MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446 chromosome

Total Repeats: 4551

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3001	NC_013205	CGC	2	6	1807923	1807928	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3002	NC_013205	GCG	2	6	1807934	1807939	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3003	NC_013205	CCT	2	6	1809214	1809219	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3004	NC_013205	TCC	2	6	1810478	1810483	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3005	NC_013205	CCT	2	6	1812422	1812427	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3006	NC_013205	ATC	3	9	1816903	1816911	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3007	NC_013205	GGC	2	6	1818205	1818210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3008	NC_013205	GAG	2	6	1818248	1818253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3009	NC_013205	GAT	2	6	1819605	1819610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3010	NC_013205	TCC	2	6	1824770	1824775	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3011	NC_013205	TAA	2	6	1824823	1824828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3012	NC_013205	CGG	2	6	1826206	1826211	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3013	NC_013205	TCC	2	6	1828788	1828793	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3014	NC_013205	CGG	2	6	1830882	1830887	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3015	NC_013205	GGT	2	6	1831059	1831064	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3016	NC_013205	ACC	2	6	1831084	1831089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3017	NC_013205	CTT	2	6	1831260	1831265	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3018	NC_013205	TCG	2	6	1831403	1831408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3019	NC_013205	GCG	2	6	1831486	1831491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3020	NC_013205	CCT	2	6	1835956	1835961	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3021	NC_013205	TCC	2	6	1838786	1838791	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3022	NC_013205	TCG	2	6	1838799	1838804	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3023	NC_013205	TTC	2	6	1838838	1838843	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3024	NC_013205	CCG	2	6	1840229	1840234	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3025	NC_013205	GAA	2	6	1840793	1840798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3026	NC_013205	AGA	2	6	1840802	1840807	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3027	NC_013205	CCT	2	6	1841505	1841510	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3028	NC_013205	TCG	2	6	1845984	1845989	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3029	NC_013205	GAG	2	6	1846019	1846024	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3030	NC_013205	GAG	2	6	1846031	1846036	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3031	NC_013205	AGG	2	6	1847319	1847324	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3032	NC_013205	TAC	2	6	1851866	1851871	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3033	NC_013205	GAG	2	6	1851897	1851902	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3034	NC_013205	ATC	2	6	1857995	1858000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3035	NC_013205	CCT	2	6	1858004	1858009	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3036	NC_013205	GAA	2	6	1860022	1860027	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3037	NC_013205	TGA	2	6	1860073	1860078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3038	NC_013205	AGG	2	6	1860466	1860471	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3039	NC_013205	CGC	2	6	1862284	1862289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3040	NC_013205	ATC	2	6	1862610	1862615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3041	NC_013205	GCT	2	6	1863322	1863327	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3042	NC_013205	CGG	2	6	1863362	1863367	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3043	NC_013205	TCC	2	6	1865179	1865184	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3044	NC_013205	CAC	2	6	1865188	1865193	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3045	NC_013205	GAG	2	6	1865207	1865212	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3046	NC_013205	GCT	2	6	1866729	1866734	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3047	NC_013205	CTC	2	6	1869271	1869276	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3048	NC_013205	ATG	2	6	1870050	1870055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3049	NC_013205	TGA	2	6	1871200	1871205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3050	NC_013205	TTG	2	6	1873201	1873206	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3051	NC_013205	CGG	2	6	1874403	1874408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3052	NC_013205	CGC	3	9	1874438	1874446	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3053	NC_013205	GGC	2	6	1874554	1874559	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3054	NC_013205	CGC	2	6	1874580	1874585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3055	NC_013205	TCC	2	6	1879977	1879982	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3056	NC_013205	ACC	2	6	1880034	1880039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3057	NC_013205	GAC	2	6	1880108	1880113	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3058	NC_013205	TCC	2	6	1880794	1880799	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3059	NC_013205	GAC	2	6	1880818	1880823	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3060	NC_013205	GAG	2	6	1880905	1880910	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3061	NC_013205	CTC	2	6	1882506	1882511	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3062	