MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 4551

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_013205	AGG	2	6	2250044	2250049	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3502	NC_013205	CCG	2	6	2251234	2251239	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3503	NC_013205	CGG	2	6	2251248	2251253	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3504	NC_013205	ACC	2	6	2251463	2251468	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3505	NC_013205	GAA	2	6	2251477	2251482	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3506	NC_013205	ACA	2	6	2251574	2251579	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3507	NC_013205	CAT	2	6	2251626	2251631	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3508	NC_013205	GAG	2	6	2251644	2251649	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3509	NC_013205	CCG	2	6	2251711	2251716	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3510	NC_013205	CAG	2	6	2251748	2251753	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3511	NC_013205	TCG	2	6	2251857	2251862	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3512	NC_013205	CCT	2	6	2252081	2252086	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3513	NC_013205	ACT	2	6	2253552	2253557	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3514	NC_013205	CCT	2	6	2253581	2253586	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3515	NC_013205	CAT	2	6	2253597	2253602	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3516	NC_013205	ACG	2	6	2253685	2253690	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3517	NC_013205	TAG	2	6	2253791	2253796	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3518	NC_013205	CGA	2	6	2254009	2254014	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3519	NC_013205	TCT	2	6	2255494	2255499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3520	NC_013205	ATG	2	6	2255505	2255510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3521	NC_013205	TCT	2	6	2256225	2256230	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3522	NC_013205	GAA	2	6	2256245	2256250	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3523	NC_013205	GAA	2	6	2256257	2256262	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3524	NC_013205	CAG	2	6	2256331	2256336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3525	NC_013205	CTG	2	6	2256346	2256351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3526	NC_013205	TCT	2	6	2256499	2256504	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3527	NC_013205	TCC	2	6	2259087	2259092	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3528	NC_013205	CCT	2	6	2259406	2259411	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3529	NC_013205	CAT	2	6	2259453	2259458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3530	NC_013205	TAA	2	6	2259568	2259573	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3531	NC_013205	GGA	2	6	2259718	2259723	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3532	NC_013205	TCA	2	6	2259976	2259981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3533	NC_013205	GAG	2	6	2260027	2260032	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3534	NC_013205	GGC	2	6	2260378	2260383	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3535	NC_013205	GCC	2	6	2260392	2260397	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3536	NC_013205	GCC	2	6	2261451	2261456	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3537	NC_013205	GCC	2	6	2261476	2261481	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3538	NC_013205	TTC	2	6	2261545	2261550	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3539	NC_013205	TTC	2	6	2261553	2261558	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3540	NC_013205	AGG	2	6	2261660	2261665	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3541	NC_013205	TTG	2	6	2261679	2261684	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3542	NC_013205	TGA	2	6	2261693	2261698	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3543	NC_013205	GAG	2	6	2261712	2261717	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3544	NC_013205	CCT	2	6	2266712	2266717	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3545	NC_013205	CGG	2	6	2266783	2266788	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3546	NC_013205	GCG	3	9	2266832	2266840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3547	NC_013205	CGA	3	9	2266930	2266938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3548	NC_013205	GCG	2	6	2266971	2266976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3549	NC_013205	TCC	3	9	2268004	2268012	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3550	NC_013205	TCG	2	6	2268022	2268027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3551	NC_013205	AGC	2	6	2268083	2268088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3552	NC_013205	CGG	2	6	2268976	2268981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3553	NC_013205	CAA	2	6	2270086	2270091	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3554	NC_013205	GGA	2	6	2270167	2270172	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3555	NC_013205	CGG	2	6	2270263	2270268	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3556	NC_013205	TGG	2	6	2270451	2270456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3557	NC_013205	CCG	2	6	2270474	2270479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3558	NC_013205	GCC	2	6	2270524	2270529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3559	NC_013205	TGG	2	6	2270540	2270545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3560	NC_013205	ATA	2	6	2270724	2270729	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3561	NC_013205	CAT	2	6	2271912	2271917	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3562	NC_013205	AGT	2	6	2271947	2271952	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3563	NC_013205	TCC	2	6	2273865	2273870	