MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1 chromosome

Total Repeats: 4221

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4001	NC_008340	ATG	2	6	3048296	3048301	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4002	NC_008340	GAG	2	6	3048310	3048315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4003	NC_008340	CTT	2	6	3050871	3050876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4004	NC_008340	GGC	2	6	3051441	3051446	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4005	NC_008340	ACG	3	9	3054131	3054139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4006	NC_008340	CAT	2	6	3054168	3054173	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4007	NC_008340	ACG	2	6	3054796	3054801	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4008	NC_008340	CCA	2	6	3058466	3058471	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4009	NC_008340	CTG	2	6	3059330	3059335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4010	NC_008340	ACA	2	6	3062255	3062260	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4011	NC_008340	GCC	2	6	3062295	3062300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4012	NC_008340	GGA	2	6	3062304	3062309	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4013	NC_008340	CGG	3	9	3063246	3063254	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4014	NC_008340	CGC	2	6	3063580	3063585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4015	NC_008340	GCA	2	6	3065497	3065502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4016	NC_008340	ACC	2	6	3068787	3068792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4017	NC_008340	CGG	2	6	3070149	3070154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4018	NC_008340	GAG	2	6	3070226	3070231	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4019	NC_008340	GCG	2	6	3070285	3070290	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4020	NC_008340	GCC	2	6	3070309	3070314	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4021	NC_008340	CGG	2	6	3071907	3071912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4022	NC_008340	ACG	2	6	3073170	3073175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4023	NC_008340	ACC	2	6	3073202	3073207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4024	NC_008340	GAC	2	6	3077788	3077793	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4025	NC_008340	GCG	2	6	3081230	3081235	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4026	NC_008340	CTG	2	6	3081787	3081792	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4027	NC_008340	CGC	2	6	3081799	3081804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4028	NC_008340	TGC	2	6	3081823	3081828	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4029	NC_008340	ACA	2	6	3081835	3081840	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4030	NC_008340	GCG	2	6	3081863	3081868	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4031	NC_008340	AGG	2	6	3081874	3081879	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4032	NC_008340	ACT	2	6	3081883	3081888	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4033	NC_008340	TGG	2	6	3081898	3081903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4034	NC_008340	ACC	2	6	3081920	3081925	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4035	NC_008340	GCG	2	6	3081981	3081986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4036	NC_008340	CTG	3	9	3082004	3082012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4037	NC_008340	CCG	2	6	3082039	3082044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4038	NC_008340	TAA	2	6	3082077	3082082	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4039	NC_008340	ACC	2	6	3082103	3082108	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4040	NC_008340	ACC	2	6	3082568	3082573	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4041	NC_008340	GGC	2	6	3082581	3082586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4042	NC_008340	GCC	2	6	3082590	3082595	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4043	NC_008340	CTT	2	6	3082683	3082688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4044	NC_008340	GCG	2	6	3082775	3082780	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4045	NC_008340	CTC	2	6	3082793	3082798	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4046	NC_008340	GCC	2	6	3082816	3082821	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4047	NC_008340	GGC	2	6	3082890	3082895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4048	NC_008340	AAC	2	6	3085414	3085419	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4049	NC_008340	CAA	2	6	3086501	3086506	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4050	NC_008340	GCC	2	6	3086511	3086516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4051	NC_008340	CGC	2	6	3086540	3086545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4052	NC_008340	TGC	2	6	3086578	3086583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4053	NC_008340	GCC	2	6	3086680	3086685	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4054	NC_008340	TCC	2	6	3090937	3090942	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4055	NC_008340	CGC	2	6	3091167	3091172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4056	NC_008340	AGG	2	6	3091179	3091184	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4057	NC_008340	AGC	2	6	3092559	3092564	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4058	NC_008340	CAA	2	6	3092573	3092578	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4059	NC_008340	ACA	2	6	3092650	3092655	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4060	NC_008340	TGT	2	6	3092744	3092749	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4061	NC_008340	TGC	2	6	3092811	3092816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4062	NC_008340	ACA	2	6	3092818	3092823	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4063	NC_008340	CAG	2	6	3092984	