG	2	6	2733151	2733156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_013205	GTT	2	6	2733235	2733240	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4116	NC_013205	CCG	2	6	2733241	2733246	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4117	NC_013205	TCG	2	6	2733250	2733255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4118	NC_013205	TGT	2	6	2733307	2733312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4119	NC_013205	CCG	2	6	2733314	2733319	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4120	NC_013205	TCG	2	6	2733323	2733328	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4121	NC_013205	GTT	2	6	2733380	2733385	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4122	NC_013205	CCG	2	6	2733386	2733391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4123	NC_013205	TCG	2	6	2733395	2733400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4124	NC_013205	GTT	2	6	2733451	2733456	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4125	NC_013205	CCG	2	6	2733457	2733462	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4126	NC_013205	TCG	2	6	2733466	2733471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4127	NC_013205	ATC	2	6	2733490	2733495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4128	NC_013205	ATC	2	6	2733514	2733519	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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4131	NC_013205	GGC	2	6	2733543	2733548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4132	NC_013205	CCG	2	6	2733562	2733567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4251	NC_013205	GCG	3	9	2819052	2819060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4252	NC_013205	GCC	2	6	2820368	2820373	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4254	NC_013205	CCT	2	6	2822313	2822318	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4255	NC_013205	CAC	2	6	2823210	2823215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4256	NC_013205	TCC	2	6	2826170	2826175	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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4259	NC_013205	CCA	2	6	2827736	2827741	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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