MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 4551

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_013205	TGT	2	6	541343	541348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_013205	GCG	2	6	541374	541379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_013205	ACG	2	6	541425	541430	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1004	NC_013205	CGC	2	6	541499	541504	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1005	NC_013205	CCG	2	6	541570	541575	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1006	NC_013205	GAA	2	6	541657	541662	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1007	NC_013205	GAC	2	6	542114	542119	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_013205	TAC	2	6	542339	542344	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1009	NC_013205	CTT	2	6	542351	542356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1010	NC_013205	AAG	2	6	542375	542380	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1011	NC_013205	GTG	2	6	542412	542417	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1012	NC_013205	TGA	2	6	545607	545612	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1013	NC_013205	GGT	2	6	549538	549543	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1014	NC_013205	CGA	3	9	549566	549574	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1015	NC_013205	GCG	2	6	549617	549622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_013205	CGA	2	6	549676	549681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1017	NC_013205	CTG	2	6	549684	549689	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1018	NC_013205	CAT	2	6	549736	549741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1019	NC_013205	CAA	2	6	550509	550514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1020	NC_013205	GAT	2	6	550522	550527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1021	NC_013205	TTC	2	6	550544	550549	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_013205	CTG	2	6	550631	550636	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1023	NC_013205	CAT	2	6	550679	550684	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_013205	ACA	2	6	550711	550716	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_013205	GTG	2	6	550752	550757	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_013205	AGG	2	6	551840	551845	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_013205	CCG	2	6	552672	552677	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1028	NC_013205	GAC	2	6	552717	552722	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_013205	CTA	2	6	552986	552991	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1030	NC_013205	CGA	2	6	553019	553024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1031	NC_013205	AGG	2	6	553030	553035	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_013205	AGA	2	6	556914	556919	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1033	NC_013205	TAT	2	6	556954	556959	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_013205	TTG	2	6	556974	556979	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1035	NC_013205	GGA	2	6	558219	558224	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_013205	CTG	2	6	558615	558620	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1037	NC_013205	ATC	2	6	558659	558664	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1038	NC_013205	TGG	2	6	559896	559901	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1039	NC_013205	CTT	2	6	559937	559942	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_013205	TCA	2	6	560065	560070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_013205	AGT	2	6	560103	560108	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1042	NC_013205	GAT	2	6	560134	560139	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1043	NC_013205	ACG	2	6	560598	560603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1044	NC_013205	GCT	2	6	561579	561584	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1045	NC_013205	CCG	2	6	561609	561614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1046	NC_013205	TCA	2	6	561749	561754	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_013205	CCA	2	6	561885	561890	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1048	NC_013205	ACC	2	6	562089	562094	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1049	NC_013205	GTA	2	6	562277	562282	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1050	NC_013205	ACC	2	6	562356	562361	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1051	NC_013205	CCG	2	6	562401	562406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1052	NC_013205	TCC	2	6	562551	562556	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1053	NC_013205	TCT	2	6	562604	562609	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1054	NC_013205	TCC	2	6	562668	562673	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1055	NC_013205	GAT	2	6	562745	562750	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_013205	GAT	2	6	562768	562773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1057	NC_013205	CGC	2	6	564177	564182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1058	NC_013205	TTC	2	6	564183	564188	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1059	NC_013205	TCC	2	6	564205	564210	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1060	NC_013205	GTG	2	6	564378	564383	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1061	NC_013205	CAC	2	6	564414	564419	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1062	NC_013205	TTC	2	6	564448	564453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1063	NC_013205	GCT	2	6	564482	564487	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1064	NC_013205	CTC	2	6	564546	564551	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1065	NC_013205	CTT	2	6	564675	564680	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1066	NC_013205	AGG	2	6	564748	564753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1067	NC_013205	TCC	2	6	564762	564767	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1068	NC_013205	ACC	2	6	564798	564803	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1069	NC_013205	TCA	2	6	564811	564816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1070	NC_013205	TCC	2	6	564897	564902	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1071	NC_013205	CTT	2	6	565045	565050	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1072	NC_013205	CGA	2	6	565167	565172	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1073	NC_013205	GTA	2	6	565235	565240	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_013205	CGA	2	6	565245	565250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1075	NC_013205	ACA	2	6	565273	565278	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1076	NC_013205	CCG	2	6	565330	565335	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1077	NC_013205	CGC	2	6	565484	565489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1078	NC_013205	GTT	2	6	565546	565551	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_013205	AAC	2	6	565602	565607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1080	NC_013205	AGA	2	6	565828	565833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1081	NC_013205	ACG	2	6	565893	565898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1082	NC_013205	GAC	2	6	566217	566222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1083	NC_013205	GTC	2	6	566317	566322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1084	NC_013205	ACC	2	6	567262	567267	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1085	NC_013205	GGA	2	6	567347	567352	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1086	NC_013205	GCG	2	6	567422	567427	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1087	NC_013205	AAG	2	6	571470	571475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_013205	GTG	2	6	571480	571485	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1089	NC_013205	TAC	2	6	575638	575643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1090	NC_013205	CAA	2	6	575902	575907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1091	NC_013205	CGG	2	6	575934	575939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1092	NC_013205	CAT	2	6	575963	575968	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1093	NC_013205	CAG	2	6	576005	576010	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1094	NC_013205	GTG	3	9	576041	576049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1095	NC_013205	CCT	2	6	576157	576162	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1096	NC_013205	CAA	2	6	576215	576220	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1097	NC_013205	ACT	2	6	576241	576246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1098	NC_013205	CCT	2	6	576331	576336	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1099	NC_013205	ACC	2	6	576412	576417	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1100	NC_013205	CGT	2	6	577660	577665	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1101	NC_013205	GTC	2	6	579466	579471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1102	NC_013205	CAA	2	6	579600	579605	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1103	NC_013205	ATG	2	6	579639	579644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_013205	CAA	2	6	579788	579793	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_013205	TTA	2	6	579914	579919	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1106	NC_013205	CCG	2	6	581592	581597	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1107	NC_013205	CAA	2	6	581660	581665	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1108	NC_013205	TCA	2	6	581736	581741	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1109	NC_013205	ACG	2	6	581840	581845	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1110	NC_013205	TGT	2	6	581890	581895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1111	NC_013205	GTG	2	6	581917	581922	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1112	NC_013205	CTT	2	6	583210	583215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1113	NC_013205	TAT	2	6	583282	583287	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
1114	NC_013205	ATC	2	6	584093	584098	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1115	NC_013205	GTA	2	6	584139	584144	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1116	NC_013205	GAT	2	6	584145	584150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_013205	GCA	2	6	584151	584156	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1118	NC_013205	TAA	2	6	584381	584386	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_013205	GAA	2	6	588049	588054	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_013205	TTG	2	6	588185	588190	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1121	NC_013205	GTT	2	6	588273	588278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1122	NC_013205	AAT	2	6	588310	588315	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_013205	AAC	2	6	588520	588525	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1124	NC_013205	ATC	2	6	588551	588556	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1125	NC_013205	CTG	2	6	588586	588591	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_013205	GAG	2	6	588610	588615	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1127	NC_013205	ACT	2	6	588620	588625	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1128	NC_013205	GGC	2	6	588627	588632	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1130	NC_013205	TGG	2	6	588970	588975	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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