3092989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4064	NC_008340	ATG	2	6	3093002	3093007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4065	NC_008340	GAG	2	6	3093013	3093018	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4066	NC_008340	GCC	2	6	3094573	3094578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4067	NC_008340	CGA	2	6	3094591	3094596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4068	NC_008340	AGG	2	6	3094648	3094653	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4069	NC_008340	TCC	2	6	3097186	3097191	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4070	NC_008340	CCA	2	6	3097502	3097507	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4071	NC_008340	GAG	2	6	3097544	3097549	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4072	NC_008340	GCC	2	6	3099396	3099401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4073	NC_008340	GCA	2	6	3099402	3099407	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4074	NC_008340	GGA	2	6	3100940	3100945	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4075	NC_008340	ATA	2	6	3103723	3103728	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4076	NC_008340	AAC	2	6	3103796	3103801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4077	NC_008340	AGG	2	6	3103821	3103826	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4078	NC_008340	CCG	2	6	3105841	3105846	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4079	NC_008340	AAC	2	6	3105855	3105860	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4080	NC_008340	CCT	2	6	3107117	3107122	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4081	NC_008340	CGC	2	6	3107185	3107190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4082	NC_008340	CGA	2	6	3108058	3108063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4083	NC_008340	CAT	2	6	3109613	3109618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4084	NC_008340	CCG	2	6	3109668	3109673	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4085	NC_008340	ATC	2	6	3109950	3109955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4086	NC_008340	TCC	2	6	3114824	3114829	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4087	NC_008340	CGC	2	6	3114964	3114969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4088	NC_008340	ATC	2	6	3114981	3114986	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4089	NC_008340	GAC	2	6	3115010	3115015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4090	NC_008340	GAT	2	6	3116422	3116427	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4091	NC_008340	CGG	2	6	3116431	3116436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4092	NC_008340	GGT	2	6	3116444	3116449	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4093	NC_008340	CGG	2	6	3116504	3116509	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4094	NC_008340	CAG	2	6	3117857	3117862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4095	NC_008340	AGG	2	6	3117890	3117895	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4096	NC_008340	GCG	2	6	3120756	3120761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4097	NC_008340	GAT	2	6	3120774	3120779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4098	NC_008340	TAC	2	6	3122642	3122647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4099	NC_008340	GCC	2	6	3122695	3122700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4100	NC_008340	CGT	2	6	3122726	3122731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4101	NC_008340	TAT	2	6	3123100	3123105	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4102	NC_008340	ACC	2	6	3123118	3123123	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4103	NC_008340	TGA	2	6	3123232	3123237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4104	NC_008340	CCG	2	6	3124700	3124705	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4105	NC_008340	CGA	2	6	3127997	3128002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4106	NC_008340	GGA	2	6	3129643	3129648	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4107	NC_008340	GAT	2	6	3136941	3136946	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4108	NC_008340	GCA	2	6	3136952	3136957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4109	NC_008340	CCG	2	6	3143078	3143083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4110	NC_008340	CCA	2	6	3143112	3143117	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4111	NC_008340	CGC	2	6	3143130	3143135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4112	NC_008340	GAG	2	6	3143231	3143236	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4113	NC_008340	CCG	2	6	3144589	3144594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4114	NC_008340	GAG	2	6	3145077	3145082	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4115	NC_008340	GGC	2	6	3146184	3146189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4116	NC_008340	GCC	2	6	3146250	3146255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4117	NC_008340	GAC	2	6	3146265	3146270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4118	NC_008340	CAA	2	6	3149293	3149298	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4119	NC_008340	CGA	2	6	3149371	3149376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4120	NC_008340	CGT	2	6	3149574	3149579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4121	NC_008340	CGT	2	6	3152792	3152797	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4122	NC_008340	CTA	2	6	3152807	3152812	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4123	NC_008340	GCG	2	6	3154308	3154313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4124	NC_008340	CGC	2	6	3154469	3154474	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4125	NC_008340	GCC	2	6	3162360	3162365	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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4127	NC_008340	CGG	2	6	3164803	3164808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.