MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 4551

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_013205	AGA	2	6	231208	231213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
502	NC_013205	CTT	2	6	231843	231848	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
503	NC_013205	AGC	2	6	232821	232826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
504	NC_013205	ATG	2	6	232861	232866	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
505	NC_013205	CCG	2	6	235213	235218	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
506	NC_013205	TAC	2	6	235227	235232	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
507	NC_013205	GGA	2	6	235297	235302	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
508	NC_013205	CGA	2	6	238646	238651	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
509	NC_013205	GGC	2	6	239658	239663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
510	NC_013205	AGG	2	6	239772	239777	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
511	NC_013205	AGG	2	6	244872	244877	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
512	NC_013205	TCA	2	6	247013	247018	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
513	NC_013205	GAG	2	6	247088	247093	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
514	NC_013205	GAG	2	6	247177	247182	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
515	NC_013205	TTG	2	6	248629	248634	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
516	NC_013205	GCG	2	6	250269	250274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
517	NC_013205	CCT	2	6	250323	250328	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
518	NC_013205	GAG	2	6	250354	250359	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
519	NC_013205	TCT	2	6	255235	255240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
520	NC_013205	TCG	2	6	255893	255898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
521	NC_013205	GCG	2	6	255927	255932	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
522	NC_013205	TCG	2	6	255938	255943	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
523	NC_013205	GAG	2	6	258971	258976	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
524	NC_013205	AGG	2	6	258981	258986	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
525	NC_013205	CAC	2	6	259040	259045	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
526	NC_013205	TGA	2	6	259664	259669	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
527	NC_013205	TGT	2	6	260098	260103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
528	NC_013205	TGG	2	6	260136	260141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
529	NC_013205	GAG	2	6	260153	260158	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
530	NC_013205	GCC	2	6	260239	260244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
531	NC_013205	GCG	2	6	260344	260349	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
532	NC_013205	TCG	2	6	260480	260485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
533	NC_013205	TGA	2	6	260486	260491	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
534	NC_013205	GCG	2	6	260570	260575	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
535	NC_013205	GAT	2	6	260594	260599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
536	NC_013205	CAG	2	6	260600	260605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
537	NC_013205	TCG	2	6	260608	260613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
538	NC_013205	GTG	2	6	260634	260639	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
539	NC_013205	GGA	2	6	260652	260657	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
540	NC_013205	CTG	3	9	264826	264834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
541	NC_013205	ACG	2	6	264947	264952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
542	NC_013205	ACC	2	6	266816	266821	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
543	NC_013205	ATC	2	6	268563	268568	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
544	NC_013205	TCG	2	6	268570	268575	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
545	NC_013205	GGC	2	6	268659	268664	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
546	NC_013205	CAT	2	6	268693	268698	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
547	NC_013205	CCG	2	6	268709	268714	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
548	NC_013205	GCC	2	6	268795	268800	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
549	NC_013205	TCC	2	6	268875	268880	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
550	NC_013205	TTG	2	6	270564	270569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
551	NC_013205	GCG	2	6	270594	270599	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
552	NC_013205	GCC	2	6	270621	270626	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
553	NC_013205	GCG	2	6	270844	270849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
554	NC_013205	CAA	2	6	270853	270858	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
555	NC_013205	AGC	2	6	270873	270878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
556	NC_013205	GTT	2	6	270881	270886	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
557	NC_013205	GCC	2	6	270888	270893	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
558	NC_013205	CGA	2	6	273256	273261	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
559	NC_013205	CGG	2	6	273302	273307	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
560	NC_013205	GTT	2	6	273372	273377	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
561	NC_013205	GGA	2	6	273380	273385	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
562	NC_013205	GCG	2	6	280269	280274	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
563	NC_013205	GGA	2	6	280291	280296	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
564	NC_013205	TCC	2	6	280928	280933	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
565	NC_013205	GAG	2	6	283417	283422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
566	NC_013205	GTT	2	6	284762	284767	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
