MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Alpha proteobacterium HIMB5 chromosome

Total Repeats: 18710

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_018643	ATA	2	6	34643	34648	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705630
502	NC_018643	CCA	2	6	34763	34768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406705630
503	NC_018643	TAA	2	6	34842	34847	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705630
504	NC_018643	ATT	2	6	34870	34875	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705630
505	NC_018643	CCT	2	6	34937	34942	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406705630
506	NC_018643	ATG	2	6	34977	34982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406705630
507	NC_018643	TTA	2	6	35096	35101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705630
508	NC_018643	ATT	2	6	35120	35125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705630
509	NC_018643	AAT	2	6	35138	35143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705630
510	NC_018643	TAA	2	6	35269	35274	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705630
511	NC_018643	ATT	2	6	35374	35379	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705631
512	NC_018643	ATC	2	6	35388	35393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406705631
513	NC_018643	TGA	2	6	35481	35486	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406705631
514	NC_018643	TTA	2	6	35551	35556	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705631
515	NC_018643	TAA	2	6	35589	35594	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705631
516	NC_018643	CGT	2	6	35627	35632	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406705631
517	NC_018643	TGT	2	6	35743	35748	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406705631
518	NC_018643	GAT	2	6	35753	35758	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406705631
519	NC_018643	AAT	2	6	35775	35780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705631
520	NC_018643	TAC	2	6	35786	35791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406705631
521	NC_018643	ACC	2	6	35835	35840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406705631
522	NC_018643	TAT	2	6	35924	35929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705631
523	NC_018643	ACA	2	6	36076	36081	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406705631
524	NC_018643	TCT	2	6	36154	36159	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406705631
525	NC_018643	TAA	2	6	36165	36170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705631
526	NC_018643	TAA	2	6	36426	36431	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705631
527	NC_018643	TAT	2	6	36586	36591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705632
528	NC_018643	TTA	2	6	36614	36619	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705632
529	NC_018643	TCA	2	6	36642	36647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406705632
530	NC_018643	GTA	2	6	36729	36734	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406705632
531	NC_018643	CTT	2	6	36831	36836	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406705632
532	NC_018643	ATC	2	6	36838	36843	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406705632
533	NC_018643	TGT	2	6	36874	36879	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406705632
534	NC_018643	GCT	2	6	36920	36925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406705632
535	NC_018643	AAT	2	6	36958	36963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705632
536	NC_018643	TTC	2	6	37006	37011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406705632
537	NC_018643	TCC	2	6	37081	37086	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	406705632
538	NC_018643	CCA	2	6	37091	37096	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406705632
539	NC_018643	GCA	3	9	37097	37105	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406705632
540	NC_018643	TAT	2	6	37149	37154	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705632
541	NC_018643	ATC	2	6	37198	37203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406705632
542	NC_018643	ACC	2	6	37204	37209	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406705632
543	NC_018643	TGT	2	6	37262	37267	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406705632
544	NC_018643	ACC	2	6	37333	37338	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406705632
545	NC_018643	CCA	2	6	37343	37348	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406705632
546	NC_018643	CCA	2	6	37355	37360	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406705632
547	NC_018643	CAC	2	6	37401	37406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406705632
548	NC_018643	ATA	2	6	37451	37456	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705632
549	NC_018643	AAC	2	6	37532	37537	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406705633
550	NC_018643	CAC	2	6	37651	37656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406705633
551	NC_018643	GAT	2	6	37707	37712	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406705633
552	NC_018643	ATA	2	6	37808	37813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705634
553	NC_018643	TCT	3	9	37896	37904	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406705634
554	NC_018643	CTT	2	6	37905	37910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406705634
555	NC_018643	TTG	2	6	37976	37981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406705634
556	NC_018643	ATA	2	6	38140	38145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705634
557	NC_018643	TCT	2	6	38282	38287	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406705635
558	NC_018643	TTC	2	6	38437	38442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406705635
559	NC_018643	ATT	2	6	38686	38691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705635
560	NC_018643	TCA	2	6	38864	38869	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406705635
561	NC_018643	ATA	2	6	38906	38911	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705635
562	NC_018643	TAA	2	6	39232	39237	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705636