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3564	NC_013205	TCC	2	6	2277309	2277314	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3565	NC_013205	TAC	2	6	2277772	2277777	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3566	NC_013205	GAG	2	6	2277799	2277804	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3567	NC_013205	CGG	2	6	2278283	2278288	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3568	NC_013205	GTT	2	6	2278292	2278297	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3569	NC_013205	CAG	2	6	2279895	2279900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3570	NC_013205	CCT	2	6	2279903	2279908	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3571	NC_013205	TAC	2	6	2279985	2279990	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3572	NC_013205	GCG	2	6	2282056	2282061	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3573	NC_013205	CTC	2	6	2286318	2286323	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3574	NC_013205	CGG	2	6	2286372	2286377	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3575	NC_013205	TCC	2	6	2288678	2288683	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3576	NC_013205	GTC	2	6	2291457	2291462	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3577	NC_013205	GTA	2	6	2291569	2291574	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3578	NC_013205	TCC	2	6	2293004	2293009	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3579	NC_013205	GAC	2	6	2293087	2293092	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3580	NC_013205	CCT	2	6	2298424	2298429	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3581	NC_013205	TCA	2	6	2298473	2298478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3582	NC_013205	GCC	2	6	2301585	2301590	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3583	NC_013205	CCT	2	6	2302851	2302856	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3584	NC_013205	CCT	2	6	2304736	2304741	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3585	NC_013205	CGC	2	6	2304811	2304816	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3587	NC_013205	GGC	2	6	2305072	2305077	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3588	NC_013205	GCC	2	6	2305085	2305090	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3589	NC_013205	TCT	2	6	2306615	2306620	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3590	NC_013205	CCT	2	6	2306759	2306764	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3591	NC_013205	AGG	2	6	2306789	2306794	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3592	NC_013205	ATC	2	6	2307992	2307997	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3593	NC_013205	TCC	2	6	2310773	2310778	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3594	NC_013205	CAT	2	6	2310818	2310823	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3595	NC_013205	CAC	2	6	2310852	2310857	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3596	NC_013205	TCC	2	6	2314446	2314451	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3597	NC_013205	GTC	2	6	2314458	2314463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3598	NC_013205	GCC	2	6	2314511	2314516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3599	NC_013205	CCT	2	6	2316102	2316107	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3600	NC_013205	TCC	2	6	2316128	2316133	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3601	NC_013205	ATG	2	6	2320684	2320689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3602	NC_013205	GAA	2	6	2324489	2324494	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3603	NC_013205	TCG	2	6	2324556	2324561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3604	NC_013205	TCG	2	6	2324573	2324578	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3605	NC_013205	CGA	2	6	2324684	2324689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3606	NC_013205	CGC	2	6	2324704	2324709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3607	NC_013205	CGC	2	6	2324826	2324831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3608	NC_013205	GCG	2	6	2324854	2324859	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3609	NC_013205	TCA	2	6	2329823	2329828	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3610	NC_013205	CGT	2	6	2330819	2330824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3611	NC_013205	GGA	2	6	2330841	2330846	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3612	NC_013205	CGT	2	6	2332933	2332938	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3613	NC_013205	AAG	2	6	2334246	2334251	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3614	NC_013205	TCG	2	6	2336427	2336432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3615	NC_013205	GGA	2	6	2336434	2336439	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3616	NC_013205	AGC	2	6	2337687	2337692	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3617	NC_013205	CAG	2	6	2337697	2337702	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3618	NC_013205	GAC	2	6	2337821	2337826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3619	NC_013205	TAA	2	6	2342688	2342693	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3620	NC_013205	ATT	2	6	2343758	2343763	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3621	NC_013205	CAA	3	9	2343930	2343938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3622	NC_013205	CCG	2	6	2347705	2347710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3623	NC_013205	AGG	2	6	2348753	2348758	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3624	NC_013205	GAC	2	6	2349307	2349312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3625	NC_013205	TCC	2	6	2349790	2349795	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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3627	NC_013205	TCC	2	6	2352528	2352533	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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