567	NC_013205	CGC	2	6	284865	284870	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
568	NC_013205	GTA	2	6	284930	284935	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
569	NC_013205	CTT	2	6	286099	286104	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
570	NC_013205	GAG	2	6	286110	286115	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
571	NC_013205	TTG	2	6	288174	288179	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
572	NC_013205	GTT	2	6	288190	288195	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
573	NC_013205	GCA	2	6	288227	288232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
574	NC_013205	CCG	2	6	289113	289118	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
575	NC_013205	AGT	2	6	290679	290684	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
576	NC_013205	CCG	2	6	290940	290945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
577	NC_013205	AGA	2	6	290968	290973	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
578	NC_013205	AGG	2	6	292753	292758	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
579	NC_013205	CAG	2	6	293793	293798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
580	NC_013205	GCT	2	6	293812	293817	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
581	NC_013205	ACC	2	6	293847	293852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
582	NC_013205	AAC	2	6	294025	294030	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
583	NC_013205	CCG	2	6	294117	294122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
584	NC_013205	GCG	2	6	294130	294135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
585	NC_013205	GTG	2	6	294165	294170	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
586	NC_013205	GAG	2	6	294319	294324	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
587	NC_013205	ATG	2	6	294461	294466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
588	NC_013205	ACC	2	6	294493	294498	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
589	NC_013205	GTG	2	6	294507	294512	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
590	NC_013205	CAT	2	6	294696	294701	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
591	NC_013205	CGA	2	6	294725	294730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
592	NC_013205	AGC	2	6	294790	294795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
593	NC_013205	CCT	2	6	294813	294818	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
594	NC_013205	CGA	2	6	295039	295044	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
595	NC_013205	GCT	2	6	295063	295068	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
596	NC_013205	GGT	2	6	295212	295217	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
597	NC_013205	TCC	2	6	295376	295381	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
598	NC_013205	AGC	2	6	295396	295401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
599	NC_013205	GAC	2	6	295410	295415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
600	NC_013205	ATG	2	6	295432	295437	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
601	NC_013205	GTT	2	6	295537	295542	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
602	NC_013205	AAC	2	6	295596	295601	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
603	NC_013205	TGT	2	6	295690	295695	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
604	NC_013205	CGC	2	6	295735	295740	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
605	NC_013205	GTC	2	6	295816	295821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
606	NC_013205	GGC	2	6	295889	295894	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
607	NC_013205	ACC	2	6	295948	295953	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
608	NC_013205	GGC	2	6	296033	296038	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
609	NC_013205	GCG	2	6	296081	296086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
610	NC_013205	GAG	2	6	296169	296174	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
611	NC_013205	TCT	2	6	296178	296183	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
612	NC_013205	CCA	2	6	296256	296261	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
613	NC_013205	CGA	2	6	296265	296270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
614	NC_013205	GCA	2	6	296339	296344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
615	NC_013205	CGC	2	6	296386	296391	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
616	NC_013205	GAA	2	6	296398	296403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
617	NC_013205	CAG	2	6	296508	296513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
618	NC_013205	GGA	2	6	296699	296704	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
619	NC_013205	GAA	2	6	296960	296965	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
620	NC_013205	GGT	2	6	297034	297039	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
621	NC_013205	GTC	2	6	297048	297053	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
622	NC_013205	GGA	2	6	297161	297166	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
623	NC_013205	ATC	2	6	297185	297190	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
624	NC_013205	CAC	2	6	297396	297401	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
625	NC_013205	GAT	2	6	297470	297475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
626	NC_013205	CCT	2	6	297526	297531	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
627	NC_013205	GAA	2	6	297691	297696	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
628	NC_013205	CAG	2	6	297788	297793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
629	NC_013205	AGT	2	6	297881	297886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
630	NC_013205	GGA	2	6	297900	297905	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
631	NC_013205	GCG	2	6	297968	297973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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633	NC_013205	GGA	2	6	298328	298333	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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