563	NC_018643	TTA	2	6	39297	39302	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705636
564	NC_018643	CCA	2	6	39441	39446	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406705636
565	NC_018643	TAA	2	6	39523	39528	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705637
566	NC_018643	CAA	2	6	39546	39551	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406705637
567	NC_018643	TAA	2	6	39586	39591	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705637
568	NC_018643	ACC	2	6	39763	39768	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406705637
569	NC_018643	AAT	2	6	39789	39794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705637
570	NC_018643	CAA	2	6	39840	39845	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406705637
571	NC_018643	TTC	2	6	39930	39935	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406705637
572	NC_018643	TGC	2	6	39979	39984	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406705637
573	NC_018643	GAA	2	6	40176	40181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	406705637
574	NC_018643	CCA	2	6	40202	40207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406705637
575	NC_018643	AAT	2	6	40217	40222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705637
576	NC_018643	TTA	2	6	40223	40228	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705637
577	NC_018643	CTT	2	6	40308	40313	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406705637
578	NC_018643	CCA	2	6	40432	40437	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406705637
579	NC_018643	CAA	2	6	40470	40475	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	406705637
580	NC_018643	AAT	2	6	40818	40823	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705638
581	NC_018643	TGA	2	6	41046	41051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406705638
582	NC_018643	AAT	2	6	41053	41058	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705638
583	NC_018643	TTG	2	6	41180	41185	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406705638
584	NC_018643	AAT	2	6	41290	41295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705638
585	NC_018643	TTC	2	6	41360	41365	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	406705638
586	NC_018643	TTG	3	9	41366	41374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406705638
587	NC_018643	ATG	2	6	41375	41380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406705638
588	NC_018643	TTA	2	6	41382	41387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705638
589	NC_018643	CAT	2	6	41489	41494	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406705638
590	NC_018643	ATT	2	6	41527	41532	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705638
591	NC_018643	GCC	2	6	41587	41592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	406705638
592	NC_018643	AGC	2	6	41595	41600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406705638
593	NC_018643	TAA	2	6	41622	41627	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705638
594	NC_018643	ATA	2	6	41639	41644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705638
595	NC_018643	ATT	2	6	42096	42101	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705639
596	NC_018643	AGT	2	6	42159	42164	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	406705639
597	NC_018643	TCA	2	6	42189	42194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406705639
598	NC_018643	GTG	2	6	42323	42328	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	406705639
599	NC_018643	TAA	2	6	42334	42339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705639
600	NC_018643	AGG	2	6	42548	42553	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	406705639
601	NC_018643	AGC	2	6	42575	42580	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	406705639
602	NC_018643	AAT	2	6	42615	42620	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705639
603	NC_018643	TAA	2	6	42698	42703	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705639
604	NC_018643	AAT	2	6	42707	42712	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705639
605	NC_018643	ATC	2	6	42821	42826	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406705640
606	NC_018643	AAT	2	6	42829	42834	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705640
607	NC_018643	ATT	2	6	42851	42856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705640
608	NC_018643	AAT	2	6	43057	43062	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705640
609	NC_018643	TAA	2	6	43219	43224	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705640
610	NC_018643	ATT	2	6	43268	43273	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705640
611	NC_018643	TTA	2	6	43311	43316	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705640
612	NC_018643	TAA	2	6	43322	43327	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705640
613	NC_018643	TCA	2	6	43347	43352	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406705640
614	NC_018643	CCA	3	9	43419	43427	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	406705640
615	NC_018643	TAT	2	6	43510	43515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705640
616	NC_018643	ATC	2	6	43580	43585	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	406705640
617	NC_018643	AAT	2	6	43633	43638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705640
618	NC_018643	ATA	2	6	43673	43678	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705640
619	NC_018643	ATT	2	6	43766	43771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705640
620	NC_018643	TTG	2	6	43969	43974	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406705640
621	NC_018643	ATT	2	6	44003	44008	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	406705640
622	NC_018643	ATA	2	6	44054	44059	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705640
623	NC_018643	TTG	2	6	44078	44083	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	406705640
624	NC_018643	TAA	2	6	44088	44093	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	406705640
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626	NC_018643	GCT	2	6	44233	44238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	406705640
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