NC_013205	CCA	3	9	1882525	1882533	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3063	NC_013205	TCC	2	6	1886584	1886589	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3064	NC_013205	CGC	2	6	1892027	1892032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3065	NC_013205	CTG	2	6	1893758	1893763	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3066	NC_013205	CCT	2	6	1895120	1895125	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3067	NC_013205	TCC	2	6	1897172	1897177	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3068	NC_013205	CGA	2	6	1897200	1897205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3069	NC_013205	CAC	2	6	1897229	1897234	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3070	NC_013205	AGG	2	6	1897315	1897320	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3071	NC_013205	AGA	2	6	1897346	1897351	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3072	NC_013205	GCT	2	6	1897354	1897359	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3073	NC_013205	CGC	2	6	1897413	1897418	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3075	NC_013205	CTC	2	6	1898993	1898998	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3076	NC_013205	CTT	2	6	1902063	1902068	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3077	NC_013205	ATG	2	6	1902501	1902506	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3078	NC_013205	GGC	2	6	1902537	1902542	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3079	NC_013205	ATG	2	6	1903333	1903338	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3080	NC_013205	CGA	2	6	1903354	1903359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3081	NC_013205	CCT	2	6	1903821	1903826	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3082	NC_013205	CTC	2	6	1905137	1905142	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3083	NC_013205	CCG	2	6	1905164	1905169	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3084	NC_013205	AGG	2	6	1905310	1905315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3085	NC_013205	CGC	2	6	1906946	1906951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3088	NC_013205	CTT	2	6	1909438	1909443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3089	NC_013205	CGA	2	6	1909511	1909516	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3090	NC_013205	CCG	2	6	1909983	1909988	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3091	NC_013205	TCC	2	6	1913234	1913239	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3092	NC_013205	TCA	2	6	1916750	1916755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3093	NC_013205	CGC	2	6	1916797	1916802	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3094	NC_013205	ACG	2	6	1916803	1916808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3095	NC_013205	AGG	2	6	1916857	1916862	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3096	NC_013205	ACC	2	6	1916900	1916905	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3097	NC_013205	GTG	2	6	1916947	1916952	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3098	NC_013205	CCG	2	6	1916980	1916985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3099	NC_013205	GCG	2	6	1916993	1916998	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3100	NC_013205	TGT	2	6	1917214	1917219	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3101	NC_013205	CGG	2	6	1917239	1917244	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3102	NC_013205	CGG	2	6	1917246	1917251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3103	NC_013205	CCG	2	6	1917258	1917263	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3104	NC_013205	CCT	2	6	1918768	1918773	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3105	NC_013205	CCG	2	6	1918794	1918799	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3106	NC_013205	TTC	2	6	1923803	1923808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3107	NC_013205	TGG	2	6	1923823	1923828	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3108	NC_013205	GAG	2	6	1924111	1924116	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3109	NC_013205	CCT	2	6	1926337	1926342	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3110	NC_013205	GCG	2	6	1928500	1928505	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3111	NC_013205	TCG	2	6	1928511	1928516	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3112	NC_013205	CGC	2	6	1928522	1928527	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3113	NC_013205	GAG	2	6	1931147	1931152	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3114	NC_013205	CGC	2	6	1932564	1932569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3115	NC_013205	GGC	2	6	1932583	1932588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
3116	NC_013205	GCC	2	6	1932601	1932606	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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3118	NC_013205	CCT	2	6	1937387	1937392	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3119	NC_013205	CAG	2	6	1937405	1937410	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3120	NC_013205	ATG	2	6	1939638	1939643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
3121	NC_013205	GCC	2	6	1940956	1940961	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3122	NC_013205	CCT	2	6	1941823	1941828	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3123	NC_013205	TGC	2	6	1942105	1942110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3124	NC_013205	CCA	2	6	1942119	1942124	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
3125	NC_013205	TCG	2	6	1944266	1944271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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3127	NC_013205	GCG	3	9	1948210	1948218	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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